53 genes were found for organism Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Pnap_4760  CDS  NC_008761  1158  1565  408  hypothetical protein  YP_973911  normal  0.0475052  normal  0.112354  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4761  CDS  NC_008761  1583  2455  873  mucin-associated surface protein  YP_973912  normal  0.0858649  normal  0.123675  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4762  CDS  NC_008761  3682  3879  198  hypothetical protein  YP_973913  normal  0.132493  normal  0.167294  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4763  CDS  NC_008761  4046  4534  489  hypothetical protein  YP_973914  normal  0.828975  normal  0.240544  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4764  CDS  NC_008761  4584  5000  417  PilT domain-containing protein  YP_973915  normal  normal  0.310304  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4765  CDS  NC_008761  4997  5251  255  plasmid stabilization protein  YP_973916  normal  normal  0.218672  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4766  CDS  NC_008761  5451  5756  306  hypothetical protein  YP_973917  normal  normal  0.39172  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4767  CDS  NC_008761  5856  6098  243  phage tail collar domain-containing protein  YP_973918  normal  normal  0.428551  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4768  CDS  NC_008761  6621  7325  705  hypothetical protein  YP_973919  normal  normal  0.532508  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4769  CDS  NC_008761  7325  7567  243  ExeA-like protein  YP_973920  normal  normal  0.43553  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4770  CDS  NC_008761  7747  8313  567  Tn5044 transposase  YP_973921  normal  normal  0.653954  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4771  CDS  NC_008761  8670  9197  528  hypothetical protein  YP_973922  normal  normal  0.648636  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4772  CDS  NC_008761  9239  10309  1071  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  YP_973923  normal  normal  0.826591  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4773  CDS  NC_008761  10458  10760  303  hypothetical protein  YP_973924  normal  normal  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4774  CDS  NC_008761  11708  12745  1038  TrfA family protein  YP_973925  normal  normal  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4775  CDS  NC_008761  12820  13128  309  hypothetical protein  YP_973926  normal  normal  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4776  CDS  NC_008761  13125  13754  630  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_973927  normal  0.74468  normal  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4777  CDS  NC_008761  14048  15601  1554  N-6 DNA methylase  YP_973928  normal  0.797401  normal  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4778  CDS  NC_008761  15591  16838  1248  restriction modification system DNA specificity subunit  YP_973929  normal  0.16943  normal  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4779  CDS  NC_008761  16835  17920  1086  hypothetical protein  YP_973930  normal  0.975397  normal  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4780  CDS  NC_008761  18013  18414  402  hypothetical protein  YP_973931  normal  0.533353  normal  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4781  CDS  NC_008761  18461  19348  888  hypothetical protein  YP_973932  normal  0.699787  normal  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4782  CDS  NC_008761  19345  22434  3090  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  YP_973933  normal  normal  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4783  CDS  NC_008761  22591  23646  1056  hypothetical protein  YP_973934  normal  0.269518  normal  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4784  CDS  NC_008761  23770  24048  279  hypothetical protein  YP_973935  normal  normal  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4785  CDS  NC_008761  24090  24344  255  hypothetical protein  YP_973936  normal  normal  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4786  CDS  NC_008761  24402  24602  201  hypothetical protein  YP_973937  normal  normal  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4787  CDS  NC_008761  24931  25662  732  IstB ATP binding domain-containing protein  YP_973938  normal  normal  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4788  CDS  NC_008761  25704  27242  1539  integrase catalytic subunit  YP_973939  normal  normal  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4789  CDS  NC_008761  27680  28204  525  hypothetical protein  YP_973940  normal  normal  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4790  CDS  NC_008761  28201  28617  417  hypothetical protein  YP_973941  normal  normal  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4791  CDS  NC_008761  28607  29371  765  hypothetical protein  YP_973942  normal  normal  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4792  CDS  NC_008761  29627  30814  1188  hypothetical protein  YP_973943  normal  normal  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4793  CDS  NC_008761  30822  31463  642  hypothetical protein  YP_973944  normal  normal  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4794  CDS  NC_008761  31549  32130  582  resolvase domain-containing protein  YP_973945  normal  normal  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4795  CDS  NC_008761  32650  38079  5430  hypothetical protein  YP_973946  normal  normal  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4796  CDS  NC_008761  38473  38901  429  hypothetical protein  YP_973947  normal  0.926961  normal  0.928025  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4797  CDS  NC_008761  38898  39350  453  hypothetical protein  YP_973948  normal  normal  0.761912  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4798  CDS  NC_008761  39355  40350  996  phage integrase family protein  YP_973949  normal  normal  0.586427  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4799  CDS  NC_008761  40363  41442  1080  DNA/RNA non-specific endonuclease  YP_973950  normal  normal  0.313673  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4800  CDS  NC_008761  41897  49429  7533  zinc finger, CHC2-family protein  YP_973951  normal  normal  0.0650684  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4801  CDS  NC_008761  49675  51168  1494  transposase, IS4 family protein  YP_973952  decreased coverage  0.00542003  normal  0.0251535  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4802  CDS  NC_008761  51354  51734  381  PilT domain-containing protein  YP_973953  hitchhiker  0.005118  normal  0.0206517  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4803  CDS  NC_008761  51731  51937  207  hypothetical protein  YP_973954  normal  0.0192558  normal  0.0179772  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4804  CDS  NC_008761  52074  53060  987  hypothetical protein  YP_973955  normal  normal  0.0209075  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4805  CDS  NC_008761  53528  54088  561  hypothetical protein  YP_973956  normal  normal  0.0150793  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4806  CDS  NC_008761  54174  55154  981  hypothetical protein  YP_973957  normal  0.567164  hitchhiker  0.00543977  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4807  CDS  NC_008761  55410  55634  225  helix-turn-helix domain-containing protein  YP_973958  normal  0.125806  hitchhiker  0.00510188  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4808  CDS  NC_008761  55758  56309  552  hypothetical protein  YP_973959  normal  0.614132  hitchhiker  0.00504868  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4809    NC_008761  56312  57081  770      normal  0.49964  hitchhiker  0.00283414  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4810  CDS  NC_008761  57078  57341  264  hypothetical protein  YP_973960  normal  0.0802082  hitchhiker  0.00240732  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4811  CDS  NC_008761  57390  57596  207  putative transcriptional regulator  YP_973961  normal  0.0622579  hitchhiker  0.00296923  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4812  CDS  NC_008761  57909  58718  810  hypothetical protein  YP_973962  normal  0.430232  hitchhiker  0.00508797  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>