1192 genes were found for organism Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 12    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Rpic_3761  CDS  NC_010678  23  1618  1596  peptide chain release factor 3  YP_001892304  normal  0.672983  normal  0.106529  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3762  CDS  NC_010678  1899  2207  309  hypothetical protein  YP_001892305  normal  0.0872464  normal  0.0774778  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3763  CDS  NC_010678  2330  2632  303  hypothetical protein  YP_001892306  normal  0.0591449  normal  0.0802364  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3764  CDS  NC_010678  2647  3636  990  ribonuclease BN  YP_001892307  normal  0.0316697  normal  0.101597  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3765  CDS  NC_010678  3721  4026  306  hypothetical protein  YP_001892308  normal  0.0394823  normal  0.0837723  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3766  CDS  NC_010678  4080  4247  168  protein of unknown function DUF1328  YP_001892309  normal  0.0488299  normal  0.0834725  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3767  CDS  NC_010678  4367  5773  1407  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  YP_001892310  normal  0.114638  normal  0.0523944  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3768  CDS  NC_010678  6310  7407  1098  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  YP_001892311  normal  0.251278  normal  0.151277  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3769  CDS  NC_010678  7630  7950  321  conserved hypothetical signal peptide protein  YP_001892312  normal  0.198131  normal  0.0852665  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3770  CDS  NC_010678  8263  9765  1503  RNA polymerase factor sigma-54  YP_001892313  normal  0.0528545  normal  0.0523944  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3771  CDS  NC_010678  9819  10991  1173  glycosyl transferase group 1  YP_001892314  normal  0.607496  normal  0.0472047  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3772  CDS  NC_010678  11010  11804  795  hypothetical protein  YP_001892315  normal  0.516985  normal  0.0626785  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3773  CDS  NC_010678  11811  12347  537  phosphoesterase PA-phosphatase related  YP_001892316  normal  normal  0.0882252  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3774  CDS  NC_010678  12325  13497  1173  glycosyl transferase group 1  YP_001892317  normal  0.872783  normal  0.105154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3775  CDS  NC_010678  13506  13937  432  hypothetical protein  YP_001892318  normal  normal  0.0873068  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3776  CDS  NC_010678  14139  15458  1320  protein of unknown function UPF0118  YP_001892319  normal  normal  0.165443  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3777  CDS  NC_010678  15460  17844  2385  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  YP_001892320  normal  0.410783  normal  0.29106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3778  CDS  NC_010678  17929  18711  783  hypothetical protein  YP_001892321  normal  0.157644  normal  0.0998357  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3779  CDS  NC_010678  19004  20287  1284  putative proline-rich protein  YP_001892322  normal  0.0230018  normal  0.115334  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3780  CDS  NC_010678  20561  21865  1305  Xanthine/uracil/vitamin C permease  YP_001892323  normal  0.0612559  normal  0.111868  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3781  CDS  NC_010678  23271  24344  1074  plasmid encoded RepA protein  YP_001892324  normal  0.407659  normal  0.193464  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3782  CDS  NC_010678  24421  24624  204  cold-shock DNA-binding domain protein  YP_001892325  normal  0.0399631  normal  0.208523  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3783  CDS  NC_010678  25030  25698  669  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_001892326  normal  0.0208258  normal  0.232472  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3784  CDS  NC_010678  25695  26702  1008  parB-like partition protein  YP_001892327  normal  0.123683  normal  0.254535  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3785  CDS  NC_010678  27001  27837  837  hypothetical protein  YP_001892328  normal  0.294021  normal  0.31087  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3786  CDS  NC_010678  28088  29041  954  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  YP_001892329  normal  0.0945557  normal  0.170806  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3787  CDS  NC_010678  29300  30646  1347  General substrate transporter  YP_001892330  normal  0.536994  normal  0.195761  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3788  CDS  NC_010678  30651  32558  1908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001892331  normal  normal  0.119976  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3789  CDS  NC_010678  32555  33913  1359  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  YP_001892332  normal  normal  0.146089  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3790  CDS  NC_010678  33910  34710  801  putative lipoprotein transmembrane  YP_001892333  normal  normal  0.0897884  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3791  CDS  NC_010678  34823  35263  441  conserved hypothetical signal peptide protein  YP_001892334  normal  normal  0.0846584  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3792  CDS  NC_010678  35376  38057  2682  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  YP_001892335  normal  normal  0.226695  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3793  