2475 genes were found for organism Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 25    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Teth514_0001  CDS  NC_010320  195  1526  1332  chromosomal replication initiation protein  YP_001661661  hitchhiker  0.00172749  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0002  CDS  NC_010320  1762  2874  1113  DNA polymerase III subunit beta  YP_001661662  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0003  CDS  NC_010320  2895  3101  207  RNA-binding S4 domain-containing protein  YP_001661663  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0004  CDS  NC_010320  3112  4200  1089  recombination protein F  YP_001661664  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0005  CDS  NC_010320  4212  4469  258  hypothetical protein  YP_001661665  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0006  CDS  NC_010320  4482  6740  2259  Alpha-glucosidase  YP_001661666  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0007  CDS  NC_010320  6758  7489  732  glutamine amidotransferase  YP_001661667  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0008  CDS  NC_010320  7501  8841  1341  hypothetical protein  YP_001661668  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0009  CDS  NC_010320  9195  11096  1902  DNA gyrase subunit B  YP_001661669  decreased coverage  0.0000695632  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0010  CDS  NC_010320  11111  13534  2424  DNA gyrase, A subunit  YP_001661670  normal  0.0200618  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0011  CDS  NC_010320  13560  14573  1014  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  YP_001661671  normal  0.0271468  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0012  CDS  NC_010320  15127  15630  504  acetolactate synthase, small subunit  YP_001661672  normal  0.046385  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0013  CDS  NC_010320  15630  16625  996  ketol-acid reductoisomerase  YP_001661673  normal  0.86609  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0014  CDS  NC_010320  16644  17840  1197  pyruvate carboxyltransferase  YP_001661674  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0015  CDS  NC_010320  17831  19087  1257  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  YP_001661675  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0016  CDS  NC_010320  19087  19569  483  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  YP_001661676  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0017  CDS  NC_010320  19572  20639  1068  3-isopropylmalate dehydrogenase  YP_001661677  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0018  CDS  NC_010320  20636  22315  1680  dihydroxy-acid dehydratase  YP_001661678  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0019  CDS  NC_010320  22312  23976  1665  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  YP_001661679  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0020  CDS  NC_010320  24174  25256  1083  riboflavin biosynthesis protein RibD  YP_001661680  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0021  CDS  NC_010320  25267  25890  624  riboflavin synthase, alpha subunit  YP_001661681  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0022  CDS  NC_010320  25928  27118  1191  GTP cyclohydrolase II  YP_001661682  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0023  CDS  NC_010320  27196  27660  465  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  YP_001661683  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0024  CDS  NC_010320  27679  28746  1068  hypothetical protein  YP_001661684  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0025  CDS  NC_010320  28894  30276  1383  IS605 family transposase OrfB  YP_001661685  normal  0.0400359  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0026  CDS  NC_010320  30587  30757  171  hypothetical protein  YP_001661686  hitchhiker  0.0000812517  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0027  CDS  NC_010320  30895  31425  531  signal peptidase I  YP_001661687  hitchhiker  0.0000806265  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0028  CDS  NC_010320  31701  32972  1272  seryl-tRNA synthetase  YP_001661688  decreased coverage  0.0000346844  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0029  CDS  NC_010320  33814  34539  726  GDSL family lipase  YP_001661689  decreased coverage  0.0000804758  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0030    NC_010320  34573  34764  192      hitchhiker  0.000139692  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0031  CDS  NC_010320  34883  35329  447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  YP_001661690  hitchhiker  0.000369042  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0032  CDS  NC_010320  35952  37850  1899  putative PAS/PAC sensor protein  YP_001661691  normal  0.0790714  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0033  CDS  NC_010320  37909  39465  1557  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  YP_001661692  normal  0.168879  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0034  CDS  NC_010320  39532  39867  336  hypothetical protein  YP_001661693  hitchhiker  0.00230988  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0035  CDS  NC_010320  39877  40476  600  recombination protein RecR  YP_001661694  hitchhiker  0.0000323966  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0036  CDS  NC_010320  40645  41049  405  CrcB protein  YP_001661695  hitchhiker  0.0000868029  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0037  CDS  NC_010320  41046  41429  384  CrcB protein  YP_001661696  hitchhiker  0.0000769905  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0038  CDS  NC_010320  41614  42657  1044  metal dependent phosphohydrolase  YP_001661697  hitchhiker  0.0000509519  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0039  CDS  NC_010320  42707  42979  273  hypothetical protein  YP_001661698  hitchhiker  0.000000513828  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0040  CDS  NC_010320  43035  43307  273  sigmaK-factor processing regulatory BofA  YP_001661699  hitchhiker  0.0000000669156  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0041  CDS  NC_010320  43388  43651  264  hypothetical protein  YP_001661700  hitchhiker  0.000000000757952  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0042  CDS  NC_010320  46874  47242  369  hypothetical protein  YP_001661701  normal  0.97869  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0043  CDS  NC_010320  49159  49377  219  hypothetical protein  YP_001661702  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0044  CDS  NC_010320  49389  50282  894  LysR family transcriptional regulator  YP_001661703  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0045  CDS  NC_010320  50478  51128  651  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  YP_001661704  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0046  CDS  NC_010320  51162  51389  228  SirA family protein  YP_001661705  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0047  CDS  NC_010320  51406  51948  543  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  YP_001661706  normal  0.607535  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0048  CDS  NC_010320  51995  53218  1224  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_001661707  normal  0.282171  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0049  CDS  NC_010320  53601  54548  948  ROK family glucokinase  YP_001661708  decreased coverage  0.00642511  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0050  CDS  NC_010320  54559  55131  573  DNA-3-methyladenine glycosylase I  YP_001661709  normal  0.184428  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0051  CDS  NC_010320  55286  55498  213  hypothetical protein  YP_001661710  normal  0.956114  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0052  