5515 genes were found for organism Caulobacter sp. K31



Page 1 of 56    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Caul_0001  CDS  NC_010338  389  1852  +  1464  chromosomal replication initiation protein  YP_001681637  normal  0.775334  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0002  CDS  NC_010338  2016  2654  -  639  2OG-Fe(II) oxygenase  YP_001681638  normal  0.691503  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0003  CDS  NC_010338  2749  5409  +  2661  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  YP_001681639  normal  0.350265  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0004  CDS  NC_010338  5803  7698  +  1896  molecular chaperone DnaK  YP_001681640  normal  0.0827361  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0005  CDS  NC_010338  7890  8351  +  462  hypothetical protein  YP_001681641  normal  0.120217  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0006  CDS  NC_010338  8388  9536  +  1149  chaperone protein DnaJ  YP_001681642  normal  0.359061  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0007  CDS  NC_010338  9533  10543  -  1011  putative DNA-binding protein  YP_001681643  normal  0.341702  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0008  CDS  NC_010338  10642  13356  +  2715  DNA mismatch repair protein MutS  YP_001681644  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0009  CDS  NC_010338  13433  16258  +  2826  PII uridylyl-transferase  YP_001681645  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0010  CDS  NC_010338  17391  17726  -  336  hypothetical protein  YP_001681646  normal  0.249727  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0011  CDS  NC_010338  18125  19681  +  1557  integral membrane protein MviN  YP_001681647  normal  0.0453851  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0012  CDS  NC_010338  20020  21054  +  1035  tryptophanyl-tRNA synthetase  YP_001681648  decreased coverage  0.00178071  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0013  CDS  NC_010338  21091  21498  -  408  ferric uptake regulator family protein  YP_001681649  hitchhiker  0.00124444  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0014  CDS  NC_010338  21545  21988  -  444  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  YP_001681650  hitchhiker  0.00268172  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0015  CDS  NC_010338  21985  22626  -  642  peptidase M22 glycoprotease  YP_001681651  hitchhiker  0.00456768  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0016  CDS  NC_010338  22623  23276  -  654  hypothetical protein  YP_001681652  hitchhiker  0.00437073  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0017  CDS  NC_010338  23281  23934  -  654  hypothetical protein  YP_001681653  normal  0.014008  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0018  CDS  NC_010338  24099  24686  -  588  hypothetical protein  YP_001681654  normal  0.0309934  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0019  CDS  NC_010338  24846  25415  -  570  scaffold protein Nfu/NifU  YP_001681655  normal  0.01661  normal  0.743316  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0020  CDS  NC_010338  25534  26802  +  1269  cytochrome P450  YP_001681656  normal  0.0467456  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0021  CDS  NC_010338  26966  28318  +  1353  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  YP_001681657  normal  0.0814495  normal  0.787059  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0022  CDS  NC_010338  28315  29259  +  945  PhoH family protein  YP_001681658  normal  0.123804  normal  0.726212  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0023  CDS  NC_010338  29260  29748  +  489  hypothetical protein  YP_001681659  normal  0.0474552  normal  0.677353  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0024  CDS  NC_010338  29760  30674  +  915  CBS domain-containing protein  YP_001681660  normal  0.307011  normal  0.720082  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0025  CDS  NC_010338  30671  32257  +  1587  apolipoprotein N-acyltransferase  YP_001681661  normal  0.129672  normal  0.499637  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0026  CDS  NC_010338  32306  32740  +  435  XRE family transcriptional regulator  YP_001681662  normal  0.153059  normal  0.660956  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0027  CDS  NC_010338  32867  34090  +  1224  S-adenosylmethionine synthetase  YP_001681663  normal  0.114949  normal  0.726212  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0028  CDS  NC_010338  34182  34862  +  681  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  YP_001681664  normal  0.125198  normal  0.674789  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0029  CDS  NC_010338  34925  35458  -  534  inorganic pyrophosphatase  YP_001681665  normal  0.360391  normal  0.680332  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0030  CDS  NC_010338  35779  36378  +  600  hypothetical protein  YP_001681666  normal  0.906317  normal  0.667348  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0031  CDS  NC_010338  36381  38087  +  1707  transcription elongation factor NusA  YP_001681667  normal  1  normal  0.351795  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0032  CDS  NC_010338  38142  38807  +  666  hypothetical protein  YP_001681668  normal  1  normal  0.306313  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0033  CDS  NC_010338  39009  42146  +  3138  translation initiation factor IF-2  YP_001681669  normal  1  normal  0.286863  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0034  CDS  NC_010338  