7489 genes were found for organism Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 75    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Bphyt_0001  CDS  NC_010681  299  1936  1638  chromosomal replication initiation protein  YP_001893678  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0002  CDS  NC_010681  2157  3260  1104  DNA polymerase III subunit beta  YP_001893679  normal  0.243689  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0003  CDS  NC_010681  3375  5846  2472  DNA gyrase subunit B  YP_001893680  normal  0.0806649  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0004  CDS  NC_010681  5901  6305  405  PAAR repeat-containing protein  YP_001893681  normal  0.0248137  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0005    NC_010681  6309  6650  342      hitchhiker  0.00945794  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0006  CDS  NC_010681  7686  10244  2559  type VI secretion system Vgr family protein  YP_001893682  normal  0.0359048  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0007  CDS  NC_010681  10252  11259  1008  hypothetical protein  YP_001893683  decreased coverage  0.00121916  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0008  CDS  NC_010681  11305  14187  2883  hypothetical protein  YP_001893684  normal  0.0209378  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0009  CDS  NC_010681  14184  14939  756  hypothetical protein  YP_001893685  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0010  CDS  NC_010681  14958  15692  735  hypothetical protein  YP_001893686  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0011  CDS  NC_010681  15765  16016  252  PAAR repeat-containing protein  YP_001893687  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0012  CDS  NC_010681  16121  18958  2838  hypothetical protein  YP_001893688  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0013  CDS  NC_010681  18955  19692  738  hypothetical protein  YP_001893689  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0014  CDS  NC_010681  19944  21122  1179  conserved hypothetical cytosolic protein  YP_001893690  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0015  CDS  NC_010681  21119  24493  3375  conserved hypothetical cytosolic protein  YP_001893691  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0016  CDS  NC_010681  24486  25133  648  hypothetical protein  YP_001893692  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0017  CDS  NC_010681  25136  26590  1455  hypothetical protein  YP_001893693  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0018  CDS  NC_010681  26795  28150  1356  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  YP_001893694  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0019  CDS  NC_010681  28838  29782  945  transcriptional regulator, AraC family  YP_001893695  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0020  CDS  NC_010681  29985  31388  1404  ethanolamine transproter  YP_001893696  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0021  CDS  NC_010681  31432  32826  1395  Ethanolamine ammonia lyase large subunit  YP_001893697  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0022  CDS  NC_010681  32823  33620  798  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  YP_001893698  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0023  CDS  NC_010681  33626  34021  396  protein of unknown function DUF779  YP_001893699  normal  0.722181  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0024  CDS  NC_010681  34086  35606  1521  Aldehyde Dehydrogenase  YP_001893700  normal  0.548418  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0025  CDS  NC_010681  35941  36990  1050  transcriptional regulator, AraC family  YP_001893701  normal  0.258502  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0026  CDS  NC_010681  37034  39139  2106  heavy metal translocating P-type ATPase  YP_001893702  normal  0.260901  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0027  CDS  NC_010681  39233  39436  204  hypothetical protein  YP_001893703  normal  0.378689  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0028  CDS  NC_010681  39486  39917  432  transcriptional regulator, MerR family  YP_001893704  normal  0.234521  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0029  CDS  NC_010681  40032  40232  201  hypothetical protein  YP_001893705  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0030  CDS  NC_010681  40276  41679  1404  ATP-dependent RNA helicase DbpA  YP_001893706  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0031  CDS  NC_010681  41982  43136  1155  putative aminotransferase  YP_001893707  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0032  CDS  NC_010681  43261  44049  789  extracellular solute-binding protein family 3  YP_001893708  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0033  CDS  NC_010681  44181  45026  846  transcriptional regulator, AraC family  YP_001893709  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0034  CDS  NC_010681  45049  45636  588  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  YP_001893710  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0035    NC_010681  46198  47084  887      normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0036    NC_010681  47404  48198  795      normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0037  CDS  NC_010681  48397  48915  519  hypothetical protein  YP_001893711  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0038  CDS  NC_010681  48923  50146  1224  major facilitator superfamily MFS_1  YP_001893712  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0039  CDS  NC_010681  50143  51210  1068  conserved hypothetical signal peptide protein  YP_001893713  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0040  CDS  NC_010681  51437  52348  912  transcriptional regulator, LysR family  YP_001893714  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0041  CDS  NC_010681  53101  54552  1452  Amidase  YP_001893715  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0042  CDS  NC_010681  54738  55496  759  transcriptional regulator, DeoR family  YP_001893716  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0043  CDS  NC_010681  55474  56766  1293  allantoate amidohydrolase  YP_001893717  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0044  CDS  NC_010681  56777  57727  951  aminoglycoside phosphotransferase  YP_001893718  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0045  CDS  NC_010681  57733  58674  942  Choline/ethanolamine kinase  YP_001893719  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0046  CDS  NC_010681  58832  59089  258  hypothetical protein  YP_001893720  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0047  CDS  NC_010681  59086  60612  1527  Na+/solute symporter  YP_001893721  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0048  CDS  NC_010681  60797  62173  1377  aminotransferase class-III  YP_001893722  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0049  CDS  NC_010681  62769  63911  1143  putative amidase expression-regulating protein  