1782 genes were found for organism Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 18    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
MTHE_0  tRNA  NC_008553  80001  80075  +  75  tRNA-OTHER    normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0001  CDS  NC_008553  100  1020  -  921  quinolinate synthetase complex, A subunit  YP_842444  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0002  CDS  NC_008553  1966  2574  -  609  hypothetical protein  YP_842445  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0003  CDS  NC_008553  2618  3631  -  1014  RNA 3'-terminal-phosphate cyclase  YP_842446  normal  0.382529  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0004  CDS  NC_008553  3628  3903  -  276  RNA polymerase, dimerisation  YP_842447  normal  0.627074  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0005  CDS  NC_008553  3914  4471  -  558  exosome complex RNA-binding protein Csl4  YP_842448  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0006  CDS  NC_008553  4476  5105  -  630  methyltransferase small  YP_842449  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0007  CDS  NC_008553  5227  6981  -  1755  putative ATPase RIL  YP_842450  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0008  CDS  NC_008553  6991  7410  -  420  hypothetical protein  YP_842451  normal  0.519212  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0009  CDS  NC_008553  8008  8286  +  279  MoaD family protein  YP_842452  normal  0.555142  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0010  CDS  NC_008553  8287  8682  +  396  molybdopterin biosynthesis MoaE  YP_842453  normal  0.235692  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0011  CDS  NC_008553  8661  8978  +  318  CutA1 divalent ion tolerance protein  YP_842454  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0012  CDS  NC_008553  9232  9699  +  468  hypothetical protein  YP_842455  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0013  CDS  NC_008553  10103  11386  +  1284  phenylacetate--CoA ligase  YP_842456  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0014  CDS  NC_008553  11419  11802  +  384  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase  YP_842457  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0015  CDS  NC_008553  11856  12287  +  432  UspA domain-containing protein  YP_842458  normal  0.246066  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0016  CDS  NC_008553  12657  13691  +  1035  radical SAM domain-containing protein  YP_842459  normal  0.238462  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0017  CDS  NC_008553  13730  14032  +  303  hypothetical protein  YP_842460  normal  0.758792  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0018  CDS  NC_008553  14069  15562  -  1494  radical SAM domain-containing protein  YP_842461  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0019  CDS  NC_008553  15964  17475  +  1512  hypothetical protein  YP_842462  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0020  CDS  NC_008553  17472  17858  +  387  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_842463  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0021  CDS  NC_008553  18006  18992  +  987  protein of unknown function Met10  YP_842464  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0022  CDS  NC_008553  19073  20974  -  1902  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit E  YP_842465  normal  0.737796  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0023  CDS  NC_008553  21000  21227  -  228  transcription factor  YP_842466  normal  0.466699  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0024  CDS  NC_008553  21765  22250  +  486  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  YP_842467  normal  0.321106  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0025  CDS  NC_008553  22247  23371  +  1125  3-isopropylmalate dehydrogenase  YP_842468  normal  0.0500752  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0026  CDS  NC_008553  23572  23808  +  237  DNA-directed RNA polymerase subunit H  YP_842469  normal  0.0350925  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0027  CDS  NC_008553  23826  25316  +  1491  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  YP_842470  normal  0.483388  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0028  CDS  NC_008553  25309  27123  +  1815  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  YP_842471  normal  0.274287  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0029  CDS  NC_008553  27132  29762  +  2631  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  YP_842472  normal  0.358518  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0030  CDS  NC_008553  29759  30913  +  1155  DNA-directed RNA polymerase subunit A''  YP_842473  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0031  CDS  NC_008553  30910  31221  +  312  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  YP_842474  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0032  CDS  NC_008553  31214  31645  +  432  NusA family protein  YP_842475  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0033  CDS  NC_008553  31707  32129  +  423  30S ribosomal protein S12P  YP_842476  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0034  CDS  NC_008553  32134  32691  +  558  30S ribosomal protein S7P  YP_842477  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0035  CDS  NC_008553  32799  33515  -  717  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  YP_842478  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0036  CDS  NC_008553  33791  34768  +  978  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  YP_842479  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0037  CDS  NC_008553  34770  35537  +  768  ABC-2 type transporter  YP_842480  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0038  CDS  NC_008553  35534  35950  -  417  hypothetical protein  YP_842481  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0039  CDS  NC_008553  36677  37084  +  408  hypothetical protein  YP_842482  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0040  CDS  NC_008553  37127  37600  +  474  hypothetical protein  YP_842483  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0041  CDS  NC_008553  37597  38292  +  696  triosephosphate isomerase  YP_842484  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0042  CDS  NC_008553  38297  38569  +  273  acylphosphatase  YP_842485  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0043  CDS  NC_008553  38588  38767  +  180  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_842486  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0044  CDS  NC_008553  38764  39939  +  1176  geranylgeranyl reductase  YP_842487  normal  0.345503  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0045  CDS  NC_008553  40177  40641  -  465  peptidylprolyl isomerase  YP_842488  normal  0.0601501  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0046  CDS  NC_008553  41252  43309  +  2058  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  YP_842489  normal  0.0357051  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0047  CDS  NC_008553  43314  43802  +  489  AsnC family transcriptional regulator  YP_842490  normal  0.0361845  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0048    NC_008553  43799  44323  +  525      normal  0.352936  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0049  CDS  NC_008553  44469  45704  +  1236  glutamyl-tRNA reductase  YP_842491  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0050  