5131 genes were found for organism Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 52    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
PXO_00002  CDS  NC_010717  1552635  1552748  +  114  hypothetical protein  YP_001912712  normal  1  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00003  CDS  NC_010717  1551004  1552623  +  1620  tetratricopeptide repeat domain protein  YP_001912711  normal  1  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00004  CDS  NC_010717  1548734  1550980  +  2247  Rhs element Vgr protein, putative  YP_001912710  normal  1  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00005  CDS  NC_010717  1546629  1548509  +  1881  PDZ domain family protein  YP_001912709  normal  1  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00006  CDS  NC_010717  1546127  1546462  +  336  cytOchrome o ubiquinol oxidase subunit IV  YP_001912708  normal  1  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00007  CDS  NC_010717  1545495  1546127  +  633  cytOchrome o ubiquinol oxidase, subunit III  YP_001912707  normal  1  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00008  CDS  NC_010717  1543498  1545498  +  2001  cytOchrome o ubiquinol oxidase, subunit I  YP_001912706  normal  1  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00009  CDS  NC_010717  1542563  1543498  +  936  ubiquinol oxidase, subunit II  YP_001912705  normal  0.829439  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00012  CDS  NC_010717  1536395  1537357  +  963  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  YP_001912700  hitchhiker  0.000105637  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00013  CDS  NC_010717  1534568  1536142  +  1575  integral membrane protein MviN  YP_001912699  hitchhiker  0.0000000383198  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00014  CDS  NC_010717  1534152  1534421  -  270  30S ribosomal protein S20  YP_001912698  hitchhiker  0.000000000123306  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00015  CDS  NC_010717  1533008  1534060  +  1053  GTPase ObgE  YP_001912697  hitchhiker  0.00000000178881  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00017  CDS  NC_010717  1851780  1854890  +  3111  TonB-dependent receptor  YP_001912975  unclonable  0.000000000276656  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00019  CDS  NC_010717  1850347  1850805  -  459  hypothetical protein  YP_001912974  hitchhiker  0.000000103575  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00020  CDS  NC_010717  1848287  1850092  -  1806  TonB-dependent outer membrane Receptor  YP_001912973  hitchhiker  0.00000882452  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00021  CDS  NC_010717  1847938  1848138  -  201  PepSY-associated membrane protein  YP_001912972  hitchhiker  0.00102474  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00022  CDS  NC_010717  1847155  1847862  -  708  superoxide dismutase  YP_001912971  hitchhiker  0.00410451  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00023  CDS  NC_010717  1846611  1847003  -  393  TonB-dependent siderophore receptor, putative  YP_001912970  normal  0.0156654  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00024  CDS  NC_010717  1846073  1846564  -  492  TonB-dependent receptor  YP_001912969  normal  0.0168751  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00025  CDS  NC_010717  1845665  1845805  +  141  hypothetical protein  YP_001912967  normal  0.0758026  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00026  CDS  NC_010717  1844894  1845607  -  714  flagellar motor protein  YP_001912966  normal  0.142899  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00027  CDS  NC_010717  1844027  1844887  -  861  flagellar motor protein MotD  YP_001912965  normal  0.170514  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00028  CDS  NC_010717  1843129  1843911  -  783  chromosome partioning protein  YP_001912964  normal  0.287581  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00029  CDS  NC_010717  1842110  1843132  -  1023  chemotaxis protein  YP_001912963  normal  0.377111  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00030  CDS  NC_010717  1841701  1842000  -  300  hypothetical protein  YP_001912962  normal  0.261661  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00031  CDS  NC_010717  1841339  1841689  -  351  chemotaxis response regulator  YP_001912961  normal  0.371607  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00032  CDS  NC_010717  1839296  1841305  -  2010  chemotaxis protein CheA  YP_001912960  normal  0.814284  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00033  CDS  NC_010717  1838874  1839128  -  255  transposition helper protein  YP_001912959  normal  0.216389  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00034  CDS  NC_010717  1837588  1837713  +  126  hypothetical protein  YP_001912958  normal  0.487551  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00035    NC_010717  1837704  1838597  -  894      normal  0.31679  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00036  CDS  NC_010717  1836506  1837195  -  690  chemotaxis protein  YP_001912957  normal  0.804712  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00037  CDS  NC_010717  1836187  1836306  -  120  hypothetical protein  YP_001912956  normal  0.898675  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00038  CDS  NC_010717  1835429  1836178  -  750  hypothetical protein  YP_001912955  normal  0.960532  