2408 genes were found for organism Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 25    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Pars_0001  CDS  NC_009376  24  695  +  672  30S ribosomal protein S7P  YP_001152270  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0002  CDS  NC_009376  725  1714  +  990  replication factor C small subunit  YP_001152271  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0003  CDS  NC_009376  1715  2983  +  1269  replication factor C large subunit  YP_001152272  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0004  CDS  NC_009376  2985  3296  +  312  hypothetical protein  YP_001152273  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0005  CDS  NC_009376  3361  4530  +  1170  cell division control protein 6  YP_001152274  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0006  CDS  NC_009376  4527  4823  +  297  regulatory protein, ArsR  YP_001152275  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0007  CDS  NC_009376  4874  5527  +  654  hypothetical protein  YP_001152276  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0008  CDS  NC_009376  5541  6596  +  1056  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  YP_001152277  normal  0.679741  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0009  CDS  NC_009376  6698  7015  +  318  hypothetical protein  YP_001152278  normal  0.336822  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0010  CDS  NC_009376  7015  8148  +  1134  PUA domain-containing protein  YP_001152279  normal  0.929374  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0011  CDS  NC_009376  8407  9048  +  642  AMMECR1 domain-containing protein  YP_001152280  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0012  CDS  NC_009376  9049  9510  -  462  hypothetical protein  YP_001152281  normal  0.833881  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0013  CDS  NC_009376  9589  9774  -  186  hypothetical protein  YP_001152282  normal  0.589931  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0014  CDS  NC_009376  9814  11097  -  1284  hypothetical protein  YP_001152283  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0015  CDS  NC_009376  11097  11885  -  789  band 7 protein  YP_001152284  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0016  CDS  NC_009376  12100  12417  +  318  hypothetical protein  YP_001152285  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0017  CDS  NC_009376  12414  13442  +  1029  H+-transporting ATP synthase subunit C  YP_001152286  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0018  CDS  NC_009376  13444  13710  -  267  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  YP_001152287  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0019  CDS  NC_009376  13717  13881  -  165  hypothetical protein  YP_001152288  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0020  CDS  NC_009376  13905  14504  -  600  V-type ATPase, D subunit  YP_001152289  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0021  CDS  NC_009376  14542  15327  +  786  GTP-binding protein, HSR1-related  YP_001152290  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0022  CDS  NC_009376  15350  15823  +  474  hypothetical protein  YP_001152291  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0023  CDS  NC_009376  15925  16482  -  558  hypothetical protein  YP_001152292  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0024  CDS  NC_009376  16600  18003  +  1404  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_001152293  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0025  CDS  NC_009376  17988  19274  -  1287  phosphomannomutase  YP_001152294  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0026  CDS  NC_009376  19392  20507  +  1116  hypothetical protein  YP_001152295  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0027  CDS  NC_009376  20504  21103  -  600  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  YP_001152296  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0028  CDS  NC_009376  21321  22238  +  918  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  YP_001152297  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0029  CDS  NC_009376  22235  22765  +  531  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  YP_001152298  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0030  CDS  NC_009376  22809  24329  +  1521  hypothetical protein  YP_001152299  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0031  CDS  NC_009376  24477  25961  +  1485  type II secretion system protein E  YP_001152300  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0032  CDS  NC_009376  26341  26853  +  513  hypothetical protein  YP_001152301  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0033  CDS  NC_009376  26880  28367  +  1488  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  YP_001152302  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0034  CDS  NC_009376  28356  29072  -  717  hypothetical protein  YP_001152303  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0035  CDS  NC_009376  29069  29581  -  513  transcription factor TFIIE, alpha subunit  YP_001152304  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0036  CDS  NC_009376  29639  30784  -  1146  small GTP-binding protein  YP_001152305  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0037  CDS  NC_009376  30774  31259  -  486  helix-turn-helix domain-containing protein  YP_001152306  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0038  CDS  NC_009376  31265  31756  +  492  PUA domain-containing protein  YP_001152307  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0039  CDS  NC_009376  31725  32003  -  279  hypothetical protein  YP_001152308  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0040  CDS  NC_009376  31987  32280  -  294  hypothetical protein  YP_001152309  normal  0.927069  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0041  CDS  NC_009376  32360  32602  +  243  like-Sm ribonucleoprotein, core  YP_001152310  normal  0.444041  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0042  CDS  NC_009376  32599  32757  +  159  50S ribosomal protein L37e  YP_001152311  normal  0.558285  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0043  CDS  NC_009376  32838  33428  +  591  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  YP_001152312  normal  0.31536  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0044  CDS  NC_009376  33452  34378  +  927  hypothetical protein  YP_001152313  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0045  CDS  NC_009376  34375  34758  -  384  cytidine deaminase  YP_001152314  normal  0.51644  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0046  CDS  NC_009376  34796  35728  +  933  hypothetical protein  YP_001152315  normal  0.316164  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0047  CDS  NC_009376  35752  36534  +  783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001152316  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0048  CDS  NC_009376  36523  37812  -  1290  serine hydroxymethyltransferase  YP_001152317  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0049  CDS  NC_009376  37851  38582  -  732  molybdenum cofactor biosynthesis protein (moaC)  YP_001152318  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0050  CDS  NC_009376  38579  38908  -  330  hypothetical