226 genes were found for organism Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Swit_4887  CDS  NC_009508  10  1215  -  1206  beta-ketoadipyl CoA thiolase  YP_001260276  normal  1  normal  0.0589853  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4888  CDS  NC_009508  1212  1874  -  663  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  YP_001260277  normal  0.544225  normal  0.033457  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4889  CDS  NC_009508  1874  2584  -  711  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  YP_001260278  normal  0.269229  normal  0.0348451  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4890  CDS  NC_009508  2581  3480  -  900  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  YP_001260279  normal  0.352228  normal  0.0244252  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4891  CDS  NC_009508  3505  4575  -  1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  YP_001260280  normal  0.592699  normal  0.0411098  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4892  CDS  NC_009508  4575  6269  -  1695  hypothetical protein  YP_001260281  normal  0.0498261  normal  0.117948  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4893  CDS  NC_009508  6517  6837  -  321  ferredoxin  YP_001260282  normal  0.042497  normal  0.0721521  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4894  CDS  NC_009508  6965  9391  -  2427  TonB-dependent receptor  YP_001260283  normal  0.0512869  normal  0.075257  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4895  CDS  NC_009508  9537  10385  -  849  alpha/beta hydrolase fold  YP_001260284  normal  0.0335992  normal  0.294667  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4896  CDS  NC_009508  10646  11185  -  540  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  YP_001260285  normal  0.225329  normal  0.376607  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4897  CDS  NC_009508  11182  12489  -  1308  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  YP_001260286  normal  0.227325  normal  0.4666  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4898  CDS  NC_009508  12709  13521  +  813  IS4 family transposase  YP_001260287  normal  0.0763576  normal  0.401338  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4899  CDS  NC_009508  13643  14464  +  822  IS4 family transposase  YP_001260288  normal  0.134652  normal  0.305485  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4900  CDS  NC_009508  14785  15597  +  813  IS4 family transposase  YP_001260289  normal  0.413324  normal  0.183223  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4901  CDS  NC_009508  16125  16928  +  804  GntR family transcriptional regulator  YP_001260290  normal  0.296075  normal  0.244529  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4902  CDS  NC_009508  17011  17895  +  885  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001260291  normal  0.671705  normal  0.255308  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4903  CDS  NC_009508  18006  18392  +  387  transposase IS3/IS911 family protein  YP_001260292  normal  1  normal  0.294667  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4904  CDS  NC_009508  18389  18733  +  345  hypothetical protein  YP_001260293  normal  1  normal  0.290887  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4905  CDS  NC_009508  18798  20171  -  1374  IS4 family transposase  YP_001260294  normal  1  normal  0.24611  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4906  CDS  NC_009508  20283  20900  +  618  integrase catalytic subunit  YP_001260295  normal  1  normal  0.350856  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4907    NC_009508  21032  21142  -  111      normal  1  normal  0.410653  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4908  CDS  NC_009508  21498  22349  -  852  integrase catalytic subunit  YP_001260296  normal  1  normal  0.168017  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4909  CDS  NC_009508  22391  22669  -  279  transposase IS3/IS911 family protein  YP_001260297  normal  1  normal  0.189828  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4910  CDS  NC_009508  22865  23275  -  411  dehydrogenase  YP_001260298  normal  1  normal  0.271824  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4911  CDS  NC_009508  23463  24674  +  1212  transposase, mutator type  YP_001260299  normal  1  normal  0.462522  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4912  CDS  NC_009508  24703  24948  -  246  hypothetical protein  YP_001260300  normal  1  normal  0.448303  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4913  CDS  NC_009508  25042  26328  +  1287  integrase catalytic subunit  YP_001260301  normal  1  normal  0.279769  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4914  CDS  NC_009508  26328  27143  +  816  IstB ATP binding domain-containing protein  YP_001260302  normal  1  normal  0.297532  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4915  CDS  NC_009508  27127  27570  +  444  transposase IS3/IS911 family protein  YP_001260303  normal  1  normal  0.269908  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4916  CDS  NC_009508  27567  27914  +  348  IS66 Orf2 family protein  YP_001260304  normal  1  normal  0.256223  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4917    NC_009508  27945  29303  +  1359      normal  1  normal  0.280499  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4918  CDS  NC_009508  29331  31400  -  2070  