CDS  NC_008553  45701  46654  +  954  delta-aminolevulinic acid dehydratase  YP_842492  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0051  CDS  NC_008553  47213  47662  +  450  hypothetical protein  YP_842493  normal  0.54012  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0052  CDS  NC_008553  47742  48332  +  591  hypothetical protein  YP_842494  normal  0.15478  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0053  CDS  NC_008553  48431  49045  -  615  hypothetical protein  YP_842495  normal  0.0647937  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0054  CDS  NC_008553  49204  49476  -  273  hypothetical protein  YP_842496  normal  0.0338874  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0055  CDS  NC_008553  49689  50306  -  618  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  YP_842497  decreased coverage  0.00610804  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0056  CDS  NC_008553  50355  50627  -  273  gas vesicle synthesis family protein  YP_842498  decreased coverage  0.00544654  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0057  CDS  NC_008553  50640  51002  -  363  hypothetical protein  YP_842499  normal  0.0285502  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0058  CDS  NC_008553  50995  52050  -  1056  gas vesicle protein GvpN  YP_842500  normal  0.0714681  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0059  CDS  NC_008553  52091  52990  -  900  hypothetical protein  YP_842501  normal  0.317141  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0060  CDS  NC_008553  53028  53258  -  231  gas vesicle synthesis protein GvpA  YP_842502  normal  0.537884  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0061  CDS  NC_008553  53270  53494  -  225  gas vesicle synthesis protein GvpA  YP_842503  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0062  CDS  NC_008553  53506  53730  -  225  gas vesicle synthesis protein GvpA  YP_842504  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0063  CDS  NC_008553  53742  53966  -  225  gas vesicle synthesis protein GvpA  YP_842505  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0064  CDS  NC_008553  54364  54723  +  360  response regulator receiver protein  YP_842506  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0065  CDS  NC_008553  54727  55860  +  1134  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  YP_842507  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0066  CDS  NC_008553  55886  56485  +  600  hypothetical protein  YP_842508  normal  0.903506  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0067  CDS  NC_008553  56694  57083  +  390  PadR-like family transcriptional regulator  YP_842509  normal  0.995572  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0068  CDS  NC_008553  57080  57760  +  681  signal transduction ATPase  YP_842510  normal  0.580007  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0069  CDS  NC_008553  58024  58272  +  249  hypothetical protein  YP_842511  normal  0.5251  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0070  CDS  NC_008553  58334  58714  +  381  gas vesicle protein GVPa  YP_842512  normal  0.471557  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0071  CDS  NC_008553  58704  59396  +  693  gas vesicle protein GVPa  YP_842513  normal  0.0463018  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0072  CDS  NC_008553  59420  59734  +  315  gas vesicle K  YP_842514  normal  0.349915  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0073  CDS  NC_008553  59721  60755  +  1035  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  YP_842515  normal  0.494868  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0074  CDS  NC_008553  61853  62692  -  840  hypothetical protein  YP_842516  normal  0.355584  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0075  CDS  NC_008553  62703  63122  -  420  hypothetical protein  YP_842517  normal  0.8926  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0076  CDS  NC_008553  63154  63480  -  327  PRC-barrel domain-containing protein  YP_842518  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0077  CDS  NC_008553  63480  65699  -  2220  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  YP_842519  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0078  CDS  NC_008553  65888  67762  -  1875  peptidyl-arginine deiminase  YP_842520  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0079  CDS  NC_008553  67781  68416  -  636  30S ribosomal protein S3Ae  YP_842521  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0080  CDS  NC_008553  68755  69627  -  873  ATP phosphoribosyltransferase  YP_842522  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0081  CDS  NC_008553  70157  70969  +  813  hypothetical protein  YP_842523  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0082  CDS  NC_008553  71407  73314  -  1908  beta-lactamase domain-containing protein  YP_842524  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0083  CDS  NC_008553  73335  73958  -  624  proteasome endopeptidase complex  YP_842525  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0084  CDS  NC_008553  74262  75470  +  1209  ammonium transporter  YP_842526  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0085  CDS  NC_008553  75480  75818  +  339  nitrogen regulatory protein P-II  YP_842527  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0086  CDS  NC_008553  76187  78097  +  1911  acetyl-CoA hydrolase/transferase  YP_842528  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0087  CDS  NC_008553  78173  79273  -  1101  TPR repeat-containing protein  YP_842529  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0088  CDS  NC_008553  80258  80890  +  633  hypothetical protein  YP_842530  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0089  CDS  NC_008553  81214  81831  -  618  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  YP_842531  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0090  CDS  NC_008553  81828  82277  -  450  hypothetical protein  YP_842532  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0091  CDS  NC_008553  82941  83873  +  933  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  YP_842533  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0092  CDS  NC_008553  83870  84718  +  849  ABC transporter related  YP_842534  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0093  CDS  NC_008553  85407  86447  +  1041  TGS domain-containing protein  YP_842535  normal  0.0617741  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0094  CDS  NC_008553  86633  87010  +  378  carboxymuconolactone decarboxylase  YP_842536  normal  0.0425129  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0095  CDS  NC_008553  87152  87955  -  804  hypothetical protein  YP_842537  normal  0.342459  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0096  CDS  NC_008553  87952  88998  -  1047  AsnC family transcriptional regulator  YP_842538  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0097  CDS  NC_008553  89794  90270  -  477  hypothetical protein  YP_842539  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0098  CDS  NC_008553  90267  91055  -  789  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  YP_842540  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Mthe_0099  CDS  NC_008553  91052  93358  -  2307  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  YP_842541  normal  1  n/a    Methanosaeta thermophila PT  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 18    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>