6153 genes were found for organism Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 62    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Daci_0001  CDS  NC_010002  16  1422  +  1407  chromosomal replication initiation protein  YP_001561033  normal  0.0688864  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0002  CDS  NC_010002  1544  2662  +  1119  DNA polymerase III, beta subunit  YP_001561034  decreased coverage  0.00413752  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0003  CDS  NC_010002  2865  5444  +  2580  DNA gyrase, B subunit  YP_001561035  normal  0.202279  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0004  CDS  NC_010002  5770  6699  -  930  LysR family transcriptional regulator  YP_001561036  normal  0.357807  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0005  CDS  NC_010002  6915  7727  +  813  hypothetical protein  YP_001561037  normal  0.76896  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0006  CDS  NC_010002  7781  8029  +  249  hypothetical protein  YP_001561038  normal  0.896952  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0007  CDS  NC_010002  8040  9437  +  1398  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  YP_001561039  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0008  CDS  NC_010002  9434  10345  +  912  allophanate hydrolase subunit 1  YP_001561040  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0009  CDS  NC_010002  10335  11312  +  978  urea amidolyase related protein  YP_001561041  normal  0.871318  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0010  CDS  NC_010002  11432  12595  -  1164  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  YP_001561042  normal  0.743075  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0011  CDS  NC_010002  12690  13610  -  921  LysR family transcriptional regulator  YP_001561043  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0012  CDS  NC_010002  13737  14708  +  972  hypothetical protein  YP_001561044  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0013  CDS  NC_010002  14720  15184  +  465  dehydratase  YP_001561045  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0014  CDS  NC_010002  15195  15713  +  519  hypothetical protein  YP_001561046  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0015  CDS  NC_010002  15884  17290  -  1407  histidine kinase  YP_001561047  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0016  CDS  NC_010002  17295  18083  -  789  two component transcriptional regulator  YP_001561048  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0017  CDS  NC_010002  18230  19651  -  1422  outer membrane efflux protein  YP_001561049  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0018  CDS  NC_010002  19638  22742  -  3105  CzcA family heavy metal efflux protein  YP_001561050  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0019  CDS  NC_010002  22764  23912  -  1149  RND family efflux transporter MFP subunit  YP_001561051  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0020  CDS  NC_010002  24333  24644  +  312  hypothetical protein  YP_001561052  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0021  CDS  NC_010002  24810  26888  +  2079  ATP-dependent DNA helicase DinG  YP_001561053  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0022  CDS  NC_010002  28449  29111  -  663  hypothetical protein  YP_001561054  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0023  CDS  NC_010002  29287  29841  -  555  hypothetical protein  YP_001561055  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0024  CDS  NC_010002  30152  31207  +  1056  recombination associated protein  YP_001561056  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0025  CDS  NC_010002  31268  32455  -  1188  beta-ketothiolase  YP_001561057  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0026  CDS  NC_010002  32555  33343  -  789  enoyl-CoA hydratase/isomerase  YP_001561058  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0027  CDS  NC_010002  33353  35188  -  1836  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_001561059  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0028  CDS  NC_010002  35334  36152  -  819  ABC transporter related  YP_001561060  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0029  CDS  NC_010002  36178  37359  -  1182  extracellular ligand-binding receptor  YP_001561061  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0030  CDS  NC_010002  37397  38434  -  1038  inner-membrane translocator  YP_001561062  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0031  CDS  NC_010002  38457  39338  -  882  inner-membrane translocator  YP_001561063  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0032  CDS  NC_010002  39335  40219  -  885  ABC transporter related  YP_001561064  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0033  CDS  NC_010002  40350  41120  +  771  TetR family transcriptional regulator  YP_001561065  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0034  CDS  NC_010002  41147  41581  -  435  MerR family transcriptional regulator  YP_001561066  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0035  CDS  NC_010002  41626  41820  -  195  heavy metal transport/detoxification protein  YP_001561067  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0036  CDS  NC_010002  42121  43824  +  1704  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_001561068  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0037  CDS  NC_010002  43930  45048  -  1119  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  YP_001561069  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0038  CDS  NC_010002  45130  45711  -  582  NADPH-dependent FMN reductase  YP_001561070  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0039  CDS  NC_010002  45716  46690  -  975  hypothetical protein  YP_001561071  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0040  CDS  NC_010002  46791  47342  -  552  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001561072  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0041  CDS  NC_010002  47355  47741  -  387  NIPSNAP family protein  YP_001561073  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0042  CDS  NC_010002  47755  48510  -  756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001561074  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0043  CDS  NC_010002  48625  49398  +  774  IclR family transcriptional regulator  YP_001561075  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0044  CDS  NC_010002  49470  50120  -  651  glutathione S-transferase domain-containing protein  YP_001561076  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0045  CDS  NC_010002  50174  50761  -  588  NADPH-dependent FMN reductase  YP_001561077  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0046  CDS  NC_010002  51062  53041  +  1980  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  YP_001561078  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0047  CDS  NC_010002  53038  53697  +  660  16S rRNA methyltransferase GidB  YP_001561079  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0048  CDS  NC_010002  53804  54418  +  615  lysine exporter protein LysE/YggA  YP_001561080  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0049  CDS  NC_010002  54432  55202  +  771  cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_001561081  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0050  CDS  NC_010002  55374  55934  +  561  hypothetical protein  YP_001561082  