302 genes were found for organism Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 4    << first  < prev  1  2  3  4    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Mflv_5274  CDS  NC_009339  28  1518  1491  hypothetical protein  YP_001136526  normal  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5275  CDS  NC_009339  1524  1868  345  hypothetical protein  YP_001136527  hitchhiker  0.00179111  normal  0.238967  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5276  CDS  NC_009339  1868  2284  417  hypothetical protein  YP_001136528  hitchhiker  0.00080064  normal  0.152508  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5277  CDS  NC_009339  2421  2933  513  hypothetical protein  YP_001136529  hitchhiker  0.000645981  normal  0.0763304  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5278  CDS  NC_009339  3095  3742  648  hypothetical protein  YP_001136530  hitchhiker  0.000128794  normal  0.0297343  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5279  CDS  NC_009339  4032  5003  972  hypothetical protein  YP_001136531  hitchhiker  0.000309085  normal  0.00944563  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5280  CDS  NC_009339  5263  10047  4785  methyltransferase type 11  YP_001136532  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5281  CDS  NC_009339  10615  11070  456  histidine kinase  YP_001136533  normal  0.263883  normal  0.386303  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5282  CDS  NC_009339  11239  12645  1407  transposase, IS4 family protein  YP_001136534  normal  normal  0.278664  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5283  CDS  NC_009339  12776  13564  789  hypothetical protein  YP_001136535  normal  normal  0.21658  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5284  CDS  NC_009339  13638  14099  462  hypothetical protein  YP_001136536  normal  normal  0.21026  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5285  CDS  NC_009339  14701  15558  858  hypothetical protein  YP_001136537  normal  normal  0.136846  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5286  CDS  NC_009339  15716  16687  972  hypothetical protein  YP_001136538  normal  0.789525  normal  0.137555  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5287  CDS  NC_009339  17026  18249  1224  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  YP_001136539  normal  normal  0.070896  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5288  CDS  NC_009339  18772  19545  774  NLP/P60 protein  YP_001136540  normal  normal  0.181073  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5289  CDS  NC_009339  19609  20301  693  response regulator receiver protein  YP_001136541  normal  normal  0.125341  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5290  CDS  NC_009339  20731  21651  921  hypothetical protein  YP_001136542  normal  normal  0.0721405  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5291  CDS  NC_009339  21648  22013  366  CopY family transcriptional regulator  YP_001136543  normal  normal  0.17183  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5292  CDS  NC_009339  22394  23803  1410  NLP/P60 protein  YP_001136544  normal  0.308075  normal  0.186714  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5293  CDS  NC_009339  24164  24442  279  response regulator receiver protein  YP_001136545  normal  0.47339  normal  0.134883  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5294  CDS  NC_009339  25393  25503  111  hypothetical protein  YP_001136546  normal  0.864395  normal  0.0794698  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5295    NC_009339  25585  26123  539      normal  0.763843  normal  0.108805  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5296  CDS  NC_009339  26282  26536  255  hypothetical protein  YP_001136547  normal  0.882847  normal  0.168446  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5297  CDS  NC_009339  26655  26882  228  hypothetical protein  YP_001136548  normal  normal  0.206623  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5298  CDS  NC_009339  26919  27680  762  hypothetical protein  YP_001136549  normal  normal  0.184703  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5299  CDS  NC_009339  27677  28408  732  ABC transporter related  YP_001136550  normal  normal  0.273593  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5300  CDS  NC_009339  28389  29888  1500  putative ABC transporter membrane protein  YP_001136551  normal  0.439686  normal  0.527461  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5301  CDS  NC_009339  29888  30295  408  hypothetical protein  YP_001136552  normal  0.316763  normal  0.437189  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5302  CDS  NC_009339  30444  30971  528  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  YP_001136553  normal  0.293491  normal  0.364318  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5303  CDS  NC_009339  31199  31492  294  hypothetical protein  YP_001136554  normal  0.198456  normal  0.383245  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5304  CDS  NC_009339  31655  31897  243  heavy metal transport/detoxification protein  YP_001136555  normal  0.562582  normal  0.337627  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5305  CDS  NC_009339  31938  34286  2349  heavy metal translocating