199 genes were found for organism Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Bind_3677  CDS  NC_010580  46  585  +  540  hypothetical protein  YP_001830973  normal  1  normal  0.15424  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3678  CDS  NC_010580  578  1543  +  966  DotC  YP_001830974  normal  1  normal  0.165494  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3679  CDS  NC_010580  1540  2682  +  1143  type II secretion system protein E  YP_001830975  normal  1  normal  0.165494  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3680  CDS  NC_010580  2682  2930  +  249  IcmT  YP_001830976  normal  1  normal  0.208936  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3681  CDS  NC_010580  2927  3355  +  429  hypothetical protein  YP_001830977  normal  1  normal  0.216333  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3682  CDS  NC_010580  3364  3876  +  513  lytic transglycosylase catalytic  YP_001830978  normal  1  normal  0.325069  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3683  CDS  NC_010580  3876  5024  +  1149  hypothetical protein  YP_001830979  normal  0.162009  normal  0.165494  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3684  CDS  NC_010580  5039  5578  +  540  hypothetical protein  YP_001830980  normal  0.157197  normal  0.148307  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3685  CDS  NC_010580  5588  5854  +  267  hypothetical protein  YP_001830981  normal  0.121619  normal  0.217338  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3686  CDS  NC_010580  5886  8246  +  2361  DotL  YP_001830982  decreased coverage  0.00900266  normal  0.235831  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3687  CDS  NC_010580  8344  8592  +  249  prevent-host-death family protein  YP_001830983  normal  0.0726516  normal  0.144685  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3688  CDS  NC_010580  8582  8869  +  288  addiction module antitoxin  YP_001830984  normal  0.125211  normal  0.144102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3689  CDS  NC_010580  9808  10167  +  360  hypothetical protein  YP_001830985  normal  0.0745286  normal  0.216333  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3690  CDS  NC_010580  10218  11063  -  846  LysR family transcriptional regulator  YP_001830986  normal  0.129943  normal  0.235682  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3691  CDS  NC_010580  11154  11570  +  417  hypothetical protein  YP_001830987  normal  0.0890683  normal  0.205332  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3692  CDS  NC_010580  11638  14844  -  3207  TrwC relaxase  YP_001830988  normal  1  normal  0.372056  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3693  CDS  NC_010580  14841  15140  -  300  hypothetical protein  YP_001830989  normal  0.620942  normal  0.311533  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3694  CDS  NC_010580  15688  16098  +  411  hypothetical protein  YP_001830990  normal  0.143691  normal  0.463845  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3695  CDS  NC_010580  16129  24864  +  8736  proprotein convertase P  YP_001830991  normal  1  normal  0.523637  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3696  CDS  NC_010580  24960  27122  +  2163  type I secretion system ATPase  YP_001830992  normal  1  normal  0.202443  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3697  CDS  NC_010580  27119  28564  +  1446  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  YP_001830993  normal  1  normal  0.108936  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3698  CDS  NC_010580  28835  29197  -  363  prophage antirepressor  YP_001830994  normal  1  normal  0.206352  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3699  CDS  NC_010580  29603  30187  +  585  hypothetical protein  YP_001830995  normal  0.969015  normal  0.298268  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3700  CDS  NC_010580  30201  30986  +  786  hypothetical protein  YP_001830996  normal  1  normal  0.304458  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3701  CDS  NC_010580  30959  31963  +  1005  hypothetical protein  YP_001830997  normal  1  normal  0.216333  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3702  CDS  NC_010580  31956  32573  +  618  hypothetical protein  YP_001830998  normal  1  normal  0.189362  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3703  CDS  NC_010580  32686  33387  +  702  hypothetical protein  YP_001830999  normal  1  normal  0.194118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3704  CDS  NC_010580  33371  33709  +  339  hypothetical protein  YP_001831000  normal  1  normal  0.174215  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3705  CDS  NC_010580  33800  34690  +  891  hypothetical protein  YP_001831001  normal  1  normal  0.126431  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3706  CDS  NC_010580  34705  35100  +  396  hypothetical protein  YP_001831002  normal  1  normal  0.117125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3707  CDS  NC_010580  35259  35504  +  246  transcription factor  YP_001831003  normal  1  normal  0.116158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3708  CDS  NC_010580  35504  