4397 genes were found for organism Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 44    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Patl_0001  CDS  NC_008228  96  1520  +  1425  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_659588  decreased coverage  0.00208216  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0002  CDS  NC_008228  1541  2644  +  1104  DNA polymerase III, beta subunit  YP_659589  decreased coverage  0.00000485336  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0003  CDS  NC_008228  2667  3758  +  1092  DNA replication and repair protein RecF  YP_659590  normal  0.0752559  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0004  CDS  NC_008228  3763  6183  +  2421  DNA gyrase, B subunit  YP_659591  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0005  CDS  NC_008228  6298  6996  +  699  aspartate racemase  YP_659592  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0006  CDS  NC_008228  7111  8718  -  1608  diguanylate cyclase  YP_659593  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0007  CDS  NC_008228  8792  9232  -  441  hypothetical protein  YP_659594  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0008  CDS  NC_008228  9269  11347  -  2079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  YP_659595  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0009  CDS  NC_008228  11351  12256  -  906  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  YP_659596  normal  0.424313  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0010  CDS  NC_008228  12372  12944  +  573  DNA-3-methyladenine glycosylase I  YP_659597  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0011  CDS  NC_008228  12966  13415  -  450  hypothetical protein  YP_659598  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0012  CDS  NC_008228  13424  13951  -  528  hypothetical protein  YP_659599  normal  0.91121  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0013  CDS  NC_008228  14429  15118  -  690  cytochrome c, class I  YP_659600  normal  0.741785  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0014  CDS  NC_008228  15261  15881  +  621  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  YP_659601  normal  0.877601  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0015  CDS  NC_008228  16229  19015  -  2787  DNA polymerase I  YP_659602  normal  0.853211  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0016  CDS  NC_008228  19825  21276  +  1452  TrkH family potassium uptake protein  YP_659603  normal  0.81784  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0017  CDS  NC_008228  21516  22262  -  747  TraT complement resistance  YP_659604  normal  0.10549  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0018  CDS  NC_008228  22303  22662  -  360  hypothetical protein  YP_659605  normal  0.0460228  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0019  CDS  NC_008228  22918  23454  -  537  hypothetical protein  YP_659606  normal  0.065898  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0020  CDS  NC_008228  23559  24938  -  1380  potassium transporter peripheral membrane component  YP_659607  normal  0.688304  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0021  CDS  NC_008228  24986  26299  -  1314  sun protein  YP_659608  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0022  CDS  NC_008228  26296  27243  -  948  methionyl-tRNA formyltransferase  YP_659609  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0023  CDS  NC_008228  27253  27762  -  510  peptide deformylase  YP_659610  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0024  CDS  NC_008228  28001  29080  +  1080  peptidoglycan-binding LysM  YP_659611  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0025  CDS  NC_008228  29105  30244  +  1140  DNA protecting protein DprA  YP_659612  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0026  CDS  NC_008228  30246  30722  +  477  hypothetical protein  YP_659613  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0027  CDS  NC_008228  30779  31339  +  561  DNA topoisomerase, type IA, Zn finger  YP_659614  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0028  CDS  NC_008228  31408  31971  +  564  SUA5/yciO/yrdC-like  YP_659615  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0029  CDS  NC_008228  31975  32898  +  924  coproporphyrinogen III oxidase  YP_659616  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0030  CDS  NC_008228  33101  33784  +  684  OmpW  YP_659617  normal  0.109784  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0031  CDS  NC_008228  33931  34749  +  819  shikimate 5-dehydrogenase  YP_659618  hitchhiker  0.00161886  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0032  CDS  NC_008228  34746  34988  +  243  hypothetical protein  YP_659619  hitchhiker  0.0000584366  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0033  CDS  NC_008228  35035  35568  -  534  carbonic anhydrase/acetyltransferase  YP_659620  hitchhiker  0.000120925  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0034    NC_008228  42057  45148  -  3092      normal  0.940199  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0035  CDS  NC_008228  45151  46605  -  1455  hypothetical protein  YP_659621  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0036  CDS  NC_008228  46615  47304  -  690  hypothetical protein  YP_659622  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0037  CDS  NC_008228  47478  47951  +  474  hypothetical protein  YP_659623  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0038  CDS  NC_008228  47969  48841  -  873  hypothetical protein  YP_659624  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0039  CDS  NC_008228  48863  49564  -  702  hypothetical protein  YP_659625  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0040  CDS  NC_008228  49808  51577  -  1770  hypothetical protein  YP_659626  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0041  CDS  NC_008228  51625  51948  -  324  hypothetical protein  YP_659627  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0042  CDS  NC_008228  52248  53906  +  1659  peptidase M28  YP_659628  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0043  CDS  NC_008228  54077  55933  +  1857  hypothetical protein  YP_659629  hitchhiker  0.0062992  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0044  CDS  NC_008228  56015  56608  -  594  nucleoid occlusion protein  YP_659630  hitchhiker  0.00442405  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0045  CDS  NC_008228  56671  57924  -  1254  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  YP_659631  decreased coverage  0.00115408  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0046  CDS  NC_008228  58059  58733  +  675  DNA repair protein RadC  YP_659632  normal  0.178856  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0047  CDS  NC_008228  58861  59673  +  813  glycosyl transferase family protein  YP_659633  normal  0.4972  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0048  CDS  NC_008228  59813  60049  +  237  ribosomal protein L28  YP_659634  normal  0.635259  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0049  CDS  NC_008228  60062  60217  +  156  50S ribosomal protein L33  YP_659635  normal  0.754437  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0050  CDS  NC_008228  60368  60898  +  531  hypothetical protein  YP_659636  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0051  CDS  NC_008228  60939  61751  +  813  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  YP_659637  