P-type ATPase  YP_001136556  normal  0.585321  normal  0.36068  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5306  CDS  NC_009339  34369  34623  255  hypothetical protein  YP_001136557  normal  0.0763794  normal  0.335058  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5307  CDS  NC_009339  34766  36322  1557  multicopper oxidase, type 2  YP_001136558  normal  0.117713  normal  0.384729  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5308  CDS  NC_009339  36319  36663  345  hypothetical protein  YP_001136559  normal  0.450863  normal  0.445514  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5309  CDS  NC_009339  36673  37413  741  two component transcriptional regulator  YP_001136560  normal  0.383621  normal  0.611504  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5310  CDS  NC_009339  37410  38555  1146  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001136561  normal  0.748065  normal  0.851667  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5311  CDS  NC_009339  38617  39330  714  hypothetical protein  YP_001136562  normal  0.126804  normal  0.734032  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5312  CDS  NC_009339  39550  39963  414  hypothetical protein  YP_001136563  normal  0.849521  normal  0.398368  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5313  CDS  NC_009339  40000  42387  2388  copper-translocating P-type ATPase  YP_001136564  normal  normal  0.620833  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5314  CDS  NC_009339  42859  43698  840  integrase catalytic subunit  YP_001136565  normal  normal  0.389747  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5315  CDS  NC_009339  43749  44048  300  transposase IS3/IS911 family protein  YP_001136566  normal  normal  0.323663  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5316  CDS  NC_009339  44461  44961  501  hypothetical protein  YP_001136567  normal  normal  0.449659  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5317  CDS  NC_009339  45039  45380  342  hypothetical protein  YP_001136568  normal  normal  0.552932  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5318  CDS  NC_009339  45414  47546  2133  heavy metal translocating P-type ATPase  YP_001136569  normal  normal  0.449789  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5319  CDS  NC_009339  47539  47922  384  regulatory protein, ArsR  YP_001136570  normal  normal  0.584755  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5320  CDS  NC_009339  48078  49046  969  hypothetical protein  YP_001136571  normal  normal  0.573782  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5321  CDS  NC_009339  49094  49876  783  helix-turn-helix domain-containing protein  YP_001136572  normal  normal  0.833678  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5322  CDS  NC_009339  50067  50663  597  hypothetical protein  YP_001136573  normal  normal  0.633891  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5323  CDS  NC_009339  50710  51390  681  putative adenylate/guanylate cyclase  YP_001136574  normal  normal  0.680293  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5324  CDS  NC_009339  51925  52695  771  NLP/P60 protein  YP_001136575  normal  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5325  CDS  NC_009339  53106  53867  762  hypothetical protein  YP_001136576  normal  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5326  CDS  NC_009339  54301  54960  660  DSBA oxidoreductase  YP_001136577  normal  0.950308  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5327  CDS  NC_009339  55031  55624  594  hypothetical protein  YP_001136578  normal  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5328  CDS  NC_009339  55621  57546  1926  copper resistance D domain-containing protein  YP_001136579  normal  0.102981  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5329  CDS  NC_009339  57661  58431  771  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  YP_001136580  normal  0.262903  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5330  CDS  NC_009339  58606  59562  957  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  YP_001136581  normal  0.104787  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5331  CDS  NC_009339  59719  59934  216  putative transcriptional regulator  YP_001136582  normal  0.0697124  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5332  CDS  NC_009339  60424  60705  282  hypothetical protein  YP_001136583  normal  0.058385  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5333  CDS  NC_009339  60743  61138  396  hypothetical protein  YP_001136584  normal  0.0718376  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5334  CDS  NC_009339  61309  61905  597  hypothetical protein  YP_001136585  normal  0.10557  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5335  CDS  NC_009339  62439  62693  255  putative adenylate/guanylate cyclase  YP_001136586  normal  0.482042  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5336  CDS  NC_009339  62650  63261  612  putative adenylate/guanylate cyclase  YP_001136587  normal  0.615827  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5337  CDS  NC_009339  63258  65813  2556  heavy metal translocating P-type ATPase  YP_001136588  normal  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5338  CDS  NC_009339  