7255 genes were found for organism Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 73    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BURPS1106A_0001  CDS  NC_009076  1116  1116  carboxylate-amine ligase  YP_001064286  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0002  CDS  NC_009076  1161  2375  1215  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  YP_001064287  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0003  CDS  NC_009076  3114  5249  2136  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  YP_001064288  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0004  CDS  NC_009076  5488  5766  279  DNA-binding protein HU-alpha  YP_001064289  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0005  CDS  NC_009076  5869  7209  1341  CobW/P47K family protein  YP_001064290  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0006  CDS  NC_009076  7528  8013  486  putative invasion protein  YP_001064291  normal  0.435281  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0007  CDS  NC_009076  8395  10668  2274  general secretion pathway protein D  YP_001064292  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0008  CDS  NC_009076  10665  12158  1494  general secretory pathway protein E  YP_001064293  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0009  CDS  NC_009076  12163  13380  1218  general secretion pathway protein F  YP_001064294  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0010  CDS  NC_009076  13452  13862  411  general secretion pathway protein C  YP_001064295  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0011  CDS  NC_009076  13861  13992  132  hypothetical protein  YP_001064296  normal  0.869672  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0012  CDS  NC_009076  14010  14462  453  general secretion pathway protein G  YP_001064297  normal  0.127302  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0013  CDS  NC_009076  14497  15096  600  general secretion pathway protein H  YP_001064298  normal  0.036848  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0014  CDS  NC_009076  15093  15503  411  general secretion pathway protein I  YP_001064299  normal  0.0635584  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0015  CDS  NC_009076  15481  16209  729  general secretion pathway protein J  YP_001064300  normal  0.0530373  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0016  CDS  NC_009076  16211  17461  1251  general secretion pathway protein K  YP_001064301  normal  0.252749  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0017  CDS  NC_009076  17507  18916  1410  general secretion pathway protein L  YP_001064302  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0018  CDS  NC_009076  18892  19419  528  general secretory pathway protein M  YP_001064303  normal  0.563775  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0019  CDS  NC_009076  19458  20249  792  general secretory pathway protein N  YP_001064304  normal  0.0275939  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0020  CDS  NC_009076  20494  22110  1617  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  YP_001064305  normal  0.0374207  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0021  CDS  NC_009076  22332  22604  273  hypothetical protein  YP_001064306  normal  0.0867544  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0022  CDS  NC_009076  22797  23294  498  MarR family transcriptional regulator  YP_001064307  normal  0.278494  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0023  CDS  NC_009076  23442  25004  1563  EmrB/QacA family drug resistance transporter  YP_001064308  normal  0.636069  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0024  CDS  NC_009076  25064  25987  924  LysR family transcriptional regulator  YP_001064309  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0025  CDS  NC_009076  26127  26597  471  LrgA family protein  YP_001064310  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0026  CDS  NC_009076  26666  27388  723  LrgB-like family protein  YP_001064311  normal  0.23092  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0027  CDS  NC_009076  27877  28116  240  hypothetical protein  YP_001064312  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0028  CDS  NC_009076  28217  28714  498  flagellar basal body-associated protein FliL  YP_001064313  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0029  CDS  NC_009076  28737  29735  999  flagellar motor switch protein FliM  YP_001064314  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0030  CDS  NC_009076  29728  30225  498  flagellar motor switch protein FliN  YP_001064315  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0031  CDS  NC_009076  30222  30887  666  flagellar biosynthesis protein FliO  YP_001064316  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0032  CDS  NC_009076  30889  31719  831  flagellar biosynthesis protein FliP  YP_001064317  normal  0.908902  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0033  CDS  NC_009076  31745  32017  273  flagellar biosynthesis protein FliQ  YP_001064318  normal  0.810295  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0034  CDS  NC_009076  32136  32918  783  flagellar biosynthetic protein FliR  YP_001064319  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0035  CDS  NC_009076  33238  33666  429  MerR family transcriptional regulator  YP_001064320  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0036  CDS  NC_009076  33748  34623  876  putative methyltransferase  YP_001064321  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0037  CDS  NC_009076  34616  35137  522  hypothetical protein  YP_001064322  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0038  CDS  NC_009076  35295  36308  1014  hypothetical protein  YP_001064323  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0039  CDS  NC_009076  36392  37189  798  ABC transporter, ATP-binding protein  YP_001064324  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0040  CDS  NC_009076  37217  38065  849  ABC transporter, permease protein  YP_001064325  normal  0.522623  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0041  CDS  NC_009076  38143  39522  1380  sensor histidine kinase  YP_001064326  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0042  CDS  NC_009076  39533  40210  678  DNA-binding response regulator  YP_001064327  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0043  CDS  NC_009076  40377  40544  168  hypothetical protein  YP_001064328  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0044  CDS  NC_009076  40500  41660  1161  putative porin  YP_001064329  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0045  CDS  NC_009076  41696  41878  183  hypothetical protein  YP_001064330  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0046  CDS  NC_009076  42115  44148  2034  type III DNA modification methyltransferase  YP_001064331  normal  0.312444  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0047  CDS  NC_009076  44189  47218  3030  Type III restriction enzyme, res subunit  YP_001064332  normal  0.678865  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0048  CDS  NC_009076  47459  47611  153  hypothetical protein  YP_001064333  normal  0.398574  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0049  CDS  NC_009076  47756  48856  1101  putative porin  YP_001064334  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0050  CDS  NC_009076  49256  50215  960  putative