136 genes were found for organism Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
YpsIP31758_B0001  CDS  NC_009705  151696  153015  -  1320  hypothetical protein  YP_001393435  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0002  CDS  NC_009705  596  1870  +  1275  hypothetical protein  YP_001393300  normal  0.691922  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0003  CDS  NC_009705  1964  8365  +  6402  helicase. putatve  YP_001393301  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0004  CDS  NC_009705  8970  9767  +  798  hypothetical protein  YP_001393302  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0005  CDS  NC_009705  9787  10539  +  753  hypothetical protein  YP_001393303  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0006  CDS  NC_009705  10542  11687  +  1146  hypothetical protein  YP_001393304  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0007  CDS  NC_009705  11698  12858  +  1161  putative lipoprotein  YP_001393305  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0008  CDS  NC_009705  12938  13993  +  1056  M23 peptidase domain-containing protein  YP_001393306  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0009  CDS  NC_009705  14008  15687  +  1680  hypothetical protein  YP_001393307  normal  0.535705  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0010  CDS  NC_009705  15793  16500  -  708  type IV prepilin peptidase PilD  YP_001393308  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0011  CDS  NC_009705  16497  16976  -  480  conjugal transfer protein  YP_001393309  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0012  CDS  NC_009705  17153  17611  +  459  type IV pilus biogenesis protein PilM  YP_001393310  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0013  CDS  NC_009705  17749  18915  +  1167  type IV pilus biosynthesis protein PilL  YP_001393311  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0014  CDS  NC_009705  18931  20625  +  1695  PilN family type IV pilus biogenesis protein  YP_001393312  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0015  CDS  NC_009705  20716  22251  +  1536  type IV pilus biogenesis protein PilO2  YP_001393313  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0016  CDS  NC_009705  22238  22774  +  537  type IV pilus biogenesis protein PilP  YP_001393314  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0017  CDS  NC_009705  22802  24301  +  1500  type IV pilus biosynthesis protein PilQ  YP_001393315  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0018  CDS  NC_009705  24350  25429  +  1080  type II secretion system protein F  YP_001393316  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0019  CDS  NC_009705  25453  25980  +  528  type IV prepilin domain-containing protein PilS  YP_001393317  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0020  CDS  NC_009705  26018  26974  +  957  type IV secretion system protein PilT  YP_001393318  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0021  CDS  NC_009705  26993  28279  +  1287  type IV pilus biogenesis protein PilV  YP_001393319  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0022  CDS  NC_009705  28990  30117  +  1128  shufflon-specific DNA recombinase  YP_001393320  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0023  CDS  NC_009705  30238  30870  -  633  hypothetical protein  YP_001393321  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0024  CDS  NC_009705  31069  31194  +  126  hypothetical protein  YP_001393322  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0025  CDS  NC_009705  31244  32746  -  1503  hypothetical protein  YP_001393323  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0026  CDS  NC_009705  32927  33907  +  981  hypothetical protein  YP_001393324  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0027  CDS  NC_009705  33907  34389  +  483  hypothetical protein  YP_001393325  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0028  CDS  NC_009705  34389  35030  +  642  hypothetical protein  YP_001393326  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0029  CDS  NC_009705  35096  35545  +  450  hypothetical protein  YP_001393327  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0030  CDS  NC_009705  35580  35987  +  408  hypothetical protein  YP_001393328  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0031  CDS  NC_009705  35996  37555  +  1560  putative DNA topoisomerase  YP_001393329  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0032  CDS  NC_009705  37527  37994  +  468  hypothetical protein  YP_001393330  normal  0.912788  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0033  CDS  NC_009705  38031  40478  +  2448  putative DNA topoisomerase III  YP_001393331  normal  0.448865  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0034  CDS  NC_009705  40729  42777  +  2049  putative DNA replication primase  YP_001393332  hitchhiker  0.000123462  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0035  