2240 genes were found for organism Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 23    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Amuc_0001  CDS  NC_010655  793  1353  -  561  NUDIX hydrolase  YP_001876629  normal  0.621893  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0002  CDS  NC_010655  1882  3288  +  1407  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_001876630  normal  0.504592  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0003  CDS  NC_010655  3438  4373  +  936  ABC transporter related  YP_001876631  normal  0.445352  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0004  CDS  NC_010655  4429  5211  +  783  hypothetical protein  YP_001876632  normal  0.750522  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0005  CDS  NC_010655  5246  6817  +  1572  hypothetical protein  YP_001876633  normal  0.206267  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0006  CDS  NC_010655  6846  8900  +  2055  hypothetical protein  YP_001876634  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0007  CDS  NC_010655  8914  9693  +  780  protein of unknown function DUF34  YP_001876635  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0008  CDS  NC_010655  9710  10681  +  972  pseudouridine synthase, RluA family  YP_001876636  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0009  CDS  NC_010655  11054  12211  +  1158  chorismate mutase  YP_001876637  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0010  CDS  NC_010655  12257  13873  +  1617  Alpha-L-fucosidase  YP_001876638  normal  0.886548  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0011  CDS  NC_010655  13898  16282  +  2385  DNA ligase, NAD-dependent  YP_001876639  normal  0.996124  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0012  CDS  NC_010655  16460  17068  +  609  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  YP_001876640  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0013  CDS  NC_010655  17172  17333  +  162  hypothetical protein  YP_001876641  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0014  CDS  NC_010655  17295  18533  -  1239  hypothetical protein  YP_001876642  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0015  CDS  NC_010655  19074  20345  +  1272  DEAD/DEAH box helicase domain protein  YP_001876643  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0016  CDS  NC_010655  20457  21065  +  609  hypothetical protein  YP_001876644  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0017  CDS  NC_010655  21561  23006  +  1446  oxidoreductase domain protein  YP_001876645  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0018  CDS  NC_010655  23308  24450  +  1143  hypothetical protein  YP_001876646  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0019  CDS  NC_010655  24455  25414  +  960  hypothetical protein  YP_001876647  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0020  CDS  NC_010655  25433  26587  -  1155  putative MFS family transporter protein  YP_001876648  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0021  CDS  NC_010655  26737  28134  -  1398  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  YP_001876649  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0022  CDS  NC_010655  28275  28985  +  711  lipolytic protein G-D-S-L family  YP_001876650  normal  1  normal  0.954295  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0023  CDS  NC_010655  29374  30150  +  777  phenazine biosynthesis protein PhzF family  YP_001876651  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0024  CDS  NC_010655  30657  31256  +  600  protein of unknown function DUF204  YP_001876652  normal  1  normal  0.992365  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0025  CDS  NC_010655  31260  33593  +  2334  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  YP_001876653  normal  1  normal  0.688717  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0026  CDS  NC_010655  33610  34827  +  1218  hypothetical protein  YP_001876654  normal  1  normal  0.609145  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0027  CDS  NC_010655  35058  36437  -  1380  AAA ATPase central domain protein  YP_001876655  normal  1  normal  0.797145  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0028  CDS  NC_010655  36545  36940  -  396  hypothetical protein  YP_001876656  normal  1  normal  0.606752  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0029  CDS  NC_010655  37306  38232  -  927  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_001876657  normal  1  normal  0.497032  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0030  CDS  NC_010655  38259  39353  -  1095  hypothetical protein  YP_001876658  normal  1  normal  0.549525  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0031  CDS  NC_010655  39366  40241  -  876  hypothetical protein  YP_001876659  normal  1  normal  0.426299  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0032  CDS  NC_010655  40350  41069  -  720  hypothetical protein  YP_001876660  normal  1  normal  0.553496  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0033  CDS  NC_010655  41173  41865  +  693  peptidase M50  YP_001876661  normal  1  normal  0.756035  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0034  CDS  NC_010655  41923  43443  +  1521  prolyl-tRNA synthetase  YP_001876662  normal  1  normal  0.599841  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0035  