287 genes were found for organism Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Rleg_6287  CDS  NC_012854  122  1300  +  1179  hypothetical protein  YP_002979284  normal  0.110098  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6288    NC_012854  1484  2256  +  773      normal  0.171239  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6289  CDS  NC_012854  2547  2873  -  327  hypothetical protein  YP_002979285  normal  0.0529401  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6290  CDS  NC_012854  3237  3734  +  498  hypothetical protein  YP_002979286  normal  0.381791  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6291  CDS  NC_012854  3803  5080  +  1278  hypothetical protein  YP_002979287  normal  0.27721  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6292  CDS  NC_012854  5370  5573  +  204  cold-shock DNA-binding domain protein  YP_002979288  normal  0.392497  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6293  CDS  NC_012854  5643  6431  +  789  protein of unknown function DUF88  YP_002979289  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6294  CDS  NC_012854  6529  7896  +  1368  hypothetical protein  YP_002979290  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6295  CDS  NC_012854  8146  8316  +  171  hypothetical protein  YP_002979291  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6296  CDS  NC_012854  8310  9365  +  1056  putative transcriptional regulator, XRE family  YP_002979292  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6297  CDS  NC_012854  9828  11744  +  1917  hypothetical protein  YP_002979293  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6298  CDS  NC_012854  11749  13344  +  1596  hypothetical protein  YP_002979294  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6299  CDS  NC_012854  13365  14933  -  1569  HSP90 family molecular chaperone-like protein  YP_002979295  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6300  CDS  NC_012854  14930  16561  -  1632  Radical SAM domain protein  YP_002979296  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6301  CDS  NC_012854  16554  17579  -  1026  DGQHR domain protein  YP_002979297  normal  0.483477  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6302  CDS  NC_012854  17678  18691  -  1014  hypothetical protein  YP_002979298  normal  0.101925  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6303  CDS  NC_012854  18688  20169  -  1482  helicase domain protein  YP_002979299  normal  0.881514  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6304  CDS  NC_012854  20177  20596  -  420  hypothetical protein  YP_002979300  normal  0.537326  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6305  CDS  NC_012854  20601  21647  -  1047  hypothetical protein  YP_002979301  normal  0.652821  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6306  CDS  NC_012854  21800  24466  +  2667  hypothetical protein  YP_002979302  normal  1  normal  0.990957  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6307  CDS  NC_012854  24512  25636  -  1125  protein of unknown function DUF1612  YP_002979303  normal  0.396537  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6308  CDS  NC_012854  25826  26116  +  291  prevent-host-death family protein  YP_002979304  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6309  CDS  NC_012854  26113  26490  +  378  hypothetical protein  YP_002979305  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6310  CDS  NC_012854  26502  26831  +  330  hypothetical protein  YP_002979306  normal  0.541643  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6311  CDS  NC_012854  26828  27970  +  1143  integrase family protein  YP_002979307  normal  0.692197  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6312  CDS  NC_012854  28089  28337  +  249  Rv0623 family protein transcription factor  YP_002979308  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6313  CDS  NC_012854  28334  28720  +  387  PilT protein domain protein  YP_002979309  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6314    NC_012854  28723  29323  +  601      normal  0.698768  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6315  CDS  NC_012854  29391  30698  -  1308  replication initiation protein RepC  YP_002979310  normal  0.829822  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6316  CDS  NC_012854  30898  31887  -  990  plasmid partitioning protein RepB  YP_002979311  normal  0.758859  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6317  CDS  NC_012854  31884  33101  -  1218  plasmid partitioning protein RepA  YP_002979312  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6318  CDS  NC_012854  34404  35489  -  1086  hypothetical protein  YP_002979313  normal  0.247104  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6319  CDS  NC_012854  35635  36393  +  759  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  YP_002979314  normal  0.777067  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6320  CDS  NC_012854  36592  37476  +  885  transcriptional regulator, AraC family  YP_002979315  normal  0.636258  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6321  CDS  NC_012854  37700  38764  +  1065  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  YP_002979316  normal  0.402352  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6322  CDS  NC_012854  38836  39657  +  822  ABC transporter related  YP_002979317  normal  0.645186  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6323  CDS  NC_012854  39654  40913  +  1260  inner-membrane translocator  YP_002979318  normal  0.47689  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6324  CDS  NC_012854  40940  41668  +  729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_002979319  normal  0.14693  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6325  CDS  NC_012854  41721  42485  +  765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_002979320  normal  0.251484  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6326  CDS  NC_012854  42662  43057  -  396  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_002979321  normal  0.0629107  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6327  CDS  NC_012854  43144  43569  -  426  hypothetical protein  YP_002979322  normal  0.0209388  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6328  CDS  NC_012854  43691  44290  +  600  transcriptional regulator, TetR family  YP_002979323  decreased coverage  0.00138827  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6329  CDS  NC_012854  44405  45427  -  1023  histidine kinase  YP_002979324  hitchhiker  0.00201026  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6330  CDS  NC_012854  45427  46131  -  705  two component transcriptional regulator, winged helix family  YP_002979325  decreased coverage  0.000626879  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6331  CDS  NC_012854  46179  47675  -  1497  hypothetical protein  YP_002979326  hitchhiker  0.00569126  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6332  CDS  NC_012854  48261  48449  -  189  hypothetical protein  YP_002979327  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6333  CDS  NC_012854  48645  49358  -  714  autoaggregation protein  YP_002979328  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6334  CDS  NC_012854  49629  49730  -  102  hypothetical protein  YP_002979329  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6335  CDS  NC_012854  49812  49964  +  153  hypothetical protein  YP_002979330  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6336  CDS  NC_012854  50004  50240  +  237  30S ribosomal protein S21  YP_002979331  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6337  CDS  NC_012854  50301  50495  +  195  hypothetical protein  YP_002979332  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6338  CDS  NC_012854  