3692 genes were found for organism Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 37    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Acry_0001  CDS  NC_009484  261  1709  +  1449  chromosomal replication initiation protein  YP_001233149  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0002  CDS  NC_009484  1737  2588  -  852  carboxylesterase  YP_001233150  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0003  CDS  NC_009484  2902  3105  +  204  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_001233151  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0004  CDS  NC_009484  3693  4202  +  510  MerR family transcriptional regulator  YP_001233152  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0005  CDS  NC_009484  4227  5363  +  1137  acetyl-CoA acetyltransferase  YP_001233153  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0006  CDS  NC_009484  5363  7723  +  2361  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  YP_001233154  normal  0.329396  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0007  CDS  NC_009484  7746  9536  +  1791  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  YP_001233155  normal  0.419421  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0008  CDS  NC_009484  9556  10113  -  558  PEBP family protein  YP_001233156  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0009  CDS  NC_009484  10125  10877  -  753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001233157  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0010  CDS  NC_009484  10874  11788  -  915  ABC-type molybdate transport system periplasmic component-like protein  YP_001233158  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0011  CDS  NC_009484  11903  12280  +  378  ModE family transcriptional regulator  YP_001233159  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0012  CDS  NC_009484  12360  12881  +  522  TspO and MBR like protein  YP_001233160  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0013  CDS  NC_009484  12925  13539  +  615  hypothetical protein  YP_001233161  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0014  CDS  NC_009484  13684  14235  +  552  GPR1/FUN34/yaaH family protein  YP_001233162  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0015  CDS  NC_009484  14489  14716  +  228  twin arginine-targeting protein translocase  YP_001233163  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0016  CDS  NC_009484  14727  14984  +  258  twin arginine-targeting protein translocase  YP_001233164  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0017  CDS  NC_009484  15001  15642  +  642  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  YP_001233165  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0018  CDS  NC_009484  15639  16181  +  543  acireductone dioxygenase, ARD  YP_001233166  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0019  CDS  NC_009484  16198  16896  +  699  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  YP_001233167  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0020  CDS  NC_009484  16908  18437  +  1530  apolipoprotein N-acyltransferase  YP_001233168  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0021  CDS  NC_009484  18742  19227  +  486  XRE family transcriptional regulator  YP_001233169  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0022  CDS  NC_009484  19292  19963  +  672  ribulose-phosphate 3-epimerase  YP_001233170  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0023  CDS  NC_009484  19977  21551  +  1575  heparinase II/III family protein  YP_001233171  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0024  CDS  NC_009484  21556  22554  +  999  UDP-glucose 4-epimerase  YP_001233172  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0025  CDS  NC_009484  22562  23686  +  1125  glycosyl transferase, group 1  YP_001233173  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0026  CDS  NC_009484  23698  24165  +  468  CreA family protein  YP_001233174  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0027  CDS  NC_009484  24181  25722  +  1542  bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase  YP_001233175  normal  0.493241  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0028  CDS  NC_009484  25728  26285  +  558  carboxymuconolactone decarboxylase  YP_001233176  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0029  CDS  NC_009484  26325  28286  -  1962  DNA topoisomerase IV subunit B  YP_001233177  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0030  CDS  NC_009484  28312  28950  -  639  cytidylate kinase  YP_001233178  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0031  CDS  NC_009484  28947  30284  -  1338  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  YP_001233179  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0032  CDS  NC_009484  30423  30746  +  324  hypothetical protein  YP_001233180  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0033  CDS  NC_009484  30796  31047  -  252  hypothetical protein  YP_001233181  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0034  CDS  NC_009484  31136  32365  +  1230  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  YP_001233182  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0035  CDS  NC_009484  32380  33219  +  840  hypothetical protein  YP_001233183  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0036  CDS  NC_009484  33219  34070  +  852  putative ribonuclease BN  YP_001233184  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0037  CDS  NC_009484  34256  36493  +  2238  ribonuclease R  YP_001233185  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0038  CDS  NC_009484  36490  38094  +  1605  C-terminal processing peptidase  YP_001233186  normal  0.462359  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0039  CDS  NC_009484  38140  38307  +  168  50S ribosomal protein L33  YP_001233187  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0040  CDS  NC_009484  38471  39610  -  1140  lipid-A-disaccharide synthase  YP_001233188  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0041  CDS  NC_009484  39607  40482  -  876  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  YP_001233189  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0042  CDS  NC_009484  40479  41000  -  522  hypothetical protein  YP_001233190  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0043  CDS  NC_009484  41089  42816  -  1728  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  YP_001233191  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0044  CDS  NC_009484  43357  44583  -  1227  5-aminolevulinate synthase  YP_001233192  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0045  CDS  NC_009484  44723  45655  -  933  FAD-dependent thymidylate synthase  YP_001233193  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0046  CDS  NC_009484  46354  46794  -  441  hypothetical protein  YP_001233194  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0047  CDS  NC_009484  46791  47420  -  630  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_001233195  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0048  CDS  NC_009484  47474  48880  +  1407  carbohydrate kinase, YjeF related protein  YP_001233196  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0049  CDS  NC_009484  49470  50570  +  1101  glycine cleavage system T protein  YP_001233197  normal  0.866309  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0050  CDS  NC_009484  50582  50956  +  375  glycine cleavage system H protein  YP_001233198  normal  0.968123  