42282  42797  +  516  hypothetical protein  YP_001681670  normal  0.966463  normal  0.181454  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0035  CDS  NC_010338  42821  43375  +  555  hypothetical protein  YP_001681671  normal  0.798732  normal  0.18247  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0036  CDS  NC_010338  43559  45103  +  1545  TPR repeat-containing protein  YP_001681672  normal  0.83786  normal  0.225653  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0037  CDS  NC_010338  45328  46116  +  789  dienelactone hydrolase  YP_001681673  normal  0.889494  normal  0.444574  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0038  CDS  NC_010338  46237  46731  +  495  ribosome-binding factor A  YP_001681674  normal  0.623045  normal  0.446494  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0039  CDS  NC_010338  46734  47666  +  933  tRNA pseudouridine synthase B  YP_001681675  normal  0.651075  normal  0.326168  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0040  CDS  NC_010338  47681  47950  +  270  30S ribosomal protein S15  YP_001681676  normal  0.431761  normal  0.280394  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0041  CDS  NC_010338  48198  50348  +  2151  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  YP_001681677  normal  0.382985  normal  0.134416  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0042  CDS  NC_010338  51024  51743  -  720  ribonuclease T2  YP_001681678  normal  0.389135  normal  0.181454  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0043  CDS  NC_010338  51941  52573  -  633  lysine exporter protein LysE/YggA  YP_001681679  normal  0.822659  normal  0.173523  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0044  CDS  NC_010338  53347  55731  +  2385  TonB-dependent siderophore receptor  YP_001681680  normal  1  normal  0.236212  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0045  CDS  NC_010338  55826  56509  +  684  putative hydroxylase  YP_001681681  normal  0.635627  normal  0.44842  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0046  CDS  NC_010338  56597  59302  +  2706  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  YP_001681682  normal  0.135172  normal  0.385882  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0047  CDS  NC_010338  59376  61037  +  1662  general substrate transporter  YP_001681683  normal  0.252827  normal  0.746127  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0048  CDS  NC_010338  61063  61941  -  879  siroheme synthase  YP_001681684  normal  0.16033  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0049  CDS  NC_010338  62085  62651  +  567  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  YP_001681685  normal  0.0706173  normal  0.653074  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0050  CDS  NC_010338  62648  64834  +  2187  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  YP_001681686  normal  0.151255  normal  0.855639  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0051  CDS  NC_010338  64928  65671  +  744  LuxR family transcriptional regulator  YP_001681687  normal  0.0498037  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0052  CDS  NC_010338  65746  66093  +  348  hypothetical protein  YP_001681688  normal  0.209817  normal  0.976984  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0053  CDS  NC_010338  66155  66373  +  219  hypothetical protein  YP_001681689  normal  0.313981  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0054  CDS  NC_010338  66437  66868  +  432  hypothetical protein  YP_001681690  normal  0.233107  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0055  CDS  NC_010338  66892  67497  -  606  hypothetical protein  YP_001681691  normal  0.447473  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0056  CDS  NC_010338  67526  68572  +  1047  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  YP_001681692  normal  0.0808361  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0057  CDS  NC_010338  68575  68814  +  240  molybdopterin converting factor, subunit 1  YP_001681693  normal  0.116564  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0058  CDS  NC_010338  68811  69251  +  441  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  YP_001681694  normal  0.0904514  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0059  CDS  NC_010338  69263  69817  +  555  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  YP_001681695  normal  0.0728283  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0060  CDS  NC_010338  69814  70284  +  471  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  YP_001681696  normal  0.199942  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0061  CDS  NC_010338  70290  71303  -  1014  hypothetical protein  YP_001681697  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0062  CDS  NC_010338  71398  72273  +  876  bifunctional regulator KidO  YP_001681698  normal  0.99559  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0063  CDS  NC_010338  72339  73043  +  705  acylneuraminate cytidylyltransferase  YP_001681699  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0064  CDS  NC_010338  73155  74267  -  1113  alanine dehydrogenase  YP_001681700  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0065  CDS  NC_010338  74388  74861  +  474  AsnC family transcriptional regulator  YP_001681701  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0066  CDS  NC_010338  74945  75772  +  828  carbonic anhydrase  YP_001681702  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0067  CDS  NC_010338  75991  81039  +  5049  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  YP_001681703  