5070 genes were found for organism Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 51    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Veis_0001  CDS  NC_008786  493  1944  1452  chromosomal replication initiation protein  YP_994812  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0002  CDS  NC_008786  2040  3158  1119  DNA polymerase III, beta subunit  YP_994813  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0003  CDS  NC_008786  3321  5927  2607  DNA gyrase, B subunit  YP_994814  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0004  CDS  NC_008786  7315  7905  591  mobile mystery protein B  YP_994815  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0005  CDS  NC_008786  7896  8411  516  mobile mystery protein A  YP_994816  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0006  CDS  NC_008786  8724  11030  2307  type III restriction enzyme, res subunit  YP_994817  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0007  CDS  NC_008786  11421  12317  897  LysR family transcriptional regulator  YP_994818  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0008  CDS  NC_008786  12341  13222  882  hypothetical protein  YP_994819  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0009  CDS  NC_008786  13414  14997  1584  protein of unknown function DUF894, DitE  YP_994820  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0010  CDS  NC_008786  15099  16211  1113  uroporphyrinogen decarboxylase  YP_994821  normal  0.717373  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0011  CDS  NC_008786  16497  18635  2139  primosomal protein N'  YP_994822  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0012  CDS  NC_008786  18688  20538  1851  putative inner membrane transmembrane protein  YP_994823  normal  0.672275  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0013  CDS  NC_008786  20727  21254  528  shikimate kinase  YP_994824  normal  0.668155  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0014  CDS  NC_008786  21430  24165  2736  methionine synthase  YP_994825  normal  0.0698387  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0015  CDS  NC_008786  24349  24993  645  TetR family transcriptional regulator  YP_994826  normal  0.576639  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0016  CDS  NC_008786  25187  26308  1122  3-dehydroquinate synthase  YP_994827  normal  0.691661  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0017  CDS  NC_008786  26392  27594  1203  hypothetical protein  YP_994828  normal  0.735291  normal  0.491222  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0018  CDS  NC_008786  27620  29758  2139  type IV pilus secretin PilQ  YP_994829  normal  normal  0.845155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0019  CDS  NC_008786  29755  30297  543  pilus assembly protein, PilQ  YP_994830  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0020  CDS  NC_008786  30297  30968  672  pilus assembly protein, PilO  YP_994831  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0021  CDS  NC_008786  30970  31593  624  fimbrial assembly family protein  YP_994832  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0022  CDS  NC_008786  31590  32669  1080  type IV pilus assembly protein PilM  YP_994833  normal  normal  0.738489  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0023  CDS  NC_008786  33001  35400  2400  1A family penicillin-binding protein  YP_994834  normal  0.432475  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0024  CDS  NC_008786  35409  35738  330  frataxin family protein  YP_994835  normal  normal  0.960861  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0025  CDS  NC_008786  35913  37325  1413  FAD linked oxidase domain-containing protein  YP_994836  normal  0.43762  normal  0.732346  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0026  CDS  NC_008786  37456  38568  1113  quinolinate synthetase  YP_994837  normal  0.44147  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0027  CDS  NC_008786  38614  39504  891  hypothetical protein  YP_994838  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0028  CDS  NC_008786  39536  40468  933  3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase  YP_994839  normal  0.640886  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0029  CDS  NC_008786  40590  41432  843  pantoate--beta-alanine ligase  YP_994840  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0030  CDS  NC_008786  41568  42623  1056  hypothetical protein  YP_994841  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0031  CDS  NC_008786  42665  44071  1407  multi-sensor signal transduction histidine kinase  YP_994842  normal  0.231222  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0032  CDS  NC_008786  44140  44772  633  two component LuxR family transcriptional regulator  YP_994843  normal  0.245451  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0033  CDS  NC_008786  45035  45496  462  response regulator receiver protein  YP_994844  normal  0.315681  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0034  CDS  NC_008786  45576  46325  750  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  YP_994845  normal  0.439342  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0035  CDS  NC_008786  46637  48073  1437  carboxyl-terminal protease  YP_994846  normal  0.118794  normal  0.879403  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0036  CDS  NC_008786  48218  48955  738  phosphoglycerate mutase 1 family protein  YP_994847  normal  0.945791  normal  0.827774  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0037  CDS  NC_008786  49114  51003  1890  dihydroxy-acid dehydratase  YP_994848  normal  normal  0.93636  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0038  CDS  NC_008786  51205  52203  999  hypothetical protein  YP_994849  normal  normal  0.914226  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0039  CDS  NC_008786  52347  52754  408  rhodanese domain-containing protein  YP_994850  normal  0.861184  normal  0.831321  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0040  CDS  NC_008786  52771  53031  261  glutaredoxin 3  YP_994851  normal  normal  0.802614  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0041  CDS  NC_008786  53068  53577  510  preprotein translocase subunit SecB  YP_994852  normal  normal  0.815394  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0042  CDS  NC_008786  53643  54653  1011  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  YP_994853  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0043  CDS  NC_008786  54844  55770  927  xylose isomerase domain-containing protein  YP_994854  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0044  CDS  NC_008786  56329  57810  1482  GntR family transcriptional regulator  YP_994855  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0045  CDS  NC_008786  57940  58923  984  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  YP_994856  normal  0.765358  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0046  CDS  NC_008786  58972  60018  1047  inner-membrane translocator  YP_994857  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0047  CDS  NC_008786  60015  60758  744  ABC transporter related  YP_994858  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0048  CDS  NC_008786  60776  61525  750  LmbE family protein  YP_994859  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0049  CDS  NC_008786  61567  62514  948  xylose isomerase domain-containing protein  YP_994860  