170 genes were found for organism Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Caul_5292  CDS  NC_010333  285  1859  1575  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  YP_001672071  normal  normal  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5293  CDS  NC_010333  2018  2218  201  transposase (class III)  YP_001672072  normal  normal  0.923099  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5294  CDS  NC_010333  2709  3515  807  integrase family protein  YP_001672073  normal  normal  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5295  CDS  NC_010333  3496  3990  495  hypothetical protein  YP_001672074  normal  normal  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5296  CDS  NC_010333  4405  5673  1269  cytochrome P450  YP_001672075  normal  normal  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5297  CDS  NC_010333  5701  7359  1659  FAD dependent oxidoreductase  YP_001672076  normal  normal  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5298  CDS  NC_010333  7364  8974  1611  acyl-CoA synthetase  YP_001672077  normal  normal  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5299  CDS  NC_010333  8986  10074  1089  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  YP_001672078  normal  0.797236  normal  0.678656  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5300  CDS  NC_010333  10074  11282  1209  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  YP_001672079  normal  normal  0.712748  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5301  CDS  NC_010333  11332  11763  432  hypothetical protein  YP_001672080  normal  normal  0.653983  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5302  CDS  NC_010333  11769  12935  1167  putative nonspecific lipid-transfer protein  YP_001672081  normal  normal  0.739228  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5303  CDS  NC_010333  12992  14086  1095  alcohol dehydrogenase  YP_001672082  normal  0.803168  normal  0.725419  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5304  CDS  NC_010333  14233  14808  576  carboxymuconolactone decarboxylase  YP_001672083  normal  0.377989  normal  0.661983  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5305  CDS  NC_010333  14838  15689  852  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  YP_001672084  normal  0.0297084  normal  0.691461  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5306  CDS  NC_010333  15698  17734  2037  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  YP_001672085  normal  0.0503962  normal  0.110792  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5307  CDS  NC_010333  17757  18524  768  IclR family transcriptional regulator  YP_001672086  normal  0.144609  normal  0.0901346  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5308  CDS  NC_010333  18539  18982  444  thioesterase superfamily protein  YP_001672087  normal  0.218824  normal  0.0896722  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5309  CDS  NC_010333  19001  20143  1143  2-nitropropane dioxygenase NPD  YP_001672088  normal  normal  0.1832  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5310  CDS  NC_010333  20193  21002  810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  YP_001672089  normal  normal  0.181246  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5311  CDS  NC_010333  21168  22025  858  alpha/beta hydrolase fold  YP_001672090  normal  normal  0.106317  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5312  CDS  NC_010333  22446  22859  414  integrase/recombinase  YP_001672091  normal  normal  0.169843  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5313  CDS  NC_010333  22877  23230  354  response regulator receiver protein  YP_001672092  normal  0.90998  normal  0.171465  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5314  CDS  NC_010333  23376  23696  321  type IV pilus assembly PilZ  YP_001672093  normal  0.947891  normal  0.173027  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5315  CDS  NC_010333  23833  24267  435  response regulator receiver protein  YP_001672094  normal  0.813269  normal  0.296683  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5316  CDS  NC_010333  24254  27463  3210  multi-sensor hybrid histidine kinase  YP_001672095  normal  0.72275  normal  0.481403  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5317  CDS  NC_010333  27883  28803  921  integrase catalytic region  YP_001672096  normal  0.0707814  normal  0.862383  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5318  CDS  NC_010333  28970  29395  426  hypothetical protein  YP_001672097  normal  0.0503726  normal  0.811239  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5319  CDS  NC_010333  29529  29942  414  response regulator receiver protein  YP_001672098  normal  0.0886883  normal  0.780288  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5320  CDS  NC_010333  29932  32643  2712  multi-sensor hybrid histidine kinase  YP_001672099  normal  0.544718  normal  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5321  CDS  NC_010333  32984  33238  255  putative sensory transduction regulatory protein  YP_001672100  normal  0.563131  normal  0.70291  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5322  CDS  NC_010333  33469  33762  294  hypothetical protein  YP_001672101  normal  0.642861  normal  0.725419  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5323    NC_010333  34453  34803  351      normal  normal  0.736716  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5324  CDS  NC_010333  34800  35120  321  