4254 genes were found for organism Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 43    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
RSPH17029_0  tRNA  NC_009049  940724  940807  -  84  tRNA-Tyr    normal  1  normal  0.155544  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0001  CDS  NC_009049  36  1346  +  1311  FliI/YscN family ATPase  YP_001041893  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0002  CDS  NC_009049  1350  1673  -  324  hypothetical protein  YP_001041894  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0003  CDS  NC_009049  1663  1941  -  279  putative chemotactic signal-response protein CheL  YP_001041895  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0004  CDS  NC_009049  2045  4264  +  2220  hypothetical protein  YP_001041896  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0005  CDS  NC_009049  4274  4942  +  669  flagellar basal body rod modification protein  YP_001041897  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0006  CDS  NC_009049  4937  6466  -  1530  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  YP_001041898  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0007  CDS  NC_009049  6468  7220  -  753  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  YP_001041899  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0008  CDS  NC_009049  7314  8165  +  852  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  YP_001041900  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0009  CDS  NC_009049  8226  9002  +  777  enoyl-CoA hydratase/isomerase  YP_001041901  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0010  CDS  NC_009049  9113  9391  +  279  30S ribosomal protein S20  YP_001041902  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0011  CDS  NC_009049  9930  11297  +  1368  chromosomal replication initiation protein  YP_001041903  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0012  CDS  NC_009049  11415  12533  +  1119  DNA polymerase III subunit beta  YP_001041904  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0013  CDS  NC_009049  12601  13692  +  1092  recombination protein F  YP_001041905  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0014  CDS  NC_009049  13689  14111  +  423  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001041906  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0015  CDS  NC_009049  14203  16638  +  2436  DNA gyrase subunit B  YP_001041907  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0016  CDS  NC_009049  16595  17884  -  1290  hypothetical protein  YP_001041908  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0017  CDS  NC_009049  17974  19050  +  1077  AFG1 family ATPase  YP_001041909  normal  0.761776  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0018  CDS  NC_009049  19254  20129  -  876  phosphoserine phosphatase SerB  YP_001041910  normal  0.395606  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0019  CDS  NC_009049  20269  21426  +  1158  phosphoserine aminotransferase  YP_001041911  normal  0.625481  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0020  CDS  NC_009049  21507  23102  +  1596  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  YP_001041912  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0021  CDS  NC_009049  23199  23930  +  732  metallophosphoesterase  YP_001041913  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0022  CDS  NC_009049  23980  25182  +  1203  beta-ketothiolase  YP_001041914  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0023  CDS  NC_009049  25192  27216  -  2025  penicillin-binding protein 1C  YP_001041915  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0024  CDS  NC_009049  27213  32639  -  5427  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  YP_001041916  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0025  CDS  NC_009049  32793  35342  +  2550  histidine kinase  YP_001041917  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0026  CDS  NC_009049  35496  36269  -  774  hypothetical protein  YP_001041918  normal  0.234225  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0027  CDS  NC_009049  36269  38314  -  2046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  YP_001041919  normal  0.0879817  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0028  CDS  NC_009049  38372  38662  -  291  protein of unknown function YGGT  YP_001041920  normal  0.242413  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0029  CDS  NC_009049  38791  39318  +  528  hypothetical protein  YP_001041921  normal  0.786921  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0030  CDS  NC_009049  39413  40783  +  1371  major facilitator transporter  YP_001041922  normal  0.550857  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0031  CDS  NC_009049  40780  41664  +  885  penicillin-insensitive murein endopeptidase  YP_001041923  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0032  CDS  NC_009049  41637  42527  +  891  hypothetical protein  YP_001041924  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0033  CDS  NC_009049  42609  43235  +  627  hypothetical protein  YP_001041925  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0034  CDS  NC_009049  43515  43940  +  426  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  YP_001041926  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0035  CDS  NC_009049  43949  45241  -  1293  nicotinate phosphoribosyltransferase  YP_001041927  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0036  CDS  NC_009049  45243  45848  -  606  nicotinamidase  YP_001041928  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0037  CDS  NC_009049  46041  46823  +  783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001041929  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0038  CDS  NC_009049  46820  47743  +  924  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  YP_001041930  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0039  CDS  NC_009049  47701  49311  -  1611  alpha amylase, catalytic region  YP_001041931  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0040  CDS  NC_009049  49785  51023  +  1239  major facilitator transporter  YP_001041932  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0041  CDS  NC_009049  51116  52288  +  1173  major facilitator transporter  YP_001041933  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0042  CDS  NC_009049  52337  53371  +  1035  glycosyl transferase, group 1  YP_001041934  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0043  CDS  NC_009049  53368  53994  +  627  hypothetical protein  YP_001041935  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0044  CDS  NC_009049  54123  55145  +  1023  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  YP_001041936  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0045  CDS  NC_009049  55230  55874  -  645  carbonate dehydratase  YP_001041937  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0046  CDS  NC_009049  56013  56396  +  384  hypothetical protein  YP_001041938  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0047  CDS  NC_009049  56467  57852  +  1386  leucyl aminopeptidase  YP_001041939  normal  0.168796  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0048  CDS  NC_009049  57852  58664  +  813  NLP/P60 protein  YP_001041940  normal  0.0780825  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0049  CDS  NC_009049  58771  59991  -  1221  hypothetical protein  YP_001041941  normal  0.130826  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0050  CDS  NC_009049  60006  61184  -  1179  radical SAM protein  YP_001041942  normal  0.890909  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0051  CDS  NC_009049  