5064 genes were found for organism Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 51    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Pnap_0001    NC_008781  147  2701  +  2555      normal  1  normal  0.2582  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0002  CDS  NC_008781  2826  3659  +  834  hypothetical protein  YP_980249  normal  1  normal  0.183279  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0003  CDS  NC_008781  3701  4522  -  822  hypothetical protein  YP_980250  normal  1  normal  0.179185  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0004  CDS  NC_008781  4747  4953  +  207  hypothetical protein  YP_980251  normal  0.655625  normal  0.162856  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0005  CDS  NC_008781  5033  5608  +  576  NnrU family protein  YP_980252  normal  0.977134  normal  0.174949  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0006  CDS  NC_008781  5834  6508  +  675  hypothetical protein  YP_980253  normal  1  normal  0.382734  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0007  CDS  NC_008781  6653  6913  -  261  cell division topological specificity factor MinE  YP_980254  normal  1  normal  0.256237  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0008  CDS  NC_008781  6920  7735  -  816  septum site-determining protein MinD  YP_980255  normal  1  normal  0.27938  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0009  CDS  NC_008781  7871  8641  -  771  septum site-determining protein MinC  YP_980256  normal  1  normal  0.274749  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0010  CDS  NC_008781  8791  9030  +  240  hypothetical protein  YP_980257  normal  1  normal  0.232692  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0011  CDS  NC_008781  9140  9574  +  435  hypothetical protein  YP_980258  normal  1  normal  0.243646  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0012  CDS  NC_008781  9620  10642  -  1023  hypothetical protein  YP_980259  normal  1  normal  0.27645  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0013  CDS  NC_008781  10635  11936  -  1302  cardiolipin synthase 2  YP_980260  normal  1  normal  0.282981  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0014  CDS  NC_008781  12012  12845  -  834  endonuclease/exonuclease/phosphatase  YP_980261  normal  1  normal  0.241981  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0015  CDS  NC_008781  13194  13568  +  375  hypothetical protein  YP_980262  normal  1  normal  0.21043  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0016  CDS  NC_008781  13600  14670  -  1071  NADPH-dependent FMN reductase  YP_980263  normal  1  normal  0.253639  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0017  CDS  NC_008781  14939  15508  -  570  hypothetical protein  YP_980264  normal  1  normal  0.343432  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0018  CDS  NC_008781  15738  16397  +  660  hypothetical protein  YP_980265  normal  1  normal  0.463988  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0019  CDS  NC_008781  16663  18579  +  1917  thiamine biosynthesis protein ThiC  YP_980266  normal  0.691133  normal  0.432221  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0020  CDS  NC_008781  18854  19921  +  1068  glycine oxidase ThiO  YP_980267  normal  1  normal  0.504997  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0021  CDS  NC_008781  19946  20155  +  210  thiamine biosynthesis protein ThiS  YP_980268  normal  0.71048  normal  0.598538  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0022  CDS  NC_008781  20158  20976  +  819  thiazole synthase  YP_980269  normal  0.675637  normal  0.696528  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0023  CDS  NC_008781  21038  21679  +  642  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  YP_980270  normal  0.564168  normal  0.364212  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0024  CDS  NC_008781  21825  22331  +  507  hypothetical protein  YP_980271  normal  0.309029  normal  0.358699  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0025  CDS  NC_008781  22361  23635  -  1275  glycosyl transferase family protein  YP_980272  normal  0.676454  normal  0.397236  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0026  CDS  NC_008781  23632  24183  -  552  hypothetical protein  YP_980273  normal  0.262685  normal  0.496359  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0027  CDS  NC_008781  24208  25053  -  846  hypothetical protein  YP_980274  normal  0.601971  normal  0.528638  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0028  CDS  NC_008781  25129  27234  -  2106  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  YP_980275  normal  0.880979  normal  0.680993  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0029  CDS  NC_008781  27624  29060  -  1437  sensory histidine kinase CreC  YP_980276  normal  1  normal  0.290671  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0030  CDS  NC_008781  29057  29905  -  849  two component transcriptional regulator  YP_980277  normal  0.815374  normal  0.380288  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0031  CDS  NC_008781  29940  31055  -  1116  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  YP_980278  normal  1  normal  0.371979  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0032  CDS  NC_008781  31502  31687  +  186  hypothetical protein  YP_980279  normal  0.637733  normal  0.748196  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0033  CDS  NC_008781  31692  32006  +  315  hypothetical protein  YP_980280  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0034  