867 genes were found for organism Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 9    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
MCAP_0001  CDS  NC_007633  1353  1353  chromosomal replication initiation protein  YP_424001  normal  0.14003  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0002  CDS  NC_007633  1518  2645  1128  DNA polymerase III, beta subunit  YP_424002  normal  0.140323  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0003  CDS  NC_007633  2682  3224  543  primase-related protein  YP_424003  normal  0.458899  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0004  CDS  NC_007633  3214  4014  801  dimethyladenosine transferase  YP_424004  normal  0.50922  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0005  CDS  NC_007633  4069  5163  1095  hypothetical protein  YP_424005  normal  0.844263  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0006  misc_RNA  NC_007633  5232  5308  77  4.5S RNA    normal  0.297057  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0007  CDS  NC_007633  5328  5771  444  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  YP_424006  normal  0.160132  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0008  CDS  NC_007633  5851  7860  2010  DNA polymerase III gamma-tau subunits  YP_424007  normal  0.167579  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0009  CDS  NC_007633  7862  8452  591  DNA repair protein RecM  YP_424008  normal  0.35386  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0010  CDS  NC_007633  8455  9096  642  thymidylate kinase  YP_424009  normal  0.852172  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0011  CDS  NC_007633  9074  9817  744  DNA polymerase III, delta prime subunit  YP_424010  normal  0.158279  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0012  CDS  NC_007633  9877  10539  663  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  YP_424011  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0013  CDS  NC_007633  10590  11411  822  hypothetical protein  YP_424012  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0014  CDS  NC_007633  11416  12621  1206  hypothetical protein  YP_424013  normal  0.709368  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0015  CDS  NC_007633  12618  13454  837  hypothetical protein  YP_424014  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0016  misc_RNA  NC_007633  13475  13569  95  MCS2 RNA    normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0017  CDS  NC_007633  13687  15639  1953  ATP-dependent metalloprotease FtsH  YP_424015  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0018  CDS  NC_007633  16712  22105  5394  hypothetical protein  YP_424016  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0019  CDS  NC_007633  22249  25407  3159  hypothetical protein  YP_424017  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0020  CDS  NC_007633  25583  26449  867  chaperonin HSP33  YP_424018  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0021  CDS  NC_007633  26497  27534  1038  ABC transporter, ATP-binding protein  YP_424019  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0022  CDS  NC_007633  27586  28185  600  azoreductase  YP_424020  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0023  CDS  NC_007633  28374  28580  207  cold shock protein  YP_424021  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0024  CDS  NC_007633  28783  29196  414  30S ribosomal protein S6  YP_424022  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0025  CDS  NC_007633  29212  29652  441  single-strand DNA-binding protein  YP_424023  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0026  CDS  NC_007633  29671  29898  228  30S ribosomal protein S18  YP_424024  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0027  CDS  NC_007633  30594  31982  1389  hypothetical protein  YP_424025  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0028  CDS  NC_007633  32257  33810  1554  PTS system, mannitol-specific IIBC component, putative  YP_424026  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0029  CDS  NC_007633  33810  34568  759  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  YP_424027  normal  0.369219  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0030  CDS  NC_007633  34568  34813  246  PTS system, mannitol-specific IIA component, putative  YP_424028  normal  0.761217  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0031  CDS  NC_007633  35027  35824  798  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator , putative  YP_424029  normal  0.89127  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0032  CDS  NC_007633  35825  36829  1005  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase, putative  YP_424030  normal  0.49746  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0033  CDS  NC_007633  36866  38458  1593  lipoprotein, putative (LppA)  YP_424031  normal  0.116107  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0034  CDS  NC_007633  38483  40042  1560  LppA family lipoprotein  YP_424032  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0035  CDS  NC_007633  40240  41769  1530  methionyl-tRNA synthetase  YP_424033  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0036    NC_007633  41953  43596  1644      normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0037  CDS  NC_007633  43614  45221  1608  ABC transporter, ATP-binding protein  YP_424034  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0038  CDS  NC_007633  45211  47769  2559  ABC transporter, permease protein  YP_424035  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0039  CDS  NC_007633  47772  48749  978  ABC transporter, permease protein  YP_424036  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0040  CDS  NC_007633  48817  51204  2388  DNA gyrase, A subunit  YP_424037  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0041  CDS  NC_007633  51336  53240  1905  DNA gyrase, B subunit  YP_424038  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0042  CDS  NC_007633  53640  55241  1602  putative lipoprotein  YP_424039  normal  0.444396  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0043  CDS  NC_007633  55409  56182  774  hypothetical protein  YP_424040  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0044  CDS  NC_007633  56166  56888  723  hypothetical protein  YP_424041  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0045  CDS  NC_007633  56998  59832  2835  preprotein translocase subunit SecA  YP_424042  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0046  CDS  NC_007633  59912  60487  576  hypothetical protein  YP_424043  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0047  CDS  NC_007633  60583  61497  915  5-3 exonuclease family protein  YP_424044  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0048  CDS  NC_007633  61692  62708  1017  adenine-specific DNA methylase, putative  YP_424045  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0049  CDS  NC_007633  62638  63615  