98 genes were found for organism Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
YpAngola_B0001  CDS  NC_010157  103  717  +  615  integrase core subunit  YP_001604437  normal  1  normal  0.274298  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0002  CDS  NC_010157  780  1172  -  393  YopE regulator YerA  YP_001604438  normal  1  normal  0.350003  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0003  CDS  NC_010157  1366  2025  +  660  outer membrane virulence protein YopE  YP_001604439  normal  1  normal  0.292287  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0004  CDS  NC_010157  2165  2464  -  300  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  YP_001604440  normal  1  normal  0.232384  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0005  CDS  NC_010157  2457  2699  -  243  CC2985 family addiction module antidote protein  YP_001604441  normal  1  normal  0.182538  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0006  CDS  NC_010157  3243  3416  +  174  hypothetical protein  YP_001604442  normal  1  normal  0.114582  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0007  CDS  NC_010157  3533  3850  +  318  hypothetical protein  YP_001604443  normal  1  normal  0.127816  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0008  CDS  NC_010157  3961  4926  -  966  plasmid-partitioning protein  YP_001604444  normal  1  normal  0.188709  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0009  CDS  NC_010157  4923  6089  -  1167  plasmid-partitioning protein SopA  YP_001604445  normal  1  normal  0.0766545  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0010  CDS  NC_010157  6638  6751  +  114  hypothetical protein  YP_001604446  normal  0.6331  normal  0.0989113  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0011    NC_010157  6889  7653  -  765      normal  0.49726  normal  0.136747  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0012  CDS  NC_010157  7677  7994  -  318  transposase  YP_001604447  normal  0.671169  normal  0.107805  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0013    NC_010157  8101  8851  -  751      normal  0.486549  normal  0.136128  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0014    NC_010157  8852  9184  -  333      normal  0.122978  normal  0.0662754  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0015  CDS  NC_010157  9328  9876  -  549  YopK protein  YP_001604448  normal  0.0546716  normal  0.0466201  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0016  CDS  NC_010157  10376  11344  +  969  cysteine protease YopT  YP_001604449  normal  0.0918474  normal  0.0316711  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0017  CDS  NC_010157  11344  11742  +  399  YopT-specific chaperone SycT  YP_001604450  normal  0.220523  normal  0.0290828  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0018  CDS  NC_010157  11786  12097  -  312  hypothetical protein  YP_001604451  normal  0.180387  normal  0.0377005  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0019    NC_010157  12097  12429  +  333      normal  0.18633  normal  0.0387146  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0020  CDS  NC_010157  12447  12866  +  420  hypothetical protein  YP_001604452  normal  0.208936  normal  0.0417317  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0021  CDS  NC_010157  12823  12954  +  132  hypothetical protein  YP_001604453  normal  0.154993  normal  0.0346713  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0022  CDS  NC_010157  13125  13244  +  120  hypothetical protein  YP_001604454  normal  0.113879  normal  0.0350747  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0023  CDS  NC_010157  13394  13516  -  123  putative transposase, truncation  YP_001604455  normal  0.0855648  normal  0.103449  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0024  CDS  NC_010157  13760  14059  +  300  putative transposase, truncation  YP_001604456  normal  0.0871155  normal  0.267888  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0025  CDS  NC_010157  14102  15268  -  1167  effector protein YopM  YP_001604457  normal  0.012796  normal  0.260783  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0026  CDS  NC_010157  15406  15531  +  126  hypothetical protein  YP_001604458  normal  0.183508  normal  0.24584  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0027  CDS  NC_010157  15599  15808  -  210  hypothetical protein  YP_001604459  normal  0.262931  normal  0.168769  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0028    NC_010157  15788  16466  +  679      normal  0.426889  normal  0.164006  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0029  CDS  NC_010157  16934  17854  -  921  translocator protein YopD  YP_001604460  normal  1  normal  0.240018  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0030  CDS  NC_010157  17873  19078  -  1206  translocator protein YopB  YP_001604461  normal  1  normal  0.556106  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0031  CDS  NC_010157  19056  19562  -  507  type III secretion low calcium response chaperone LcrH  YP_001604462  normal  1  normal  0.768005  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0032  CDS  NC_010157  