118 genes were found for organism Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Rsph17029_4068  CDS  NC_009040  70  4755  -  4686  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  YP_001041782  normal  1  normal  0.516852  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4069  CDS  NC_009040  5009  6781  +  1773  TPR repeat-containing protein  YP_001041783  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4070  CDS  NC_009040  6898  9072  +  2175  ABC transporter related  YP_001041784  decreased coverage  0.00000105324  normal  0.180346  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4071  CDS  NC_009040  9069  10367  +  1299  secretion protein HlyD family protein  YP_001041785  hitchhiker  0.0000586904  normal  0.188824  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4072  CDS  NC_009040  10391  10984  +  594  methyltransferase type 11  YP_001041786  hitchhiker  0.00042768  normal  0.252291  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4073  CDS  NC_009040  11118  11954  -  837  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  YP_001041787  normal  0.0636922  normal  0.189954  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4074  CDS  NC_009040  12156  12881  +  726  hypothetical protein  YP_001041788  normal  0.488227  normal  0.187336  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4075  CDS  NC_009040  13248  14030  +  783  sulfotransferase  YP_001041789  normal  0.0470564  normal  0.231356  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4076  CDS  NC_009040  14005  14895  -  891  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  YP_001041790  normal  0.0532179  normal  0.23652  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4077  CDS  NC_009040  14892  15743  -  852  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  YP_001041791  normal  0.362561  normal  0.125461  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4078  CDS  NC_009040  15740  16780  -  1041  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  YP_001041792  normal  0.29374  normal  0.0761668  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4079  CDS  NC_009040  16784  17347  -  564  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  YP_001041793  normal  0.351894  normal  0.0589285  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4080  CDS  NC_009040  17411  18349  -  939  glycosyl transferase family protein  YP_001041794  normal  1  normal  0.106116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4081  CDS  NC_009040  18401  19363  -  963  hypothetical protein  YP_001041795  normal  1  normal  0.23652  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4082  CDS  NC_009040  20057  21511  +  1455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_001041796  normal  0.525863  normal  0.173158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4083  CDS  NC_009040  21636  22742  +  1107  nuclease  YP_001041797  normal  1  normal  0.214085  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4084  CDS  NC_009040  23042  23851  -  810  ABC transporter related  YP_001041798  normal  0.185467  normal  0.229237  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4085  CDS  NC_009040  23868  25007  -  1140  capsule polysaccharide export protein-like  YP_001041799  normal  0.387523  normal  0.315996  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4086  CDS  NC_009040  25721  26521  +  801  ABC-2 type transporter  YP_001041800  normal  0.0164855  normal  0.276113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4087  CDS  NC_009040  26585  28840  +  2256  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  YP_001041801  normal  0.885758  normal  0.378221  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4088  CDS  NC_009040  28841  29833  +  993  hypothetical protein  YP_001041802  decreased coverage  0.00189441  normal  0.318027  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4089  CDS  NC_009040  29991  31349  -  1359  hypothetical protein  YP_001041803  normal  1  normal  0.180938  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4090  CDS  NC_009040  31952  33253  +  1302  hypothetical protein  YP_001041804  normal  1  normal  0.150292  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4091  CDS  NC_009040  33435  34376  +  942  hemolysin-type calcium-binding region  YP_001041805  normal  1  normal  0.402698  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4092  CDS  NC_009040  34492  35799  +  1308  hypothetical protein  YP_001041806  normal  1  normal  0.327898  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4093  CDS  NC_009040  35889  36578  +  690  hypothetical protein  YP_001041807  normal  0.968365  normal  0.786731  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4094  CDS  NC_009040  36611  37705  -  1095  hypothetical protein  YP_001041808  normal  0.435077  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4095  CDS  NC_009040  37733  38737  -  1005  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_001041809  normal  0.59701  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4096  CDS  NC_009040  39021  39416  -  396  hypothetical protein  YP_001041810  normal  0.31442  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4097  CDS  NC_009040  40664  42058  +  1395  F0F1 ATP synthase subunit beta  YP_001041811  hitchhiker  0.00195065  