990 genes were found for organism Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 10    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BamMC406_5516  CDS  NC_010557  39  851  +  813  TetR family transcriptional regulator  YP_001815513  normal  0.165925  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5517  CDS  NC_010557  909  1763  +  855  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  YP_001815514  normal  0.480424  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5518  CDS  NC_010557  1744  4566  +  2823  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  YP_001815515  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5519  CDS  NC_010557  4595  5872  +  1278  major facilitator transporter  YP_001815516  normal  0.524338  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5520  CDS  NC_010557  5945  6724  -  780  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001815517  normal  0.890921  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5521  CDS  NC_010557  6875  10396  -  3522  pyruvate carboxylase  YP_001815518  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5522    NC_010557  10628  10774  -  147      normal  0.724941  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5523  CDS  NC_010557  11683  13338  +  1656  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_001815519  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5524  CDS  NC_010557  13335  14222  +  888  hypothetical protein  YP_001815520  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5525  CDS  NC_010557  14222  15328  +  1107  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  YP_001815521  normal  0.757548  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5526  CDS  NC_010557  15325  16323  +  999  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  YP_001815522  normal  0.386832  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5527  CDS  NC_010557  16329  17225  +  897  beta-lactamase domain-containing protein  YP_001815523  normal  0.453026  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5528  CDS  NC_010557  17315  21133  +  3819  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_001815524  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5529  CDS  NC_010557  21145  23283  +  2139  hypothetical protein  YP_001815525  normal  0.396327  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5530  CDS  NC_010557  23463  24317  -  855  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  YP_001815526  normal  0.335528  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5531  CDS  NC_010557  24356  25549  -  1194  beta-ketothiolase  YP_001815527  normal  0.649531  normal  0.870894  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5532  CDS  NC_010557  25597  27270  -  1674  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  YP_001815528  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5533  CDS  NC_010557  27305  29095  -  1791  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  YP_001815529  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5534  CDS  NC_010557  29590  30507  -  918  LysR family transcriptional regulator  YP_001815530  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5535  CDS  NC_010557  30647  31411  +  765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001815531  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5536  CDS  NC_010557  31486  32193  +  708  pirin domain-containing protein  YP_001815532  normal  0.379569  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5537  CDS  NC_010557  32271  32867  -  597  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  YP_001815533  normal  0.115181  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5538  CDS  NC_010557  32895  33662  -  768  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001815534  decreased coverage  0.00687705  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5539  CDS  NC_010557  33676  34410  -  735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001815535  normal  0.101629  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5540  CDS  NC_010557  34517  35458  +  942  LysR family transcriptional regulator  YP_001815536  normal  0.108539  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5541  CDS  NC_010557  35852  36442  +  591  putative transcriptional regulator protein  YP_001815537  normal  0.871085  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5542  CDS  NC_010557  36988  38589  +  1602  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  YP_001815538  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5543  CDS  NC_010557  38603  40015  +  1413  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  YP_001815539  normal  0.362184  normal  0.925993  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5544  CDS  NC_010557  40125  41198  +  1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_001815540  normal  1  normal  0.849034  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5545  CDS  NC_010557  41198  41371  +  174  hypothetical protein  YP_001815541  normal  1  normal  0.708628  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5546  CDS  NC_010557  41353  42474  -  1122  AraC family transcriptional regulator  YP_001815542  normal  1  normal  0.883146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5547  CDS  NC_010557  42516  44150  -  1635  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_001815543  normal  1  normal  0.730505  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5548  CDS  NC_010557  44470  45570  +  1101  AraC family transcriptional regulator  YP_001815544  normal  1  normal  0.893001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5549  CDS  NC_010557  45597  47093  -  1497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001815545  normal  0.961003  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5550  CDS  NC_010557  47090  47809  -  720  two component transcriptional regulator  YP_001815546  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5551  CDS  NC_010557  48389  48718  -  330  hypothetical protein  YP_001815547  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5552  CDS  NC_010557  48830  50278  -  1449  radical SAM domain-containing protein  YP_001815548  normal  1  normal  0.789613  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5553  CDS  NC_010557  50378  50962  -  585  hypothetical protein  YP_001815549  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5554  CDS  NC_010557  51009  51626  -  618  hypothetical protein  YP_001815550  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5555  CDS  NC_010557  51675  51863  -  189  hypothetical protein  YP_001815551  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5556  CDS  NC_010557  52243  54525  -  2283  putative sigma54 specific transcriptional regulator  YP_001815552  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5557  CDS  NC_010557  55353  56390  -  1038  LysR family transcriptional regulator  YP_001815553  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5558  CDS  NC_010557  56473  57216  -  744  NmrA family protein  YP_001815554  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5559  CDS  NC_010557  57412  58908  +  1497  transcriptional regulator  YP_001815555  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5560  CDS  NC_010557  59269  59769  +  501  OsmC family protein  YP_001815556  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5561  CDS  NC_010557  59885  61093  -  1209  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_001815557  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5562  CDS  NC_010557  61363  62364  +  1002  membrane protein-like protein  YP_001815558  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5563  CDS  NC_010557  62821  63600  +  780  acetoacetate decarboxylase  YP_001815559  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5564  CDS  NC_010557  63616  64398  +  783  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  YP_001815560  