7899 genes were found for organism Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 79    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Bphy_0001  CDS  NC_010622  362  1918  +  1557  chromosomal replication initiation protein  YP_001856244  normal  1  hitchhiker  0.000470324  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0002  CDS  NC_010622  2175  3278  +  1104  DNA polymerase III subunit beta  YP_001856245  normal  0.201514  hitchhiker  0.00206466  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0003  CDS  NC_010622  3392  5863  +  2472  DNA gyrase subunit B  YP_001856246  normal  0.211892  hitchhiker  0.00365115  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0004  CDS  NC_010622  5956  6237  -  282  hypothetical protein  YP_001856247  normal  0.515328  hitchhiker  0.00276568  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0005    NC_010622  6240  7009  -  770      normal  0.375347  hitchhiker  0.0031921  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0006  CDS  NC_010622  7331  8734  +  1404  ethanolamine transproter  YP_001856248  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0007  CDS  NC_010622  8816  10210  +  1395  ethanolamine ammonia lyase large subunit  YP_001856249  normal  1  hitchhiker  0.00710474  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0008  CDS  NC_010622  10207  11001  +  795  ethanolamine ammonia-lyase small subunit  YP_001856250  normal  1  hitchhiker  0.00990942  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0009  CDS  NC_010622  11042  11434  -  393  hypothetical protein  YP_001856251  normal  0.860087  normal  0.0144121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0010  CDS  NC_010622  11514  13034  -  1521  aldehyde dehydrogenase  YP_001856252  normal  1  normal  0.0379018  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0011  CDS  NC_010622  13381  14397  +  1017  AraC family transcriptional regulator  YP_001856253  normal  1  normal  0.0768217  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0012  CDS  NC_010622  14834  15019  +  186  hypothetical protein  YP_001856254  normal  1  normal  0.0879726  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0013  CDS  NC_010622  15034  16425  +  1392  ATP-dependent RNA helicase DbpA  YP_001856255  normal  1  normal  0.12565  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0014  CDS  NC_010622  16752  17906  +  1155  putative aminotransferase  YP_001856256  normal  1  normal  0.167209  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0015  CDS  NC_010622  17921  18763  +  843  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  YP_001856257  normal  0.946819  normal  0.288208  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0016  CDS  NC_010622  18797  19588  +  792  extracellular solute-binding protein  YP_001856258  normal  0.62462  normal  0.384726  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0017  CDS  NC_010622  19749  20486  +  738  putative transmembrane anti-sigma factor  YP_001856259  normal  1  normal  0.481233  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0018  CDS  NC_010622  20605  21123  +  519  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  YP_001856260  normal  1  normal  0.747529  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0019  CDS  NC_010622  21120  21953  +  834  putative transmembrane anti-sigma factor  YP_001856261  normal  1  normal  0.836012  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0020  CDS  NC_010622  22125  22394  +  270  hypothetical protein  YP_001856262  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0021    NC_010622  22697  23020  +  324      normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0022  CDS  NC_010622  23411  25324  +  1914  type VI secretion protein  YP_001856263  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0023  CDS  NC_010622  25363  28020  +  2658  type VI secretion system Vgr family protein  YP_001856264  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0024  CDS  NC_010622  28054  28971  +  918  hypothetical protein  YP_001856265  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0025  CDS  NC_010622  29288  29647  +  360  hypothetical protein  YP_001856266  normal  0.569396  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0026  CDS  NC_010622  29667  30656  +  990  hypothetical protein  YP_001856267  normal  0.976247  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0027  CDS  NC_010622  31178  31582  +  405  thioesterase superfamily protein  YP_001856268  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0028  CDS  NC_010622  31634  32500  +  867  patatin  YP_001856269  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0029  CDS  NC_010622  32555  33568  -  1014  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  YP_001856270  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0030  CDS  NC_010622  33920  35776  +  1857  phosphoenolpyruvate carboxykinase  YP_001856271  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0031  CDS  NC_010622  36108  37196  +  1089  LysR family transcriptional regulator  YP_001856272  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0032  CDS  NC_010622  37341  40067  -  2727  DNA topoisomerase III  YP_001856273  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0033  CDS  NC_010622  40305  40682  -  378  thioredoxin domain-containing protein  YP_001856274  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0034  CDS  NC_010622  40737  41906  -  1170  DNA protecting protein DprA  YP_001856275  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0035  CDS  NC_010622  42162  42665  +  504  peptide deformylase  YP_001856276  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0036  CDS  NC_010622  42691  43674  +  984  methionyl-tRNA formyltransferase  YP_001856277  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0037  CDS  NC_010622  43774  44418  +  645  lysine exporter protein LysE/YggA  YP_001856278  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0038  CDS  NC_010622  44522  45379  +  858  M48 family peptidase  YP_001856279  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0039  CDS  NC_010622  45662  47023  +  1362  sun protein  YP_001856280  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0040  CDS  NC_010622  47020  47610  +  591  hypothetical protein  YP_001856281  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0041  CDS  NC_010622  47612  50023  +  2412  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001856282  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0042  CDS  NC_010622  50024  50713  +  690  two component Fis family transcriptional regulator  YP_001856283  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0043  CDS  NC_010622  51253  51984  +  732  exsB protein  YP_001856284  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0044  CDS  NC_010622  52054  52686  +  633  radical SAM domain-containing protein  YP_001856285  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0045  CDS  NC_010622  52693  53139  +  447  queuosine biosynthesis protein QueD  YP_001856286  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0046  CDS  NC_010622  53327  54109  +  783  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  YP_001856287  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0047  CDS  NC_010622  54106  54816  +  711  Sel1 domain-containing protein  YP_001856288  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0048  CDS  NC_010622  54875  56023  -  1149  rod shape-determining protein RodA  YP_001856289  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0049  CDS  NC_010622  56034  58436  -  2403  penicillin-binding protein 2  YP_001856290  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0050  CDS  NC_010622  58558  59070  -  513  rod