769 genes were found for organism Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 8    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Rleg_4642  CDS  NC_012848  1239  1239  putative signal transduction histidine kinase  YP_002972839  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4643  CDS  NC_012848  1520  2536  1017  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  YP_002972840  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4644  CDS  NC_012848  2609  4057  1449  ABC transporter related  YP_002972841  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4645  CDS  NC_012848  4054  5001  948  inner-membrane translocator  YP_002972842  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4646  CDS  NC_012848  4998  5948  951  inner-membrane translocator  YP_002972843  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4647  CDS  NC_012848  5963  6877  915  Gluconolactonase  YP_002972844  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4648  CDS  NC_012848  7276  12411  5136  hypothetical protein  YP_002972845  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4649  CDS  NC_012848  12598  13041  444  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_002972846  normal  0.200798  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4650    NC_012848  13133  14711  1579      normal  0.204714  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4651  CDS  NC_012848  14781  15134  354  IS66 Orf2 family protein  YP_002972847  normal  0.0650066  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4652  CDS  NC_012848  15131  15538  408  transposase IS3/IS911 family protein  YP_002972848  normal  0.110926  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4653  CDS  NC_012848  15736  16962  1227  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002972849  normal  0.523264  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4654  CDS  NC_012848  17082  17681  600  transcriptional regulator, TetR family  YP_002972850  normal  0.416931  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4655  CDS  NC_012848  17868  19205  1338  Epoxide hydrolase domain protein  YP_002972851  normal  0.246703  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4656  CDS  NC_012848  19330  19941  612  hypothetical protein  YP_002972852  normal  0.720744  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4657  CDS  NC_012848  19934  20863  930  protein of unknown function DUF182  YP_002972853  normal  0.836128  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4658  CDS  NC_012848  20920  23118  2199  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  YP_002972854  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4659  CDS  NC_012848  23122  24072  951  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  YP_002972855  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4660  CDS  NC_012848  24069  24716  648  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  YP_002972856  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4661  CDS  NC_012848  24949  25815  867  Creatininase  YP_002972857  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4662  CDS  NC_012848  25778  26767  990  transcriptional regulator, LysR family  YP_002972858  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4663  CDS  NC_012848  26952  27968  1017  NMT1/THI5 like domain protein  YP_002972859  normal  normal  0.679325  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4664  CDS  NC_012848  28036  28860  825  ABC transporter related  YP_002972860  normal  normal  0.456657  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4665  CDS  NC_012848  28860  29714  855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002972861  normal  normal  0.65192  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4666  CDS  NC_012848  29714  31027  1314  cytosine deaminase-like protein  YP_002972862  normal  normal  0.69631  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4667  CDS  NC_012848  31029  32438  1410  FAD linked oxidase domain protein  YP_002972863  normal  normal  0.526864  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4668  CDS  NC_012848  32435  33016  582  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  YP_002972864  normal  normal  0.588797  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4669  CDS  NC_012848  33013  33402  390  Endoribonuclease L-PSP  YP_002972865  normal  normal  0.570729  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4670  CDS  NC_012848  33592  35469  1878  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_002972866  normal  normal  0.817515  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4671    NC_012848  35804  36278  475      normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4672  CDS  NC_012848  36362  37144  783  ferric iron reductase  YP_002972867  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4673  CDS  NC_012848  37154  39337  2184  TonB-dependent siderophore receptor  YP_002972868  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4674  CDS  NC_012848  39576  40001  426  PilT protein domain protein  YP_002972869  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4675  CDS  NC_012848  39998  40261  264  hypothetical protein  YP_002972870  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4676  CDS  NC_012848  40559  41131  573  transcriptional regulator, TetR family  YP_002972871  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4677    NC_012848  41270  41539  270      normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4678  CDS  NC_012848  41636  41863  228  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  YP_002972872  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4679  CDS  NC_012848  42228  43664  1437  putative transcriptional regulator  YP_002972873  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4680  CDS  NC_012848  43925  45142  1218  diguanylate cyclase  YP_002972874  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4681  CDS  NC_012848  45293  46036  744  GntR domain protein  YP_002972875  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4682  CDS  NC_012848  46020  47618  1599  extracellular solute-binding protein family 5  YP_002972876  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4683  CDS  NC_012848  47732  48649  918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002972877  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4684  CDS  NC_012848  48652  49530  879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002972878  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4685  CDS  NC_012848  49549  50466  918  dihydrodipicolinate synthetase  YP_002972879  normal  0.828547  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4686  CDS  NC_012848  50475  51491  1017  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  YP_002972880  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4687  CDS  NC_012848  51492  52445  954  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  YP_002972881  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4688  CDS  NC_012848  52472  53407  936  dihydrodipicolinate synthetase  YP_002972882  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4689  CDS  NC_012848  53512  54276  765  transcriptional regulator, IclR family  YP_002972883  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4690  CDS  NC_012848  54470  56044  1575  extracellular solute-binding protein family 5  YP_002972884  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4691  CDS  NC_012848  56192  57046  855  poly(aspartic acid) hydrolase  YP_002972885  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4692  CDS  NC_012848  