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0068  CDS  NC_010338  81219  83261  +  2043  penicillin-binding protein 1C  YP_001681704  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0069  CDS  NC_010338  83519  84340  +  822  flagellin domain-containing protein  YP_001681705  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0070  CDS  NC_010338  84480  85106  -  627  carbonate dehydratase  YP_001681706  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0071  CDS  NC_010338  85099  85752  -  654  maleylacetoacetate isomerase  YP_001681707  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0072  CDS  NC_010338  85752  86429  -  678  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  YP_001681708  normal  0.620736  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0073  CDS  NC_010338  86658  87536  +  879  ABC transporter related  YP_001681709  normal  0.403382  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0074  CDS  NC_010338  87536  91186  +  3651  hypothetical protein  YP_001681710  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0075  CDS  NC_010338  91183  91635  +  453  thioesterase superfamily protein  YP_001681711  normal  1  normal  0.829882  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0076  CDS  NC_010338  91725  92324  -  600  hypothetical protein  YP_001681712  normal  1  normal  0.580617  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0077  CDS  NC_010338  92446  93642  +  1197  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  YP_001681713  normal  1  normal  0.641646  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0078  CDS  NC_010338  93642  94061  +  420  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  YP_001681714  normal  1  normal  0.55179  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0079  CDS  NC_010338  94113  96032  -  1920  signal transduction histidine kinase  YP_001681715  normal  1  normal  0.464916  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0080  CDS  NC_010338  96222  96608  +  387  hypothetical protein  YP_001681716  normal  1  normal  0.221108  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0081  CDS  NC_010338  96605  97000  +  396  hypothetical protein  YP_001681717  normal  1  normal  0.216447  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0082  CDS  NC_010338  97093  97710  +  618  superoxide dismutase  YP_001681718  normal  1  normal  0.078547  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0083  CDS  NC_010338  97734  98594  -  861  metallophosphoesterase  YP_001681719  normal  1  normal  0.0874822  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0084  CDS  NC_010338  98591  99457  -  867  diacylglycerol kinase catalytic region  YP_001681720  normal  1  normal  0.0847561  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0085  CDS  NC_010338  99577  99918  +  342  17 kDa surface antigen  YP_001681721  normal  1  normal  0.129787  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0086  CDS  NC_010338  100001  100471  +  471  OmpA/MotB domain-containing protein  YP_001681722  normal  1  normal  0.131489  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0087  CDS  NC_010338  100797  101009  +  213  hypothetical protein  YP_001681723  normal  1  normal  0.0366409  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0088  CDS  NC_010338  101020  101271  +  252  hypothetical protein  YP_001681724  normal  1  normal  0.0362517  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0089  CDS  NC_010338  101360  102160  -  801  two-component response regulator  YP_001681725  normal  1  normal  0.0453236  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0090  CDS  NC_010338  102405  102590  +  186  hypothetical protein  YP_001681726  normal  0.81517  normal  0.0401934  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0091  CDS  NC_010338  102593  103198  +  606  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  YP_001681727  normal  1  normal  0.043222  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0092  CDS  NC_010338  103195  104907  +  1713  signal transduction histidine kinase  YP_001681728  normal  1  normal  0.0277499  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0093  CDS  NC_010338  104974  105108  +  135  entericidin EcnAB  YP_001681729  normal  0.805686  normal  0.0204354  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0094  CDS  NC_010338  105378  106439  +  1062  hypothetical protein  YP_001681730  normal  1  normal  0.0247866  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0095  CDS  NC_010338  106458  107285  -  828  MCP methyltransferase, CheR-type  YP_001681731  normal  1  normal  0.0489946  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0096  CDS  NC_010338  107282  107647  -  366  response regulator receiver protein  YP_001681732  normal  1  normal  0.0434623  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0097  CDS  NC_010338  107735  108427  -  693  hypothetical protein  YP_001681733  normal  1  normal  0.0423469  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0098  CDS  NC_010338  108507  108692  +  186  hypothetical protein  YP_001681734  normal  0.97718  normal  0.124135  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0099  CDS  NC_010338  108693  109469  +  777  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  YP_001681735  normal  0.58993  normal  0.140317  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0100  CDS  NC_010338  109905  110375  -  471  hypothetical protein  YP_001681736  normal  1  normal  0.131489  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 56    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>