4023 genes were found for organism Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 41    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Cphy_0001  CDS  NC_010001  75  1436  +  1362  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_001557131  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0002  CDS  NC_010001  1849  2961  +  1113  DNA polymerase III, beta subunit  YP_001557132  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0003  CDS  NC_010001  3099  3314  +  216  RNA-binding S4 domain-containing protein  YP_001557133  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0004  CDS  NC_010001  3870  4952  +  1083  DNA replication and repair protein RecF  YP_001557134  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0005  CDS  NC_010001  4986  6914  +  1929  DNA gyrase, B subunit  YP_001557135  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0006  CDS  NC_010001  6932  9631  +  2700  DNA gyrase, A subunit  YP_001557136  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0007  CDS  NC_010001  9911  10753  +  843  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  YP_001557137  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0008  CDS  NC_010001  10807  11355  +  549  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  YP_001557138  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0009  CDS  NC_010001  11434  11871  +  438  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  YP_001557139  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0010  CDS  NC_010001  12344  13630  +  1287  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  YP_001557140  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0011  CDS  NC_010001  13672  14604  +  933  cysteine synthase A  YP_001557141  normal  0.857978  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0012  CDS  NC_010001  22337  23074  +  738  NAD-dependent deacetylase  YP_001557142  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0013  CDS  NC_010001  23329  23982  +  654  transaldolase  YP_001557143  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0014  CDS  NC_010001  24186  26168  +  1983  transketolase  YP_001557144  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0015  CDS  NC_010001  26532  27218  +  687  two component transcriptional regulator  YP_001557145  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0016  CDS  NC_010001  27208  28647  +  1440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001557146  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0017  CDS  NC_010001  29061  30842  -  1782  ABC transporter related  YP_001557147  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0018  CDS  NC_010001  30987  32732  -  1746  ABC transporter related  YP_001557148  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0019  CDS  NC_010001  33488  33748  +  261  hypothetical protein  YP_001557149  hitchhiker  0.0000197047  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0020  CDS  NC_010001  33777  34718  +  942  RelA/SpoT domain-containing protein  YP_001557150  unclonable  0.00000000113301  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0021  CDS  NC_010001  34946  35857  -  912  RNA-binding S1 domain-containing protein  YP_001557151  hitchhiker  0.00000787373  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0022  CDS  NC_010001  36006  36809  +  804  NUDIX hydrolase  YP_001557152  normal  0.0640861  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0023  CDS  NC_010001  36983  37717  -  735  hypothetical protein  YP_001557153  normal  0.471227  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0024  CDS  NC_010001  38095  39390  +  1296  putative aminopeptidase 2  YP_001557154  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0025  CDS  NC_010001  40543  42537  +  1995  methionyl-tRNA synthetase  YP_001557155  normal  0.0492884  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0026  CDS  NC_010001  42711  42926  -  216  hypothetical protein  YP_001557156  normal  0.992414  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0027  CDS  NC_010001  43272  43535  +  264  hypothetical protein  YP_001557157  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0028    NC_010001  43750  44175  +  426      normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0029  CDS  NC_010001  44224  44937  +  714  methyltransferase type 11  YP_001557158  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0030  CDS  NC_010001  44956  45768  +  813  hypothetical protein  YP_001557159  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0031  CDS  NC_010001  46157  47131  +  975  hypothetical protein  YP_001557160  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0032  CDS  NC_010001  47419  48633  +  1215  type II secretion system protein E  YP_001557161  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0033  CDS  NC_010001  48724  49467  +  744  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  YP_001557162  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0034  CDS  NC_010001  49484  50941  +  1458  hypothetical protein  YP_001557163  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0035  CDS  NC_010001  51057  51260  +  204  hypothetical protein  YP_001557164  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0036  CDS  NC_010001  51273  53756  +  2484  hypothetical protein  YP_001557165  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0037  CDS  NC_010001  53921  54835  +  915  hypothetical protein  YP_001557166  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0038  CDS  NC_010001  54915  55349  +  435  peptidase A24A prepilin type IV  YP_001557167  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0039  CDS  NC_010001  55496  56068  +  573  hypothetical protein  YP_001557168  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0040  CDS  NC_010001  56324  58066  +  1743  FHA domain-containing protein  YP_001557169  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0041  CDS  NC_010001  58361  59860  +  1500  glycerol kinase  YP_001557170  normal  0.684813  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0042  CDS  NC_010001  59873  61063  +  1191  rhomboid family protein  YP_001557171  normal  0.0740017  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0043  CDS  NC_010001  61053  62057  +  1005  hypothetical protein  YP_001557172  normal  0.0701676  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0044  CDS  NC_010001  62196  62465  +  270  hypothetical protein  YP_001557173  normal  0.114018  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0045  CDS  NC_010001  62635  63609  +  975  hypothetical protein  YP_001557174  normal  0.113185  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0046  CDS  NC_010001  63796  65364  +  1569  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  YP_001557175  normal  0.241439  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0047  CDS  NC_010001  65391  65750  +  360  hypothetical protein  YP_001557176  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0048  CDS  NC_010001  66208  66804  +  597  recombination protein RecR  YP_001557177  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0049  CDS  NC_010001  66922  68031  +  1110  hypothetical protein  YP_001557178  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0050  CDS  NC_010001  68096  68689  -  594  sporulation protein YyaC  YP_001557179  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0051  CDS  NC_010001  69062  70372  +  1311  peptidoglycan-binding LysM  YP_001557180  normal  0.492826  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0052  