CDS  NC_008781  32075  32929  +  855  transglutaminase domain-containing protein  YP_980281  normal  0.646179  normal  0.858985  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0035  CDS  NC_008781  33135  34937  -  1803  allophanate hydrolase  YP_980282  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0036  CDS  NC_008781  34934  38545  -  3612  biotin carboxylation domain-containing protein  YP_980283  normal  1  normal  0.879734  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0037  CDS  NC_008781  38686  39339  -  654  hypothetical protein  YP_980284  normal  0.0850268  normal  0.482024  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0038  CDS  NC_008781  39336  40070  -  735  hypothetical protein  YP_980285  normal  0.119148  normal  0.345502  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0039  CDS  NC_008781  40067  40897  -  831  ABC transporter related  YP_980286  normal  0.147558  normal  0.492978  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0040  CDS  NC_008781  40903  41682  -  780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_980287  normal  0.832577  normal  0.34867  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0041  CDS  NC_008781  41693  42709  -  1017  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  YP_980288  normal  1  normal  0.487407  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0042  CDS  NC_008781  43159  43542  -  384  methylglyoxal synthase  YP_980289  normal  1  normal  0.304097  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0043  CDS  NC_008781  43586  44605  -  1020  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  YP_980290  normal  0.482624  normal  0.263408  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0044  CDS  NC_008781  44646  45938  -  1293  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  YP_980291  normal  0.520063  normal  0.383909  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0045  CDS  NC_008781  45944  46456  -  513  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  YP_980292  normal  1  normal  0.325039  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0046  CDS  NC_008781  46453  46962  -  510  carbohydrate kinase  YP_980293  normal  1  normal  0.324095  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0047  CDS  NC_008781  47101  48171  +  1071  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  YP_980294  normal  1  normal  0.108972  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0048  CDS  NC_008781  48364  48840  +  477  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_980295  normal  1  normal  0.146084  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0049  CDS  NC_008781  48852  50699  +  1848  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  YP_980296  normal  1  normal  0.0868561  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0050  CDS  NC_008781  50775  52064  +  1290  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_980297  normal  1  normal  0.118378  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0051  CDS  NC_008781  52061  52315  +  255  thiamineS protein  YP_980298  normal  1  normal  0.0952955  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0052  CDS  NC_008781  52320  52619  +  300  hypothetical protein  YP_980299  normal  1  normal  0.093428  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0053  CDS  NC_008781  52725  54020  +  1296  acetyl-CoA hydrolase/transferase  YP_980300  normal  1  normal  0.123416  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0054  CDS  NC_008781  54110  55105  +  996  hypothetical protein  YP_980301  normal  1  normal  0.16835  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0055  CDS  NC_008781  55153  55944  +  792  hypothetical protein  YP_980302  normal  1  normal  0.0983595  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0056  CDS  NC_008781  56052  58742  -  2691  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_980303  normal  1  normal  0.145927  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0057  CDS  NC_008781  58751  59677  -  927  histone deacetylase superfamily protein  YP_980304  normal  0.620754  normal  0.137866  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0058  CDS  NC_008781  59940  61100  -  1161  hypothetical protein  YP_980305  normal  0.615926  normal  0.1354  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0059  CDS  NC_008781  61169  63475  -  2307  hypothetical protein  YP_980306  normal  1  normal  0.0504917  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0060  CDS  NC_008781  63703  64887  -  1185  beta-ketothiolase  YP_980307  normal  1  normal  0.629911  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0061  CDS  NC_008781  65095  65376  +  282  prevent-host-death family protein  YP_980308  normal  0.933415  normal  0.536193  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0062  CDS  NC_008781  65380  65799  +  420  hypothetical protein  YP_980309  normal  0.506925  normal  0.544054  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0063  CDS  NC_008781  65801  67804  +  2004  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  YP_980310  normal  1  normal  0.709755  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0064  CDS  NC_008781  67804  68469  +  666  16S rRNA methyltransferase GidB  YP_980311  normal  1  normal  0.75809  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0065  CDS  NC_008781  68499  69125  +  627  lysine exporter protein LysE/YggA  YP_980312  normal  1  normal  0.969114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0066  CDS  NC_008781  