68 genes were found for organism Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Sbal195_4525  CDS  NC_009998  2  535  -  534  hypothetical protein  YP_001556942  normal  0.575928  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4526  CDS  NC_009998  573  3386  -  2814  TraG domain-containing protein  YP_001556943  normal  1  normal  0.769424  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4527  CDS  NC_009998  3389  4777  -  1389  TraH family protein  YP_001556944  normal  0.40492  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4528  CDS  NC_009998  4950  5387  -  438  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  YP_001556945  normal  0.372665  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4529  CDS  NC_009998  5401  6276  -  876  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  YP_001556946  normal  0.92832  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4530  CDS  NC_009998  6273  8090  -  1818  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  YP_001556947  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4531  CDS  NC_009998  8087  8827  -  741  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  YP_001556948  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4532  CDS  NC_009998  8850  9863  -  1014  TraU family protein  YP_001556949  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4533  CDS  NC_009998  9850  10554  -  705  type-F conjugative transfer system protein TraW  YP_001556950  normal  1  normal  0.8295  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4534  CDS  NC_009998  10551  10922  -  372  pilus assembly protein  YP_001556951  normal  1  normal  0.783095  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4535  CDS  NC_009998  10924  13512  -  2589  type-IV secretion system protein TraC  YP_001556952  normal  1  normal  0.862751  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4536  CDS  NC_009998  13516  13959  -  444  type IV conjugative transfer system protein TraV  YP_001556953  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4537  CDS  NC_009998  13992  15518  -  1527  TraB pilus assembly family protein  YP_001556954  normal  0.749618  normal  0.479712  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4538  CDS  NC_009998  15515  16333  -  819  type-F conjugative transfer system secretin TraK  YP_001556955  normal  0.30335  normal  0.434856  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4539  CDS  NC_009998  16333  16899  -  567  type IV conjugative transfer system protein TraE  YP_001556956  normal  0.369103  normal  0.416907  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4540  CDS  NC_009998  16940  17242  -  303  type IV conjugative transfer system protein TraL  YP_001556957  normal  0.370941  normal  0.572808  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4541  CDS  NC_009998  17246  17620  -  375  hypothetical protein  YP_001556958  normal  0.443974  normal  0.601472  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4542  CDS  NC_009998  17974  18231  -  258  hypothetical protein  YP_001556959  normal  0.532824  normal  0.849913  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4543  CDS  NC_009998  18351  18533  +  183  hypothetical protein  YP_001556960  normal  0.558972  normal  0.854163  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4544  CDS  NC_009998  18980  19711  +  732  hypothetical protein  YP_001556961  normal  0.120137  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4545  CDS  NC_009998  20373  20603  -  231  hypothetical protein  YP_001556962  normal  0.307653  normal  0.630491  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4546  CDS  NC_009998  20769  21968  +  1200  cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_001556963  normal  0.931063  normal  0.514808  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4547  CDS  NC_009998  21968  23065  +  1098  ParB family protein  YP_001556964  normal  1  normal  0.471951  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4548  CDS  NC_009998  23216  23785  +  570  hypothetical protein  YP_001556965  normal  1  normal  0.608133  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4549  CDS  NC_009998  23925  24443  +  519  hypothetical protein  YP_001556966  normal  1  normal  0.86404  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4550  CDS  NC_009998  24589  27561  +  2973  hypothetical protein  YP_001556967  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4551  CDS  NC_009998  28591  30594  +  2004  hypothetical protein  YP_001556968  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4552  CDS  NC_009998  30672  30869  +  198  hypothetical protein  YP_001556969  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4553  CDS  NC_009998  30895  31527  +  633  hypothetical protein  YP_001556970  normal  1  normal  0.86686  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4554  CDS  NC_009998  31785  32036  +  252  hypothetical protein  YP_001556971  normal  1  normal  0.787417  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4555  CDS  NC_009998  32080  32961  -  882  Sel1 domain-containing protein  YP_001556972  normal  0.809469  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4556  CDS  NC_009998  32985  36071  -  3087  transposase Tn3 family protein  YP_001556973  normal  1  normal  0.875652  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4557  CDS  NC_009998  36394  37335  +  942  integrase