19575  20555  -  981  virulence-associated V antigen LcrV  YP_001604463  normal  0.800412  normal  0.883363  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0033  CDS  NC_010157  20557  20844  -  288  type III secretion protein LcrG  YP_001604464  normal  0.393247  normal  0.925985  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0034  CDS  NC_010157  20886  21326  -  441  type III secretion system regulator LcrR  YP_001604465  normal  0.627747  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0035  CDS  NC_010157  21323  23437  -  2115  type III secretion protein LcrD  YP_001604466  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0036  CDS  NC_010157  23424  23768  -  345  type III secretion chaperone YscY  YP_001604467  normal  0.144179  normal  0.888827  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0037  CDS  NC_010157  23765  24133  -  369  type III secretion protein YscX  YP_001604468  normal  0.060691  normal  0.904901  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0038  CDS  NC_010157  24130  24501  -  372  YopN-specific chaperone SycN  YP_001604469  normal  0.0156732  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0039  CDS  NC_010157  24488  24766  -  279  type III secretion effector delivery regulator TyeA  YP_001604470  normal  0.0173693  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0040  CDS  NC_010157  24747  25628  -  882  type III secretion regulator YopN  YP_001604471  hitchhiker  0.00159694  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0041  CDS  NC_010157  25826  27145  +  1320  type III secretion system ATPase  YP_001604472  hitchhiker  0.0000000570854  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0042  CDS  NC_010157  27142  27606  +  465  type III secretion protein YscO  YP_001604473  hitchhiker  0.00000000000384931  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0043  CDS  NC_010157  27606  28973  +  1368  type III secretion system needle length determinant YscP  YP_001604474  decreased coverage  5.35952e-19  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0044  CDS  NC_010157  28970  29893  +  924  type III secretion system protein  YP_001604475  hitchhiker  0.000000000000156559  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0045  CDS  NC_010157  29890  30543  +  654  type III secretion system protein  YP_001604476  hitchhiker  0.00000000772372  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0046  CDS  NC_010157  30545  30811  +  267  type III secretion apparatus protein YscS  YP_001604477  hitchhiker  0.000000568257  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0047  CDS  NC_010157  30808  31593  +  786  type III secretion apparatus protein YscT  YP_001604478  hitchhiker  0.0000121402  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0048  CDS  NC_010157  31593  32657  +  1065  type III secretion appartus protein YscU  YP_001604479  hitchhiker  0.000158953  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0049  CDS  NC_010157  33232  33627  +  396  type III secretion system chaperone VirG  YP_001604480  normal  0.0320424  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0050  CDS  NC_010157  33751  34566  +  816  thermoregulatory protein LcrF  YP_001604481  normal  0.24501  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0051  CDS  NC_010157  34744  34875  +  132  hypothetical protein  YP_001604482  normal  0.655604  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0052  CDS  NC_010157  34969  35382  +  414  YopN-specific chaperone YscB  YP_001604483  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0053  CDS  NC_010157  37185  37337  -  153  hypothetical protein  YP_001604485  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0054  CDS  NC_010157  35373  37211  +  1839  type III secretion outer membrane pore YscC  YP_001604484  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0055  CDS  NC_010157  37208  38467  +  1260  type III secretion apparatus protein YscD  YP_001604486  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0056  CDS  NC_010157  38464  38664  +  201  type III secretion appartus protein YscE  YP_001604487  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0057  CDS  NC_010157  38665  38928  +  264  type III secretion apparatus needle protein YscF  YP_001604488  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0058  CDS  NC_010157  38930  39277  +  348  type III secretion chaperone YscG  YP_001604489  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0059  CDS  NC_010157  39274  39771  +  498  type III secretion protein YopR  YP_001604490  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0060  CDS  NC_010157  39772  40119  +  348  type III secretion apparatus protein YscI  YP_001604491  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0061  CDS  NC_010157  40126  40860  +  735  type III secretion apparatus lipoprotein YscJ  YP_001604492  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0062  CDS  NC_010157  40863  41489  +  627  type III secretion apparatus protein YscK  YP_001604493  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0063  CDS  NC_010157  41468  42100  +  633  type III secretion system protein  YP_001604494  