179 genes were found for organism Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Acry_3292  CDS  NC_009468  42  3290  3249  DNA polymerase III, alpha subunit  YP_001220047  normal  0.0677218  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3293  CDS  NC_009468  3287  4855  1569  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  YP_001220048  normal  0.247641  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3294    NC_009468  4788  5504  717      normal  0.0805092  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3295  CDS  NC_009468  5797  7950  2154  UvrD/REP helicase  YP_001220049  normal  0.763792  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3296  CDS  NC_009468  7943  8677  735  hypothetical protein  YP_001220050  normal  0.543717  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3297  CDS  NC_009468  8578  9501  924  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  YP_001220051  normal  0.445227  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3298  CDS  NC_009468  9556  11154  1599  integrase catalytic subunit  YP_001220052  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3299  CDS  NC_009468  11151  12026  876  IstB ATP binding domain-containing protein  YP_001220053  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3300  CDS  NC_009468  12089  12448  360  hypothetical protein  YP_001220054  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3301  CDS  NC_009468  12472  12888  417  transposase IS200-family protein  YP_001220055  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3302  CDS  NC_009468  13271  14263  993  hypothetical protein  YP_001220056  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3303  CDS  NC_009468  14557  15813  1257  RND family efflux transporter MFP subunit  YP_001220057  normal  0.3496  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3304  CDS  NC_009468  15810  16952  1143  hypothetical protein  YP_001220058  normal  0.578664  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3305  CDS  NC_009468  16945  17709  765  ABC transporter related  YP_001220059  normal  0.11679  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3306  CDS  NC_009468  18027  18344  318  hypothetical protein  YP_001220060  normal  0.339745  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3307  CDS  NC_009468  19016  20407  1392  replication protein C  YP_001220061  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3308  CDS  NC_009468  21035  21919  885  LysR family transcriptional regulator  YP_001220062  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3309  CDS  NC_009468  22010  23197  1188  major facilitator transporter  YP_001220063  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3310  CDS  NC_009468  23194  24246  1053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  YP_001220064  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3311  CDS  NC_009468  24631  25020  390  hypothetical protein  YP_001220065  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3312  CDS  NC_009468  25326  25595  270  hypothetical protein  YP_001220066  normal  0.455385  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3313  CDS  NC_009468  25710  26090  381  hypothetical protein  YP_001220067  normal  0.368997  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3314  CDS  NC_009468  26164  28842  2679  CRISPR-associated helicase Cas3  YP_001220068  normal  0.036255  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3315  CDS  NC_009468  29133  30722  1590  CRISPR-associated Cse1 family protein  YP_001220069  normal  0.439764  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3316  CDS  NC_009468  30719  31258  540  hypothetical protein  YP_001220070  normal  0.531087  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3317  CDS  NC_009468  31258  32370  1113  CRISPR-associated Cse4 family protein  YP_001220071  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3318  CDS  NC_009468  32372  33121  750  CRISPR-associated Cas5 family protein  YP_001220072  normal  0.295879  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3319  CDS  NC_009468  33127  33804  678  CRISPR-associated Cse3 family protein  YP_001220073  normal  0.148514  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3320  CDS  NC_009468  33797  34759  963  CRISPR-associated Cas1 family protein  YP_001220074  normal  0.118981  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3321  CDS  NC_009468  38112  40184  2073  hypothetical protein  YP_001220075  normal  0.112633  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3322  CDS  NC_009468  40187  41011  825  hypothetical protein  YP_001220076  normal  0.235174  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3323  CDS  NC_009468  41008  41421  414  hypothetical protein  YP_001220077  normal  0.236385  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3324  CDS  NC_009468  41657  42250  594  resolvase domain-containing protein  YP_001220078  normal  0.296266  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3325  CDS  NC_009468  42244  43443  1200  IS605 family transposase OrfB  YP_001220079  normal  0.156682  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3326  CDS  NC_009468  43830  44450  621  DNA recombination protein RuvA  YP_001220080  normal  0.0154506  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3327  CDS  NC_009468  44507  45445  939  Holliday junction DNA helicase RuvB  YP_001220081  normal  0.0117566  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3328  CDS  NC_009468  45445  45996  552  hypothetical protein  YP_001220082  normal  0.224423  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3329  CDS  NC_009468  46324  46656  333  hypothetical protein  YP_001220083  normal  0.418936  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3330  CDS  NC_009468  46722  46973  252  hypothetical protein  YP_001220084  normal  0.368997  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3331  CDS  NC_009468  47613  48353  741  YceI family protein  YP_001220085  normal  0.634515  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3332  CDS  NC_009468  48346  48891  546  cytochrome B561  YP_001220086  normal  0.474748  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3333  CDS  NC_009468  49942  50958  1017  hypothetical protein  YP_001220087  normal  0.664615  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3334  CDS  NC_009468  51404  52369  966  diguanylate cyclase  YP_001220088  normal  0.798372  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3335  CDS  NC_009468  53072  53572  501  hypothetical protein  YP_001220089  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3336  CDS  NC_009468  53885  54379  495  hypothetical protein  YP_001220090  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3337  CDS  NC_009468  54386  55231  846  hypothetical protein  YP_001220091  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3338  CDS  NC_009468  55335  55895  561  resolvase domain-containing protein  YP_001220092  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3339  CDS  NC_009468  55948  56460  513  transposase IS3/IS911 family protein  YP_001220093  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3340  CDS  NC_009468  56496  56885  390  hypothetical