171 genes were found for organism Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Pnap_4440  CDS  NC_008758  402  641  +  240  hypothetical protein  YP_973459  normal  0.0289392  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4441  CDS  NC_008758  850  2157  +  1308  hypothetical protein  YP_973460  normal  0.0268222  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4442  CDS  NC_008758  2160  2741  +  582  hypothetical protein  YP_973461  normal  0.520896  normal  0.812467  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4443  CDS  NC_008758  2738  5578  +  2841  hypothetical protein  YP_973462  normal  1  normal  0.67216  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4444  CDS  NC_008758  5575  6525  +  951  hypothetical protein  YP_973463  normal  0.767619  normal  0.17831  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4445  CDS  NC_008758  6606  6926  -  321  hypothetical protein  YP_973464  normal  0.622262  normal  0.145764  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4446  CDS  NC_008758  7274  8443  +  1170  hypothetical protein  YP_973465  normal  0.178  normal  0.138408  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4447  CDS  NC_008758  8927  9319  +  393  transposase IS3/IS911 family protein  YP_973466  normal  0.151096  normal  0.0837239  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4448  CDS  NC_008758  9316  9657  +  342  IS66 Orf2 family protein  YP_973467  normal  0.657267  normal  0.0820923  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4449  CDS  NC_008758  9739  11325  +  1587  transposase IS66  YP_973468  normal  0.543683  normal  0.0438734  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4450    NC_008758  11491  11849  -  359      normal  0.233098  normal  0.0261284  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4451  CDS  NC_008758  12108  12353  -  246  hypothetical protein  YP_973469  normal  0.0601744  normal  0.0168193  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4452  CDS  NC_008758  12777  12968  +  192  addiction module antitoxin  YP_973470  normal  0.128999  hitchhiker  0.00983141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4453  CDS  NC_008758  13006  13941  +  936  hypothetical protein  YP_973471  normal  0.276043  hitchhiker  0.00572017  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4454  CDS  NC_008758  13938  14189  +  252  hypothetical protein  YP_973472  normal  0.186093  hitchhiker  0.00392795  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4455  CDS  NC_008758  14186  15907  +  1722  hypothetical protein  YP_973473  normal  0.169873  hitchhiker  0.00310728  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4456  CDS  NC_008758  16794  17612  -  819  hypothetical protein  YP_973474  normal  0.169598  hitchhiker  0.000128626  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4457  CDS  NC_008758  18089  18520  +  432  hypothetical protein  YP_973475  normal  0.681029  hitchhiker  0.0000888949  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4458  CDS  NC_008758  18685  19140  +  456  hypothetical protein  YP_973476  normal  0.887881  hitchhiker  0.0000445296  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4459  CDS  NC_008758  19312  19848  +  537  hypothetical protein  YP_973477  normal  1  hitchhiker  0.00000900711  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4460  CDS  NC_008758  20136  20393  +  258  hypothetical protein  YP_973478  normal  1  hitchhiker  0.00000315529  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4461  CDS  NC_008758  21293  22660  +  1368  hypothetical protein  YP_973479  normal  0.51239  hitchhiker  0.000000163815  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4462  CDS  NC_008758  23343  23999  +  657  hypothetical protein  YP_973480  normal  1  hitchhiker  0.00000000206181  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4463  CDS  NC_008758  24543  25442  +  900  hypothetical protein  YP_973481  normal  1  hitchhiker  0.000000000037222  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4464  CDS  NC_008758  25439  25990  +  552  hypothetical protein  YP_973482  normal  1  hitchhiker  0.00000000000102719  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4465  CDS  NC_008758  25984  26301  +  318  hypothetical protein  YP_973483  normal  1  hitchhiker  0.000000000000744253  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4466  CDS  NC_008758  26298  26645  +  348  hypothetical protein  YP_973484  normal  1  hitchhiker  0.000000000000137092  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4467  CDS  NC_008758  26973  27188  +  216  hypothetical protein  YP_973485  normal  0.763052  hitchhiker  0.0000000000000179875  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4468  CDS  NC_008758  28632  29723  -  1092  parB-like partition proteins  YP_973486  normal  0.99602  hitchhiker  7.6726e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4469  CDS  NC_008758  30096  31088  +  993  Rad3-related DNA helicases-like protein  YP_973487  normal  0.0968334  hitchhiker  7.6564e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4470  CDS  NC_008758  31163  32176  -  1014  TrfA  YP_973488  hitchhiker  0.00253708  hitchhiker  4.02006e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4471  