309 genes were found for organism Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 4    << first  < prev  1  2  3  4    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
SbBS512_A0002  CDS  NC_010660  191  1096  -  906  IS2 transposase orfB  YP_001883072  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0003    NC_010660  1054  1239  -  186      normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0004  CDS  NC_010660  1533  1667  +  135  putative resolvase  YP_001883073  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0005  CDS  NC_010660  1894  2760  +  867  OspB  YP_001883074  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0006  CDS  NC_010660  3089  3829  +  741  putative acid phosphatase  YP_001883075  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0007  CDS  NC_010660  3902  4024  +  123  hypothetical protein  YP_001883076  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0008    NC_010660  4189  4350  -  162      normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0009  CDS  NC_010660  4368  4871  -  504  IS1 transposase orfB  YP_001883077  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0010  CDS  NC_010660  4882  5094  -  213  IS1 transposase orfA  YP_001883078  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0011  CDS  NC_010660  5157  6062  -  906  IS2 transposase orfB  YP_001883079  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0012    NC_010660  6020  6205  -  186      normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0013    NC_010660  6613  6738  -  126      normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0014    NC_010660  6900  7277  +  378      normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0015  CDS  NC_010660  7379  7930  -  552  transposase and inactivated derivatives  YP_001883080  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0016    NC_010660  7923  8282  -  360      normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0017  CDS  NC_010660  8437  9975  -  1539  IS66 family element, transposase  YP_001883081  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0018  CDS  NC_010660  10024  10371  -  348  ISEc8 transposase  YP_001883082  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0019  CDS  NC_010660  10368  10769  -  402  hypothetical protein  YP_001883083  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0020  CDS  NC_010660  10824  11069  -  246  transposase family  YP_001883084  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0021  CDS  NC_010660  11360  11677  +  318  hypothetical protein  YP_001883085  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0022  CDS  NC_010660  11759  13468  -  1710  OspD2  YP_001883086  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0023  CDS  NC_010660  13657  13770  +  114  hypothetical protein  YP_001883087  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0024  CDS  NC_010660  13900  14619  -  720  mouse killing factor  YP_001883088  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0025  CDS  NC_010660  14744  15328  -  585  ISL3 family transposase  YP_001883089  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0026  CDS  NC_010660  15658  16236  -  579  hypothetical protein  YP_001883090  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0027    NC_010660  16285  16404  -  120      normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0028    NC_010660  16460  16579  -  120      normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0029  CDS  NC_010660  16999  17115  -  117  hypothetical protein  YP_001883091  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0030    NC_010660  17202  17603  -  402      normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0031  CDS  NC_010660  17558  17743  -  186  IS91 orf  YP_001883092  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0032  CDS  NC_010660  17906  18190  +  285  Aec51  YP_001883093  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0033  CDS  NC_010660  18201  19547  -  1347  IS4 transposase  YP_001883094  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0034  CDS  NC_010660  19656  19991  +  336  transposase  YP_001883095  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0035  CDS  NC_010660  19991  20338  +  348  IS66 family element, Orf2 protein  YP_001883096  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0036  CDS  NC_010660  20358  21590  +  1233  transposase family  YP_001883097  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0037    NC_010660  22359  22565  +  207      normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0038  CDS  NC_010660  22641  22781  +  141  description: insertion element; ORF5 protein  YP_001883098  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0039  CDS  NC_010660  23152  23829  +  678  OspD1  YP_001883099  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0040    NC_010660  24329  24535  -  207      normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0041  CDS  NC_010660  24937  25503  +  567  IpgB2  YP_001883100  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0042  CDS  NC_010660  26000  26584  +  585  ISEc17, transposase orfB  YP_001883101  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0043  CDS  NC_010660  26719  26832  +  114  hypothetical protein  YP_001883102  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0044  CDS  NC_010660  27052  27174  -  123  hypothetical protein  YP_001883103  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0045    NC_010660  27176  27553  -  378      normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0046    NC_010660  27715  27840  +  126      normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0047  CDS  NC_010660  27902  28090  -  189  hypothetical protein  YP_001883104  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0048  CDS  NC_010660  28147  29169  +  1023  IS100 transposase orfA  YP_001883105  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0049  CDS  NC_010660  29166  29948  +  783  transposase/IS protein  YP_001883106  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0050    NC_010660  30176  30352  +  177      normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0051  CDS  NC_010660  30412  30555  +  144  hypothetical protein  YP_001883107  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0052  CDS  NC_010660  30674  31873  +  1200  plasmid segregation protein  YP_001883108  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0053  CDS  NC_010660  31873  32853  +  981  plasmid Partition par B protein  YP_001883109  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0054  