66799  68985  2187  acyltransferase 3  YP_001136589  normal  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5339  CDS  NC_009339  69089  70069  981  cytochrome c assembly protein  YP_001136590  normal  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5340  CDS  NC_009339  70239  70733  495  hypothetical protein  YP_001136591  normal  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5341  CDS  NC_009339  70885  72630  1746  cytochrome-c oxidase  YP_001136592  normal  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5342  CDS  NC_009339  73142  74164  1023  peptidase M23B  YP_001136593  normal  0.556656  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5343  CDS  NC_009339  74343  74726  384  CopY family transcriptional regulator  YP_001136594  normal  0.813895  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5344  CDS  NC_009339  74723  75667  945  peptidase M48, Ste24p  YP_001136595  normal  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5345  CDS  NC_009339  76214  76780  567  hypothetical protein  YP_001136596  normal  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5346  CDS  NC_009339  76847  77842  996  hypothetical protein  YP_001136597  normal  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5347  CDS  NC_009339  77913  78584  672  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  YP_001136598  normal  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5348  CDS  NC_009339  78909  79268  360  hypothetical protein  YP_001136599  normal  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5349  CDS  NC_009339  79265  79858  594  cytochrome c oxidase, subunit III  YP_001136600  normal  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5350  CDS  NC_009339  80197  81243  1047  NLP/P60 protein  YP_001136601  normal  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5351  CDS  NC_009339  81327  82007  681  copper resistance protein CopC  YP_001136602  normal  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5352  CDS  NC_009339  82085  82723  639  putative lipoprotein LpqU  YP_001136603  normal  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5353  CDS  NC_009339  82891  83805  915  hypothetical protein  YP_001136604  normal  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5354  CDS  NC_009339  84169  85713  1545  hypothetical protein  YP_001136605  normal  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5355  CDS  NC_009339  85745  87049  1305  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  YP_001136606  normal  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5356  CDS  NC_009339  87259  88545  1287  transposase, mutator type  YP_001136607  normal  0.0116782  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5357    NC_009339  89707  90341  635      normal  0.139159  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5358  CDS  NC_009339  90683  90943  261  protein tyrosine phosphatase  YP_001136608  normal  0.168011  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5359  CDS  NC_009339  91224  92459  1236  transposase, mutator type  YP_001136609  normal  0.502156  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5360  CDS  NC_009339  92625  92960  336  hypothetical protein  YP_001136610  normal  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5361    NC_009339  93145  93393  249      normal  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5362  CDS  NC_009339  93768  94520  753  integrase catalytic subunit  YP_001136611  normal  0.958298  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5363  CDS  NC_009339  94619  94906  288  transposase IS3/IS911 family protein  YP_001136612  normal  0.657542  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5364  CDS  NC_009339  94911  95540  630  hypothetical protein  YP_001136613  normal  0.865399  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5365  CDS  NC_009339  95537  96298  762  hypothetical protein  YP_001136614  normal  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5366  CDS  NC_009339  96947  97576  630  hypothetical protein  YP_001136615  normal  0.285277  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5367  CDS  NC_009339  97886  99799  1914  copper resistance D domain-containing protein  YP_001136616  normal  0.164782  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5368  CDS  NC_009339  99915  100751  837  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  YP_001136617  normal  0.428452  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5369  CDS  NC_009339  100822  101778  957  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  YP_001136618  normal  0.846692  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5370  CDS  NC_009339  101852  102235  384  regulatory protein, ArsR  YP_001136619  normal  0.56529  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5371  CDS  NC_009339  102232  104190  1959  heavy metal translocating P-type ATPase  YP_001136620  normal  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5372  CDS  NC_009339  104613  104894  282  hypothetical protein  YP_001136621  normal  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_5373  CDS  NC_009339  105500  106096  597  hypothetical protein  YP_001136622  normal  normal  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 4    << first  < prev  1  2  3  4    next >  last >>