CDS  NC_010655  44582  44995  -  414  hypothetical protein  YP_001876663  normal  1  normal  0.366312  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0036  CDS  NC_010655  45594  51467  -  5874  YD repeat protein  YP_001876664  normal  1  normal  0.13873  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0037  CDS  NC_010655  51964  53448  +  1485  amino acid permease-associated region  YP_001876665  normal  1  normal  0.877998  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0038  CDS  NC_010655  53441  54382  +  942  glutaminase  YP_001876666  normal  1  normal  0.744531  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0039  CDS  NC_010655  54611  55021  -  411  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001876667  normal  1  normal  0.42411  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0040  CDS  NC_010655  55485  56894  +  1410  amino acid carrier protein  YP_001876668  normal  1  normal  0.489781  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0041  CDS  NC_010655  57297  58373  +  1077  peptide chain release factor 1  YP_001876669  normal  1  normal  0.334875  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0042  CDS  NC_010655  58390  59295  +  906  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  YP_001876670  normal  1  normal  0.24008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0043  CDS  NC_010655  59317  61533  +  2217  primosomal protein N'  YP_001876671  normal  1  normal  0.401318  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0044  CDS  NC_010655  61593  62417  +  825  Diaminopimelate epimerase  YP_001876672  normal  1  normal  0.315608  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0045  CDS  NC_010655  62461  63240  -  780  hypothetical protein  YP_001876673  normal  1  normal  0.500079  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0046  CDS  NC_010655  63380  63646  -  267  hypothetical protein  YP_001876674  normal  1  normal  0.624498  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0047  CDS  NC_010655  63997  64668  +  672  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  YP_001876675  normal  1  normal  0.601084  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0048  CDS  NC_010655  64665  66170  +  1506  MATE efflux family protein  YP_001876676  normal  1  normal  0.331446  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0049  CDS  NC_010655  66361  66591  -  231  hypothetical protein  YP_001876677  normal  1  normal  0.200113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0050    NC_010655  66594  67443  -  850      normal  0.460836  normal  0.194809  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0051  CDS  NC_010655  68018  69757  -  1740  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  YP_001876678  normal  0.458674  normal  0.205446  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0052  CDS  NC_010655  69948  72809  -  2862  Hyalurononglucosaminidase  YP_001876679  normal  0.110511  normal  0.10576  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0053  CDS  NC_010655  73252  74193  +  942  periplasmic solute binding protein  YP_001876680  normal  0.0166309  normal  0.103773  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0054  CDS  NC_010655  74190  74624  +  435  hypothetical protein  YP_001876681  normal  0.0144492  normal  0.105165  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0055  CDS  NC_010655  74621  75421  +  801  ABC transporter related  YP_001876682  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0056  CDS  NC_010655  75418  76281  +  864  ABC-3 protein  YP_001876683  normal  0.0649375  normal  0.0936265  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0057  CDS  NC_010655  76349  76885  +  537  UvrB/UvrC protein  YP_001876684  decreased coverage  0.00323429  normal  0.240627  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0058  CDS  NC_010655  76891  77946  +  1056  ATP:guanido phosphotransferase  YP_001876685  decreased coverage  0.00335671  normal  0.178856  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0059  CDS  NC_010655  77975  80557  +  2583  ATPase AAA-2 domain protein  YP_001876686  normal  0.0310475  normal  0.148916  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0060  CDS  NC_010655  80688  83234  +  2547  Alpha-N-acetylglucosaminidase  YP_001876687  normal  0.741522  normal  0.0337012  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0061    NC_010655  84259  85335  +  1077      normal  1  normal  0.0559751  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0062  CDS  NC_010655  85349  86056  +  708  hypothetical protein  YP_001876688  normal  1  normal  0.0902551  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0063  CDS  NC_010655  86369  86710  -  342  Rhodanese domain protein  YP_001876689  normal  1  normal  0.0402698  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0064  CDS  NC_010655  86946  87824  -  879  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  YP_001876690  normal  1  normal  0.0263266  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0065  CDS  NC_010655  87991  89547  +  1557  2-isopropylmalate synthase  YP_001876691  normal  1  normal  0.0518457  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0066  CDS  NC_010655  89669  90583  +  915  putative ATP/GTP-binding protein  YP_001876692  normal  1  normal  0.268496  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0067  