CDS  NC_010660  33109  33594  +  486  transposase and inactivated derivatives  YP_001883110  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0055  CDS  NC_010660  33621  33767  -  147  Aec53  YP_001883111  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0056  CDS  NC_010660  33883  35100  -  1218  reverse transcriptase  YP_001883112  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0057    NC_010660  34991  35116  -  126      normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0058  CDS  NC_010660  35578  35715  -  138  transposase family  YP_001883113  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0059    NC_010660  35803  36471  -  669      normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0060  CDS  NC_010660  36686  37012  -  327  IS629 transposase orfA  YP_001883114  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0061  CDS  NC_010660  37180  37308  -  129  hypothetical protein  YP_001883115  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0062    NC_010660  37314  37610  +  297      normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0063  CDS  NC_010660  37662  38081  +  420  IS66 family element, orf1  YP_001883116  normal  0.854269  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0064  CDS  NC_010660  38093  38437  -  345  hypothetical protein  YP_001883117  normal  0.510173  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0065  CDS  NC_010660  38459  40051  +  1593  IS66 family element, transposase  YP_001883118  normal  0.116785  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0066  CDS  NC_010660  40092  40577  -  486  acetyltransferase, gnat family  YP_001883119  normal  0.0299506  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0067  CDS  NC_010660  40565  40849  -  285  hypothetical protein  YP_001883120  normal  0.0712969  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0068  CDS  NC_010660  41522  41824  +  303  IS911, transposase orfA  YP_001883121  hitchhiker  0.00561335  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0069    NC_010660  41851  42672  +  822      hitchhiker  0.0000143037  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0070    NC_010660  42706  44244  -  1539      hitchhiker  0.00000253615  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0071    NC_010660  44293  44640  -  348      hitchhiker  0.0000000673847  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0072  CDS  NC_010660  44637  45026  -  390  IS66 family element, orf1  YP_001883122  hitchhiker  0.0000000202563  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0073  CDS  NC_010660  45523  46428  -  906  IS2 transposase orfB  YP_001883123  hitchhiker  0.0000000000629539  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0074    NC_010660  46386  46571  -  186      hitchhiker  0.0000000000000314733  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0075  CDS  NC_010660  46870  46986  -  117  hypothetical protein  YP_001883124  hitchhiker  8.16064e-18  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0076    NC_010660  46946  47164  -  219      hitchhiker  1.5349100000000001e-18  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0077  CDS  NC_010660  47219  47857  -  639  hypothetical protein  YP_001883125  hitchhiker  3.50075e-19  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0078  CDS  NC_010660  48513  50114  -  1602  transposase family  YP_001883126  decreased coverage  7.38697e-26  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0079    NC_010660  50111  50290  -  180      hitchhiker  3.47406e-17  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0080  CDS  NC_010660  50619  50945  +  327  IS1203 transposase orfA  YP_001883127  hitchhiker  0.000000000000633207  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0081    NC_010660  51160  51828  +  669      hitchhiker  0.000000000841675  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0082    NC_010660  51868  52056  -  189      hitchhiker  0.0000000224255  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0083  CDS  NC_010660  52092  52394  -  303  transposase family  YP_001883128  hitchhiker  0.0000000612813  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0084    NC_010660  52433  52585  +  153      hitchhiker  0.0000000660347  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0085    NC_010660  52901  53176  +  276      hitchhiker  0.00000406972  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0086    NC_010660  53233  53412  +  180      hitchhiker  0.00000668728  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0087  CDS  NC_010660  53892  55619  +  1728  IpaH1.4  YP_001883129  hitchhiker  0.00799741  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0088  CDS  NC_010660  55637  55804  -  168  transposase  YP_001883130  normal  0.310139  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0089    NC_010660  56022  56747  -  726      normal  0.927604  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0090  CDS  NC_010660  56774  57076  -  303  IS911, transposase orfA  YP_001883131  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0091    NC_010660  57057  57371  -  315      normal  0.773726  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0092  CDS  NC_010660  57931  58716  -  786  transcriptional activator of virulence loci  YP_001883132  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0093    NC_010660  59051  59428  -  378      normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0094    NC_010660  59590  59715  +  126      normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0095  CDS  NC_010660  59930  60073  +  144  hypothetical protein  YP_001883133  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0096  CDS  NC_010660  60088  60354  +  267  OspE2  YP_001883134  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0097  CDS  NC_010660  60768  60947  +  180  hypothetical protein  YP_001883135  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0098  CDS  NC_010660  60935  61246  +  312  prophage protein gp49  YP_001883136  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0099  CDS  NC_010660  61246  61533  +  288  DNA-binding protein  YP_001883137  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0100  CDS  NC_010660  62071  63303  -  1233  IS91 ORF  YP_001883138  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
SbBS512_A0101  CDS  NC_010660  63258  63680  -  423  IS91, orf2  YP_001883139  normal  1  n/a    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 4    << first  < prev  1  2  3  4    next >  last >>