transcriptional regulator  YP_001064335  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0051  CDS  NC_009076  50338  51069  732  ABC transporter, ATP-binding protein  YP_001064336  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0052  CDS  NC_009076  51054  51452  399  hypothetical protein  YP_001064337  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0053  CDS  NC_009076  51442  52164  723  ABC transporter, ATP-binding protein  YP_001064338  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0054  CDS  NC_009076  52161  53210  1050  ABC transporter, permease protein  YP_001064339  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0055  CDS  NC_009076  53207  54085  879  ABC transporter, permease protein  YP_001064340  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0056  CDS  NC_009076  54090  55349  1260  putative ABC transporter, substrate-binding protein  YP_001064341  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0057  CDS  NC_009076  55566  57071  1506  putative phenylacetaldehyde dehydrogenase  YP_001064342  normal  0.0727392  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0058  CDS  NC_009076  57126  57518  393  hypothetical protein  YP_001064343  normal  0.118011  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0059  CDS  NC_009076  57529  58338  810  hypothetical protein  YP_001064344  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0060  CDS  NC_009076  58384  59181  798  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  YP_001064345  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0061  CDS  NC_009076  59266  60936  1671  GMC oxidoreductase  YP_001064346  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0062  CDS  NC_009076  61663  62004  342  PadR family transcriptional regulator  YP_001064347  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0063  CDS  NC_009076  62001  63188  1188  hypothetical protein  YP_001064348  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0064  CDS  NC_009076  63268  63387  120  hypothetical protein  YP_001064349  normal  0.976496  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0065  CDS  NC_009076  63532  63837  306  hypothetical protein  YP_001064350  normal  0.573899  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0066  CDS  NC_009076  63861  64847  987  fatty acid desaturase family protein  YP_001064351  normal  0.43697  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0067  CDS  NC_009076  64877  65713  837  hypothetical protein  YP_001064352  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0068  CDS  NC_009076  66153  67382  1230  AraC family transcriptional regulator  YP_001064353  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0069  CDS  NC_009076  67381  68517  1137  acyl-CoA dehydrogenase  YP_001064354  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0070  CDS  NC_009076  68565  68789  225  hypothetical protein  YP_001064355  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0071  CDS  NC_009076  68772  68918  147  hypothetical protein  YP_001064356  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0072  CDS  NC_009076  69172  70377  1206  acetyl-CoA acetyltransferase  YP_001064357  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0073  CDS  NC_009076  70390  72513  2124  putative 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  YP_001064358  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0074  CDS  NC_009076  72510  72653  144  hypothetical protein  YP_001064359  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0075  CDS  NC_009076  72919  74052  1134  CAIB/BAIF family protein  YP_001064360  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0076  CDS  NC_009076  74129  74695  567  putative lipoprotein  YP_001064361  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0077  CDS  NC_009076  74801  74956  156  hypothetical protein  YP_001064362  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0078  CDS  NC_009076  75043  75528  486  hypothetical protein  YP_001064363  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0079  CDS  NC_009076  75535  76503  969  hypothetical protein  YP_001064364  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0080  CDS  NC_009076  76490  76858  369  putative lipoprotein  YP_001064365  normal  0.300819  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0081  CDS  NC_009076  77239  77517  279  hypothetical protein  YP_001064367  normal  0.0815374  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0082  CDS  NC_009076  77081  77242  162  hypothetical protein  YP_001064366  normal  0.108674  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0083  CDS  NC_009076  77544  78302  759  transmembrane regulator PrtR  YP_001064368  normal  0.273948  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0084  CDS  NC_009076  78299  78814  516  sigma-70 family RNA polymerase sigma factor  YP_001064369  normal  0.0118305  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0085  CDS  NC_009076  78975  80060  1086  putative catalase  YP_001064370  normal  0.0720328  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0086  CDS  NC_009076  80057  80584  528  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  YP_001064371  normal  0.083674  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0087  CDS  NC_009076  81137  82036  900  methionine sulfoxide reductase A  YP_001064372  unclonable  0.000549703  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0088  CDS  NC_009076  82233  82385  153  hypothetical protein  YP_001064373  decreased coverage  0.00165829  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0089  CDS  NC_009076  82644  82907  264  transposase subfamily protein  YP_001064374  normal  0.0511092  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0090  CDS  NC_009076  82931  83092  162  A, transposase OrfB  YP_001064375  normal  0.092773  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0091  CDS  NC_009076  83097  83387  291  transposase A  YP_001064376  normal  0.582456  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0092  CDS  NC_009076  83381  84235  855  transposase B  YP_001064377  normal  0.762748  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0093  CDS  NC_009076  84389  85225  837  hypothetical protein  YP_001064378  normal  0.317107  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0094  CDS  NC_009076  85693  86940  1248  hypothetical protein  YP_001064379  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0095  CDS  NC_009076  87362  87685  324  XRE family transcriptional regulator  YP_001064380  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0096  CDS  NC_009076  87678  88547  870  hypothetical protein  YP_001064381  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0097  CDS  NC_009076  88777  91245  2469  type I restriction-modification system M subunit  YP_001064382  normal  0.836051  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0098  CDS  NC_009076  91595  92542  948  restriction endonuclease S subunits  YP_001064383  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0099  CDS  NC_009076  92566  95835  3270  type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  YP_001064384  normal  0.26483  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1106A_0100  CDS  NC_009076  95832  96527  696  hypothetical protein  YP_001064385  normal  0.58057  n/a    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 73    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>