298 genes were found for organism Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BamMC406_6502  CDS  NC_010553  1872  1869  hypothetical protein  YP_001812176  normal  0.571397  normal  0.732963  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6503  CDS  NC_010553  1869  3227  1359  hypothetical protein  YP_001812177  normal  0.718541  normal  0.842994  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6504  CDS  NC_010553  3224  4237  1014  hypothetical protein  YP_001812178  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6505  CDS  NC_010553  4245  4979  735  hypothetical protein  YP_001812179  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6506  CDS  NC_010553  4991  7468  2478  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  YP_001812180  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6507  CDS  NC_010553  7462  7773  312  hypothetical protein  YP_001812181  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6508  CDS  NC_010553  7766  8146  381  hypothetical protein  YP_001812182  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6509  CDS  NC_010553  8163  9293  1131  type II secretion system protein E  YP_001812183  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6510  CDS  NC_010553  9570  10775  1206  hypothetical protein  YP_001812184  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6511  CDS  NC_010553  10783  11709  927  hypothetical protein  YP_001812185  normal  0.531425  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6512  CDS  NC_010553  11804  12832  1029  ATPase  YP_001812186  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6513  CDS  NC_010553  12951  13202  252  hypothetical protein  YP_001812187  normal  0.521299  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6514  CDS  NC_010553  13459  13923  465  hypothetical protein  YP_001812188  normal  0.586089  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6515  CDS  NC_010553  13938  15458  1521  hypothetical protein  YP_001812189  normal  0.398503  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6516  CDS  NC_010553  15538  15948  411  hypothetical protein  YP_001812190  normal  0.688169  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6517  CDS  NC_010553  16036  16161  126  hypothetical protein  YP_001812191  normal  0.584789  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6518  CDS  NC_010553  16164  16637  474  hypothetical protein  YP_001812192  normal  0.534415  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6519  CDS  NC_010553  16646  17038  393  hypothetical protein  YP_001812193  normal  0.595549  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6520  CDS  NC_010553  17125  17586  462  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  YP_001812194  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6521  CDS  NC_010553  17729  18016  288  hypothetical protein  YP_001812195  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6522  CDS  NC_010553  18275  18547  273  hypothetical protein  YP_001812196  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6523  CDS  NC_010553  18634  19452  819  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  YP_001812197  normal  normal  0.87249  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6524  CDS  NC_010553  19452  20087  636  hypothetical protein  YP_001812198  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6525  CDS  NC_010553  20084  20812  729  hypothetical protein  YP_001812199  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6526  CDS  NC_010553  20824  21966  1143  hypothetical protein  YP_001812200  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6527  CDS  NC_010553  22066  22284  219  hypothetical protein  YP_001812201  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6528  CDS  NC_010553  22296  22745  450  hypothetical protein  YP_001812202  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6529  CDS  NC_010553  22827  24494  1668  parB-like partition protein  YP_001812203  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6530  CDS  NC_010553  24724  25761  1038  hypothetical protein  YP_001812204  normal  0.634262  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6531  CDS  NC_010553  25798  25902  105  hypothetical protein  YP_001812205  normal  0.241691  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6532  CDS  NC_010553  26525  26647  123  hypothetical protein  YP_001812206  normal  0.0938621  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6533  CDS  NC_010553  26669  27895  1227  hypothetical protein  YP_001812207  normal  0.350446  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6534  CDS  NC_010553  27990  28442  453  hypothetical protein  YP_001812208  normal  0.168837  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6535  CDS  NC_010553  28581  29024  444  hypothetical protein  YP_001812209  normal  0.167775  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6536  CDS  NC_010553  29143  29814  672  hypothetical protein  YP_001812210  normal  0.173953  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6537  CDS  NC_010553  30033  31175  1143  Fis family transcriptional regulator  YP_001812211  normal  0.196102  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6538  CDS  NC_010553  32337  33341  1005  hypothetical protein  YP_001812212  normal  0.21958  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6539  CDS  NC_010553  33351  33683  333  hypothetical protein  YP_001812213  normal  0.274729  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6540  CDS  NC_010553  33805  33960  156  hypothetical protein  YP_001812214  normal  0.545605  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6541  CDS  NC_010553  33957  34199  243  hypothetical protein  YP_001812215  normal  0.833261  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6542  CDS  NC_010553  34282  34503  222  hypothetical protein  YP_001812216  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6543  CDS  NC_010553  34600  35745  1146  hypothetical protein  YP_001812217  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6544  CDS  NC_010553  36148  36714  567  single-strand binding protein  YP_001812218  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6545  CDS  NC_010553  36726  37517  792  hypothetical protein  YP_001812219  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6546  CDS  NC_010553  37505  37954  450  hypothetical protein  YP_001812220  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6547  CDS  NC_010553  38074  38400  327  hypothetical protein  YP_001812221  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6548  CDS  NC_010553  38828  39523  696  NERD domain-containing protein  YP_001812222  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6549  CDS  NC_010553  39753  40190  438  hypothetical protein  YP_001812223  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6550  CDS  NC_010553  40195  41445  1251  hypothetical protein  YP_001812224  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6551  CDS  NC_010553  41497  42699  