shape-determining protein MreD  YP_001856291  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0051  CDS  NC_010622  59067  60170  -  1104  rod shape-determining protein MreC  YP_001856292  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0052  CDS  NC_010622  60289  61332  -  1044  rod shape-determining protein MreB  YP_001856293  normal  0.618949  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0053  CDS  NC_010622  61712  62011  +  300  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  YP_001856294  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0054  CDS  NC_010622  62165  63658  +  1494  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  YP_001856295  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0055  CDS  NC_010622  63660  65135  +  1476  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B  YP_001856296  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0056  CDS  NC_010622  65270  66106  +  837  hypothetical protein  YP_001856297  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0057  CDS  NC_010622  66149  66928  +  780  exodeoxyribonuclease III Xth  YP_001856298  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0058  CDS  NC_010622  66953  68167  -  1215  peptidase M48 Ste24p  YP_001856299  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0059  CDS  NC_010622  68167  69561  -  1395  major facilitator transporter  YP_001856300  normal  0.955073  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0060  CDS  NC_010622  69575  70183  -  609  methionine biosynthesis protein MetW  YP_001856301  normal  0.866888  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0061  CDS  NC_010622  70180  71325  -  1146  homoserine O-acetyltransferase  YP_001856302  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0062  CDS  NC_010622  71569  72267  -  699  nucleoid occlusion protein  YP_001856303  normal  0.249336  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0063  CDS  NC_010622  72304  73062  -  759  pyrimidine 5'-nucleotidase  YP_001856304  normal  0.264362  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0064  CDS  NC_010622  73262  74161  -  900  acetylglutamate kinase  YP_001856305  normal  0.207968  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0065  CDS  NC_010622  74476  74751  +  276  hypothetical protein  YP_001856306  normal  0.274783  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0066  CDS  NC_010622  74789  76426  -  1638  TPR repeat-containing protein  YP_001856307  normal  0.152932  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0067  CDS  NC_010622  76529  77833  +  1305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001856308  normal  0.541426  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0068  CDS  NC_010622  77830  78372  +  543  two component Fis family transcriptional regulator  YP_001856309  normal  0.207076  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0069  CDS  NC_010622  78455  79798  -  1344  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  YP_001856310  normal  0.234013  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0070  CDS  NC_010622  79808  80344  -  537  ATP-dependent protease peptidase subunit  YP_001856311  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0071  CDS  NC_010622  80718  81137  -  420  TraR/DksA family transcriptional regulator  YP_001856312  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0072  CDS  NC_010622  81752  82840  -  1089  cobalamin synthesis protein P47K  YP_001856313  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0073  CDS  NC_010622  83006  84208  -  1203  PUA domain-containing protein  YP_001856314  normal  0.891321  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0074  CDS  NC_010622  84294  85217  -  924  site-specific tyrosine recombinase XerC  YP_001856315  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0075  CDS  NC_010622  85228  85947  -  720  hypothetical protein  YP_001856316  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0076  CDS  NC_010622  86034  86894  -  861  diaminopimelate epimerase  YP_001856317  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0077  CDS  NC_010622  86949  87833  -  885  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  YP_001856318  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0078  CDS  NC_010622  88106  89293  +  1188  S-adenosylmethionine synthetase  YP_001856319  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0079  CDS  NC_010622  89507  89803  -  297  hypothetical protein  YP_001856320  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0080  CDS  NC_010622  90294  91055  +  762  phytanoyl-CoA dioxygenase  YP_001856321  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0081  CDS  NC_010622  91100  91300  -  201  hypothetical protein  YP_001856322  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0082  CDS  NC_010622  91610  92653  +  1044  aldo/keto reductase  YP_001856323  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0083  CDS  NC_010622  92765  92947  -  183  hypothetical protein  YP_001856324  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0084  CDS  NC_010622  93217  94488  -  1272  major facilitator transporter  YP_001856325  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0085  CDS  NC_010622  94454  95173  -  720  hypothetical protein  YP_001856326  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0086  CDS  NC_010622  95551  95763  +  213  hypothetical protein  YP_001856327  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0087  CDS  NC_010622  95889  96911  +  1023  serine/threonine protein kinase  YP_001856328  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0088  CDS  NC_010622  97214  97378  +  165  hypothetical protein  YP_001856329  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0089  CDS  NC_010622  97489  98517  -  1029  hypothetical protein  YP_001856330  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0090  CDS  NC_010622  98490  99071  -  582  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  YP_001856331  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0091  CDS  NC_010622  99062  100297  -  1236  VWA containing CoxE family protein  YP_001856332  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0092  CDS  NC_010622  100303  101193  -  891  ATPase  YP_001856333  normal  0.919057  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0093  CDS  NC_010622  101327  102124  -  798  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  YP_001856334  normal  0.398559  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0094  CDS  NC_010622  102137  104524  -  2388  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  YP_001856335  normal  0.852848  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0095  CDS  NC_010622  104536  105036  -  501  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  YP_001856336  normal  0.739421  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0096  CDS  NC_010622  105421  106821  -  1401  amino acid permease-associated region  YP_001856337  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0097  CDS  NC_010622  106959  107615  -  657  two component LuxR family transcriptional regulator  YP_001856338  normal  0.605108  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0098  CDS  NC_010622  107677  108543  -  867  histidine kinase  YP_001856339  normal  0.625315  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0099  CDS  NC_010622  109090  109860  -  771  oxidoreductase FAD-binding subunit  YP_001856340  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_0100  CDS  NC_010622  110381  111022  -  642  lysine exporter protein LysE/YggA  YP_001856341  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 79    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>