CDS  NC_008758  33169  34173  -  1005  parB-like partition proteins  YP_973489  hitchhiker  0.00000480201  decreased coverage  1.87892e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4472  CDS  NC_008758  34170  34868  -  699  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_973490  unclonable  0.0000000000116025  unclonable  2.19652e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4473  CDS  NC_008758  36177  38006  -  1830  phage integrase family protein  YP_973491  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4474    NC_008758  38498  38910  -  413      normal  0.0414937  hitchhiker  3.91435e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4475  CDS  NC_008758  39859  41004  -  1146  histidine kinase  YP_973492  normal  1  hitchhiker  0.000000000000400204  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4476  CDS  NC_008758  41278  41568  -  291  hypothetical protein  YP_973493  normal  0.922582  hitchhiker  0.00000000138128  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4477    NC_008758  41574  41747  +  174      normal  1  hitchhiker  0.00000000450731  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4478    NC_008758  41842  43286  -  1445      normal  1  hitchhiker  0.000000164932  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4479  CDS  NC_008758  43641  46463  -  2823  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  YP_973494  normal  1  hitchhiker  0.00000467097  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4480  CDS  NC_008758  46580  46798  -  219  putative transposase  YP_973495  normal  1  hitchhiker  0.00000754165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4481  CDS  NC_008758  46898  48223  +  1326  hypothetical protein  YP_973496  normal  0.579978  hitchhiker  0.0000396419  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4482  CDS  NC_008758  48225  48509  -  285  transposase family protein  YP_973497  normal  0.584954  hitchhiker  0.00016401  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4483  CDS  NC_008758  48509  49057  -  549  hypothetical protein  YP_973498  normal  0.675401  hitchhiker  0.000216351  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4484  CDS  NC_008758  49497  49931  +  435  transposase, IS4 family protein  YP_973499  normal  0.604726  hitchhiker  0.00217113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4485  CDS  NC_008758  50164  51234  +  1071  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_973500  normal  0.218146  hitchhiker  0.00890094  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4486  CDS  NC_008758  52320  52772  +  453  hypothetical protein  YP_973501  normal  0.111572  normal  0.0535541  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4487  CDS  NC_008758  53119  53355  +  237  heavy metal transport/detoxification protein  YP_973502  normal  0.206644  normal  0.0472192  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4488  CDS  NC_008758  53352  54212  +  861  hypothetical protein  YP_973503  normal  0.521418  normal  0.0804877  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4489  CDS  NC_008758  54236  54673  +  438  heavy metal transport/detoxification protein  YP_973504  normal  0.485283  normal  0.0949598  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4490  CDS  NC_008758  54761  55153  +  393  hypothetical protein  YP_973505  normal  0.649718  normal  0.0933812  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4491  CDS  NC_008758  55228  57897  +  2670  copper-translocating P-type ATPase  YP_973506  normal  1  normal  0.217728  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4492  CDS  NC_008758  58522  58788  +  267  hypothetical protein  YP_973507  normal  1  normal  0.573992  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4493  CDS  NC_008758  59253  60926  +  1674  hypothetical protein  YP_973508  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4494  CDS  NC_008758  60942  62774  +  1833  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  YP_973509  normal  0.210127  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4495  CDS  NC_008758  62771  63877  +  1107  transaldolase  YP_973510  normal  0.595041  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4496  CDS  NC_008758  63874  65535  +  1662  phosphoglucomutase  YP_973511  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4497  CDS  NC_008758  65532  67904  +  2373  putative phosphoketolase  YP_973512  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4498  CDS  NC_008758  67901  68971  +  1071  acetate kinase  YP_973513  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4499  CDS  NC_008758  68992  71058  +  2067  transketolase  YP_973514  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4500  CDS  NC_008758  71029  71745  -  717  hypothetical protein  YP_973515  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4501  CDS  NC_008758  71792  72817  -  1026  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  YP_973516  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4502  CDS  NC_008758  73378  74346  +  969  hypothetical protein  YP_973517  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4503  CDS  NC_008758  74343  75674  +  1332  hypothetical