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0051  CDS  NC_010002  55948  56883  +  936  parB-like partition protein  YP_001561083  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0052  CDS  NC_010002  57079  58113  +  1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  YP_001561084  normal  0.716094  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0053  CDS  NC_010002  58302  59123  +  822  methyltransferase type 12  YP_001561085  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0054  CDS  NC_010002  59137  59484  -  348  cytochrome c, class I  YP_001561086  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0055  CDS  NC_010002  59571  60824  -  1254  oxidoreductase molybdopterin binding  YP_001561087  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0056  CDS  NC_010002  60896  61483  -  588  hypothetical protein  YP_001561088  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0057  CDS  NC_010002  61480  62070  -  591  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  YP_001561089  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0058  CDS  NC_010002  62127  63056  -  930  AraC family transcriptional regulator  YP_001561090  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0059  CDS  NC_010002  63263  64516  +  1254  major facilitator transporter  YP_001561091  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0060  CDS  NC_010002  64674  65963  +  1290  glutamate carboxypeptidase  YP_001561092  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0061  CDS  NC_010002  66152  67153  -  1002  hypothetical protein  YP_001561093  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0062  CDS  NC_010002  67225  68433  -  1209  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  YP_001561094  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0063  CDS  NC_010002  68563  69468  +  906  LysR family transcriptional regulator  YP_001561095  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0064  CDS  NC_010002  69458  70882  -  1425  FAD linked oxidase domain-containing protein  YP_001561096  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0065  CDS  NC_010002  70965  71333  -  369  signal transduction protein  YP_001561097  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0066  CDS  NC_010002  71515  72087  +  573  ATP--cobalamin adenosyltransferase  YP_001561098  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0067  CDS  NC_010002  72141  73046  +  906  LysR family transcriptional regulator  YP_001561099  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0068  CDS  NC_010002  73214  74146  +  933  hypothetical protein  YP_001561100  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0069  CDS  NC_010002  74836  76071  -  1236  D-amino-acid dehydrogenase  YP_001561101  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0070  CDS  NC_010002  76294  77175  +  882  extracellular solute-binding protein  YP_001561102  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0071  CDS  NC_010002  77190  77951  +  762  aspartate racemase  YP_001561103  normal  0.937931  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0072  CDS  NC_010002  77945  79264  -  1320  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  YP_001561104  normal  0.860838  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0073  CDS  NC_010002  79291  80718  -  1428  benzoyl-CoA oxygenase component B  YP_001561105  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0074  CDS  NC_010002  80757  82427  -  1671  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  YP_001561106  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0075  CDS  NC_010002  82621  83535  -  915  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  YP_001561107  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0076  CDS  NC_010002  83710  85266  +  1557  benzoate-CoA ligase family  YP_001561108  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0077  CDS  NC_010002  85325  86488  +  1164  extracellular ligand-binding receptor  YP_001561109  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0078  CDS  NC_010002  86539  87411  +  873  inner-membrane translocator  YP_001561110  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0079  CDS  NC_010002  87415  88500  +  1086  inner-membrane translocator  YP_001561111  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0080  CDS  NC_010002  88493  89251  +  759  ABC transporter related  YP_001561112  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0081  CDS  NC_010002  89244  89957  +  714  ABC transporter related  YP_001561113  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0082  CDS  NC_010002  89990  90835  -  846  hypothetical protein  YP_001561114  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0083  CDS  NC_010002  90832  91446  -  615  hypothetical protein  YP_001561115  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0084  CDS  NC_010002  91554  92027  -  474  thioesterase superfamily protein  YP_001561116  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0085  CDS  NC_010002  92166  93680  -  1515  succinate CoA transferase  YP_001561117  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0086  CDS  NC_010002  93888  95195  -  1308  uracil-xanthine permease  YP_001561118  normal  0.587016  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0087  CDS  NC_010002  95340  97454  +  2115  acetoacetyl-CoA synthetase  YP_001561119  normal  0.387097  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0088  CDS  NC_010002  97543  98700  +  1158  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  YP_001561120  normal  0.745656  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0089  CDS  NC_010002  98869  99897  +  1029  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  YP_001561121  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0090  CDS  NC_010002  99921  100709  +  789  enoyl-CoA hydratase  YP_001561122  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0091  CDS  NC_010002  100809  101624  +  816  septum site-determining protein MinC  YP_001561123  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0092  CDS  NC_010002  101674  102486  +  813  septum site-determining protein MinD  YP_001561124  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0093  CDS  NC_010002  102493  102756  +  264  cell division topological specificity factor MinE  YP_001561125  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0094  CDS  NC_010002  102986  104047  -  1062  amino acid permease-associated region  YP_001561126  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0095    NC_010002  104029  104391  -  363      normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0096  CDS  NC_010002  104602  105105  -  504  flavin reductase domain-containing protein  YP_001561127  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0097  CDS  NC_010002  105296  105931  -  636  DNA polymerase III, epsilon subunit  YP_001561128  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0098  CDS  NC_010002  105976  106476  -  501  MarR family transcriptional regulator  YP_001561129  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0099  CDS  NC_010002  106551  107372  -  822  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  YP_001561130  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_0100  CDS  NC_010002  107391  108845  -  1455  succinic semialdehyde dehydrogenase  YP_001561131  normal  1  normal  1  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 62    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>