YP_001893723  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0050  CDS  NC_010681  63908  64510  603  response regulator receiver and ANTAR domain protein  YP_001893724  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0051  CDS  NC_010681  64702  65532  831  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  YP_001893725  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0052  CDS  NC_010681  65601  66764  1164  Extracellular ligand-binding receptor  YP_001893726  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0053  CDS  NC_010681  66845  67681  837  inner-membrane translocator  YP_001893727  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0054  CDS  NC_010681  67674  69488  1815  ABC transporter related  YP_001893728  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0055  CDS  NC_010681  69485  70186  702  ABC transporter related  YP_001893729  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0056  CDS  NC_010681  70224  70910  687  urease, beta subunit  YP_001893730  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0057  CDS  NC_010681  70913  72628  1716  urease subunit alpha  YP_001893731  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0058  CDS  NC_010681  72638  73252  615  urease accessory protein UreG  YP_001893732  normal  0.418935  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0059  CDS  NC_010681  73249  74064  816  Urease accessory protein UreD  YP_001893733  normal  0.33184  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0060  CDS  NC_010681  74073  74594  522  UreE urease accessory domain protein  YP_001893734  normal  0.184655  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0061  CDS  NC_010681  74587  75306  720  Urease accessory protein UreF  YP_001893735  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0062  CDS  NC_010681  75327  76892  1566  extracellular solute-binding protein family 5  YP_001893736  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0063  CDS  NC_010681  77409  78440  1032  transcriptional regulator, LacI family  YP_001893737  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0064  CDS  NC_010681  79164  79841  678  protein of unknown function DUF1028  YP_001893738  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0065  CDS  NC_010681  79951  81129  1179  Extracellular ligand-binding receptor  YP_001893739  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0066  CDS  NC_010681  81567  82532  966  hypothetical protein  YP_001893740  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0067  CDS  NC_010681  83504  84052  549  4-vinyl reductase 4VR  YP_001893741  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0068  CDS  NC_010681  84101  85099  999  peptidase M19 renal dipeptidase  YP_001893742  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0069  CDS  NC_010681  85116  85775  660  transcriptional regulator, TetR family  YP_001893743  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0070  CDS  NC_010681  85909  87195  1287  major facilitator superfamily MFS_1  YP_001893744  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0071  CDS  NC_010681  87469  88155  687  hypothetical protein  YP_001893745  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0072  CDS  NC_010681  89774  90931  1158  porin Gram-negative type  YP_001893746  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0073  CDS  NC_010681  91180  92604  1425  amine oxidase  YP_001893747  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0074  CDS  NC_010681  92781  93749  969  protein of unknown function DUF534  YP_001893748  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0075  CDS  NC_010681  93734  94582  849  ABC transporter related  YP_001893749  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0076  CDS  NC_010681  94579  95499  921  inner-membrane translocator  YP_001893750  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0077  CDS  NC_010681  95634  96227  594  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  YP_001893751  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0078  CDS  NC_010681  96224  97567  1344  UbiD family decarboxylase  YP_001893752  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0079  CDS  NC_010681  97764  98918  1155  transcriptional regulator, AraC family  YP_001893753  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0080  CDS  NC_010681  99091  100518  1428  Aldehyde Dehydrogenase  YP_001893754  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0081  CDS  NC_010681  101029  101316  288  hypothetical protein  YP_001893755  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0082  CDS  NC_010681  101715  102809  1095  transcriptional regulator, LacI family  YP_001893756  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0083  CDS  NC_010681  102962  104251  1290  extracellular solute-binding protein family 1  YP_001893757  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0084    NC_010681  104353  104496  144      normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0085    NC_010681  104730  104837  108      normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0086  CDS  NC_010681  105093  106013  921  transcriptional regulator, LysR family  YP_001893758  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0087  CDS  NC_010681  106307  106684  378  protein of unknown function DUF336  YP_001893759  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0088  CDS  NC_010681  106681  107841  1161  putative major royal jelly-like protein  YP_001893760  normal  0.898622  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0089  CDS  NC_010681  107899  109131  1233  hypothetical protein  YP_001893761  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0090    NC_010681  109147  109254  108      normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0091    NC_010681  109253  109513  261      normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0092    NC_010681  109653  109801  149      normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0093  CDS  NC_010681  109893  110165  273  prevent-host-death family protein  YP_001893762  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0094  CDS  NC_010681  110165  110578  414  protein of unknown function DUF132  YP_001893763  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0095    NC_010681  110618  110980  363      normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0096    NC_010681  110980  111567  588      normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0097  CDS  NC_010681  111634  111849  216  hypothetical protein  YP_001893764  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0098  CDS  NC_010681  111851  112708  858  AAA ATPase  YP_001893765  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0099  CDS  NC_010681  112705  114141  1437  Integrase catalytic region  YP_001893766  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Bphyt_0100  CDS  NC_010681  114240  114818  579  hypothetical protein  YP_001893767  normal  normal  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 75    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>