CDS  NC_010678  38492  39652  1161  Extracellular ligand-binding receptor  YP_001892336  normal  normal  0.15379  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3794  CDS  NC_010678  39749  40630  882  inner-membrane translocator  YP_001892337  normal  0.751055  normal  0.192822  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3795  CDS  NC_010678  40644  41552  909  inner-membrane translocator  YP_001892338  normal  normal  0.189427  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3796  CDS  NC_010678  41560  42357  798  ABC transporter related  YP_001892339  normal  0.477228  normal  0.17284  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3797  CDS  NC_010678  42354  43079  726  ABC transporter related  YP_001892340  normal  normal  0.166271  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3798  CDS  NC_010678  43153  44049  897  transcriptional regulator, LysR family  YP_001892341  normal  normal  0.244352  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3799  CDS  NC_010678  44225  45223  999  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  YP_001892342  normal  normal  0.0978462  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3800  CDS  NC_010678  45319  45636  318  YCII-related  YP_001892343  normal  normal  0.0541652  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3801  CDS  NC_010678  45689  47083  1395  Chloride channel core  YP_001892344  normal  normal  0.101597  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3802  CDS  NC_010678  47353  49581  2229  TonB-dependent siderophore receptor  YP_001892345  normal  0.799699  normal  0.136718  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3803  CDS  NC_010678  49630  50316  687  putative hydroxylase  YP_001892346  normal  normal  0.327184  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3804  CDS  NC_010678  50377  50523  147  hypothetical protein  YP_001892347  normal  normal  0.222147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3805  CDS  NC_010678  50648  53176  2529  Pyruvate, water dikinase  YP_001892348  normal  normal  0.294309  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3806  CDS  NC_010678  53176  53805  630  transcriptional regulator, TetR family  YP_001892349  normal  normal  0.238661  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3807  CDS  NC_010678  53925  54878  954  proline iminopeptidase  YP_001892350  normal  normal  0.180049  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3808  CDS  NC_010678  54933  57359  2427  multi-sensor hybrid histidine kinase  YP_001892351  normal  0.0284545  normal  0.136228  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3809  CDS  NC_010678  57801  58388  588  Fimbrial protein  YP_001892352  decreased coverage  0.00136767  normal  0.0813635  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3810  CDS  NC_010678  58473  59216  744  Pili assembly chaperone, N-terminal  YP_001892353  normal  0.0391987  normal  0.124157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3811  CDS  NC_010678  59300  61927  2628  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  YP_001892354  normal  0.647139  normal  0.153634  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3812    NC_010678  62518  63093  576      normal  0.393149  normal  0.329762  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3813    NC_010678  63341  63622  282      normal  normal  0.329762  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3814  CDS  NC_010678  63686  63982  297  transposase IS3/IS911 family protein  YP_001892355  normal  normal  0.339406  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3815  CDS  NC_010678  63979  64872  894  Integrase catalytic region  YP_001892356  normal  normal  0.382453  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3816  CDS  NC_010678  64884  65552  669  Fimbrial protein  YP_001892357  normal  normal  0.351886  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3817  CDS  NC_010678  66041  66868  828  Beta-lactamase  YP_001892358  normal  normal  0.485737  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3818  CDS  NC_010678  66878  67603  726  transcriptional regulator, ArsR family  YP_001892359  normal  normal  0.389627  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3819  CDS  NC_010678  67725  69101  1377  major facilitator superfamily MFS_1  YP_001892360  normal  normal  0.247868  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3820  CDS  NC_010678  69918  70097  180  hypothetical protein  YP_001892361  normal  0.0432882  normal  0.337677  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3821  CDS  NC_010678  70097  71605  1509  Na+/solute symporter  YP_001892362  normal  0.154963  normal  0.247868  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3822  CDS  NC_010678  71890  72288  399  hypothetical protein  YP_001892363  normal  0.0612941  normal  0.263563  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3823  CDS  NC_010678  72406  72690  285  hypothetical protein  YP_001892364  normal  0.212047  normal  0.325504  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3824  CDS  NC_010678  72842  73264  423  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001892365  normal  0.114693  normal  0.354709  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3825  CDS  NC_010678  73316  74386  1071  arsenical-resistance protein  YP_001892366  normal  0.941857  normal  0.301769  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3826  CDS  NC_010678  74460  74963  504  protein tyrosine phosphatase  YP_001892367  normal  normal  0.248837  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3827  CDS  NC_010678  74974  75456  483  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001892368  normal  normal  0.445011  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3828  