protein  YP_973518  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4504  CDS  NC_008758  75735  76118  +  384  hypothetical protein  YP_973519  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4505  CDS  NC_008758  76277  76939  -  663  transposase  YP_973520  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4506  CDS  NC_008758  76936  77409  -  474  transposase  YP_973521  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4507  CDS  NC_008758  77447  78565  -  1119  phospholipase D/transphosphatidylase  YP_973522  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4508  CDS  NC_008758  78580  79122  -  543  hypothetical protein  YP_973523  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4509  CDS  NC_008758  79505  79906  +  402  hypothetical protein  YP_973524  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4510  CDS  NC_008758  79924  80322  +  399  hypothetical protein  YP_973525  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4511  CDS  NC_008758  80399  81685  +  1287  outer membrane efflux protein  YP_973526  normal  0.336672  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4512  CDS  NC_008758  81682  83340  +  1659  RND family efflux transporter MFP subunit  YP_973527  normal  0.201635  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4513  CDS  NC_008758  83337  86504  +  3168  CzcA family heavy metal efflux protein  YP_973528  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4514  CDS  NC_008758  86692  87102  +  411  hypothetical protein  YP_973529  normal  0.759091  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4515  CDS  NC_008758  87292  87756  +  465  hypothetical protein  YP_973530  normal  0.39574  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4516  CDS  NC_008758  87770  88030  +  261  hypothetical protein  YP_973531  normal  0.486335  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4517  CDS  NC_008758  88165  89808  +  1644  Bilirubin oxidase  YP_973532  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4518  CDS  NC_008758  89859  90137  +  279  hypothetical protein  YP_973533  normal  0.292766  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4519  CDS  NC_008758  90140  90808  +  669  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  YP_973534  normal  0.105752  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4520  CDS  NC_008758  90858  91151  +  294  heavy metal transport/detoxification protein  YP_973535  normal  0.212796  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4521  CDS  NC_008758  91210  91422  +  213  hypothetical protein  YP_973536  normal  0.663863  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4522  CDS  NC_008758  91582  91824  +  243  heavy metal transport/detoxification protein  YP_973537  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4523  CDS  NC_008758  91821  92675  +  855  hypothetical protein  YP_973538  normal  0.872957  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4524  CDS  NC_008758  92699  95170  +  2472  copper-translocating P-type ATPase  YP_973539  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4525  CDS  NC_008758  95459  96223  +  765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_973540  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4526  CDS  NC_008758  96224  98005  +  1782  acetate kinase  YP_973541  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4527  CDS  NC_008758  98009  99853  +  1845  hypothetical protein  YP_973542  normal  0.0232774  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4528  CDS  NC_008758  99937  101208  +  1272  major facilitator superfamily transporter  YP_973543  normal  0.050595  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4529  CDS  NC_008758  101310  101453  +  144  heavy metal translocating P-type ATPase  YP_973544  normal  0.0742545  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4530  CDS  NC_008758  101560  101721  +  162  creatininase  YP_973545  normal  0.302482  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4531  CDS  NC_008758  101889  102047  +  159  hypothetical protein  YP_973546  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4532  CDS  NC_008758  102127  102573  +  447  transposase IS3/IS911 family protein  YP_973547  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4533  CDS  NC_008758  102561  102914  +  354  IS66 Orf2 family protein  YP_973548  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4534  CDS  NC_008758  102997  104595  +  1599  transposase IS66  YP_973549  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4535  CDS  NC_008758  105063  105359  +  297  hypothetical protein  YP_973550  normal  0.858749  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4536  CDS  NC_008758  105920  106324  +  405  hypothetical protein  YP_973551  normal  0.793326  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4537  CDS  NC_008758  106515  106961  +  447  hypothetical protein  YP_973552  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4538  CDS  NC_008758  106975  107235  +  261  hypothetical protein  YP_973553  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4539  CDS  NC_008758  107317  107619  +  303  hypothetical protein  YP_973554  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>