hypothetical protein  YP_001672102  normal  0.747548  normal  0.709668  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5325  CDS  NC_010333  35258  35851  594  hypothetical protein  YP_001672103  normal  0.969651  normal  0.742207  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5326  CDS  NC_010333  35963  36910  948  beta-lactamase domain-containing protein  YP_001672104  normal  normal  0.524715  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5327  CDS  NC_010333  37119  37520  402  hypothetical protein  YP_001672105  normal  normal  0.495145  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5328  CDS  NC_010333  37510  37761  252  hypothetical protein  YP_001672106  normal  normal  0.495145  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5329  CDS  NC_010333  37901  39124  1224  hypothetical protein  YP_001672107  normal  normal  0.54087  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5330  CDS  NC_010333  39121  40083  963  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  YP_001672108  normal  normal  0.548363  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5331  CDS  NC_010333  40137  42113  1977  TRAG family protein  YP_001672109  normal  normal  0.390385  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5332  CDS  NC_010333  42128  43624  1497  MobA/MobL protein  YP_001672110  normal  normal  0.873373  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5333  CDS  NC_010333  43884  44570  687  hypothetical protein  YP_001672111  normal  0.479724  normal  0.815278  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5334  CDS  NC_010333  44567  45469  903  hypothetical protein  YP_001672112  normal  0.632965  normal  0.811239  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5335  CDS  NC_010333  45469  46008  540  conjugal transfer protein TraF  YP_001672113  normal  normal  0.490398  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5336  CDS  NC_010333  46318  47349  1032  parB-like partition protein  YP_001672114  normal  normal  0.557995  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5337  CDS  NC_010333  47362  48567  1206  cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_001672115  normal  0.684044  normal  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5338  CDS  NC_010333  48876  49841  966  plasmid replication initiator protein-like protein  YP_001672116  normal  0.522941  normal  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5339  CDS  NC_010333  50088  50456  369  single-strand binding protein  YP_001672117  normal  0.257565  normal  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5340  CDS  NC_010333  51281  51502  222  hypothetical protein  YP_001672118  normal  0.341581  normal  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5341  CDS  NC_010333  52160  53092  933  hypothetical protein  YP_001672119  normal  normal  0.725419  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5342  CDS  NC_010333  53686  54027  342  XRE family transcriptional regulator  YP_001672120  normal  normal  0.987751  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5343  CDS  NC_010333  54176  54508  333  XRE family transcriptional regulator  YP_001672121  normal  normal  0.992998  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5344  CDS  NC_010333  54501  55748  1248  HipA domain-containing protein  YP_001672122  normal  normal  0.71584  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5345  CDS  NC_010333  55855  56109  255  hypothetical protein  YP_001672123  normal  normal  0.629231  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5346  CDS  NC_010333  56253  57014  762  DNA repair protein RadC  YP_001672124  normal  normal  0.67199  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5347  CDS  NC_010333  57157  57561  405  antirestriction protein-like protein  YP_001672125  normal  normal  0.642698  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5348  CDS  NC_010333  57564  58556  993  integrase family protein  YP_001672126  normal  normal  0.464558  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5349  CDS  NC_010333  58553  59494  942  integrase family protein  YP_001672127  normal  normal  0.447665  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5350  CDS  NC_010333  59491  60702  1212  integrase family protein  YP_001672128  normal  normal  0.467969  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5351  CDS  NC_010333  60762  61424  663  hypothetical protein  YP_001672129  normal  normal  0.666575  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5352  CDS  NC_010333  61573  65838  4266  methylase/helicase  YP_001672130  normal  normal  0.686845  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5353  CDS  NC_010333  65981  66361  381  hypothetical protein  YP_001672131  normal  normal  0.40891  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5354  CDS  NC_010333  66368  66634  267  prevent-host-death family protein  YP_001672132  normal  normal  0.250288  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5355  CDS  NC_010333  66798  68855  2058  hypothetical protein  YP_001672133  normal  normal  0.323781  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5356  CDS  NC_010333  68979  69872  894  hypothetical protein  YP_001672134  normal  normal  0.285049  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5357  CDS  NC_010333  70328  70663  336  hypothetical protein  YP_001672135  normal  normal  0.245972  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5358  CDS  NC_010333  70795  71916  1122  