protein  YP_001220094  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3341  CDS  NC_009468  57023  57577  555  hypothetical protein  YP_001220095  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3342  CDS  NC_009468  57759  58571  813  metallophosphoesterase  YP_001220096  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3343  CDS  NC_009468  58568  59284  717  metallophosphoesterase  YP_001220097  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3344  CDS  NC_009468  59338  59736  399  hypothetical protein  YP_001220098  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3345  CDS  NC_009468  59936  60745  810  regulatory protein, IclR  YP_001220099  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3346  CDS  NC_009468  60944  61801  858  ABC transporter related  YP_001220100  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3347  CDS  NC_009468  61818  63128  1311  acetylornithine deacetylase  YP_001220101  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3348  CDS  NC_009468  63145  63894  750  NUDIX hydrolase  YP_001220102  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3349    NC_009468  64143  65307  1165      normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3350  CDS  NC_009468  65524  67017  1494  Na+/solute symporter  YP_001220103  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3351  CDS  NC_009468  67234  67698  465  hypothetical protein  YP_001220104  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3352  CDS  NC_009468  67707  68312  606  restriction endonuclease  YP_001220105  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3353  CDS  NC_009468  68322  68723  402  XRE family transcriptional regulator  YP_001220106  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3354  CDS  NC_009468  68839  69462  624  hypothetical protein  YP_001220107  normal  0.76441  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3355  CDS  NC_009468  69561  70400  840  hypothetical protein  YP_001220108  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3356  CDS  NC_009468  70677  70916  240  hypothetical protein  YP_001220109  normal  0.960251  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3357  CDS  NC_009468  71007  71858  852  hypothetical protein  YP_001220110  normal  0.783996  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3358  CDS  NC_009468  71903  73144  1242  filamentation induced by cAMP protein Fic  YP_001220111  normal  0.855479  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3359  CDS  NC_009468  73293  74399  1107  hypothetical protein  YP_001220112  normal  0.263263  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3360  CDS  NC_009468  74540  75703  1164  hypothetical protein  YP_001220113  normal  0.451787  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3361  CDS  NC_009468  75757  76203  447  hypothetical protein  YP_001220114  normal  0.157255  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3362  CDS  NC_009468  76365  76922  558  hypothetical protein  YP_001220115  normal  0.116329  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3363  CDS  NC_009468  77163  77720  558  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  YP_001220116  normal  0.0689571  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3364  CDS  NC_009468  78680  80134  1455  radical SAM domain-containing protein  YP_001220117  normal  0.155713  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3365  CDS  NC_009468  80122  81303  1182  radical SAM domain-containing protein  YP_001220118  normal  0.803151  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3366  CDS  NC_009468  81684  83159  1476  ATPase central domain-containing protein  YP_001220119  normal  0.869152  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3367  CDS  NC_009468  83313  83666  354  hypothetical protein  YP_001220120  normal  0.38502  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3368  CDS  NC_009468  83663  84184  522  hypothetical protein  YP_001220121  normal  0.109584  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3369  CDS  NC_009468  84188  86872  2685  sigma-70 region 4 domain-containing protein  YP_001220122  normal  0.426709  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3370  CDS  NC_009468  87261  87539  279  hypothetical protein  YP_001220123  normal  0.515692  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3371  CDS  NC_009468  87871  88137  267  helix-turn-helix domain-containing protein  YP_001220124  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3372  CDS  NC_009468  88134  89282  1149  HipA domain-containing protein  YP_001220125  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3373  CDS  NC_009468  89444  89701  258  IstB ATP binding domain-containing protein  YP_001220126  normal  0.748723  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3374    NC_009468  89814  89999  186      normal  0.689929  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3375  CDS  NC_009468  90016  90147  132  hypothetical protein  YP_001220127  normal  0.422861  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3376  CDS  NC_009468  90683  93145  2463  putative phosphoketolase  YP_001220128  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3377  CDS  NC_009468  93356  93748  393  hypothetical protein  YP_001220129  normal  0.752265  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3378  CDS  NC_009468  94167  94619  453  hypothetical protein  YP_001220130  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3379  CDS  NC_009468  94823  96502  1680  transposase, IS4 family protein  YP_001220131  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3380  CDS  NC_009468  97123  97491  369  hypothetical protein  YP_001220132  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3381  CDS  NC_009468  97955  98353  399  hypothetical protein  YP_001220133  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3382    NC_009468  98627  99049  423      normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3383  CDS  NC_009468  99228  100943  1716  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  YP_001220134  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3384  CDS  NC_009468  100957  102585  1629  ferredoxin-dependent glutamate synthase  YP_001220135  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3385  CDS  NC_009468  103176  104042  867  MltA-interacting MipA family protein  YP_001220136  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3386  CDS  NC_009468  104254  104646  393  hypothetical protein  YP_001220137  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3387  CDS  NC_009468  104711  105934  1224  transposase, mutator type  YP_001220138  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3388  CDS  NC_009468  106073  106405  333  hypothetical protein  YP_001220139  normal  0.966055  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3389  CDS  NC_009468  106903  107499  597  hypothetical protein  YP_001220140  normal  0.699751  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3390    NC_009468  107764  108847  1084      normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3391    NC_009468  108998  109234  237      normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>