catalytic region  YP_001556974  normal  1  normal  0.839821  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4558    NC_009998  37332  37487  -  156      normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4559  CDS  NC_009998  37487  37747  -  261  prevent-host-death family protein  YP_001556975  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4560  CDS  NC_009998  37917  38495  +  579  resolvase domain-containing protein  YP_001556976  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4561  CDS  NC_009998  38496  39992  +  1497  hypothetical protein  YP_001556977  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4562  CDS  NC_009998  40641  41270  -  630  resolvase domain-containing protein  YP_001556978  normal  0.338072  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4563  CDS  NC_009998  41871  42920  +  1050  beta-lactamase domain-containing protein  YP_001556979  normal  0.079471  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4564  CDS  NC_009998  42917  44302  +  1386  hypothetical protein  YP_001556980  decreased coverage  0.000805754  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4565  CDS  NC_009998  44292  44861  +  570  hypothetical protein  YP_001556981  decreased coverage  0.000136359  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4566  CDS  NC_009998  44851  48030  +  3180  ATPase involved in DNA repair  YP_001556982  normal  0.134908  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4567  CDS  NC_009998  48649  49404  +  756  hypothetical protein  YP_001556983  normal  0.675979  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4568  CDS  NC_009998  49474  50811  +  1338  hypothetical protein  YP_001556984  normal  0.265634  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4569  CDS  NC_009998  51355  51789  +  435  peptidase S24/S26 domain-containing protein  YP_001556985  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4570  CDS  NC_009998  51777  53033  +  1257  DNA-repair protein  YP_001556986  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4571  CDS  NC_009998  53327  53992  +  666  integrase family protein  YP_001556987  normal  0.624666  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4572  CDS  NC_009998  54326  54562  +  237  hypothetical protein  YP_001556988  normal  0.0290093  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4573  CDS  NC_009998  54525  54785  +  261  hypothetical protein  YP_001556989  normal  0.0307111  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4574  CDS  NC_009998  54797  55162  +  366  hypothetical protein  YP_001556990  normal  0.0107827  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4575  CDS  NC_009998  55203  55583  +  381  hypothetical protein  YP_001556991  hitchhiker  0.00231058  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4576  CDS  NC_009998  55845  56429  +  585  hypothetical protein  YP_001556992  hitchhiker  0.00000292288  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4577  CDS  NC_009998  57348  58079  +  732  deoxyribonuclease I  YP_001556993  unclonable  3.5492500000000006e-18  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4578  CDS  NC_009998  58094  58327  +  234  hypothetical protein  YP_001556994  hitchhiker  0.0000000113631  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4579  CDS  NC_009998  58720  60594  +  1875  nuclease  YP_001556995  normal  0.0158793  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4580  CDS  NC_009998  60719  61174  +  456  hypothetical protein  YP_001556996  normal  0.0417201  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4581  CDS  NC_009998  61176  61664  +  489  hypothetical protein  YP_001556997  normal  0.271113  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4582  CDS  NC_009998  61719  61916  +  198  hypothetical protein  YP_001556998  normal  0.253889  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4583  CDS  NC_009998  62281  63210  +  930  hypothetical protein  YP_001556999  normal  0.831979  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4584  CDS  NC_009998  63212  63613  +  402  hypothetical protein  YP_001557000  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4585  CDS  NC_009998  63806  64051  +  246  HicA protein  YP_001557001  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4586  CDS  NC_009998  64048  64386  +  339  HicB family protein  YP_001557002  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4587  CDS  NC_009998  64675  65979  +  1305  hypothetical protein  YP_001557003  normal  0.37704  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4588  CDS  NC_009998  66028  66327  +  300  hypothetical protein  YP_001557004  normal  0.527517  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4589  CDS  NC_009998  66307  66453  -  147  hypothetical protein  YP_001557005  normal  0.73461  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4590  CDS  NC_009998  66886  67245  +  360  hypothetical protein  YP_001557006  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4591  CDS  NC_009998  67266  73226  -  5961  conjugative transfer relaxase protein TraI  YP_001557007  normal  1  normal  0.836035  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal195_4592  CDS  NC_009998  73478  75604  -  2127  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  YP_001557008  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS195  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>