61323  61853  -  531  hypothetical protein  YP_001041943  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0052  CDS  NC_009049  62020  63009  +  990  L-asparaginase II  YP_001041944  normal  0.527495  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0053  CDS  NC_009049  63025  63864  -  840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_001041945  normal  0.91399  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0054  CDS  NC_009049  63999  65477  +  1479  AMP nucleosidase  YP_001041946  normal  0.228346  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0055  CDS  NC_009049  65606  65893  +  288  histone family protein DNA-binding protein  YP_001041947  normal  0.0808808  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0056  CDS  NC_009049  65963  66844  +  882  hypothetical protein  YP_001041948  normal  0.0122515  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0057  CDS  NC_009049  66841  67941  -  1101  chorismate synthase  YP_001041949  normal  0.14254  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0058  CDS  NC_009049  68188  69171  +  984  thiamine transporter substrate binding subunit  YP_001041950  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0059  CDS  NC_009049  69147  70661  +  1515  thiamine transporter membrane protein  YP_001041951  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0060  CDS  NC_009049  70648  71343  +  696  ABC transporter related  YP_001041952  normal  0.740621  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0061  CDS  NC_009049  71393  72250  -  858  cytochrome c1  YP_001041953  normal  0.197339  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0062  CDS  NC_009049  72268  73605  -  1338  cytochrome b/b6 domain-containing protein  YP_001041954  normal  0.422457  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0063  CDS  NC_009049  73616  74179  -  564  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  YP_001041955  normal  0.206344  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0064  CDS  NC_009049  74685  75293  -  609  glutathione S-transferase  YP_001041956  normal  0.876217  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0065  CDS  NC_009049  75298  75591  -  294  hypothetical protein  YP_001041957  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0066  CDS  NC_009049  75722  75847  -  126  50S ribosomal protein L36  YP_001041958  normal  0.453631  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0067  CDS  NC_009049  76144  77004  +  861  N-formylglutamate amidohydrolase  YP_001041959  normal  0.365229  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0068  CDS  NC_009049  77008  78261  -  1254  DNA polymerase IV  YP_001041960  normal  0.91502  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0069  CDS  NC_009049  78388  79269  +  882  band 7 protein  YP_001041961  normal  0.212621  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0070  CDS  NC_009049  79266  79535  +  270  hypothetical protein  YP_001041962  normal  0.203479  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0071  CDS  NC_009049  79844  80179  +  336  hypothetical protein  YP_001041963  normal  0.0819371  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0072  CDS  NC_009049  80184  80882  -  699  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  YP_001041964  normal  0.109683  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0073  CDS  NC_009049  80986  81873  +  888  ROK family protein  YP_001041965  normal  0.237257  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0074  CDS  NC_009049  81887  82120  -  234  hypothetical protein  YP_001041966  normal  0.363064  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0075  CDS  NC_009049  82423  85035  +  2613  ATPase  YP_001041967  normal  0.0715422  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0076  CDS  NC_009049  85096  85566  -  471  beta-Ig-H3/fasciclin  YP_001041968  normal  0.268608  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0077  CDS  NC_009049  85763  86668  +  906  putative sulfite oxidase subunit YedY  YP_001041969  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0078  CDS  NC_009049  86669  87274  +  606  putative sulfite oxidase subunit YedZ  YP_001041970  normal  0.883139  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0079  CDS  NC_009049  87359  87685  -  327  hypothetical protein  YP_001041971  normal  0.237015  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0081  CDS  NC_009049  93400  94098  -  699  hypothetical protein  YP_001041973  normal  0.22706  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0082  CDS  NC_009049  94118  95098  -  981  alcohol dehydrogenase  YP_001041974  normal  0.0838693  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0083  CDS  NC_009049  95114  95773  -  660  TetR family transcriptional regulator  YP_001041975  normal  0.201393  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0084  CDS  NC_009049  96282  96911  +  630  ABC transporter related  YP_001041976  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0085  CDS  NC_009049  96933  97337  -  405  hypothetical protein  YP_001041977  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0086  CDS  NC_009049  97368  98135  -  768  ABC transporter related  YP_001041978  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0087  CDS  NC_009049  98132  100108  -  1977  iron-hydroxamate transporter permease subunit  YP_001041979  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0088  CDS  NC_009049  100105  101004  -  900  periplasmic binding protein  YP_001041980  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0089  CDS  NC_009049  100998  103097  -  2100  TonB-dependent siderophore receptor  YP_001041981  normal  0.26085  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0090  CDS  NC_009049  103424  104557  +  1134  ROK family protein  YP_001041982  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0091  CDS  NC_009049  104675  105931  +  1257  extracellular solute-binding protein  YP_001041983  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0092  CDS  NC_009049  106020  106910  +  891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001041984  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0093  CDS  NC_009049  106907  107755  +  849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001041985  normal  0.251855  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0094  CDS  NC_009049  107775  108878  +  1104  ABC transporter related  YP_001041986  decreased coverage  0.00776144  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0095  CDS  NC_009049  108875  109816  +  942  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  YP_001041987  normal  0.083088  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0096  CDS  NC_009049  109843  110847  +  1005  sugar isomerase (SIS)  YP_001041988  normal  0.0123272  normal  0.640121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0097  CDS  NC_009049  110902  111921  +  1020  threonine aldolase  YP_001041989  normal  0.435466  normal  0.448781  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0098  CDS  NC_009049  112106  112876  -  771  DeoR family transcriptional regulator  YP_001041990  normal  0.267831  normal  0.278019  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0099  CDS  NC_009049  113149  113943  +  795  inositol monophosphatase  YP_001041991  normal  0.110645  normal  0.117154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17029_0100  CDS  NC_009049  114016  115590  +  1575  extracellular solute-binding protein  YP_001041992  normal  1  normal  0.080172  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 43    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>