CDS  NC_010655  90682  91158  +  477  GatB/YqeY domain protein  YP_001876693  normal  1  normal  0.222802  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0068  CDS  NC_010655  91155  91850  +  696  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  YP_001876694  normal  1  normal  0.474681  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0069  CDS  NC_010655  91847  92701  +  855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_001876695  normal  0.656046  normal  0.384268  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0070  CDS  NC_010655  92893  93858  +  966  tryptophanyl-tRNA synthetase  YP_001876696  normal  0.229775  normal  0.611279  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0071  CDS  NC_010655  93947  94417  +  471  UspA domain protein  YP_001876697  normal  0.041598  normal  0.631556  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0072  CDS  NC_010655  94451  95254  +  804  metallophosphoesterase  YP_001876698  normal  0.0392512  normal  0.60167  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0073  CDS  NC_010655  95579  96373  +  795  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  YP_001876699  hitchhiker  0.000480961  normal  0.411412  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0074  CDS  NC_010655  96370  96885  +  516  hypothetical protein  YP_001876700  hitchhiker  0.00000192549  normal  0.366312  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0075  CDS  NC_010655  97286  98353  -  1068  PfkB domain protein  YP_001876701  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0076  CDS  NC_010655  98743  99246  +  504  NUDIX hydrolase  YP_001876702  hitchhiker  0.0000742195  normal  0.603343  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0077  CDS  NC_010655  100094  101293  +  1200  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  YP_001876703  normal  0.0554618  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0078  CDS  NC_010655  101329  103947  +  2619  serine/threonine protein kinase  YP_001876704  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0079  CDS  NC_010655  104109  104879  +  771  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_001876705  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0080  CDS  NC_010655  105086  107872  +  2787  serine/threonine protein kinase  YP_001876706  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0081  CDS  NC_010655  107958  108536  +  579  hypothetical protein  YP_001876707  normal  0.541096  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0082  CDS  NC_010655  108852  109427  -  576  hypothetical protein  YP_001876708  normal  0.18155  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0083  CDS  NC_010655  109564  110103  -  540  hypothetical protein  YP_001876709  normal  0.0982253  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0084  CDS  NC_010655  110100  111743  -  1644  hypothetical protein  YP_001876710  normal  0.0897347  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0085  CDS  NC_010655  112400  112657  +  258  thiamine biosynthesis protein ThiS  YP_001876711  normal  0.171422  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0086  CDS  NC_010655  112700  114601  +  1902  DNA mismatch repair protein MutL  YP_001876712  normal  0.243153  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0087  CDS  NC_010655  114737  114853  -  117  hypothetical protein  YP_001876713  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0088  CDS  NC_010655  114937  116889  +  1953  hypothetical protein  YP_001876714  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0089  CDS  NC_010655  117286  117642  +  357  protein of unknown function DUF488  YP_001876715  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0090  CDS  NC_010655  117979  118956  -  978  porphobilinogen deaminase  YP_001876716  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0091  CDS  NC_010655  118946  119968  -  1023  glutamyl-tRNA reductase  YP_001876717  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0092  CDS  NC_010655  119968  120726  -  759  cytochrome c assembly protein  YP_001876718  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0093  CDS  NC_010655  120747  121541  -  795  protein of unknown function DUF198  YP_001876719  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0094  CDS  NC_010655  121649  121894  -  246  ribosomal protein S18  YP_001876720  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0095  CDS  NC_010655  121926  122099  -  174  50S ribosomal protein L33  YP_001876721  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0096  CDS  NC_010655  122133  122756  -  624  transcriptional regulator, TraR/DksA family  YP_001876722  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0097  CDS  NC_010655  123193  124152  +  960  ROK family protein  YP_001876723  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0098  CDS  NC_010655  124157  125125  +  969  Fmu (Sun) domain protein  YP_001876724  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0099  CDS  NC_010655  125132  125641  +  510  phosphodiesterase, MJ0936 family  YP_001876725  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Amuc_0100  CDS  NC_010655  125638  126045  +  408  NUDIX hydrolase  YP_001876726  normal  1  normal  1  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 23    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>