CDS  NC_010320  55568  56989  1422  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  YP_001661711  normal  0.853869  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0053  CDS  NC_010320  56986  57597  612  dTMP kinase  YP_001661712  normal  0.115625  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0054  CDS  NC_010320  57610  57939  330  hypothetical protein  YP_001661713  normal  0.266654  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0055  CDS  NC_010320  57950  58390  441  hypothetical protein  YP_001661714  normal  0.449218  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0056  CDS  NC_010320  58399  59373  975  DNA polymerase III, delta prime subunit  YP_001661715  normal  0.907797  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0057  CDS  NC_010320  59376  60257  882  PSP1 domain-containing protein  YP_001661716  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0058  CDS  NC_010320  60509  61732  1224  arginine deiminase  YP_001661717  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0059  CDS  NC_010320  61873  62619  747  methyltransferase small  YP_001661718  normal  0.0440874  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0060  CDS  NC_010320  62622  63443  822  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  YP_001661719  hitchhiker  0.000025326  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0061    NC_010320  63569  64449  881      hitchhiker  0.0000000101777  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0062  CDS  NC_010320  64485  64736  252  AbrB family transcriptional regulator  YP_001661720  unclonable  0.0000000000163043  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0063  CDS  NC_010320  64914  65498  585  nucleoside recognition domain-containing protein  YP_001661721  unclonable  0.0000000000780152  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0064  CDS  NC_010320  65504  66025  522  nucleoside recognition domain-containing protein  YP_001661722  unclonable  0.0000000000655497  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0065  CDS  NC_010320  66106  67509  1404  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  YP_001661723  unclonable  0.00000000449224  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0066  CDS  NC_010320  67845  69743  1899  methionyl-tRNA synthetase  YP_001661724  unclonable  0.0000000521971  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0067  CDS  NC_010320  69756  70523  768  TatD family hydrolase  YP_001661725  hitchhiker  0.000000334455  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0068  CDS  NC_010320  70709  71740  1032  3D domain-containing protein  YP_001661726  hitchhiker  0.00000143922  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0069  CDS  NC_010320  71777  72598  822  dimethyladenosine transferase  YP_001661727  hitchhiker  0.000000661842  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0070  CDS  NC_010320  72668  73726  1059  hypothetical protein  YP_001661728  normal  0.0428116  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0071  CDS  NC_010320  73766  74002  237  hypothetical protein  YP_001661729  normal  0.304334  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0072  CDS  NC_010320  74138  74725  588  hypothetical protein  YP_001661730  normal  0.656192  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0073  CDS  NC_010320  74898  75890  993  hypothetical protein  YP_001661731  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0074  CDS  NC_010320  75887  76543  657  putative RNA polymerase sigma factor SigI  YP_001661732  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0075  CDS  NC_010320  76604  77716  1113  hypothetical protein  YP_001661733  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0076  CDS  NC_010320  77740  78096  357  hypothetical protein  YP_001661734  normal  0.392933  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0077  CDS  NC_010320  78237  78755  519  hypothetical protein  YP_001661735  normal  0.112528  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0078  CDS  NC_010320  78756  80228  1473  microtubule-severing ATPase  YP_001661736  decreased coverage  0.000000378681  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0079  CDS  NC_010320  80677  82008  1332  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  YP_001661737  hitchhiker  0.0000481582  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0080  CDS  NC_010320  82024  83031  1008  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  YP_001661738  normal  0.0300271  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0081  CDS  NC_010320  83032  83613  582  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  YP_001661739  normal  0.0628211  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0082  CDS  NC_010320  83636  84286  651  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  YP_001661740  normal  0.0420224  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0083  CDS  NC_010320  84261  84833  573  electron transport complex, RnfABCDGE type, A subunit  YP_001661741  normal  0.0166056  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0084  CDS  NC_010320  84845  85660  816  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  YP_001661742  normal  0.0376016  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0085  CDS  NC_010320  85739  86161  423  hypothetical protein  YP_001661743  hitchhiker  0.00288906  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0086  CDS  NC_010320  86194  86304  111  hypothetical protein  YP_001661744  hitchhiker  0.000165807  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0087  CDS  NC_010320  86413  86763  351  response regulator receiver protein  YP_001661745  hitchhiker  0.000301897  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0088  CDS  NC_010320  86888  87739  852  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  YP_001661746  hitchhiker  0.000126307  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0089  CDS  NC_010320  88046  89572  1527  transcription termination factor Rho  YP_001661747  decreased coverage  0.000000346786  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0090  CDS  NC_010320  89635  89844  210  50S ribosomal protein L31  YP_001661748  hitchhiker  0.0000000141122  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0091  CDS  NC_010320  89913  90494  582  thymidine kinase  YP_001661749  hitchhiker  0.00000469146  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0092  CDS  NC_010320  90510  91436  927  hypothetical protein  YP_001661750  normal  0.0158548  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0093  CDS  NC_010320  91423  92262  840  HemK family modification methylase  YP_001661751  normal  0.165478  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0094  CDS  NC_010320  92311  93381  1071  peptide chain release factor 1  YP_001661752  normal  0.494548  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0095  CDS  NC_010320  93713  94432  720  zinc/iron permease  YP_001661753  normal  0.983105  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0096  CDS  NC_010320  94460  95524  1065  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  YP_001661754  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0097  CDS  NC_010320  95521  95982  462  protein tyrosine phosphatase  YP_001661755  normal  0.858615  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0098  CDS  NC_010320  95979  96425  447  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  YP_001661756  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0099  CDS  NC_010320  96475  97107  633  uracil phosphoribosyltransferase  YP_001661757  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0100  CDS  NC_010320  97125  97574  450  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  YP_001661758  normal  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 25    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>