CDS  NC_010678  75468  75722  255  putative transcriptional regulator, ArsR family  YP_001892369  normal  normal  0.423099  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3829  CDS  NC_010678  76071  76991  921  recombination associated protein  YP_001892370  normal  normal  0.634835  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3830  CDS  NC_010678  77049  77726  678  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  YP_001892371  normal  normal  0.777067  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3831  CDS  NC_010678  77993  80371  2379  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  YP_001892372  normal  0.436537  normal  0.67524  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3832  CDS  NC_010678  80373  81155  783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001892373  normal  0.919217  normal  0.496442  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3833  CDS  NC_010678  81152  81736  585  transcriptional regulator, MarR family  YP_001892374  normal  normal  0.489969  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3834  CDS  NC_010678  81754  82614  861  enoyl-CoA hydratase  YP_001892375  normal  normal  0.532762  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3835  CDS  NC_010678  82616  83791  1176  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  YP_001892376  normal  normal  0.588687  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3836  CDS  NC_010678  83828  85444  1617  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_001892377  normal  normal  0.464293  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3837  CDS  NC_010678  85441  85872  432  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  YP_001892378  normal  0.368607  normal  0.488766  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3838  CDS  NC_010678  85886  86278  393  Endoribonuclease L-PSP  YP_001892379  normal  normal  0.481327  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3839  CDS  NC_010678  86584  87660  1077  transcriptional regulator, AraC family  YP_001892380  normal  0.565712  normal  0.744721  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3840  CDS  NC_010678  87800  88195  396  Carboxymuconolactone decarboxylase  YP_001892381  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3841  CDS  NC_010678  88231  89280  1050  protein of unknown function DUF849  YP_001892382  normal  0.839397  normal  0.890512  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3842  CDS  NC_010678  89396  90217  822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001892383  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3843  CDS  NC_010678  90335  91618  1284  major facilitator superfamily MFS_1  YP_001892384  normal  0.558641  normal  0.945308  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3844  CDS  NC_010678  92176  93480  1305  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  YP_001892385  normal  0.147783  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3845  CDS  NC_010678  93664  94884  1221  major facilitator superfamily MFS_1  YP_001892386  normal  0.0254807  normal  0.837631  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3846  CDS  NC_010678  94984  95820  837  transcriptional regulator, GntR family  YP_001892387  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3847  CDS  NC_010678  95985  96536  552  transcriptional regulator, HxlR family  YP_001892388  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3848  CDS  NC_010678  96670  97248  579  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001892389  hitchhiker  0.0000121275  normal  0.760581  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3849  CDS  NC_010678  97487  97921  435  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001892390  hitchhiker  0.00552747  normal  0.89966  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3850  CDS  NC_010678  97972  98844  873  transcriptional regulator, LysR family  YP_001892391  normal  0.0588074  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3851  CDS  NC_010678  98945  99730  786  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  YP_001892392  normal  0.133197  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3852  CDS  NC_010678  99735  101033  1299  major facilitator superfamily MFS_1  YP_001892393  normal  0.133619  normal  0.862924  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3853  CDS  NC_010678  101195  101836  642  transcriptional regulator, TetR family  YP_001892394  normal  0.26442  normal  0.765649  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3854  CDS  NC_010678  101968  102939  972  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  YP_001892395  normal  0.484851  normal  0.657971  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3855  CDS  NC_010678  102952  104025  1074  protein of unknown function DUF58  YP_001892396  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3856  CDS  NC_010678  104022  106046  2025  transglutaminase domain protein  YP_001892397  normal  normal  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3857  CDS  NC_010678  106559  107629  1071  putative lipoprotein  YP_001892398  normal  normal  0.511282  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3858  CDS  NC_010678  107724  108911  1188  AcnD-accessory protein PrpF  YP_001892399  normal  normal  0.502527  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3859  CDS  NC_010678  108908  111505  2598  aconitate hydratase  YP_001892400  normal  normal  0.30249  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3860  CDS  NC_010678  111821  112990  1170  methylcitrate synthase  YP_001892401  normal  normal  0.521585  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 12    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>