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4098  CDS  NC_009040  42055  42495  +  441  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  YP_001041812  hitchhiker  0.000020928  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4099  CDS  NC_009040  42492  42857  +  366  ATP synthase gene 1, putative  YP_001041813  hitchhiker  0.00000538142  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4100  CDS  NC_009040  43111  43794  +  684  F0F1 ATP synthase subunit A  YP_001041814  hitchhiker  0.00000342736  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4101  CDS  NC_009040  43791  44042  +  252  F0F1 ATP synthase subunit C  YP_001041815  hitchhiker  0.00000110269  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4102  CDS  NC_009040  44048  44752  +  705  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  YP_001041816  decreased coverage  0.0000508858  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4103  CDS  NC_009040  44742  46235  +  1494  ATP synthase F1, alpha subunit  YP_001041817  normal  0.0134913  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4104  CDS  NC_009040  46232  47083  +  852  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  YP_001041818  normal  0.791184  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4105    NC_009040  47290  47462  +  173      normal  0.318061  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4106    NC_009040  47479  47583  -  105      normal  0.412699  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4107    NC_009040  47584  48036  +  453      normal  0.680195  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4108  CDS  NC_009040  48881  49420  +  540  hypothetical protein  YP_001041819  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4109  CDS  NC_009040  50642  50866  +  225  ISSpo9, transposase  YP_001041820  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4110  CDS  NC_009040  51036  51551  +  516  hypothetical protein  YP_001041821  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4111  CDS  NC_009040  51665  56728  +  5064  YD repeat-containing protein  YP_001041822  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4112    NC_009040  56853  57493  +  641      normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4113  CDS  NC_009040  57529  58053  +  525  hypothetical protein  YP_001041823  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4114  CDS  NC_009040  58040  58450  -  411  hypothetical protein  YP_001041824  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4115  CDS  NC_009040  58480  58878  -  399  hypothetical protein  YP_001041825  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4116  CDS  NC_009040  59035  59835  +  801  AraC family transcriptional regulator  YP_001041826  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4117  CDS  NC_009040  59960  60382  -  423  MerR family transcriptional regulator  YP_001041827  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4118  CDS  NC_009040  60580  61557  +  978  cation diffusion facilitator family transporter  YP_001041828  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4119  CDS  NC_009040  61892  62389  +  498  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  YP_001041829  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4120  CDS  NC_009040  62386  63360  +  975  putative FecR  YP_001041830  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4121  CDS  NC_009040  63491  65866  +  2376  TonB-dependent siderophore receptor  YP_001041831  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4122  CDS  NC_009040  65909  66772  +  864  periplasmic binding protein  YP_001041832  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4123  CDS  NC_009040  66776  68713  +  1938  iron-hydroxamate transporter permease subunit  YP_001041833  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4124  CDS  NC_009040  68710  69585  +  876  ABC transporter related  YP_001041834  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4125    NC_009040  69658  69870  -  213      normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4126  CDS  NC_009040  70091  70480  +  390  hypothetical protein  YP_001041835  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4127    NC_009040  70926  71048  +  123      normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4128    NC_009040  71135  71245  +  111      normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4129    NC_009040  71247  71982  +  736      normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4130  CDS  NC_009040  71982  72722  -  741  hypothetical protein  YP_001041836  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4131    NC_009040  72814  73068  +  255      normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4132  CDS  NC_009040  73061  73582  -  522  hypothetical protein  YP_001041837  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4133  CDS  NC_009040  73579  74211  -  633  lysine exporter protein LysE/YggA  YP_001041838  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4134  CDS  NC_009040  74214  74759  -  546  hypothetical protein  YP_001041839  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4135  CDS  NC_009040  74874  75053  +  180  AsnC family transcriptional regulator  YP_001041840  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4136  CDS  NC_009040  