35902  +  399  PilT domain-containing protein  YP_001831004  normal  1  normal  0.122475  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3709  CDS  NC_010580  36023  36265  +  243  hypothetical protein  YP_001831005  normal  1  normal  0.0724584  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3710  CDS  NC_010580  36323  36493  -  171  hypothetical protein  YP_001831006  normal  1  normal  0.0709374  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3711  CDS  NC_010580  36577  36903  -  327  hypothetical protein  YP_001831007  normal  1  normal  0.0736956  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3712  CDS  NC_010580  36854  37480  -  627  hypothetical protein  YP_001831008  normal  1  normal  0.0772553  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3713  CDS  NC_010580  37587  38006  -  420  hypothetical protein  YP_001831009  normal  0.935915  normal  0.0740078  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3714  CDS  NC_010580  38096  38281  -  186  hypothetical protein  YP_001831010  normal  1  normal  0.0728048  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3715  CDS  NC_010580  38374  38691  -  318  hypothetical protein  YP_001831011  normal  0.473433  normal  0.0762661  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3716  CDS  NC_010580  39493  39726  -  234  hypothetical protein  YP_001831012  normal  0.206436  normal  0.0422812  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3717  CDS  NC_010580  39773  40366  -  594  hypothetical protein  YP_001831013  normal  0.200961  normal  0.0468458  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3718  CDS  NC_010580  40420  40791  -  372  hypothetical protein  YP_001831014  normal  0.369932  normal  0.0752479  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3719  CDS  NC_010580  40861  41031  -  171  hypothetical protein  YP_001831015  normal  0.440352  normal  0.0703555  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3720  CDS  NC_010580  41112  41711  -  600  hypothetical protein  YP_001831016  normal  0.199556  normal  0.0832499  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3721  CDS  NC_010580  42705  43283  +  579  hypothetical protein  YP_001831017  normal  0.123162  normal  0.0828819  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3722  CDS  NC_010580  43333  43887  -  555  hypothetical protein  YP_001831018  normal  0.0836144  normal  0.0832499  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3723  CDS  NC_010580  44013  44210  -  198  hypothetical protein  YP_001831019  normal  0.219032  normal  0.195533  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3724  CDS  NC_010580  44264  44485  -  222  hypothetical protein  YP_001831020  normal  0.226867  normal  0.193212  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3725  CDS  NC_010580  44508  44867  -  360  hypothetical protein  YP_001831021  normal  0.192827  normal  0.128141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3726  CDS  NC_010580  44946  45140  -  195  hypothetical protein  YP_001831022  normal  0.15887  normal  0.12298  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3727  CDS  NC_010580  45116  45556  -  441  hypothetical protein  YP_001831023  normal  0.131354  normal  0.136273  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3728  CDS  NC_010580  45557  45823  -  267  hypothetical protein  YP_001831024  normal  0.115535  normal  0.131326  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3729  CDS  NC_010580  45858  47555  -  1698  plasmid partitioning protein  YP_001831025  normal  0.183946  normal  0.190659  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3730    NC_010580  47781  48119  -  339      normal  0.398033  normal  0.329748  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3731  CDS  NC_010580  48400  48960  -  561  hypothetical protein  YP_001831026  normal  0.227148  normal  0.328628  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3732  CDS  NC_010580  49061  54142  -  5082  helicase domain-containing protein  YP_001831027  normal  0.253895  normal  0.261793  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3733  CDS  NC_010580  54228  54620  -  393  hypothetical protein  YP_001831028  normal  0.202432  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3734  CDS  NC_010580  54624  54950  -  327  hypothetical protein  YP_001831029  normal  0.121619  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3735  CDS  NC_010580  55225  55566  -  342  hypothetical protein  YP_001831030  normal  0.122164  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3736  CDS  NC_010580  55665  55952  -  288  hypothetical protein  YP_001831031  normal  0.168132  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3737  CDS  NC_010580  56028  56567  -  540  hypothetical protein  YP_001831032  normal  0.141349  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3738  CDS  NC_010580  56800  56949  -  150  hypothetical protein  YP_001831033  normal  0.100935  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3739  CDS  NC_010580  56984  57118  -  135  hypothetical protein  YP_001831034  normal  0.241242  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3740  CDS  NC_010580  57207  57479  -  273  