1203  hypothetical protein  YP_001812225  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6552  CDS  NC_010553  42686  42865  180  hypothetical protein  YP_001812226  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6553  CDS  NC_010553  42878  43243  366  hypothetical protein  YP_001812227  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6554  CDS  NC_010553  43416  43817  402  hypothetical protein  YP_001812228  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6555  CDS  NC_010553  44052  45065  1014  SCP-like extracellular  YP_001812229  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6556  CDS  NC_010553  45191  46513  1323  transposase IS4 family protein  YP_001812230  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6557  CDS  NC_010553  46544  47152  609  hypothetical protein  YP_001812231  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6558  CDS  NC_010553  47166  48380  1215  hypothetical protein  YP_001812232  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6559  CDS  NC_010553  48390  48983  594  hypothetical protein  YP_001812233  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6560  CDS  NC_010553  48992  50125  1134  hypothetical protein  YP_001812234  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6561  CDS  NC_010553  50122  52389  2268  type II secretion system protein E  YP_001812235  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6562  CDS  NC_010553  52386  53003  618  hypothetical protein  YP_001812236  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6563  CDS  NC_010553  52957  54288  1332  hypothetical protein  YP_001812237  normal  0.773624  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6564  CDS  NC_010553  54293  55903  1611  type II secretory pathway component PulD-like protein  YP_001812238  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6565  CDS  NC_010553  55909  56439  531  hypothetical protein  YP_001812239  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6566  CDS  NC_010553  56442  56864  423  lytic transglycosylase catalytic  YP_001812240  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6567  CDS  NC_010553  56861  58147  1287  hypothetical protein  YP_001812241  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6568  CDS  NC_010553  58144  58953  810  lytic transglycosylase catalytic  YP_001812242  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6569  CDS  NC_010553  58950  60209  1260  conjugation TrbI family protein  YP_001812243  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6570  CDS  NC_010553  60219  61100  882  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  YP_001812244  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6571  CDS  NC_010553  61097  61813  717  hypothetical protein  YP_001812245  normal  0.625526  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6572  CDS  NC_010553  62097  62645  549  hypothetical protein  YP_001812246  normal  0.174951  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6573  CDS  NC_010553  62866  63426  561  hypothetical protein  YP_001812247  normal  0.364523  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6574  CDS  NC_010553  63494  64891  1398  hypothetical protein  YP_001812248  normal  0.478836  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6575  CDS  NC_010553  65689  66897  1209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_001812249  normal  0.199192  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6576  CDS  NC_010553  66894  67868  975  parB-like partition protein  YP_001812250  normal  0.0152198  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6577  CDS  NC_010553  68348  70480  2133  integrase family protein  YP_001812251  decreased coverage  0.00328143  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6578  CDS  NC_010553  71555  71749  195  YcfA family protein  YP_001812252  hitchhiker  0.0000196737  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6579  CDS  NC_010553  71816  72229  414  hypothetical protein  YP_001812253  hitchhiker  0.000147434  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6580  CDS  NC_010553  72930  73955  1026  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_001812254  normal  0.0128065  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6581    NC_010553  74208  74303  96      normal  0.0700613  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6582  CDS  NC_010553  74303  74977  675  transposase  YP_001812255  normal  0.191311  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6583    NC_010553  74959  75150  192      normal  0.300853  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6584  CDS  NC_010553  75296  77992  2697  YadA domain-containing protein  YP_001812256  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6585    NC_010553  78279  78467  189      normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6586    NC_010553  78531  78794  264      normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6587  CDS  NC_010553  78859  80016  1158  integrase catalytic region  YP_001812257  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6588  CDS  NC_010553  80050  80940  891  integrase catalytic region  YP_001812258  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6589  CDS  NC_010553  80978  82312  1335  hypothetical protein  YP_001812259  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6590  CDS  NC_010553  82871  83692  822  hypothetical protein  YP_001812260  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6591  CDS  NC_010553  83676  84632  957  hypothetical protein  YP_001812261  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6592  CDS  NC_010553  84747  85067  321  hypothetical protein  YP_001812262  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6593  CDS  NC_010553  85207  85827  621  hypothetical protein  YP_001812263  normal  0.641986  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6594  CDS  NC_010553  86043  86930  888  transposase mutator type  YP_001812264  normal  0.771123  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6595  CDS  NC_010553  87164  88792  1629  transposase  YP_001812265  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6596  CDS  NC_010553  88801  89670  870  TniB family protein  YP_001812266  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6597  CDS  NC_010553  89648  90253  606  hypothetical protein  YP_001812267  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6598  CDS  NC_010553  90250  90396  147  transposase IS66 family  YP_001812268  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6599  CDS  NC_010553  90805  91482  678  GntR family transcriptional regulator  YP_001812269  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6600  CDS  NC_010553  91611  92408  798  extracellular solute-binding protein  YP_001812270  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_6601  CDS  NC_010553  92408  93184  777  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  YP_001812271  normal  normal  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>