resolvase domain-containing protein  YP_001260305  normal  1  normal  0.79279  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4919  CDS  NC_009508  31825  32115  +  291  hypothetical protein  YP_001260306  normal  1  normal  0.759352  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4920  CDS  NC_009508  32517  33746  -  1230  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_001260307  normal  0.764561  normal  0.762584  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4921  CDS  NC_009508  33832  34722  -  891  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  YP_001260308  normal  0.197144  normal  0.584863  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4922  CDS  NC_009508  34834  35550  -  717  pyruvate, phosphate dikinase  YP_001260309  normal  0.287654  normal  0.875905  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4923  CDS  NC_009508  35547  36572  -  1026  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  YP_001260310  normal  0.854205  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4924  CDS  NC_009508  36569  37510  -  942  acetaldehyde dehydrogenase  YP_001260311  normal  0.758356  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4925  CDS  NC_009508  37513  38295  -  783  4-oxalocrotonate decarboxylase  YP_001260312  normal  0.624784  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4926  CDS  NC_009508  38588  39184  +  597  transcriptional regulator IclR-like protein  YP_001260313  normal  0.0909011  normal  0.863129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4927  CDS  NC_009508  39177  40097  +  921  2-dehydropantoate 2-reductase  YP_001260314  normal  0.0332007  normal  0.934837  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4928  CDS  NC_009508  40130  40501  -  372  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductase-like protein  YP_001260315  normal  0.182085  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4929  CDS  NC_009508  40565  41422  -  858  IstB ATP binding domain-containing protein  YP_001260316  normal  0.155263  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4930  CDS  NC_009508  41419  42897  -  1479  transposase Tn3 family protein  YP_001260317  normal  0.142055  normal  0.882247  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4931  CDS  NC_009508  42901  43527  -  627  resolvase domain-containing protein  YP_001260318  normal  0.107506  normal  0.566204  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4932  CDS  NC_009508  43934  44611  +  678  hypothetical protein  YP_001260319  normal  0.0822637  normal  0.441175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4933    NC_009508  44591  45218  -  628      normal  0.322307  normal  0.56728  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4934  CDS  NC_009508  45364  46470  -  1107  relaxase/mobilization nuclease family protein  YP_001260320  normal  0.421912  normal  0.821482  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4935  CDS  NC_009508  46463  46999  -  537  CopG/DNA-binding domain-containing protein  YP_001260321  normal  0.291366  normal  0.856659  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4936  CDS  NC_009508  47526  48422  -  897  parB-like partition protein  YP_001260322  normal  0.0153012  normal  0.946011  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4937  CDS  NC_009508  48422  49252  -  831  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_001260323  normal  0.0647563  normal  0.762584  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4938  CDS  NC_009508  49381  49644  -  264  hypothetical protein  YP_001260324  normal  0.0500434  normal  0.645654  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4939  CDS  NC_009508  49770  50069  -  300  hypothetical protein  YP_001260325  normal  0.0562955  normal  0.822719  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4940  CDS  NC_009508  50123  50680  -  558  hypothetical protein  YP_001260326  normal  0.110846  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4941  CDS  NC_009508  50757  51143  +  387  hypothetical protein  YP_001260327  normal  0.0801944  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4942  CDS  NC_009508  51211  51519  +  309  hypothetical protein  YP_001260328  normal  0.0201428  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4943  CDS  NC_009508  51516  52253  +  738  hypothetical protein  YP_001260329  decreased coverage  0.00429148  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4944  CDS  NC_009508  52319  52879  -  561  hypothetical protein  YP_001260330  hitchhiker  0.00417208  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4945  CDS  NC_009508  53290  53802  +  513  nuclease  YP_001260331  normal  0.377656  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4946  CDS  NC_009508  53816  54247  -  432  hypothetical protein  YP_001260332  normal  0.38598  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4947  CDS  NC_009508  54437  55168  +  732  hypothetical protein  YP_001260333  normal  0.968147  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4948  CDS  NC_009508  55089  56648  +  1560  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  YP_001260334  normal  0.777522  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4949    NC_009508  56683  57225  +  543      normal  1  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4950    NC_009508  57252  57485  -  234      normal  1  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4951  CDS  NC_009508  