hypothetical protein  YP_001831035  normal  0.549838  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3741  CDS  NC_010580  57681  57950  -  270  hypothetical protein  YP_001831036  normal  0.565203  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3742    NC_010580  57956  58713  -  758      normal  1  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3743  CDS  NC_010580  58763  58933  -  171  hypothetical protein  YP_001831037  normal  1  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3744  CDS  NC_010580  58930  59292  -  363  hypothetical protein  YP_001831038  normal  1  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3745  CDS  NC_010580  59289  59495  -  207  hypothetical protein  YP_001831039  normal  1  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3746  CDS  NC_010580  59506  61698  -  2193  UvrD/REP helicase  YP_001831040  normal  1  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3747  CDS  NC_010580  61878  62198  -  321  hypothetical protein  YP_001831041  normal  1  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3748  CDS  NC_010580  62195  63139  -  945  hypothetical protein  YP_001831042  normal  1  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3749  CDS  NC_010580  63136  63528  -  393  hypothetical protein  YP_001831043  normal  1  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3750  CDS  NC_010580  63770  64204  +  435  hypothetical protein  YP_001831044  normal  1  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3751  CDS  NC_010580  64255  64704  +  450  peptidase S24/S26 domain-containing protein  YP_001831045  normal  1  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3752  CDS  NC_010580  64704  65966  +  1263  DNA-directed DNA polymerase  YP_001831046  normal  1  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3753  CDS  NC_010580  66033  66743  -  711  hypothetical protein  YP_001831047  normal  1  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3754  CDS  NC_010580  66740  67384  -  645  hypothetical protein  YP_001831048  normal  1  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3755    NC_010580  67695  68208  +  514      normal  1  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3756    NC_010580  68433  68651  -  219      normal  0.86609  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3757    NC_010580  68746  69681  +  936      normal  1  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3758  CDS  NC_010580  69815  70114  +  300  addiction module antitoxin  YP_001831049  normal  1  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3759  CDS  NC_010580  70152  70391  +  240  plasmid stabilization system protein  YP_001831050  normal  1  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3760  CDS  NC_010580  70588  70944  +  357  hypothetical protein  YP_001831051  normal  1  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3761    NC_010580  71052  71810  -  759      normal  1  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3762  CDS  NC_010580  71869  73326  -  1458  hypothetical protein  YP_001831052  normal  1  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3763  CDS  NC_010580  73316  74650  -  1335  hypothetical protein  YP_001831053  normal  0.493237  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3764  CDS  NC_010580  74987  75784  +  798  hypothetical protein  YP_001831054  normal  0.827063  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3765  CDS  NC_010580  75777  79088  +  3312  helicase domain-containing protein  YP_001831055  normal  0.197555  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3766  CDS  NC_010580  79470  79715  -  246  hypothetical protein  YP_001831056  normal  0.659248  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3767  CDS  NC_010580  79777  80442  -  666  hypothetical protein  YP_001831057  normal  1  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3768  CDS  NC_010580  80439  81545  -  1107  hypothetical protein  YP_001831058  normal  0.979798  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3769  CDS  NC_010580  81565  82203  -  639  hypothetical protein  YP_001831059  normal  1  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3770  CDS  NC_010580  82203  82670  -  468  hypothetical protein  YP_001831060  normal  1  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3771  CDS  NC_010580  82979  84136  +  1158  hypothetical protein  YP_001831061  normal  1  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3772  CDS  NC_010580  84124  84792  +  669  hypothetical protein  YP_001831062  normal  1  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3773  CDS  NC_010580  84891  86063  -  1173  integrase family protein  YP_001831063  normal  1  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3774  CDS  NC_010580  86060  86476  -  417  PilT domain-containing protein  YP_001831064  normal  1  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3775  CDS  NC_010580  86476  86718  -  243  prevent-host-death family protein  YP_001831065  normal  1  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_3776  CDS  NC_010580  87016  87324  +  309  hypothetical protein  YP_001831066  normal  1  normal  1  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>