50603  51082  +  480  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  YP_002979333  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6339  CDS  NC_012854  51303  52172  -  870  hypothetical protein  YP_002979334  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6340  CDS  NC_012854  52165  52782  -  618  hypothetical protein  YP_002979335  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6341  CDS  NC_012854  53201  54112  -  912  transcriptional regulator, LysR family  YP_002979336  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6342  CDS  NC_012854  54212  55087  +  876  putative oxidoreductase  YP_002979337  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6343  CDS  NC_012854  55122  57281  -  2160  ABC transporter related  YP_002979338  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6344  CDS  NC_012854  57291  58454  -  1164  secretion protein HlyD family protein  YP_002979339  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6345  CDS  NC_012854  58589  58798  -  210  hypothetical protein  YP_002979340  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6346  CDS  NC_012854  59040  59231  -  192  hypothetical protein  YP_002979341  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6347  CDS  NC_012854  59228  59863  -  636  hypothetical protein  YP_002979342  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6348  CDS  NC_012854  59960  61849  -  1890  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  YP_002979343  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6349  CDS  NC_012854  61996  62910  -  915  protein of unknown function DUF344  YP_002979344  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6350  CDS  NC_012854  63022  63873  -  852  transcriptional regulator, XRE family  YP_002979345  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6351  CDS  NC_012854  63946  64335  -  390  hypothetical protein  YP_002979346  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6352  CDS  NC_012854  64657  65577  +  921  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_002979347  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6353  CDS  NC_012854  65608  67260  -  1653  putative oxidoreductase protein  YP_002979348  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6354  CDS  NC_012854  67344  68426  -  1083  ABC transporter related  YP_002979349  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6355  CDS  NC_012854  68434  69318  -  885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002979350  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6356  CDS  NC_012854  69318  70205  -  888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002979351  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6357  CDS  NC_012854  70308  71540  -  1233  extracellular solute-binding protein family 1  YP_002979352  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6358  CDS  NC_012854  71599  72549  -  951  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  YP_002979353  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6359  CDS  NC_012854  72772  73842  +  1071  transcriptional regulator, LacI family  YP_002979354  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6360  CDS  NC_012854  74045  74323  +  279  transcriptional regulator, CopG family  YP_002979355  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6361  CDS  NC_012854  74311  74601  +  291  addiction module toxin, RelE/StbE family  YP_002979356  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6362  CDS  NC_012854  74766  75209  +  444  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  YP_002979357  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6363  CDS  NC_012854  75209  76594  +  1386  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  YP_002979358  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6364  CDS  NC_012854  76591  77028  +  438  hypothetical protein  YP_002979359  normal  0.301006  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6365  CDS  NC_012854  77025  77732  +  708  Allophanate hydrolase subunit 1  YP_002979360  normal  0.297553  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6366  CDS  NC_012854  77729  78724  +  996  urea amidolyase related protein  YP_002979361  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6367  CDS  NC_012854  78762  79529  +  768  LamB/YcsF family protein  YP_002979362  normal  1  normal  0.826752  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6368  CDS  NC_012854  79590  80792  +  1203  aspartate aminotransferase  YP_002979363  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6369  CDS  NC_012854  80888  81793  -  906  transcriptional regulator, LysR family  YP_002979364  normal  0.120934  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6370  CDS  NC_012854  82040  82819  +  780  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_002979365  normal  0.719831  normal  0.512814  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6371  CDS  NC_012854  82816  83523  +  708  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  YP_002979366  normal  0.128297  normal  0.494562  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6372  CDS  NC_012854  83520  84278  +  759  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  YP_002979367  normal  0.198232  normal  0.40329  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6373  CDS  NC_012854  84275  85039  +  765  ABC transporter related  YP_002979368  normal  0.535484  normal  0.530942  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6374  CDS  NC_012854  85071  85907  +  837  extracellular solute-binding protein family 3  YP_002979369  normal  0.213399  normal  0.625492  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6375  CDS  NC_012854  85999  86673  +  675  Dimethylmenaquinone methyltransferase  YP_002979370  normal  0.830889  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6376  CDS  NC_012854  86844  88028  +  1185  hypothetical protein  YP_002979371  normal  0.12547  normal  0.702736  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6377  CDS  NC_012854  88044  89057  -  1014  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  YP_002979372  normal  0.0823471  normal  0.671945  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6378  CDS  NC_012854  89088  89432  -  345  Endoribonuclease L-PSP  YP_002979373  normal  0.0807375  normal  0.458934  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6379  CDS  NC_012854  89469  90779  -  1311  hypothetical protein  YP_002979374  normal  0.619709  normal  0.462883  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6380  CDS  NC_012854  90772  91728  -  957  amidohydrolase 2  YP_002979375  normal  0.294039  normal  0.226796  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6381  CDS  NC_012854  91725  92666  -  942  inner-membrane translocator  YP_002979376  normal  0.736605  normal  0.121067  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6382  CDS  NC_012854  92663  93625  -  963  inner-membrane translocator  YP_002979377  normal  1  normal  0.079038  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6383  CDS  NC_012854  93622  95136  -  1515  ABC transporter related  YP_002979378  normal  0.446216  normal  0.131089  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6384  CDS  NC_012854  95171  96310  -  1140  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  YP_002979379  normal  0.108159  normal  0.0518769  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6385  CDS  NC_012854  96464  97249  +  786  transcriptional regulator, IclR family  YP_002979380  normal  0.040112  normal  0.0189266  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6386  CDS  NC_012854  97654  99006  +  1353  monooxygenase protein  YP_002979381  normal  0.0181294  normal  0.0362961  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>