75056  75844  -  789  alpha/beta hydrolase fold  YP_001041841  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4137  CDS  NC_009040  75929  76345  +  417  MerR family transcriptional regulator  YP_001041842  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4138  CDS  NC_009040  76342  76836  -  495  hypothetical protein  YP_001041843  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4139    NC_009040  76997  77155  +  159      normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4140  CDS  NC_009040  77169  78086  -  918  LysR family transcriptional regulator  YP_001041844  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4141  CDS  NC_009040  78171  78641  +  471  hypothetical protein  YP_001041845  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4142  CDS  NC_009040  78760  79605  -  846  UspA domain-containing protein  YP_001041846  normal  1  normal  0.976252  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4143  CDS  NC_009040  79619  81109  -  1491  sulphate transporter  YP_001041847  normal  0.508442  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4144  CDS  NC_009040  81449  82384  -  936  MscS mechanosensitive ion channel  YP_001041848  normal  1  normal  0.789982  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4145  CDS  NC_009040  82600  83013  -  414  nucleoside diphosphate kinase regulator  YP_001041849  normal  0.612026  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4146  CDS  NC_009040  84029  84760  -  732  GntR family transcriptional regulator  YP_001041850  normal  0.10084  normal  0.977946  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4147  CDS  NC_009040  84900  86456  +  1557  extracellular solute-binding protein  YP_001041851  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4148  CDS  NC_009040  86537  87490  +  954  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001041852  normal  1  normal  0.627017  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4149  CDS  NC_009040  87480  88385  +  906  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001041853  normal  1  normal  0.656131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4150  CDS  NC_009040  88397  89107  +  711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001041854  normal  1  normal  0.639156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4151    NC_009040  89299  89623  -  325      normal  1  normal  0.857789  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4152  CDS  NC_009040  89633  90379  -  747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001041855  normal  1  normal  0.883232  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4153  CDS  NC_009040  90401  91582  -  1182  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  YP_001041856  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4154  CDS  NC_009040  91688  92728  +  1041  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  YP_001041857  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4155  CDS  NC_009040  92746  94242  +  1497  MlrC domain-containing protein  YP_001041858  normal  1  normal  0.870407  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4156  CDS  NC_009040  94244  95419  +  1176  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  YP_001041859  normal  1  normal  0.845536  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4157  CDS  NC_009040  95469  96485  +  1017  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  YP_001041860  normal  1  normal  0.55271  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4158  CDS  NC_009040  96485  97513  +  1029  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  YP_001041861  normal  1  normal  0.47241  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4159  CDS  NC_009040  97796  98584  -  789  hypothetical protein  YP_001041862  normal  0.0365541  normal  0.446399  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4160  CDS  NC_009040  98581  98988  -  408  flagellar biosynthesis repressor FlbT  YP_001041863  hitchhiker  0.00283786  normal  0.231077  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4161  CDS  NC_009040  98985  99350  -  366  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  YP_001041864  decreased coverage  0.00719827  normal  0.323743  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4162  CDS  NC_009040  99440  100285  -  846  flagellin domain-containing protein  YP_001041865  hitchhiker  0.00770352  normal  0.325059  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4163  CDS  NC_009040  100694  101554  +  861  hypothetical protein  YP_001041866  normal  0.134086  normal  0.159805  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4164  CDS  NC_009040  101594  102343  -  750  hypothetical protein  YP_001041867  normal  0.0201322  normal  0.110669  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4165  CDS  NC_009040  102540  103238  +  699  GntR domain-containing protein  YP_001041868  normal  0.0218155  normal  0.105526  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4166  CDS  NC_009040  103346  104134  +  789  ModE family transcriptional regulator  YP_001041869  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_4167  CDS  NC_009040  104175  105008  +  834  modD protein  YP_001041870  hitchhiker  0.00277005  normal  0.105526  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>