3818 genes were found for organism Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 39    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Rpic_0001  CDS  NC_010682  328  1917  1590  chromosomal replication initiation protein  YP_001897600  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0002  CDS  NC_010682  2194  3309  1116  DNA polymerase III subunit beta  YP_001897601  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0003  CDS  NC_010682  3438  5966  2529  DNA gyrase subunit B  YP_001897602  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0004  CDS  NC_010682  6281  8413  2133  N-6 DNA methylase  YP_001897603  normal  0.702722  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0005  CDS  NC_010682  8418  8852  435  hypothetical protein  YP_001897604  normal  0.664847  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0006  CDS  NC_010682  9044  9454  411  hypothetical protein  YP_001897605  normal  0.64516  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0007  CDS  NC_010682  10376  10744  369  hypothetical protein  YP_001897606  normal  0.303674  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0008  CDS  NC_010682  10906  11763  858  Integrase catalytic region  YP_001897607  normal  0.230626  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0009  CDS  NC_010682  11817  12146  330  transposase IS3/IS911 family protein  YP_001897608  normal  0.445184  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0010  CDS  NC_010682  12674  13633  960  Fimbrial protein  YP_001897609  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0011  CDS  NC_010682  13662  14021  360  hypothetical protein  YP_001897610  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0012    NC_010682  14642  24747  10106      normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0014  CDS  NC_010682  25869  27560  1692  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  YP_001897611  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0015  CDS  NC_010682  27822  28013  192  hypothetical protein  YP_001897612  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0016  CDS  NC_010682  28338  29102  765  GntR domain protein  YP_001897613  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0017  CDS  NC_010682  29130  29957  828  extracellular solute-binding protein family 3  YP_001897614  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0018  CDS  NC_010682  30115  30849  735  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  YP_001897615  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0019  CDS  NC_010682  30846  31499  654  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  YP_001897616  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0020  CDS  NC_010682  31486  32223  738  ABC transporter related  YP_001897617  normal  normal  0.983785  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0021  CDS  NC_010682  32307  33263  957  protein of unknown function UPF0187  YP_001897618  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0022  CDS  NC_010682  33286  33957  672  hypothetical protein  YP_001897619  normal  normal  0.788771  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0023  CDS  NC_010682  34060  34758  699  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  YP_001897620  normal  normal  0.781949  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0024  CDS  NC_010682  34952  36586  1635  acyl-CoA synthetase  YP_001897621  normal  normal  0.702064  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0025  CDS  NC_010682  36686  38254  1569  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  YP_001897622  normal  normal  0.932986  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0026  CDS  NC_010682  38470  39015  546  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001897623  normal  normal  0.603997  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0027  CDS  NC_010682  39109  39582  474  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  YP_001897624  normal  normal  0.456012  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0028  CDS  NC_010682  39715  40623  909  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  YP_001897625  normal  normal  0.467256  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0029  CDS  NC_010682  40695  42893  2199  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  YP_001897626  normal  normal  0.598305  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0030  CDS  NC_010682  43133  43747  615  Glutathione S-transferase domain  YP_001897627  normal  normal  0.591162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0031  CDS  NC_010682  43755  44903  1149  CBS domain containing membrane protein  YP_001897628  normal  normal  0.668358  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0032  CDS  NC_010682  45136  45333  198  hypothetical protein  YP_001897629  normal  normal  0.694262  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0033  CDS  NC_010682  45347  46393  1047  autotransporter-associated beta strand repeat protein  YP_001897630  normal  normal  0.354567  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0034  CDS  NC_010682  46398  47237  840  transcriptional regulator, AraC family  YP_001897631  normal  normal  0.255751  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0035  CDS  NC_010682  47549  47842  294  GYD family protein  YP_001897632  normal  normal  0.161065  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0036  CDS  NC_010682  47913  49103  1191  S-adenosylmethionine synthetase  YP_001897633  normal  normal  0.094057  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0037  CDS  NC_010682  49343  50191  849  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  YP_001897634  normal  normal  0.182003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0038  CDS  NC_010682  50205  51098  894  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  YP_001897635  normal  normal  0.256445  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0039  CDS  NC_010682  51188  52066  879  diaminopimelate epimerase  YP_001897636  normal  normal  0.258665  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0040  CDS  NC_010682  52114  52941  828  protein of unknown function DUF344  YP_001897637  normal  normal  0.178627  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0041  CDS  NC_010682  53067  53744  678  orotate phosphoribosyltransferase  YP_001897638  normal  normal  0.243068  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0042  CDS  NC_010682  53778  54563  786  exodeoxyribonuclease III Xth  YP_001897639  normal  normal  0.169682  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0043  CDS  NC_010682  54691  55704  1014  N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase  YP_001897640  normal  normal  0.185522  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0044  CDS  NC_010682  55777  56685  909  band 7 protein  YP_001897641  normal  normal  0.179688  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0045  CDS  NC_010682  56994  57794  801  protein of unknown function DUF218  YP_001897642  normal  normal  0.164009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0046  CDS  NC_010682  58107  59051  945  peptidase M48 Ste24p  YP_001897643  normal  normal  0.330738  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0047  CDS  NC_010682  59149  60438  1290  muropeptide transporter  YP_001897644  normal  normal  0.252605  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0048  CDS  NC_010682  60443  61636  1194  protein of unknown function DUF185  YP_001897645  normal  normal  0.244588  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0049  CDS  NC_010682  61653  62471  819  short chain dehydrogenase  YP_001897646  normal  normal  0.307047  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0050  CDS  NC_010682  62496  