3372 genes were found for organism Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 34    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Tgr7_0001  CDS  NC_011901  139  1506  +  1368  chromosomal replication initiation protein  YP_002512093  normal  0.632445  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0002  CDS  NC_011901  1758  2858  +  1101  DNA polymerase III, beta subunit  YP_002512094  normal  0.348811  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0003  CDS  NC_011901  2890  3972  +  1083  DNA replication and repair protein RecF  YP_002512095  normal  0.0698954  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0004  CDS  NC_011901  4021  6444  +  2424  DNA gyrase, B subunit  YP_002512096  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0005  CDS  NC_011901  6540  7415  -  876  extracellular solute-binding protein, family 1  YP_002512097  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0006  CDS  NC_011901  7739  9799  +  2061  Oligopeptidase A  YP_002512098  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0007  CDS  NC_011901  9837  10604  +  768  exodeoxyribonuclease III  YP_002512099  normal  0.454244  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0008  CDS  NC_011901  10752  12215  +  1464  UbiD family decarboxylase  YP_002512100  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0009  CDS  NC_011901  12359  12994  +  636  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_002512101  normal  0.363565  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0010  CDS  NC_011901  13000  13317  +  318  hypothetical protein  YP_002512102  normal  0.409313  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0011  CDS  NC_011901  13352  13555  +  204  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  YP_002512103  normal  0.369132  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0012  CDS  NC_011901  13645  13806  +  162  hypothetical protein  YP_002512104  normal  0.373075  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0013  CDS  NC_011901  13900  14361  -  462  hypothetical protein  YP_002512105  normal  0.520242  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0014    NC_011901  14646  15398  +  753      normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0015  CDS  NC_011901  15494  15775  -  282  hypothetical protein  YP_002512106  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0016  CDS  NC_011901  15890  16429  +  540  lactoylglutathione lyase  YP_002512107  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0017  CDS  NC_011901  16503  17450  +  948  Lysophospholipase-like protein  YP_002512108  normal  0.953662  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0018  CDS  NC_011901  17470  17946  +  477  hypothetical protein  YP_002512109  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0019  CDS  NC_011901  17960  18334  +  375  hypothetical protein  YP_002512110  normal  0.816073  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0020  CDS  NC_011901  18348  18809  +  462  SNARE associated Golgi protein  YP_002512111  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0021  CDS  NC_011901  18988  20445  +  1458  histidine kinase  YP_002512112  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0022  CDS  NC_011901  20438  21799  +  1362  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  YP_002512113  normal  0.0914573  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0023  CDS  NC_011901  21983  22396  +  414  hypothetical protein  YP_002512114  normal  0.0996823  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0024  CDS  NC_011901  22560  23429  -  870  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  YP_002512115  normal  0.156484  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0025  CDS  NC_011901  23531  24553  +  1023  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  YP_002512116  normal  0.775073  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0026  CDS  NC_011901  24623  25795  -  1173  HemY-like protein  YP_002512117  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0027  CDS  NC_011901  25802  27076  -  1275  protein of unknown function DUF513, HemX  YP_002512118  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0028  CDS  NC_011901  27066  27884  -  819  Uroporphyrinogen-III synthase  YP_002512119  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0029  CDS  NC_011901  27881  28831  -  951  Hydroxymethylbilane synthase  YP_002512120  normal  0.943678  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0030  CDS  NC_011901  28942  29451  +  510  hypothetical protein  YP_002512121  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0031  CDS  NC_011901  29590  30321  -  732  response regulator receiver protein  YP_002512122  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0032  CDS  NC_011901  30299  31393  -  1095  sensory transduction protein kinase AlgZ  YP_002512123  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0033  CDS  NC_011901  31585  32988  +  1404  argininosuccinate lyase  YP_002512124  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0034  CDS  NC_011901  33276  35696  -  2421  signal transduction protein containing a membrane domain an EAL and a GGDEF domain  YP_002512125  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0035  CDS  NC_011901  35932  36597  -  666  carboxylesterase  YP_002512126  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0036  CDS  NC_011901  36788  37096  -  309  sulphur oxidation protein SoxZ  YP_002512127  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0037  CDS  NC_011901  37148  37615  -  468  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  YP_002512128  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0038  CDS  NC_011901  37790  39157  -  1368  response regulator receiver protein  YP_002512129  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0039  CDS  NC_011901  39215  41182  -  1968  histidine kinase  YP_002512130  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0040  CDS  NC_011901  41305  41463  +  159  hypothetical protein  YP_002512131  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0041  CDS  NC_011901  41562  42806  +  1245  diaminopimelate decarboxylase  YP_002512132  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0042  CDS  NC_011901  42929  43600  +  672  Methyltransferase type 12  YP_002512133  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0043  CDS  NC_011901  43617  43916  -  300  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  YP_002512134  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0044  CDS  NC_011901  43930  44208  -  279  plasmid maintenance system killer  YP_002512135  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0045  CDS  NC_011901  44376  45212  +  837  Diaminopimelate epimerase  YP_002512136  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0046  CDS  NC_011901  45209  45895  +  687  putative phytochrome sensor protein  YP_002512137  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0047  CDS  NC_011901  46068  46964  +  897  tyrosine recombinase XerC  YP_002512138  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0048  CDS  NC_011901  47035  47991  +  957  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  YP_002512139  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0049  CDS  NC_011901  47995  48990  +  996  protein of unknown function DUF58  YP_002512140  normal  0.799483  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0050  