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0052  CDS  NC_008228  61839  62912  -  1074  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  YP_659638  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0053  CDS  NC_008228  63017  63499  -  483  phosphopantetheine adenylyltransferase  YP_659639  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0054  CDS  NC_008228  63548  64951  -  1404  hypothetical protein  YP_659640  normal  0.2662  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0055  CDS  NC_008228  65078  65797  -  720  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  YP_659641  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0056  CDS  NC_008228  65951  67027  +  1077  glycosyl transferase, group 1  YP_659642  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0057  CDS  NC_008228  67034  68350  -  1317  three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase-like  YP_659643  normal  0.551784  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0058  CDS  NC_008228  68610  69029  +  420  hypothetical protein  YP_659644  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0059  CDS  NC_008228  69031  70212  +  1182  hypothetical protein  YP_659645  normal  0.626146  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0060  CDS  NC_008228  70215  72662  +  2448  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  YP_659646  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0061  CDS  NC_008228  72809  74005  +  1197  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  YP_659647  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0062  CDS  NC_008228  74002  75024  +  1023  L-threonine 3-dehydrogenase  YP_659648  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0063  CDS  NC_008228  75040  75360  +  321  thiosulfate sulfurtransferase  YP_659649  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0064  CDS  NC_008228  75364  76242  +  879  rhomboid-like protein  YP_659650  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0065  CDS  NC_008228  76249  76662  -  414  flagellar basal body-associated protein FliL-like protein  YP_659651  normal  0.795758  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0066  CDS  NC_008228  76790  77368  +  579  chorismate lyase  YP_659652  normal  0.540538  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0067  CDS  NC_008228  77409  78230  +  822  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  YP_659653  normal  0.209668  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0068  CDS  NC_008228  78268  80214  +  1947  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_659654  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0069  CDS  NC_008228  80220  80471  -  252  hypothetical protein  YP_659655  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0070  CDS  NC_008228  80654  82669  +  2016  ATP-dependent DNA helicase Rep  YP_659656  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0071  CDS  NC_008228  82673  85264  -  2592  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  YP_659657  normal  0.213956  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0072  CDS  NC_008228  85401  85811  -  411  cytochrome c, class I  YP_659658  normal  0.663637  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0073  CDS  NC_008228  85909  86748  -  840  DNA ligase  YP_659659  normal  0.555561  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0074  CDS  NC_008228  87003  87830  -  828  alpha/beta hydrolase fold  YP_659660  normal  0.224768  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0075  CDS  NC_008228  88840  89112  -  273  hypothetical protein  YP_659661  normal  0.206235  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0076  CDS  NC_008228  89226  90290  -  1065  A/G-specific adenine glycosylase  YP_659662  normal  0.80443  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0077  CDS  NC_008228  90367  91098  +  732  alpha/beta hydrolase fold  YP_659663  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0078  CDS  NC_008228  91179  91898  +  720  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  YP_659664  normal  0.892836  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0079  CDS  NC_008228  91898  92929  +  1032  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  YP_659665  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0080  CDS  NC_008228  93048  94478  +  1431  glycogen synthase  YP_659666  normal  0.572578  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0081  CDS  NC_008228  94987  96576  +  1590  histidine kinase  YP_659667  normal  0.63025  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0082  CDS  NC_008228  96793  97500  +  708  two-component response regulator  YP_659668  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0083  CDS  NC_008228  97568  98053  -  486  FxsA cytoplasmic membrane protein  YP_659669  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0084  CDS  NC_008228  98333  100111  +  1779  thiol:disulfide interchange protein precursor  YP_659670  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0085  CDS  NC_008228  100158  101012  +  855  hypothetical protein  YP_659671  normal  0.720281  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0086  CDS  NC_008228  101096  101725  -  630  uracil phosphoribosyltransferase  YP_659672  normal  0.91121  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0087  CDS  NC_008228  101751  102350  -  600  hypothetical protein  YP_659673  normal  0.906418  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0088  CDS  NC_008228  102565  103050  +  486  3-dehydroquinate dehydratase  YP_659674  normal  0.2275  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0089  CDS  NC_008228  103110  103556  +  447  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxyl carrier protein  YP_659675  normal  0.423168  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0090  CDS  NC_008228  103571  104920  +  1350  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  YP_659676  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0091  CDS  NC_008228  104987  106351  -  1365  MATE efflux family protein  YP_659677  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0092  CDS  NC_008228  106492  107370  +  879  ribosomal protein L11 methyltransferase  YP_659678  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0093  CDS  NC_008228  107394  107906  -  513  HxlR family transcriptional regulator  YP_659679  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0094  CDS  NC_008228  108325  108507  +  183  hypothetical protein  YP_659680  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0095  CDS  NC_008228  108792  109910  +  1119  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  YP_659681  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0096  CDS  NC_008228  110016  111032  -  1017  hypothetical protein  YP_659682  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0097  CDS  NC_008228  111033  111287  -  255  hypothetical protein  YP_659683  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0098  CDS  NC_008228  111594  112109  -  516  sodium/calcium exchanger membrane region  YP_659684  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0099  CDS  NC_008228  112604  114013  +  1410  hypothetical protein  YP_659685  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Patl_0100  CDS  NC_008228  114100  114525  -  426  MarR family transcriptional regulator  YP_659686  normal  1  n/a    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 44    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>