CDS  NC_009705  42851  43351  +  501  hypothetical protein  YP_001393333  hitchhiker  0.0000000178342  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0036  CDS  NC_009705  43466  44107  -  642  hypothetical protein  YP_001393334  decreased coverage  0.000000000000951332  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0037  CDS  NC_009705  44523  45080  +  558  hypothetical protein  YP_001393335  decreased coverage  0.00000000000006504  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0038  CDS  NC_009705  45070  45666  +  597  hypothetical protein  YP_001393336  hitchhiker  0.00000000000885018  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0039  CDS  NC_009705  45659  46153  +  495  hypothetical protein  YP_001393337  hitchhiker  0.000000022001  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0040  CDS  NC_009705  46146  46808  +  663  hypothetical protein  YP_001393338  hitchhiker  0.0000011341  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0041  CDS  NC_009705  47080  47271  +  192  hypothetical protein  YP_001393339  hitchhiker  0.000466989  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0042  CDS  NC_009705  47271  47531  +  261  hypothetical protein  YP_001393340  hitchhiker  0.000917807  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0043  CDS  NC_009705  49007  49552  -  546  hypothetical protein  YP_001393341  normal  0.0395643  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0044  CDS  NC_009705  49728  49934  +  207  haemolysin expression modulating protein  YP_001393342  normal  0.122459  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0045  CDS  NC_009705  51008  51259  +  252  hypothetical protein  YP_001393343  normal  0.398741  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0046  CDS  NC_009705  51291  52031  +  741  hypothetical protein  YP_001393344  normal  0.485496  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0047  CDS  NC_009705  52482  53237  -  756  hypothetical protein  YP_001393345  normal  0.546748  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0048  CDS  NC_009705  53494  53610  -  117  transposase, truncation  YP_001393346  normal  0.442638  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0049  CDS  NC_009705  53809  54195  -  387  putative lipoprotein  YP_001393347  normal  0.239714  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0050  CDS  NC_009705  54197  55375  -  1179  hypothetical protein  YP_001393348  normal  0.105275  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0051  CDS  NC_009705  55378  55914  -  537  hypothetical protein  YP_001393349  normal  0.0341142  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0052  CDS  NC_009705  56448  56867  +  420  mutagenesis and repair protein MucA  YP_001393350  hitchhiker  0.00205855  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0053  CDS  NC_009705  56870  58135  +  1266  mutagenesis and repair protein MucB  YP_001393351  hitchhiker  0.000259717  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0054  CDS  NC_009705  58370  58570  +  201  hypothetical protein  YP_001393352  hitchhiker  0.0000131489  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0055  CDS  NC_009705  58563  59291  +  729  hypothetical protein  YP_001393353  decreased coverage  0.0000504638  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0056  CDS  NC_009705  59791  60450  +  660  hypothetical protein  YP_001393354  hitchhiker  0.000481012  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0057  CDS  NC_009705  60616  61206  +  591  hypothetical protein  YP_001393355  hitchhiker  0.00283817  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0058  CDS  NC_009705  61336  62319  +  984  hypothetical protein  YP_001393356  normal  0.0325671  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0059  CDS  NC_009705  62291  63076  +  786  hypothetical protein  YP_001393357  normal  0.13611  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0060  CDS  NC_009705  63339  63545  +  207  virulence modulating protein  YP_001393358  normal  0.158481  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0061  CDS  NC_009705  63912  65165  +  1254  hypothetical protein  YP_001393359  normal  0.251206  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0062  CDS  NC_009705  65878  66474  +  597  GTP cyclohydrolase II  YP_001393360  normal  0.35524  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0063  CDS  NC_009705  66487  68148  +  1662  hypothetical protein  YP_001393361  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0064  CDS  NC_009705  68249  69187  +  939  hypothetical protein  YP_001393362  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0065  CDS  NC_009705  69197  71044  +  1848  hypothetical protein  YP_001393363  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0066  CDS  NC_009705  71244  72476  +  1233  hypothetical protein  YP_001393364  