57043  58653  1611  gamma-glutamyltransferase  YP_002972886  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4693  CDS  NC_012848  58718  59692  975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002972887  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4694  CDS  NC_012848  59697  60611  915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002972888  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4695  CDS  NC_012848  60608  61585  978  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  YP_002972889  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4696  CDS  NC_012848  61585  62589  1005  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  YP_002972890  normal  0.173146  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4697  CDS  NC_012848  62809  63483  675  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  YP_002972891  normal  0.0835735  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4698  CDS  NC_012848  63480  64034  555  OmpA/MotB domain protein  YP_002972892  normal  0.0873914  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4699    NC_012848  64102  66563  2462      normal  0.194772  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4700  CDS  NC_012848  66731  67405  675  transcriptional regulator, TetR family  YP_002972893  normal  0.0565878  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4701  CDS  NC_012848  67414  68256  843  putative hydrolase protein  YP_002972894  normal  0.0255091  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4702  CDS  NC_012848  68381  69298  918  transcriptional regulator, LysR family  YP_002972895  normal  0.685712  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4703  CDS  NC_012848  69352  69951  600  RES domain protein  YP_002972896  normal  0.272414  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4704  CDS  NC_012848  69948  70670  723  hypothetical protein  YP_002972897  normal  0.625736  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4705  CDS  NC_012848  70820  73846  3027  glycoside hydrolase family 38  YP_002972898  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4706  CDS  NC_012848  74121  75140  1020  transcriptional regulator, LacI family  YP_002972899  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4707  CDS  NC_012848  75310  76569  1260  extracellular solute-binding protein family 1  YP_002972900  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4708  CDS  NC_012848  76633  77514  882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002972901  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4709  CDS  NC_012848  77507  78343  837  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002972902  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4710  CDS  NC_012848  78357  79499  1143  ABC transporter related  YP_002972903  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4711  CDS  NC_012848  79641  81014  1374  Inulin fructotransferase (DFA-I-forming)  YP_002972904  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4712  CDS  NC_012848  81071  82795  1725  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  YP_002972905  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4713  CDS  NC_012848  82936  83127  192  hypothetical protein  YP_002972906  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4714  CDS  NC_012848  83261  84400  1140  putative transcriptional regulator protein, ROK family  YP_002972907  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4715  CDS  NC_012848  84412  85470  1059  oxidoreductase domain protein  YP_002972908  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4716  CDS  NC_012848  85828  87126  1299  extracellular solute-binding protein family 1  YP_002972909  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4717  CDS  NC_012848  87197  88126  930  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002972910  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4718  CDS  NC_012848  88123  88965  843  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002972911  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4719  CDS  NC_012848  89004  90242  1239  ROK family protein  YP_002972912  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4720  CDS  NC_012848  90290  91144  855  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  YP_002972913  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4721  CDS  NC_012848  91167  92228  1062  ABC transporter related  YP_002972914  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4722  CDS  NC_012848  92344  92817  474  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  YP_002972915  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4723  CDS  NC_012848  93095  94024  930  pantoate--beta-alanine ligase  YP_002972916  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4724  CDS  NC_012848  94021  94842  822  3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase  YP_002972917  normal  0.557236  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4725  CDS  NC_012848  94864  95778  915  transcriptional regulator, LysR family  YP_002972918  normal  0.255479  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4726  CDS  NC_012848  95922  98111  2190  catalase/peroxidase HPI  YP_002972919  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4727    NC_012848  98148  98441  294      normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4728  CDS  NC_012848  98461  99018  558  hypothetical protein  YP_002972920  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4729  CDS  NC_012848  99151  99420  270  hypothetical protein  YP_002972921  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4730    NC_012848  99557  99847  291      normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4731  CDS  NC_012848  99894  100361  468  protein of unknown function DUF1486  YP_002972922  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4732  CDS  NC_012848  100480  100866  387  transcriptional regulator, HxlR family  YP_002972923  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4733  CDS  NC_012848  100879  101847  969  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  YP_002972924  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4734  CDS  NC_012848  101900  102316  417  thioesterase superfamily protein  YP_002972925  normal  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4735  CDS  NC_012848  102346  103875  1530  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_002972926  normal  0.660645  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4736  CDS  NC_012848  103853  105058  1206  acetyl-CoA acetyltransferase  YP_002972927  normal  0.0181465  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4737  CDS  NC_012848  105079  105537  459  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  YP_002972928  normal  0.0223994  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4738  CDS  NC_012848  105922  106686  765  NmrA family protein  YP_002972929  normal  0.210315  normal  0.761332  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4739  CDS  NC_012848  106730  107143  414  Cupin 2 conserved barrel domain protein  YP_002972930  normal  0.234364  normal  0.716595  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4740  CDS  NC_012848  107194  108477  1284  methionine gamma-lyase  YP_002972931  normal  0.188705  normal  0.843485  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_4741  CDS  NC_012848  108551  109630  1080  ribonuclease BN  YP_002972932  normal  0.25096  normal  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 8    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8    next >  last >>