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5565  CDS  NC_010557  64409  65692  +  1284  patatin  YP_001815561  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5566  CDS  NC_010557  65827  66804  +  978  rhodanese domain-containing protein  YP_001815562  normal  0.785557  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5567  CDS  NC_010557  67009  67923  -  915  LysR family transcriptional regulator  YP_001815563  normal  0.397683  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5568  CDS  NC_010557  68093  69526  +  1434  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  YP_001815564  normal  0.262721  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5569  CDS  NC_010557  69552  70757  +  1206  amidohydrolase  YP_001815565  normal  0.544377  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5570  CDS  NC_010557  70815  70928  +  114  hypothetical protein  YP_001815566  normal  0.922952  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5571  CDS  NC_010557  71245  71571  +  327  hypothetical protein  YP_001815567  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5572  CDS  NC_010557  71962  72387  -  426  hypothetical protein  YP_001815568  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5573  CDS  NC_010557  72992  74545  -  1554  EmrB/QacA family drug resistance transporter  YP_001815569  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5574  CDS  NC_010557  74542  75984  -  1443  secretion protein HlyD family protein  YP_001815570  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5575  CDS  NC_010557  76019  78127  -  2109  RND efflux system outer membrane lipoprotein  YP_001815571  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5576  CDS  NC_010557  78596  79096  +  501  OsmC family protein  YP_001815572  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5577  CDS  NC_010557  79292  79771  +  480  alkylhydroperoxidase  YP_001815573  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5578  CDS  NC_010557  79776  80180  +  405  cupin 2 domain-containing protein  YP_001815574  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5579  CDS  NC_010557  80761  81336  +  576  glutathione-dependent formaldehyde-activating enzyme  YP_001815575  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5580  CDS  NC_010557  81531  81866  -  336  hypothetical protein  YP_001815576  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5581  CDS  NC_010557  82241  82444  +  204  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_001815577  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5582  CDS  NC_010557  82684  82839  +  156  hypothetical protein  YP_001815578  normal  0.989122  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5583  CDS  NC_010557  83176  83460  +  285  hypothetical protein  YP_001815579  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5584  CDS  NC_010557  83477  83716  +  240  hypothetical protein  YP_001815580  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5585  CDS  NC_010557  83750  83962  +  213  30S ribosomal protein S21  YP_001815581  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5586  CDS  NC_010557  83972  84178  +  207  hypothetical protein  YP_001815582  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5587  CDS  NC_010557  84226  84567  +  342  hypothetical protein  YP_001815583  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5588  CDS  NC_010557  84625  84840  +  216  hypothetical protein  YP_001815584  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5589  CDS  NC_010557  84975  85259  +  285  hypothetical protein  YP_001815585  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5590  CDS  NC_010557  85570  86262  -  693  hypothetical protein  YP_001815586  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5591  CDS  NC_010557  86349  86795  -  447  DoxX family protein  YP_001815587  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5592  CDS  NC_010557  86797  88689  -  1893  amidohydrolase 3  YP_001815588  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5593  CDS  NC_010557  88708  88875  -  168  hypothetical protein  YP_001815589  normal  0.246716  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5594  CDS  NC_010557  89041  89727  -  687  isochorismatase hydrolase  YP_001815590  normal  0.247048  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5595  CDS  NC_010557  90034  90315  +  282  hypothetical protein  YP_001815591  normal  0.324913  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5596  CDS  NC_010557  90391  91299  +  909  LysR family transcriptional regulator  YP_001815592  normal  0.21872  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5597  CDS  NC_010557  91406  93181  -  1776  transcriptional regulator  YP_001815593  normal  0.354046  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5598  CDS  NC_010557  93546  94367  -  822  alpha/beta hydrolase fold  YP_001815594  normal  0.33887  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5599  CDS  NC_010557  94436  94861  -  426  hypothetical protein  YP_001815595  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5600  CDS  NC_010557  95264  96238  +  975  alpha/beta hydrolase fold  YP_001815596  normal  0.350573  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5601  CDS  NC_010557  96573  97853  +  1281  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  YP_001815597  normal  0.31055  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5602  CDS  NC_010557  97850  98350  +  501  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  YP_001815598  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5603  CDS  NC_010557  98350  100611  +  2262  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  YP_001815599  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5604  CDS  NC_010557  100679  101596  +  918  LysR family transcriptional regulator  YP_001815600  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5605  CDS  NC_010557  101838  103055  +  1218  major facilitator transporter  YP_001815601  normal  1  normal  0.919705  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5606  CDS  NC_010557  103224  104336  +  1113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  YP_001815602  normal  0.614361  normal  0.874995  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5607  CDS  NC_010557  104412  105083  -  672  metal-dependent phosphohydrolase  YP_001815603  normal  0.18417  normal  0.803195  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5608  CDS  NC_010557  105158  107038  -  1881  amidohydrolase 3  YP_001815604  normal  0.0446868  normal  0.586515  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5609  CDS  NC_010557  107196  110042  -  2847  transcriptional regulator  YP_001815605  normal  0.0160081  normal  0.519557  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5610  CDS  NC_010557  110433  111341  +  909  AraC family transcriptional regulator  YP_001815606  decreased coverage  0.00190409  normal  0.169642  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5611  CDS  NC_010557  111442  112383  -  942  beta-lactamase domain-containing protein  YP_001815607  normal  0.0296607  normal  0.233668  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5612  CDS  NC_010557  112617  113522  +  906  LysR family transcriptional regulator  YP_001815608  normal  0.0432905  normal  0.551599  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5613  CDS  NC_010557  113541  115016  -  1476  hypothetical protein  YP_001815609  normal  0.0706869  normal  0.469482  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5614  CDS  NC_010557  115016  115945  -  930  hypothetical protein  YP_001815610  normal  0.073434  normal  0.302344  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_5615  CDS  NC_010557  116095  116634  -  540  hypothetical protein  YP_001815611  normal  0.279853  normal  0.268886  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 10    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10    next >  last >>