65 genes were found for organism Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
YpsIP31758_A0001  CDS  NC_009704  26005  27261  +  1257  shufflon protein, N-terminal constant region  YP_001393262  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0002  CDS  NC_009704  27495  27896  +  402  hypothetical protein  YP_001393263  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0003  CDS  NC_009704  27901  28332  +  432  type IV pilus biogenesis protein PilM  YP_001393264  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0004  CDS  NC_009704  28344  28967  +  624  hypothetical protein  YP_001393265  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0005  CDS  NC_009704  28986  29492  +  507  transglycosylase SLT domain-containing protein  YP_001393266  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0006  CDS  NC_009704  29517  30002  +  486  hypothetical protein  YP_001393267  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0007  CDS  NC_009704  30036  30335  +  300  hypothetical protein  YP_001393268  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0008  CDS  NC_009704  30468  30716  +  249  hypothetical protein  YP_001393269  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0009  CDS  NC_009704  30797  31144  +  348  single-strand binding protein family protein  YP_001393270  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0010  CDS  NC_009704  32134  32799  -  666  hypothetical protein  YP_001393271  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0011  CDS  NC_009704  32812  32982  -  171  hypothetical protein  YP_001393272  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0012  CDS  NC_009704  33378  33923  +  546  hypothetical protein  YP_001393273  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0013  CDS  NC_009704  34385  34684  +  300  hypothetical protein  YP_001393274  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0014  CDS  NC_009704  35038  35337  +  300  hypothetical protein  YP_001393275  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0015  CDS  NC_009704  35377  35859  +  483  type IV pilus biogenesis protein PilT  YP_001393276  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0016  CDS  NC_009704  36026  36691  -  666  surface exclusion protien  YP_001393277  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0017  CDS  NC_009704  36756  37538  -  783  hypothetical protein  YP_001393278  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0018  CDS  NC_009704  37549  38265  -  717  hypothetical protein  YP_001393279  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0019  CDS  NC_009704  38579  39370  +  792  putative integrase/resolvase  YP_001393280  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0020  CDS  NC_009704  39675  42635  -  2961  DNA primase TraC  YP_001393282  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0021  CDS  NC_009704  39534  39689  +  156  hypothetical protein  YP_001393281  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0022  CDS  NC_009704  42628  42861  -  234  putative conjugal transfer protein TraD  YP_001393283  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0023  CDS  NC_009704  42867  44906  -  2040  DNA topoisomerase III  YP_001393284  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0024  CDS  NC_009704  44942  45466  -  525  conjugal transfer peptidase TraF  YP_001393285  normal  0.0928495  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0025  CDS  NC_009704  45463  47400  -  1938  conjugal transfer coupling protein TraG  YP_001393286  hitchhiker  0.000549825  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0026  CDS  NC_009704  47397  50018  -  2622  conjugal transfer relaxase TraI  YP_001393287  hitchhiker  0.0000000000771366  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0027  CDS  NC_009704  50056  50412  -  357  conjugal transfer relaxosome component TraJ  YP_001393288  hitchhiker  1.88401e-23  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0028  CDS  NC_009704  50435  50554  -  120  hypothetical protein  YP_001393289  hitchhiker  6.515950000000001e-23  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0029  CDS  NC_009704  50746  51123  +  378  conjugal transfer protein TraK  YP_001393290  hitchhiker  7.086299999999999e-21  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0030  CDS  NC_009704  51135  51863  +  729  conjugal transfer protein TraL  YP_001393291  hitchhiker  4.98281e-16  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0031  CDS  NC_009704  51860  52300  +  441  conjugal transfer protein TraM  YP_001393292  hitchhiker  0.0000000000000204915  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0032    NC_009704  52464  53483  -  1020      hitchhiker  0.000000000215851  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0033  CDS  NC_009704  53734  54021  +  288  hypothetical protein  YP_001393293  hitchhiker  0.000151867  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0034  CDS  NC_009704  54309  54728  +  420  hypothetical protein  YP_001393294  hitchhiker  0.00315651  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0035  CDS  NC_009704  54761  55000  +  240  hypothetical protein  YP_001393295  normal  0.0233127  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0036  CDS  NC_009704  55088  55408  -  321  hypothetical protein  YP_001393296  normal  0.0971324  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0037  CDS  NC_009704  55522  56574  -  1053  transcription repressor protein KorB  YP_001393297  normal  0.871786  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0038  CDS  NC_009704  56571  57656  -  1086  plasmid partition protein  YP_001393298  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0040  CDS  NC_009704  57838  58155  -  318  putative stable inheritance protein  YP_001393299  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0041  CDS  NC_009704  519  1556  -  1038  hypothetical protein  YP_001393236  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0042  CDS  NC_009704  1836  2138  -  303  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  YP_001393237  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0043  CDS  NC_009704  2126  2416  -  291  hypothetical protein  YP_001393238  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0044  CDS  NC_009704  3354  3650  -  297  hypothetical protein  YP_001393239  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0045  CDS  NC_009704  3928  4839  -  912  hypothetical protein  YP_001393240  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0046  CDS  NC_009704  5634  6002  +  369  conjugal transfer protein TrbA  YP_001393241  normal  0.91014  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0047  CDS  NC_009704  6020  7120  +  1101  conjugal transfer ATPase TrbB  YP_001393242  normal  0.435739  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0048  CDS  NC_009704  7133  7513  +  381  conjugal transfer protein TrbC  YP_001393243  normal  0.338701  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0049  CDS  NC_009704  7516  7830  +  315  conjugal transfer protein TrbD  YP_001393244  normal  0.635043  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0050  CDS  NC_009704  7823  10360  +  2538  conjugal transfer protein TrbE  YP_001393245  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0051  CDS  NC_009704  10357  11079  +  723  conjugal transfer protein TrbF  YP_001393246  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0052  CDS  NC_009704  11094  11981  +  888  conjugal transfer protein TrbG  YP_001393247  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0053  CDS  NC_009704  11984  12433  +  450  conjugal transfer protein TrbH  YP_001393248  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0054  CDS  NC_009704  12438  13817  +  1380  conjugal transfer protein TrbI  YP_001393249  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0055  CDS  NC_009704  13835  14611  +  777  conjugal transfer protein TrbJ  YP_001393250  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0056  CDS  NC_009704  14774  16195  +  1422  conjugal transfer protein TrbL/VirB6  YP_001393251  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0057  CDS  NC_009704  16248  16868  +  621  conjugal transfer protein TrbN  YP_001393252  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0058  CDS  NC_009704  16987  17466  +  480  transcriptional activator  YP_001393253  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0059  CDS  NC_009704  17489  18421  +  933  putative secretion system protein PilL  YP_001393254  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0060  CDS  NC_009704  18434  20140  +  1707  PilN family type IV pilus biogenesis protein  YP_001393255  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0061  CDS  NC_009704  20150  21484  +  1335  putative type IV secretion system protein PilO2  YP_001393256  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0062  CDS  NC_009704  21471  21914  +  444  type IV pilus biogenesis/secretion protein PilP  YP_001393257  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0063  CDS  NC_009704  21911  23443  +  1533  putative type IV secretion system protein PilQ  YP_001393258  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0064  CDS  NC_009704  23436  24500  +  1065  putative type IV secretion system protein PilR  YP_001393259  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0065  CDS  NC_009704  24517  25023  +  507  putative type IV secretion system protein PilS2  YP_001393260  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_A0066  CDS  NC_009704  25039  25992  +  954  type IV secretion system protein  YP_001393261  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>