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0051  CDS  NC_009484  50971  53853  +  2883  glycine dehydrogenase  YP_001233199  normal  0.794092  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0052  CDS  NC_009484  53949  54524  +  576  Lipocalin family protein  YP_001233200  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0053  CDS  NC_009484  54608  56350  +  1743  acid phosphatase  YP_001233201  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0054  CDS  NC_009484  56586  57107  +  522  cell division protein MraZ  YP_001233202  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0055  CDS  NC_009484  57104  58045  +  942  S-adenosyl-methyltransferase MraW  YP_001233203  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0056  CDS  NC_009484  58042  58911  +  870  secreted (periplasmic) protein-like protein  YP_001233204  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0057  CDS  NC_009484  58908  60998  +  2091  peptidoglycan glycosyltransferase  YP_001233205  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0058  CDS  NC_009484  61003  62448  +  1446  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  YP_001233206  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0059  CDS  NC_009484  62445  63800  +  1356  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate--D-alanyl-D-alanyl ligase  YP_001233207  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0060  CDS  NC_009484  63800  64888  +  1089  phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase  YP_001233208  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0061  CDS  NC_009484  64885  66270  +  1386  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  YP_001233209  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0062  CDS  NC_009484  66270  67433  +  1164  cell cycle protein  YP_001233210  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0063  CDS  NC_009484  67430  68536  +  1107  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  YP_001233211  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0064  CDS  NC_009484  68533  69972  +  1440  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  YP_001233212  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0065  CDS  NC_009484  69969  70898  +  930  UDP-N-acetylenolpyruvoylglucosamine reductase  YP_001233213  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0066  CDS  NC_009484  70895  71800  +  906  D-alanine--D-alanine ligase  YP_001233214  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0067  CDS  NC_009484  71788  72666  +  879  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  YP_001233215  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0068  CDS  NC_009484  72674  73987  +  1314  cell division protein FtsA  YP_001233216  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0069  CDS  NC_009484  74052  75620  +  1569  cell division protein FtsZ  YP_001233217  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0070  CDS  NC_009484  75755  76138  +  384  hypothetical protein  YP_001233218  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0071  CDS  NC_009484  76201  78294  +  2094  ComEC/Rec2-related protein  YP_001233219  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0072  CDS  NC_009484  78221  79246  -  1026  glycosyl transferase family protein  YP_001233220  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0073  CDS  NC_009484  79236  80720  -  1485  sugar transferase  YP_001233221  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0074  CDS  NC_009484  80774  81214  -  441  GtrA family protein  YP_001233222  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0075  CDS  NC_009484  81403  81900  +  498  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  YP_001233223  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0076  CDS  NC_009484  81966  84371  +  2406  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  YP_001233224  normal  0.353097  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0077  CDS  NC_009484  84384  85178  +  795  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  YP_001233225  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0078  CDS  NC_009484  85538  86461  +  924  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  YP_001233226  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0079  CDS  NC_009484  86458  87198  +  741  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  YP_001233227  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0080  CDS  NC_009484  87195  87470  +  276  coenzyme PQQ synthesis D  YP_001233228  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0081  CDS  NC_009484  87467  88588  +  1122  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  YP_001233229  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0082  CDS  NC_009484  88570  89400  -  831  RNA methyltransferase  YP_001233230  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0083  CDS  NC_009484  89808  90368  +  561  hypothetical protein  YP_001233231  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0084  CDS  NC_009484  90445  93444  -  3000  hypothetical protein  YP_001233232  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0085  CDS  NC_009484  93545  94156  -  612  nicotinamidase  YP_001233233  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0086  CDS  NC_009484  94285  95037  +  753  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001233234  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0087  CDS  NC_009484  95049  96830  +  1782  dihydroxy-acid dehydratase  YP_001233235  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0088  CDS  NC_009484  96885  97679  -  795  hypothetical protein  YP_001233236  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0089  CDS  NC_009484  97812  98225  -  414  MerR family transcriptional regulator  YP_001233237  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0090  CDS  NC_009484  98250  101312  -  3063  acriflavin resistance protein  YP_001233238  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0091  CDS  NC_009484  101322  102506  -  1185  RND family efflux transporter MFP subunit  YP_001233239  normal  0.666427  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0092  CDS  NC_009484  102503  104176  -  1674  RND efflux system outer membrane lipoprotein  YP_001233240  normal  0.602772  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0093  CDS  NC_009484  104218  104907  +  690  TetR family transcriptional regulator  YP_001233241  normal  0.247373  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0094  CDS  NC_009484  104863  105732  -  870  PaaX family transcriptional regulator  YP_001233242  normal  0.339453  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0095  CDS  NC_009484  105939  106820  -  882  transposase, IS4 family protein  YP_001233243  normal  0.728518  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0096  CDS  NC_009484  107093  107329  -  237  hypothetical protein  YP_001233244  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0097  CDS  NC_009484  107462  108439  -  978  transposase, IS4 family protein  YP_001233245  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0098  CDS  NC_009484  108572  108994  +  423  transposase  YP_001233246  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0099    NC_009484  109068  109578  -  511      normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_0100  CDS  NC_009484  109937  110284  +  348  hypothetical protein  YP_001233247  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 37    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>