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0067  CDS  NC_009705  72485  73063  +  579  putative oxidoreductase  YP_001393365  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0068  CDS  NC_009705  74150  74806  -  657  hypothetical protein  YP_001393366  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0069  CDS  NC_009705  75295  75567  -  273  hypothetical protein  YP_001393367  normal  0.585105  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0070  CDS  NC_009705  75564  76358  -  795  hypothetical protein  YP_001393368  normal  0.44763  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0071  CDS  NC_009705  76523  77980  -  1458  hypothetical protein  YP_001393369  normal  0.150336  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0072  CDS  NC_009705  78329  79402  -  1074  hypothetical protein  YP_001393370  normal  0.0197912  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0073  CDS  NC_009705  82045  82290  -  246  ChpR family protein  YP_001393371  normal  0.261005  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0074  CDS  NC_009705  82551  83390  -  840  hypothetical protein  YP_001393372  normal  0.385434  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0075  CDS  NC_009705  83794  84912  -  1119  putative conjugal transfer protein TraE  YP_001393373  normal  0.465905  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0076  CDS  NC_009705  86182  87726  -  1545  hypothetical protein  YP_001393374  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0077  CDS  NC_009705  88093  89100  -  1008  hypothetical protein  YP_001393375  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0078  CDS  NC_009705  89530  89916  -  387  hypothetical protein  YP_001393376  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0079  CDS  NC_009705  89918  91330  -  1413  hypothetical protein  YP_001393377  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0080  CDS  NC_009705  91343  91930  -  588  hypothetical protein  YP_001393378  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0081  CDS  NC_009705  92100  92549  +  450  hypothetical protein  YP_001393379  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0082  CDS  NC_009705  92987  93670  +  684  hypothetical protein  YP_001393380  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0083  CDS  NC_009705  93811  94704  -  894  hypothetical protein  YP_001393381  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0084  CDS  NC_009705  95269  95619  -  351  hypothetical protein  YP_001393382  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0085  CDS  NC_009705  95833  96606  +  774  hypothetical protein  YP_001393383  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0086  CDS  NC_009705  97034  97675  +  642  hypothetical protein  YP_001393384  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0087  CDS  NC_009705  97665  98189  +  525  hypothetical protein  YP_001393385  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0088  CDS  NC_009705  98182  98637  +  456  hypothetical protein  YP_001393386  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0089  CDS  NC_009705  98637  99281  +  645  hypothetical protein  YP_001393387  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0090  CDS  NC_009705  100218  101069  -  852  putative endonuclease  YP_001393388  normal  0.670924  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0091  CDS  NC_009705  101361  102191  -  831  hypothetical protein  YP_001393389  normal  0.885956  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0092  CDS  NC_009705  102713  103843  +  1131  putative integrase family protein  YP_001393390  normal  0.967916  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0093  CDS  NC_009705  104452  105609  -  1158  DNA-binding protein  YP_001393391  normal  0.569679  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0094  CDS  NC_009705  106241  106351  -  111  hypothetical protein  YP_001393392  normal  0.324372  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0095  CDS  NC_009705  106389  107120  +  732  hypothetical protein  YP_001393393  normal  0.278481  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0096  CDS  NC_009705  107209  107700  +  492  hypothetical protein  YP_001393394  normal  0.463984  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0097  CDS  NC_009705  107749  110271  -  2523  type IV secretion system protein DotA-like protein  YP_001393395  normal  0.551932  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0098  CDS  NC_009705  110541  111107  +  567  hypothetical protein  YP_001393396  normal  0.0251959  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0099  CDS  NC_009705  111501  112385  -  885  putative lipoprotein  YP_001393397  normal  0.03811  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_B0100  CDS  NC_009705  112397  112963  -  567  hypothetical protein  YP_001393398  normal  0.397154  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>