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0064  CDS  NC_010157  42325  42672  +  348  type III secretion apparatus protein YscM  YP_001604495  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0065  CDS  NC_010157  43220  43486  +  267  transposase  YP_001604496  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0066    NC_010157  43510  44540  +  1031      normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0067  CDS  NC_010157  44761  46167  -  1407  protein-tyrosine-phosphatase YopH  YP_001604497  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0068  CDS  NC_010157  46450  46656  -  207  putative transposase, truncation  YP_001604498  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0069  CDS  NC_010157  46728  47264  +  537  integrase core subunit  YP_001604499  normal  0.8827  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0070  CDS  NC_010157  47850  48716  -  867  effector protein YopJ  YP_001604500  normal  0.218206  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0071  CDS  NC_010157  48717  48851  -  135  hypothetical protein  YP_001604501  normal  0.259273  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0072  CDS  NC_010157  49112  51301  -  2190  protein kinase YopO  YP_001604502  normal  0.451248  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0073  CDS  NC_010157  51309  51758  -  450  putative type III secretion chaperone  YP_001604503  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0074    NC_010157  52014  52341  -  328      normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0075  CDS  NC_010157  52489  52728  -  240  hypothetical protein  YP_001604504  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0076  CDS  NC_010157  52699  52821  +  123  hypothetical protein  YP_001604505  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0077  CDS  NC_010157  53003  53143  -  141  hypothetical protein  YP_001604506  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0078  CDS  NC_010157  53900  54766  -  867  replication protein  YP_001604507  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0079  CDS  NC_010157  54759  54833  -  75  RepA leader peptide Tap  YP_001604508  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0080  CDS  NC_010157  55075  55329  -  255  replication protein  YP_001604509  normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0081  CDS  NC_010157  56132  56539  -  408  hypothetical protein  YP_001604510  normal  1  normal  0.773542  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0082  CDS  NC_010157  56563  56880  -  318  transposase  YP_001604511  normal  1  normal  0.76598  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0083    NC_010157  57052  57510  -  459      normal  1  normal  0.705767  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0084  CDS  NC_010157  57660  57848  +  189  putative transposase, truncation  YP_001604512  normal  1  normal  0.757347  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0085  CDS  NC_010157  57881  58171  +  291  hypothetical protein  YP_001604513  normal  1  normal  0.775477  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0086    NC_010157  58177  59486  -  1310      normal  1  normal  0.810971  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0087  CDS  NC_010157  59982  60101  -  120  hypothetical protein  YP_001604514  normal  1  normal  0.566535  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0088  CDS  NC_010157  60460  62775  -  2316  transposase  YP_001604516  normal  1  normal  0.560561  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0089  CDS  NC_010157  60083  60463  +  381  putative transposase  YP_001604515  normal  1  normal  0.532302  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0090  CDS  NC_010157  62939  63490  +  552  resolvase TnpR  YP_001604517  normal  0.707126  normal  0.345515  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0091  CDS  NC_010157  63509  63973  +  465  hypothetical protein  YP_001604518  normal  0.451906  normal  0.224509  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0092  CDS  NC_010157  64112  64441  +  330  hypothetical protein  YP_001604519  normal  0.888289  normal  0.298687  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0093  CDS  NC_010157  64541  64807  +  267  transposase  YP_001604520  normal  1  normal  0.426296  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0094  CDS  NC_010157  64831  65640  +  810  integrase core subunit  YP_001604521  normal  1  normal  0.445692  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0095  CDS  NC_010157  65788  66213  -  426  YopH-specific chaperone SycH  YP_001604522  normal  1  normal  0.401275  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0096  CDS  NC_010157  66557  66988  -  432  putative insertion sequence ATP-binding protein  YP_001604523  normal  1  normal  0.234743  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0097  CDS  NC_010157  66988  67890  -  903  integrase core subunit  YP_001604524  normal  1  normal  0.368489  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_B0098  ncRNA  NC_010157  54851  54940  +  90  CopA-like RNA    normal  1  normal  1  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>