69180  69944  +  765  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_980313  normal  0.701424  normal  0.808609  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0067  CDS  NC_008781  70070  70612  +  543  hypothetical protein  YP_980314  normal  0.39608  normal  0.76446  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0068  CDS  NC_008781  70682  71617  +  936  parB-like partition proteins  YP_980315  normal  1  normal  0.820114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0069  CDS  NC_008781  71660  73081  -  1422  FAD linked oxidase domain-containing protein  YP_980316  normal  0.881498  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0070  CDS  NC_008781  73261  73854  +  594  ATP--cobalamin adenosyltransferase  YP_980317  normal  0.385646  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0071  CDS  NC_008781  73873  74817  -  945  LysR family transcriptional regulator  YP_980318  normal  0.16172  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0072  CDS  NC_008781  74868  75176  -  309  hypothetical protein  YP_980319  normal  0.163829  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0073  CDS  NC_008781  75670  77220  -  1551  Acetyl-CoA hydrolase  YP_980320  normal  0.528341  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0074  CDS  NC_008781  77560  78861  +  1302  hypothetical protein  YP_980321  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0075  CDS  NC_008781  78921  79361  +  441  hypothetical protein  YP_980322  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0076  CDS  NC_008781  79407  80693  -  1287  uracil-xanthine permease  YP_980323  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0077  CDS  NC_008781  80771  81925  -  1155  twitching motility protein  YP_980324  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0078  CDS  NC_008781  82107  82568  +  462  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  YP_980325  normal  0.318478  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0079  CDS  NC_008781  82622  83347  +  726  IS605 family transposase OrfB  YP_980326  normal  0.523128  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0080  CDS  NC_008781  83455  84699  +  1245  RND family efflux transporter MFP subunit  YP_980327  normal  0.95759  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0081  CDS  NC_008781  84719  85981  +  1263  hypothetical protein  YP_980328  normal  0.466459  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0082  CDS  NC_008781  86106  86903  -  798  hypothetical protein  YP_980329  normal  0.236618  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0083    NC_008781  87202  87432  +  231      normal  0.0907531  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0084  CDS  NC_008781  87552  87908  +  357  hypothetical protein  YP_980330  normal  0.033356  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0085  CDS  NC_008781  87914  88234  +  321  putative transcriptional regulator  YP_980331  normal  0.0133229  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0086  CDS  NC_008781  88241  88936  +  696  ABC transporter related  YP_980332  normal  0.0522946  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0087  CDS  NC_008781  89356  89646  +  291  hypothetical protein  YP_980333  normal  0.0887831  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0088  CDS  NC_008781  89793  90212  -  420  hypothetical protein  YP_980334  normal  0.0639002  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0089  CDS  NC_008781  90501  92018  -  1518  adenylate cyclase  YP_980335  normal  0.445935  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0090  CDS  NC_008781  92109  93173  -  1065  hypothetical protein  YP_980336  normal  0.196986  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0091  CDS  NC_008781  93497  96289  +  2793  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  YP_980337  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0092  CDS  NC_008781  96335  96853  -  519  flavin reductase domain-containing protein  YP_980338  normal  0.817561  normal  0.852259  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0093  CDS  NC_008781  96966  97262  -  297  hypothetical protein  YP_980339  normal  0.798455  normal  0.858985  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0094  CDS  NC_008781  97385  98752  -  1368  D-amino-acid dehydrogenase  YP_980340  normal  1  normal  0.79359  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0095  CDS  NC_008781  98864  99778  +  915  chromosome replication initiation inhibitor protein  YP_980341  normal  1  normal  0.720683  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0096  CDS  NC_008781  99880  101130  +  1251  extracellular ligand-binding receptor  YP_980342  normal  1  normal  0.809601  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0097  CDS  NC_008781  101249  104923  +  3675  multi-sensor signal transduction histidine kinase  YP_980343  normal  1  normal  0.105547  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0098  CDS  NC_008781  105043  105465  -  423  UspA domain-containing protein  YP_980344  normal  0.0148787  normal  0.288023  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0099  CDS  NC_008781  105547  106497  -  951  metallophosphoesterase  YP_980345  normal  0.0787528  normal  0.210134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0100  CDS  NC_008781  106815  107771  -  957  LysR family transcriptional regulator  YP_980346  normal  0.183121  normal  0.148828  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 51    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>