39 genes were found for organism Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Veis_5016  CDS  NC_008771  130  1227  1098  zeta toxin family protein  YP_980113  normal  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5017  CDS  NC_008771  1222  2355  1134  relaxase/mobilization nuclease family protein  YP_980114  normal  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5018  CDS  NC_008771  2689  3975  1287  hypothetical protein  YP_980115  normal  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5019  CDS  NC_008771  3988  6264  2277  TRAG family protein  YP_980116  normal  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5020  CDS  NC_008771  6261  7304  1044  type II secretion system protein E  YP_980117  normal  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5021  CDS  NC_008771  7282  8634  1353  conjugation TrbI family protein  YP_980118  normal  0.553821  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5022  CDS  NC_008771  8631  9428  798  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  YP_980119  normal  0.0116672  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5023  CDS  NC_008771  9425  10141  717  VirB8 family protein  YP_980120  decreased coverage  0.00032583  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5024  CDS  NC_008771  10145  11128  984  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  YP_980121  decreased coverage  0.001184  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5025  CDS  NC_008771  11420  12085  666  type IV secretion system family protein  YP_980122  normal  0.0212937  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5026  CDS  NC_008771  12088  14502  2415  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  YP_980123  normal  0.451352  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5027  CDS  NC_008771  14465  14848  384  type IV secretory pathway, VirB3 family protein  YP_980124  normal  0.0684115  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5028  CDS  NC_008771  14853  15161  309  hypothetical protein  YP_980125  normal  0.0533967  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5029  CDS  NC_008771  15164  15622  459  hypothetical protein  YP_980126  normal  0.106902  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5030  CDS  NC_008771  15680  16042  363  hypothetical protein  YP_980127  normal  0.277071  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5031  CDS  NC_008771  16427  16888  462  hypothetical protein  YP_980128  normal  0.361029  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5032  CDS  NC_008771  16952  17269  318  putative cytoplasmic protein  YP_980129  normal  0.423569  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5033  CDS  NC_008771  17244  17561  318  hypothetical protein  YP_980130  normal  0.659592  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5034  CDS  NC_008771  17804  18193  390  plasmid recombination enzyme  YP_980131  normal  0.937465  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5035  CDS  NC_008771  18393  19295  903  hypothetical protein  YP_980132  normal  0.376631  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5036  CDS  NC_008771  19603  19884  282  hypothetical protein  YP_980133  normal  0.288436  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5037  CDS  NC_008771  20213  20818  606  resolvase domain-containing protein  YP_980134  normal  0.931406  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5038  CDS  NC_008771  20815  21681  867  hypothetical protein  YP_980135  normal  0.460865  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5039  CDS  NC_008771  22397  22705  309  hypothetical protein  YP_980136  normal  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5040  CDS  NC_008771  22864  23502  639  putative secreted protein  YP_980137  normal  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5041  CDS  NC_008771  23502  23768  267  hypothetical protein  YP_980138  normal  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5042  CDS  NC_008771  23747  23959  213  hypothetical protein  YP_980139  normal  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5043  CDS  NC_008771  23962  24339  378  hypothetical protein  YP_980140  normal  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5044  CDS  NC_008771  24397  24918  522  MobA/MobL protein  YP_980141  normal  0.803549  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5045  CDS  NC_008771  25015  25251  237  hypothetical protein  YP_980142  normal  0.403262  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5046  CDS  NC_008771  25283  25561  279  hypothetical protein  YP_980143  normal  0.896322  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5047  CDS  NC_008771  25581  25838  258  hypothetical protein  YP_980144  normal  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5048  CDS  NC_008771  26013  26834  822  hypothetical protein  YP_980145  normal  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5049  CDS  NC_008771  26993  27334  342  hypothetical protein  YP_980146  normal  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5050  CDS  NC_008771  27418  28212  795  TnpA family transposase  YP_980147  normal  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5051  CDS  NC_008771  28642  29070  429  hypothetical protein  YP_980148  normal  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5052  CDS  NC_008771  29071  29823  753  transfer origin protein, TraL  YP_980149  normal  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5053  CDS  NC_008771  29836  30189  354  hypothetical protein  YP_980150  normal  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_5054  CDS  NC_008771  30466  31047  582  mobilisation protein  YP_980151  normal  n/a    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>