62894  399  hypothetical protein  YP_001897647  normal  normal  0.370588  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0051  CDS  NC_010682  63193  64122  930  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  YP_001897648  normal  normal  0.535245  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0052  CDS  NC_010682  64147  65373  1227  ornithine aminotransferase  YP_001897649  normal  normal  0.98585  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0053  CDS  NC_010682  65492  66415  924  transcriptional regulator, LysR family  YP_001897650  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0054  CDS  NC_010682  66502  67254  753  transcriptional regulator, TetR family  YP_001897651  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0055  CDS  NC_010682  67303  68277  975  secretion protein HlyD family protein  YP_001897652  normal  0.873688  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0056  CDS  NC_010682  68274  69254  981  ABC transporter related  YP_001897653  normal  0.991306  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0057  CDS  NC_010682  69251  70414  1164  ABC-2 type transporter  YP_001897654  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0058  CDS  NC_010682  70422  72161  1740  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  YP_001897655  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0059  CDS  NC_010682  72444  73409  966  2-dehydropantoate 2-reductase  YP_001897656  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0060  CDS  NC_010682  73564  74511  948  C32 tRNA thiolase  YP_001897657  normal  0.867348  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0061  CDS  NC_010682  74849  76216  1368  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  YP_001897658  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0062  CDS  NC_010682  76334  78172  1839  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  YP_001897659  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0063  CDS  NC_010682  78297  78602  306  hypothetical protein  YP_001897660  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0064  CDS  NC_010682  78730  79002  273  hypothetical protein  YP_001897661  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0065  CDS  NC_010682  79111  80031  921  Patatin  YP_001897662  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0066  CDS  NC_010682  80154  81167  1014  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  YP_001897663  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0067  CDS  NC_010682  81169  82083  915  transcriptional regulator, LysR family  YP_001897664  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0068  CDS  NC_010682  82250  84040  1791  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  YP_001897665  normal  0.736165  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0069  CDS  NC_010682  84093  84569  477  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  YP_001897666  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0070  CDS  NC_010682  84766  85236  471  PRC-barrel domain protein  YP_001897667  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0071  CDS  NC_010682  85298  85486  189  hypothetical protein  YP_001897668  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0072  CDS  NC_010682  85554  85907  354  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001897669  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0073  CDS  NC_010682  86034  87242  1209  putative transcriptional regulator, GntR family  YP_001897670  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0074  CDS  NC_010682  87263  87769  507  transcriptional regulator, AraC family  YP_001897671  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0075  CDS  NC_010682  87769  88185  417  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001897672  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0076  CDS  NC_010682  88182  88436  255  hypothetical protein  YP_001897673  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0077  CDS  NC_010682  88744  89940  1197  major facilitator superfamily MFS_1  YP_001897674  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0078  CDS  NC_010682  90003  90710  708  Glutathione S-transferase domain  YP_001897675  normal  0.926583  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0079  CDS  NC_010682  90805  91998  1194  low temperature requirement A  YP_001897676  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0080  CDS  NC_010682  92033  92680  648  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  YP_001897677  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0081  CDS  NC_010682  93079  93321  243  hypothetical protein  YP_001897678  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0082  CDS  NC_010682  93314  94294  981  protein of unknown function DUF6 transmembrane  YP_001897679  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0083  CDS  NC_010682  94401  95123  723  transcriptional regulator, AraC family  YP_001897680  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0084  CDS  NC_010682  95357  98572  3216  transcriptional activator domain  YP_001897681  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0085  CDS  NC_010682  98936  100576  1641  hypothetical protein  YP_001897682  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0086  CDS  NC_010682  100821  101177  357  protein of unknown function DUF427  YP_001897683  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0087  CDS  NC_010682  101262  102464  1203  Rh family protein/ammonium transporter  YP_001897684  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0088  CDS  NC_010682  102724  103749  1026  conserved hypothetical/unknown signal peptide protein  YP_001897685  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0089  CDS  NC_010682  104095  107382  3288  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  YP_001897686  normal  0.571974  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0090  CDS  NC_010682  107696  108550  855  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  YP_001897687  normal  0.879146  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0091  CDS  NC_010682  108707  109564  858  phenazine biosynthesis protein PhzF family  YP_001897688  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0092  CDS  NC_010682  109582  110130  549  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001897689  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0093    NC_010682  110130  110258  129      normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0094    NC_010682  110307  110390  84      normal  0.762591  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0095  CDS  NC_010682  110413  111888  1476  protein of unknown function DUF1254  YP_001897690  normal  0.870201  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0096  CDS  NC_010682  112098  113081  984  2-nitropropane dioxygenase NPD  YP_001897691  normal  0.396522  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0097  CDS  NC_010682  113183  113731  549  intracellular protease, PfpI family  YP_001897692  normal  0.62753  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0098  CDS  NC_010682  113869  114795  927  alpha/beta hydrolase fold  YP_001897693  normal  0.480841  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0099  CDS  NC_010682  114805  115488  684  2OG-Fe(II) oxygenase  YP_001897694  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0100  CDS  NC_010682  115479  116249  771  Sel1 domain protein repeat-containing protein  YP_001897695  normal  0.334736  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0101  CDS  NC_010682  116249  118528  2280  TonB-dependent siderophore receptor  YP_001897696  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 39    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>