CDS  NC_010001  70537  71733  +  1197  hypothetical protein  YP_001557181  normal  0.0289016  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0053  CDS  NC_010001  71737  72438  +  702  hypothetical protein  YP_001557182  hitchhiker  0.00220194  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0054  CDS  NC_010001  72635  73597  +  963  2-dehydro-3-deoxyphosphogluconate aldolase/4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase  YP_001557183  decreased coverage  0.0000603646  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0055  CDS  NC_010001  73980  75317  +  1338  hypothetical protein  YP_001557184  normal  0.0173393  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0056  CDS  NC_010001  81998  82324  +  327  hypothetical protein  YP_001557185  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0057  CDS  NC_010001  82305  82850  -  546  hypothetical protein  YP_001557186  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0058  CDS  NC_010001  83519  85855  +  2337  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  YP_001557187  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0059  CDS  NC_010001  85842  86678  +  837  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  YP_001557188  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0060  CDS  NC_010001  86662  87135  +  474  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  YP_001557189  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0061  CDS  NC_010001  87449  87607  +  159  hypothetical protein  YP_001557190  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0062  CDS  NC_010001  87739  88626  -  888  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  YP_001557191  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0063  CDS  NC_010001  89122  89832  +  711  phosphotransferase domain-containing protein  YP_001557192  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0064  CDS  NC_010001  89917  90717  -  801  XRE family transcriptional regulator  YP_001557193  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0065  CDS  NC_010001  90930  91751  -  822  XRE family transcriptional regulator  YP_001557194  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0066  CDS  NC_010001  92474  93670  -  1197  hypothetical protein  YP_001557195  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0067  CDS  NC_010001  93690  96077  -  2388  hypothetical protein  YP_001557196  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0068  CDS  NC_010001  96504  98186  +  1683  cell wall hydrolase/autolysin  YP_001557197  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0069  CDS  NC_010001  98284  98904  +  621  hypothetical protein  YP_001557198  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0070  CDS  NC_010001  99198  100577  +  1380  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  YP_001557199  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0071  CDS  NC_010001  100774  102117  +  1344  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  YP_001557200  normal  0.208063  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0072  CDS  NC_010001  102256  103299  +  1044  hypothetical protein  YP_001557201  decreased coverage  0.0000140127  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0073  CDS  NC_010001  103427  103810  +  384  GntR family transcriptional regulator  YP_001557202  normal  0.138424  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0074  CDS  NC_010001  103800  104237  +  438  hypothetical protein  YP_001557203  normal  0.339899  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0075  CDS  NC_010001  104245  105003  +  759  hypothetical protein  YP_001557204  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0076  CDS  NC_010001  105399  106172  +  774  ABC transporter related  YP_001557205  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0077  CDS  NC_010001  106174  107232  +  1059  ABC-2 type transporter  YP_001557206  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0078  CDS  NC_010001  107229  108488  +  1260  ABC-2 type transporter  YP_001557207  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0079  CDS  NC_010001  108728  109885  +  1158  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001557208  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0080  CDS  NC_010001  109893  110531  +  639  two component LuxR family transcriptional regulator  YP_001557209  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0081  CDS  NC_010001  110768  111313  +  546  rubrerythrin  YP_001557210  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0082  CDS  NC_010001  111417  111740  +  324  hypothetical protein  YP_001557211  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0083  CDS  NC_010001  111752  112369  +  618  flavin reductase domain-containing protein  YP_001557212  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0084  CDS  NC_010001  112892  113914  +  1023  D-alanine--D-alanine ligase  YP_001557213  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0085  CDS  NC_010001  114069  115049  +  981  hypothetical protein  YP_001557214  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0086  CDS  NC_010001  115163  115348  -  186  hypothetical protein  YP_001557215  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0087  CDS  NC_010001  115437  117140  -  1704  hydrogenase, Fe-only  YP_001557216  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0088  CDS  NC_010001  117158  119044  -  1887  NADH dehydrogenase (quinone)  YP_001557217  normal  0.296083  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0089  CDS  NC_010001  119038  119523  -  486  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  YP_001557218  normal  0.0240051  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0090  CDS  NC_010001  120033  121487  -  1455  ferredoxin hydrogenase  YP_001557219  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0091  CDS  NC_010001  121534  122706  -  1173  protein serine/threonine phosphatase  YP_001557220  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0092  CDS  NC_010001  122755  124488  -  1734  putative PAS/PAC sensor protein  YP_001557221  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0093  CDS  NC_010001  124488  124730  -  243  hypothetical protein  YP_001557222  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0094  CDS  NC_010001  124837  125703  -  867  DegV family protein  YP_001557223  normal  1  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0095  CDS  NC_010001  126311  127729  +  1419  asparaginyl-tRNA synthetase  YP_001557224  normal  0.113003  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0096  CDS  NC_010001  127890  128408  -  519  hypothetical protein  YP_001557225  hitchhiker  0.0000816189  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0097  CDS  NC_010001  129389  129880  +  492  XRE family transcriptional regulator  YP_001557226  decreased coverage  0.0000000770328  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0098  CDS  NC_010001  130233  131072  -  840  MerR family transcriptional regulator  YP_001557227  decreased coverage  0.00000252188  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0099  CDS  NC_010001  131424  133151  +  1728  ABC transporter related  YP_001557228  hitchhiker  0.000575789  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0100  CDS  NC_010001  133148  134902  +  1755  ABC transporter related  YP_001557229  normal  0.995912  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 41    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>