57509  58273  +  765  hypothetical protein  YP_001260335  normal  1  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4952  CDS  NC_009508  58326  59375  -  1050  hypothetical protein  YP_001260336  normal  1  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4953  CDS  NC_009508  59987  60550  -  564  hypothetical protein  YP_001260337  normal  1  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4954  CDS  NC_009508  60612  61586  -  975  parB-like partition protein  YP_001260338  normal  1  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4955  CDS  NC_009508  61838  62989  -  1152  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_001260339  normal  1  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4956  CDS  NC_009508  63589  64893  +  1305  plasmid encoded RepA protein  YP_001260340  normal  1  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4957  CDS  NC_009508  65449  66216  -  768  IstB ATP binding domain-containing protein  YP_001260341  normal  1  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4958  CDS  NC_009508  66213  67721  -  1509  transposase  YP_001260342  normal  1  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4959  CDS  NC_009508  67824  68786  -  963  hypothetical protein  YP_001260343  normal  1  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4960  CDS  NC_009508  68913  69188  +  276  hypothetical protein  YP_001260344  normal  0.500865  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4961  CDS  NC_009508  69396  70847  +  1452  hypothetical protein  YP_001260345  normal  0.542068  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4962  CDS  NC_009508  70953  71678  +  726  hypothetical protein  YP_001260346  normal  0.341407  normal  0.997775  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4963  CDS  NC_009508  71684  72142  +  459  hypothetical protein  YP_001260347  normal  0.117955  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4964  CDS  NC_009508  72633  73580  +  948  hypothetical protein  YP_001260348  normal  1  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4965  CDS  NC_009508  73812  74435  +  624  hypothetical protein  YP_001260349  normal  1  normal  0.766228  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4966  CDS  NC_009508  74919  75332  +  414  single-strand binding protein  YP_001260350  normal  1  normal  0.875066  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4967  CDS  NC_009508  76285  76764  -  480  RES  YP_001260351  normal  0.928645  normal  0.913014  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4968  CDS  NC_009508  76761  77195  -  435  hypothetical protein  YP_001260352  normal  1  normal  0.749674  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4969  CDS  NC_009508  77487  77651  +  165  hypothetical protein  YP_001260353  normal  1  normal  0.689573  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4970  CDS  NC_009508  77897  78238  -  342  hypothetical protein  YP_001260354  normal  1  normal  0.723258  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4971  CDS  NC_009508  78457  80175  -  1719  RNA-directed DNA polymerase  YP_001260355  normal  1  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4972  CDS  NC_009508  80872  81597  +  726  hypothetical protein  YP_001260356  normal  1  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4973  CDS  NC_009508  81621  82016  +  396  hypothetical protein  YP_001260357  normal  1  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4974  CDS  NC_009508  82454  83302  +  849  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_001260358  normal  1  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4975  CDS  NC_009508  83302  84237  +  936  parB-like partition protein  YP_001260359  normal  1  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4976  CDS  NC_009508  84676  85071  +  396  hypothetical protein  YP_001260360  normal  1  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4977  CDS  NC_009508  85064  86197  +  1134  hypothetical protein  YP_001260361  normal  1  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4978  CDS  NC_009508  86411  88630  -  2220  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  YP_001260362  normal  1  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4979  CDS  NC_009508  88602  89906  -  1305  hypothetical protein  YP_001260363  normal  0.941662  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4980  CDS  NC_009508  89903  93274  -  3372  hypothetical protein  YP_001260364  normal  1  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4981  CDS  NC_009508  93853  94581  -  729  IstB ATP binding domain-containing protein  YP_001260365  normal  1  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4982  CDS  NC_009508  94568  95839  -  1272  integrase catalytic subunit  YP_001260366  normal  1  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4983  CDS  NC_009508  95975  97468  +  1494  transposase  YP_001260367  normal  0.712907  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4984  CDS  NC_009508  97465  98232  +  768  IstB ATP binding domain-containing protein  YP_001260368  normal  1  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4985  CDS  NC_009508  98284  98580  -  297  hypothetical protein  YP_001260369  normal  1  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4986  CDS  NC_009508  98858  99760  +  903  hypothetical protein  YP_001260370  normal  0.931595  normal  1  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>