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0050  CDS  NC_008786  62617  63705  1089  oxidoreductase domain-containing protein  YP_994861  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0051  CDS  NC_008786  63990  64427  438  hypothetical protein  YP_994862  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0052  CDS  NC_008786  64424  65329  906  hypothetical protein  YP_994863  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0053  CDS  NC_008786  65841  67013  1173  oxidoreductase domain-containing protein  YP_994864  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0054  CDS  NC_008786  67147  68076  930  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  YP_994865  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0055  CDS  NC_008786  68112  69203  1092  inner-membrane translocator  YP_994866  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0056  CDS  NC_008786  69246  70415  1170  inositol 2-dehydrogenase  YP_994867  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0057  CDS  NC_008786  70470  71276  807  xylose isomerase domain-containing protein  YP_994868  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0058  CDS  NC_008786  71328  72128  801  ABC transporter related  YP_994869  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0059  CDS  NC_008786  72130  73287  1158  inner-membrane translocator  YP_994870  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0060  CDS  NC_008786  73304  74239  936  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  YP_994871  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0061  CDS  NC_008786  74299  75849  1551  ABC transporter related  YP_994872  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0062  CDS  NC_008786  75875  76900  1026  hypothetical protein  YP_994873  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0063  CDS  NC_008786  76944  77873  930  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  YP_994874  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0064  CDS  NC_008786  78013  78945  933  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  YP_994875  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0065  CDS  NC_008786  79185  81209  2025  ribokinase-like domain-containing protein  YP_994876  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0066  CDS  NC_008786  81212  83095  1884  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  YP_994877  normal  0.354472  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0067  CDS  NC_008786  83143  84099  957  xylose isomerase domain-containing protein  YP_994878  normal  0.0290166  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0068  CDS  NC_008786  84121  84948  828  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  YP_994879  hitchhiker  0.00478014  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0069  CDS  NC_008786  85093  85431  339  XRE family transcriptional regulator  YP_994880  hitchhiker  0.00141281  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0070  CDS  NC_008786  85661  86503  843  squalene/phytoene synthase  YP_994881  decreased coverage  0.00181146  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0071  CDS  NC_008786  86787  88145  1359  amine oxidase  YP_994882  normal  0.0365942  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0072  CDS  NC_008786  88183  89091  909  HflC protein  YP_994883  normal  0.055112  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0073  CDS  NC_008786  89102  90460  1359  HflK protein  YP_994884  normal  0.715541  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0074  CDS  NC_008786  90545  91708  1164  GTP-binding protein, HSR1-related  YP_994885  normal  0.352568  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0075  CDS  NC_008786  91787  92041  255  RNA chaperone Hfq  YP_994886  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0076  CDS  NC_008786  92152  93558  1407  GTP-binding protein EngA  YP_994887  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0077  CDS  NC_008786  93574  94767  1194  Pyrrolo-quinoline quinone  YP_994888  normal  0.825382  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0078  CDS  NC_008786  94764  95444  681  hypothetical protein  YP_994889  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0079  CDS  NC_008786  95455  96780  1326  histidyl-tRNA synthetase  YP_994890  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0080  CDS  NC_008786  96793  98118  1326  4-hydroxy-3-methylbut-2-en-1-yl diphosphate synthase  YP_994891  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0081  CDS  NC_008786  98118  98990  873  hypothetical protein  YP_994892  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0082  CDS  NC_008786  98983  99840  858  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  YP_994893  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0083  CDS  NC_008786  99996  101171  1176  radical SAM protein  YP_994894  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0084  CDS  NC_008786  101185  101610  426  nucleoside-diphosphate kinase  YP_994895  normal  0.311434  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0085  CDS  NC_008786  101730  103292  1563  pseudouridine synthase  YP_994896  normal  0.300201  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0086  CDS  NC_008786  103292  103942  651  putative transcriptional regulator  YP_994897  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0087  CDS  NC_008786  104197  105231  1035  RluA family pseudouridine synthase  YP_994898  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0088  CDS  NC_008786  105237  106124  888  peptidase M23B  YP_994899  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0089  CDS  NC_008786  106129  106896  768  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  YP_994900  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0090  CDS  NC_008786  106896  107675  780  stationary phase survival protein SurE  YP_994901  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0091  CDS  NC_008786  107807  108781  975  alcohol dehydrogenase  YP_994902  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0092  CDS  NC_008786  108832  109461  630  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  YP_994903  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0093  CDS  NC_008786  109839  111800  1962  DNA primase  YP_994904  normal  0.244748  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0094  CDS  NC_008786  112053  112316  264  DNA binding domain-containing protein  YP_994905  normal  0.0288586  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0095  CDS  NC_008786  112310  115042  2733  hypothetical protein  YP_994906  normal  0.417783  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0096  CDS  NC_008786  115042  116034  993  hypothetical protein  YP_994907  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0097  CDS  NC_008786  116064  117080  1017  ATPase central domain-containing protein  YP_994908  normal  0.622643  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0098  CDS  NC_008786  117080  119698  2619  hypothetical protein  YP_994909  normal  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0099  CDS  NC_008786  119698  122913  3216  hypothetical protein  YP_994910  normal  0.658498  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_0100  CDS  NC_008786  122910  123410  501  hypothetical protein  YP_994911  normal  0.027695  normal  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 51    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>