protein  YP_001152319  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0051  CDS  NC_009376  38939  39997  -  1059  isopentenyl pyrophosphate isomerase  YP_001152320  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0052  CDS  NC_009376  39997  40737  -  741  50S ribosomal protein L2P  YP_001152321  normal  0.946037  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0053  CDS  NC_009376  40871  41086  +  216  30S ribosomal protein S17e  YP_001152322  normal  0.493826  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0054  CDS  NC_009376  41089  41778  +  690  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  YP_001152323  normal  0.650348  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0055  CDS  NC_009376  41882  42490  +  609  proteasome endopeptidase complex  YP_001152324  normal  0.671684  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0056  CDS  NC_009376  42511  43770  +  1260  phosphopyruvate hydratase  YP_001152325  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0057  CDS  NC_009376  43801  44214  +  414  ModE family transcriptional regulator  YP_001152326  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0058  CDS  NC_009376  44199  45131  -  933  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  YP_001152327  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0059  CDS  NC_009376  45588  46664  +  1077  protein kinase  YP_001152328  normal  0.339419  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0060  CDS  NC_009376  46684  47211  +  528  FHA domain-containing protein  YP_001152329  normal  0.399884  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0061  CDS  NC_009376  47247  47873  +  627  30S ribosomal protein S2  YP_001152330  normal  0.924609  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0062  CDS  NC_009376  47928  48773  +  846  hypothetical protein  YP_001152331  normal  0.853485  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0063  CDS  NC_009376  48770  50119  -  1350  pyruvate kinase  YP_001152332  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0064  CDS  NC_009376  50116  52023  -  1908  beta-lactamase domain-containing protein  YP_001152333  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0065  CDS  NC_009376  52072  53502  +  1431  cysteinyl-tRNA synthetase  YP_001152334  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0066    NC_009376  53802  53972  -  171      normal  0.700389  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0067    NC_009376  54256  54333  -  78      normal  0.627087  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0068  CDS  NC_009376  54516  54899  -  384  hypothetical protein  YP_001152335  normal  0.21828  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0069  CDS  NC_009376  55169  55405  +  237  hypothetical protein  YP_001152336  normal  0.185594  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0070  CDS  NC_009376  55467  59045  -  3579  hypothetical protein  YP_001152337  normal  0.0977869  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0071  CDS  NC_009376  59049  61013  +  1965  hypothetical protein  YP_001152338  normal  0.207619  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0072  CDS  NC_009376  61054  69057  +  8004  hypothetical protein  YP_001152339  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0073  CDS  NC_009376  69117  69713  +  597  hypothetical protein  YP_001152340  normal  0.135559  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0074  CDS  NC_009376  69743  70510  +  768  hypothetical protein  YP_001152341  normal  0.100299  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0075  CDS  NC_009376  70491  71021  +  531  putative adenylyl cyclase CyaB  YP_001152342  normal  0.109831  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0076  CDS  NC_009376  71029  72783  +  1755  ATP-dependent DNA ligase  YP_001152343  normal  0.101904  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0077  CDS  NC_009376  72771  73259  -  489  hypothetical protein  YP_001152344  normal  0.555133  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0078  CDS  NC_009376  73337  74245  +  909  ribokinase-like domain-containing protein  YP_001152345  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0079  CDS  NC_009376  74268  74603  +  336  hypothetical protein  YP_001152346  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0080  CDS  NC_009376  74600  75277  +  678  nucleotidyl transferase  YP_001152347  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0081  CDS  NC_009376  75309  76028  +  720  hypothetical protein  YP_001152348  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0082  CDS  NC_009376  76025  76579  +  555  hypothetical protein  YP_001152349  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0083  CDS  NC_009376  76563  76928  -  366  hypothetical protein  YP_001152350  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0084  CDS  NC_009376  76955  78016  +  1062  hypothetical protein  YP_001152351  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0085  CDS  NC_009376  78797  79123  -  327  hypothetical protein  YP_001152352  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0086  CDS  NC_009376  79428  80330  -  903  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_001152353  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0087  CDS  NC_009376  80332  80733  -  402  hypothetical protein  YP_001152354  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0088  CDS  NC_009376  81058  81369  +  312  50S ribosomal protein L14e  YP_001152355  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0089  CDS  NC_009376  81366  82361  +  996  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  YP_001152356  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0090  CDS  NC_009376  82385  82678  +  294  hypothetical protein  YP_001152357  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0091  CDS  NC_009376  82675  83169  +  495  hypothetical protein  YP_001152358  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0092  CDS  NC_009376  83190  83648  +  459  hypothetical protein  YP_001152359  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0093  CDS  NC_009376  83645  84577  +  933  oxidoreductase domain-containing protein  YP_001152360  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0094  CDS  NC_009376  84632  85174  +  543  hypothetical protein  YP_001152361  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0095  CDS  NC_009376  85228  85713  +  486  hypothetical protein  YP_001152362  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0096  CDS  NC_009376  85703  86500  -  798  competence damage-inducible protein A  YP_001152363  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0097  CDS  NC_009376  86510  87370  -  861  hypothetical protein  YP_001152364  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0098  CDS  NC_009376  87429  87842  +  414  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  YP_001152365  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0099  CDS  NC_009376  87839  88072  +  234  hypothetical protein  YP_001152366  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0100  CDS  NC_009376  88041  88430  -  390  hypothetical protein  YP_001152367  normal  1  normal  1  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 25    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>