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00039  CDS  NC_010717  1833073  1835400  -  2328  chemotaxis protein  YP_001912954  normal  0.371493  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00040  CDS  NC_010717  1831611  1832627  -  1017  ISXo5 transposase  YP_001912953  normal  0.765513  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00041  CDS  NC_010717  1829112  1831370  -  2259  chemotaxis protein  YP_001912952  normal  0.292066  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00043  CDS  NC_010717  1826270  1828387  -  2118  chemotaxis protein  YP_001912951  normal  0.51691  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00045  CDS  NC_010717  1823507  1825582  -  2076  chemotaxis protein  YP_001912950  normal  0.505093  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00046  CDS  NC_010717  1820653  1822914  -  2262  chemotaxis protein  YP_001912948  normal  1  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00047  CDS  NC_010717  1817998  1820199  -  2202  chemotaxis protein  YP_001912947  normal  1  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00048  CDS  NC_010717  1816819  1817295  +  477  ISXo3 transposase ORF B  YP_001912946  normal  1  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00049  CDS  NC_010717  1815391  1816188  -  798  type IV pilus assembly protein PilZ  YP_001912945  normal  1  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00050  CDS  NC_010717  1814773  1815255  -  483  chemotaxis signal transduction protein  YP_001912944  normal  0.368988  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00051  CDS  NC_010717  1813995  1814543  +  549  trancated ISXo8 transposase  YP_001912943  normal  0.526099  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00052  CDS  NC_010717  1813126  1813602  -  477  ISXo3 transposase ORF B  YP_001912942  normal  0.253469  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00053  CDS  NC_010717  1812560  1812883  -  324  hypothetical protein  YP_001912941  normal  0.146781  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00054  CDS  NC_010717  1810082  1812475  -  2394  methyl-accepting chemotaxis protein  YP_001912940  normal  0.276697  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00055  CDS  NC_010717  1808962  1809822  -  861  chemotaxis protein methyltransferase 2  YP_001912939  hitchhiker  0.00310975  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00056  CDS  NC_010717  1808369  1808953  -  585  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  YP_001912938  decreased coverage  0.00180609  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00057  CDS  NC_010717  1807296  1808372  -  1077  chemotaxis-specific methylesterase  YP_001912937  hitchhiker  0.00411063  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00058  CDS  NC_010717  1804944  1807187  -  2244  C-di-GMP phosphodiesterase A  YP_001912936  normal  0.0145768  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00059  CDS  NC_010717  1803572  1804288  +  717  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  YP_001912935  normal  0.0330214  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00060  CDS  NC_010717  1803185  1803304  +  120  hypothetical protein  YP_001912934  hitchhiker  0.00934606  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00061  CDS  NC_010717  1800528  1803119  +  2592  bifunctional aconitate hydratase 2/2-methylisocitrate dehydratase  YP_001912933  normal  0.0211333  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00062  CDS  NC_010717  1800052  1800462  +  411  PIN domain, putative  YP_001912932  normal  0.0134903  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00063  CDS  NC_010717  1799807  1800055  +  249  SpoVT / AbrB like domain protein  YP_001912931  normal  0.0332656  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00064  CDS  NC_010717  1796891  1799659  -  2769  aconitate hydratase  YP_001912930  normal  0.122891  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00065  CDS  NC_010717  1796541  1796768  +  228  hypothetical protein  YP_001912929  normal  0.496239  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00066  CDS  NC_010717  1796257  1796481  +  225  hypothetical protein  YP_001912928  normal  0.460906  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00067  CDS  NC_010717  1794559  1796241  -  1683  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  YP_001912927  normal  1  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00068  CDS  NC_010717  1793513  1794382  -  870  enoyl-CoA hydratase  YP_001912926  normal  0.279285  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00069  CDS  NC_010717  1791345  1793501  +  2157  two component sensor-regulator hybrid protein RpfC  YP_001912925  normal  0.397596  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00070  CDS  NC_010717  1789898  1790959  +  1062  Two-component system response regulator RpfG  YP_001912924  normal  0.0844737  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00071  CDS  NC_010717  1788164  1789681  +  1518  lysyl-tRNA synthetase  YP_001912923  normal  0.381624  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00072  CDS  NC_010717  1786971  1787960  +  990  peptide chain release factor 2  YP_001912922  normal  0.166445  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00073  CDS  NC_010717  1785667  1786581  +  915  RpfD regulatory protein  YP_001912921  normal  0.133671  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00079  CDS  