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_001672136  normal  normal  0.0901346  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5359  CDS  NC_010333  72407  72802  396  hypothetical protein  YP_001672137  normal  normal  0.0784591  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5360  CDS  NC_010333  72799  73299  501  hypothetical protein  YP_001672138  normal  normal  0.0813424  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5361  CDS  NC_010333  73303  73623  321  AbrB family transcriptional regulator  YP_001672139  normal  normal  0.0760953  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5362  CDS  NC_010333  73782  74375  594  mobile mystery protein B  YP_001672140  normal  normal  0.088226  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5363  CDS  NC_010333  74372  74836  465  mobile mystery protein A  YP_001672141  normal  normal  0.084336  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5364  CDS  NC_010333  74947  76353  1407  hypothetical protein  YP_001672142  normal  0.151577  normal  0.179584  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5365  CDS  NC_010333  77070  77324  255  hypothetical protein  YP_001672143  normal  0.175889  normal  0.255362  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5366  CDS  NC_010333  77326  77664  339  hypothetical protein  YP_001672144  normal  0.115194  normal  0.419295  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5367  CDS  NC_010333  77675  78931  1257  conjugation TrbI family protein  YP_001672145  normal  0.196515  normal  0.456411  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5368  CDS  NC_010333  78935  79972  1038  P-type conjugative transfer protein TrbG  YP_001672146  normal  0.151828  normal  0.266795  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5369  CDS  NC_010333  79969  80652  684  conjugal transfer protein TrbF  YP_001672147  normal  0.682768  normal  0.410714  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5370  CDS  NC_010333  80679  81992  1314  P-type conjugative transfer protein TrbL  YP_001672148  normal  0.228409  normal  0.443323  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5371  CDS  NC_010333  82220  82942  723  P-type conjugative transfer protein TrbJ  YP_001672149  normal  0.15162  normal  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5372  CDS  NC_010333  83300  85774  2475  conjugal transfer ATPase TrbE  YP_001672150  normal  0.259729  normal  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5373  CDS  NC_010333  85872  86138  267  type IV secretory pathway VirB3 family protein  YP_001672151  normal  0.0987094  normal  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5374  CDS  NC_010333  86140  86496  357  conjugal transfer protein TrbC  YP_001672152  normal  0.18687  normal  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5375  CDS  NC_010333  86568  86885  318  hypothetical protein  YP_001672153  normal  0.392977  normal  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5376  CDS  NC_010333  86885  87076  192  hypothetical protein  YP_001672154  normal  0.238869  normal  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5377    NC_010333  87511  87813  303      normal  0.0636502  normal  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5378    NC_010333  87792  88218  427      normal  0.0240344  normal  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5379  CDS  NC_010333  88389  89837  1449  RND efflux system outer membrane lipoprotein  YP_001672155  normal  0.320478  normal  0.694464  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5380  CDS  NC_010333  90015  90608  594  TetR family transcriptional regulator  YP_001672156  normal  0.768843  normal  0.61228  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5381  CDS  NC_010333  90598  91692  1095  RND family efflux transporter MFP subunit  YP_001672157  normal  0.996751  normal  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5382  CDS  NC_010333  91689  94976  3288  acriflavin resistance protein  YP_001672158  normal  0.651805  normal  0.619486  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5383  CDS  NC_010333  95221  95691  471  late embryogenesis abundant protein  YP_001672159  normal  normal  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5384  CDS  NC_010333  95747  96223  477  hypothetical protein  YP_001672160  normal  normal  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5385  CDS  NC_010333  96706  97254  549  ATP-dependent transcription regulator LuxR  YP_001672161  normal  normal  0.983573  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5386  CDS  NC_010333  97523  97870  348  transposase IS3/IS911 family protein  YP_001672162  normal  normal  0.946691  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5387  CDS  NC_010333  97867  98214  348  IS66 Orf2 family protein  YP_001672163  normal  normal  0.936654  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5388  CDS  NC_010333  98285  99973  1689  transposase IS66  YP_001672164  normal  normal  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5389  CDS  NC_010333  99989  100792  804  regulatory protein, LuxR  YP_001672165  normal  normal  0.621968  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5390  CDS  NC_010333  101034  101603  570  TetR family transcriptional regulator  YP_001672166  normal  normal  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5391  CDS  NC_010333  101710  102090  381  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001672167  normal  normal  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>