CDS  NC_011901  48987  49400  +  414  hypothetical protein  YP_002512141  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0051  CDS  NC_011901  49397  50374  +  978  von Willebrand factor type A  YP_002512142  normal  0.901325  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0052  CDS  NC_011901  50615  52384  +  1770  von Willebrand factor type A  YP_002512143  normal  0.649054  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0053  CDS  NC_011901  52381  53874  +  1494  hypothetical protein  YP_002512144  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0054  CDS  NC_011901  53946  54365  +  420  hypothetical protein  YP_002512145  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0055  CDS  NC_011901  54510  55262  -  753  ferredoxin-NADP reductase  YP_002512146  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0056  CDS  NC_011901  55444  55977  +  534  ATP-dependent protease peptidase subunit  YP_002512147  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0057  CDS  NC_011901  56035  57369  +  1335  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  YP_002512148  normal  0.408482  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0058  CDS  NC_011901  57528  57893  +  366  protein of unknown function DUF971  YP_002512149  normal  0.563148  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0059  CDS  NC_011901  58108  58857  +  750  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  YP_002512150  normal  0.802877  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0060  CDS  NC_011901  58874  59497  +  624  Sterol-binding domain protein  YP_002512151  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0061  CDS  NC_011901  59494  61170  +  1677  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  YP_002512152  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0062  CDS  NC_011901  61528  61863  +  336  SirA family protein  YP_002512153  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0063  CDS  NC_011901  61973  63388  +  1416  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  YP_002512154  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0064  CDS  NC_011901  63467  63718  +  252  SirA family protein  YP_002512155  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0065  CDS  NC_011901  63722  64033  +  312  hypothetical protein  YP_002512156  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0066  CDS  NC_011901  64043  64309  +  267  hypothetical protein  YP_002512157  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0067  CDS  NC_011901  64306  64503  +  198  hypothetical protein  YP_002512158  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0068  CDS  NC_011901  65031  66521  +  1491  rhodanese-related sulfurtransferase  YP_002512159  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0069  CDS  NC_011901  66777  68081  +  1305  hypothetical protein  YP_002512160  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0070  CDS  NC_011901  68188  68484  +  297  hypothetical protein  YP_002512161  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0071  CDS  NC_011901  68556  69089  +  534  hypothetical protein  YP_002512162  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0072  CDS  NC_011901  69124  70314  +  1191  phosphate-selective porin O and P  YP_002512163  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0073  CDS  NC_011901  70320  71837  +  1518  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  YP_002512164  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0074  CDS  NC_011901  71888  73249  +  1362  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  YP_002512165  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0075  CDS  NC_011901  73252  74070  +  819  hypothetical protein  YP_002512166  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0076  CDS  NC_011901  74404  75738  +  1335  diguanylate cyclase  YP_002512167  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0077  CDS  NC_011901  75751  76599  +  849  phosphonate ABC transporter, periplasmic phosphonate-binding protein  YP_002512168  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0078  CDS  NC_011901  76753  77991  -  1239  dihydrolipoamide acetyltransferase  YP_002512169  normal  0.286551  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0079  CDS  NC_011901  78025  80871  -  2847  alpha-ketoglutarate decarboxylase  YP_002512170  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0080  CDS  NC_011901  80980  83145  +  2166  DNA helicase II  YP_002512171  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0081  CDS  NC_011901  83298  84497  +  1200  two component transcriptional regulator, AraC family  YP_002512172  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0082  CDS  NC_011901  84564  87164  +  2601  Hpt sensor hybrid histidine kinase  YP_002512173  normal  0.0375698  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0083  CDS  NC_011901  87703  88578  -  876  enoyl-CoA hydratase  YP_002512174  normal  0.293903  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0084  CDS  NC_011901  88788  89720  -  933  Homoserine kinase  YP_002512175  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0085  CDS  NC_011901  89717  90040  -  324  hypothetical protein  YP_002512176  normal  0.551447  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0086  CDS  NC_011901  90040  90765  -  726  hypothetical protein  YP_002512177  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0087  CDS  NC_011901  91031  93742  +  2712  DNA polymerase I  YP_002512178  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0088  CDS  NC_011901  94463  95092  -  630  cell division checkpoint GTPase YihA  YP_002512179  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0089  CDS  NC_011901  95289  95906  +  618  cytochrome c class I  YP_002512180  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0090  CDS  NC_011901  96142  98181  +  2040  ResB family protein  YP_002512181  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0091  CDS  NC_011901  98227  99591  +  1365  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  YP_002512182  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0092  CDS  NC_011901  99600  100250  +  651  DSBA oxidoreductase  YP_002512183  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0093  CDS  NC_011901  100341  101225  +  885  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  YP_002512184  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0094  CDS  NC_011901  101262  102617  +  1356  diguanylate cyclase  YP_002512185  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0095  CDS  NC_011901  102770  103654  +  885  PfkB domain protein  YP_002512186  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0096  CDS  NC_011901  103726  104121  -  396  DoxX  YP_002512187  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0097  CDS  NC_011901  104296  106104  +  1809  DEAD/DEAH box helicase domain protein  YP_002512188  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0098  CDS  NC_011901  106241  107233  +  993  Fructose-bisphosphatase  YP_002512189  normal  1  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0099    NC_011901  107474  110021  +  2548      normal  0.232678  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0100  CDS  NC_011901  110213  110884  -  672  DNA repair protein RadC  YP_002512190  normal  0.234069  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 34    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>