NC_010717  1782124  1782825  -  702  transposase subfamily, putative  YP_001912920  normal  0.251545  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00080  CDS  NC_010717  1781586  1781963  +  378  hypothetical protein  YP_001912919  normal  0.124177  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00081  CDS  NC_010717  1781186  1781404  +  219  hypothetical protein  YP_001912918  normal  0.165088  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00082  CDS  NC_010717  1779476  1781110  -  1635  ISXo8 transposase  YP_001912917  normal  0.362769  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00083  CDS  NC_010717  1777253  1778929  +  1677  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  YP_001912916  normal  0.491155  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00084  CDS  NC_010717  1776273  1777193  +  921  RpfE regulatory protein  YP_001912915  normal  0.620416  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00085  CDS  NC_010717  1775792  1776256  +  465  transcription elongation factor GreA  YP_001912914  normal  0.428672  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00086  CDS  NC_010717  1772541  1775783  +  3243  carbamoyl phosphate synthase large subunit  YP_001912913  normal  1  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00087  CDS  NC_010717  1772089  1772532  +  444  putative secreted protein  YP_001912912  normal  0.217198  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00088  CDS  NC_010717  1770917  1772089  +  1173  carbamoyl phosphate synthase small subunit  YP_001912911  normal  0.562291  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00089  CDS  NC_010717  1770842  1770964  -  123  hypothetical protein  YP_001912910  normal  0.304594  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00090  CDS  NC_010717  1770057  1770725  +  669  dihydrodipicolinate reductase  YP_001912909  normal  0.266189  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00091  CDS  NC_010717  1769252  1769599  +  348  ISXoo11 transposase  YP_001912908  normal  0.522819  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00092  CDS  NC_010717  1768070  1768783  +  714  mosc domain protein  YP_001912906  normal  1  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00093  CDS  NC_010717  1766814  1768067  +  1254  valine-pyruvate aminotransferase  YP_001912905  normal  0.947467  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00095  CDS  NC_010717  1766323  1766631  +  309  hypothetical protein  YP_001912904  normal  0.571212  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00096  CDS  NC_010717  1766071  1766295  +  225  hypothetical protein  YP_001912903  normal  0.531378  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00097  CDS  NC_010717  1765757  1766011  +  255  hypothetical protein  YP_001912902  normal  0.299785  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00098  CDS  NC_010717  1763890  1765755  +  1866  ferrous iron transport protein B  YP_001912901  normal  0.069629  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00099  CDS  NC_010717  1763651  1763899  +  249  ferrous iron transport protein  YP_001912900  normal  0.0194888  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00100  CDS  NC_010717  1762739  1763536  -  798  enoyl-CoA hydratase  YP_001912899  normal  0.0191435  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00101  CDS  NC_010717  1762353  1762742  -  390  glyoxalase family protein  YP_001912898  normal  0.0731587  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00102  CDS  NC_010717  1761386  1762282  -  897  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  YP_001912897  normal  0.135051  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00103  CDS  NC_010717  1760477  1761247  -  771  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type II  YP_001912896  normal  0.34106  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00104  CDS  NC_010717  1759789  1760355  -  567  elongation factor P  YP_001912895  normal  0.525787  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00105  CDS  NC_010717  1759664  1759789  -  126  lipoprotein, putative  YP_001912894  normal  0.784187  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00106  CDS  NC_010717  1759403  1759636  -  234  hypothetical protein  YP_001912893  normal  1  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00107  CDS  NC_010717  1759190  1759321  +  132  hypothetical protein  YP_001912892  normal  1  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00108  CDS  NC_010717  1758531  1758896  +  366  hypothetical protein  YP_001912891  normal  1  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00109  CDS  NC_010717  1757488  1758462  -  975  transposase  YP_001912890  normal  1  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00110  CDS  NC_010717  1754691  1756028  +  1338  xylose isomerase  YP_001912889  normal  1  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00112  CDS  NC_010717  1753149  1754642  +  1494  xylulokinase  YP_001912888  normal  0.757855  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00113  CDS  NC_010717  1752802  1753152  +  351  hypothetical protein  YP_001912887  normal  0.688258  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
PXO_00114  CDS  NC_010717  1752017  1752805  +  789  expressed protein  YP_001912886  normal  1  n/a    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 52    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>