978  DNA adenine methylase  YP_424046  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0050  CDS  NC_007633  63593  65170  1578  restriction endonuclease  YP_424047  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0051    NC_007633  65160  66642  1483      normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0052  CDS  NC_007633  66644  67114  471  hypothetical protein  YP_424048  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0053  CDS  NC_007633  67839  68114  276  hypothetical protein  YP_424049  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0054  CDS  NC_007633  68104  68670  567  dephospho-CoA kinase  YP_424050  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0055  CDS  NC_007633  68672  69481  810  hemolysin A  YP_424051  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0056  CDS  NC_007633  69481  69696  216  hypothetical protein  YP_424052  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0057  CDS  NC_007633  69689  71095  1407  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  YP_424053  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0058  CDS  NC_007633  71097  71495  399  N utilization substance protein B (nusB), putative  YP_424054  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0059  CDS  NC_007633  71507  72577  1071  putative lipoprotein  YP_424055  normal  0.824559  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0060  CDS  NC_007633  72604  73473  870  endonuclease IV  YP_424056  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0061  CDS  NC_007633  73466  74218  753  riboflavin kinase / FAD synthetase family protein  YP_424057  normal  0.462738  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0062  tRNA  NC_007633  74293  74368  76  tRNA-Lys    normal  0.209249  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0063  CDS  NC_007633  74775  76349  1575  glycosyl transferase, group 2 family protein  YP_424058  normal  0.304687  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0064  CDS  NC_007633  76352  77230  879  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  YP_424059  normal  0.52571  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0065  CDS  NC_007633  77432  77860  429  50S ribosomal protein L11  YP_424060  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0066  CDS  NC_007633  77860  78540  681  50S ribosomal protein L1  YP_424061  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0067  CDS  NC_007633  78769  79266  498  50S ribosomal protein L10  YP_424062  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0068  CDS  NC_007633  79342  79710  369  50S ribosomal protein L7/L12  YP_424063  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0069  CDS  NC_007633  79881  81053  1173  hypothetical protein  YP_424064  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0070  CDS  NC_007633  81043  84906  3864  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  YP_424065  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0071  CDS  NC_007633  84918  88685  3768  DNA-directed RNA polymerase beta' subunit  YP_424066  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0072  CDS  NC_007633  88775  90964  2190  putative lipoprotein  YP_424067  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0073  CDS  NC_007633  90971  91276  306  hypothetical protein  YP_424068  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0074  CDS  NC_007633  91301  91798  498  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  YP_424069  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0075  CDS  NC_007633  91782  93023  1242  serine hydroxymethyltransferase  YP_424070  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0076  CDS  NC_007633  93125  93748  624  uracil phosphoribosyltransferase  YP_424071  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0077  CDS  NC_007633  93889  94287  399  hypothetical protein  YP_424072  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0078  CDS  NC_007633  94287  95147  861  F0F1 ATP synthase subunit A  YP_424073  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0079  CDS  NC_007633  95186  95491  306  ATP synthase F0, subunit c  YP_424074  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0080  CDS  NC_007633  95519  96064  546  ATP synthase F0, B subunit  YP_424075  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0081  CDS  NC_007633  96066  96611  546  F0F1 ATP synthase subunit delta  YP_424076  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0082  CDS  NC_007633  96623  98200  1578  F0F1 ATP synthase subunit alpha  YP_424077  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0083  CDS  NC_007633  98202  99044  843  F0F1 ATP synthase subunit gamma  YP_424078  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0084  CDS  NC_007633  99053  100483  1431  F0F1 ATP synthase subunit beta  YP_424079  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0085  CDS  NC_007633  100483  100782  300  ATP synthase F1, epsilon subunit  YP_424080  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0086  CDS  NC_007633  100840  102051  1212  hypothetical protein  YP_424081  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0087  CDS  NC_007633  102390  105218  2829  magnesium-translocating P-type ATPase  YP_424082  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0088  CDS  NC_007633  105679  105813  135  hypothetical protein  YP_424083  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0089  CDS  NC_007633  105998  107209  1212  arginine deiminase  YP_424084  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0090  CDS  NC_007633  107227  108222  996  ornithine carbamoyltransferase, catabolic  YP_424085  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0091  CDS  NC_007633  108285  109754  1470  transporter, putative  YP_424086  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0092    NC_007633  110217  111184  968      normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0093  CDS  NC_007633  111276  112403  1128  beta-lactamase, putative  YP_424087  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0094  CDS  NC_007633  112508  114721  2214  PTS system, glucose-specific IIABC component  YP_424088  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0095  CDS  NC_007633  115141  115629  489  hypothetical protein  YP_424089  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0096  CDS  NC_007633  115629  116075  447  SsrA-binding protein  YP_424090  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0097  CDS  NC_007633  116085  118199  2115  3'-5' exoribonuclease  YP_424091  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0098  CDS  NC_007633  118235  118591  357  preprotein translocase subunit SecG  YP_424092  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0099  CDS  NC_007633  118773  119792  1020  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  YP_424093  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
MCAP_0100  CDS  NC_007633  119802  120275  474  ribonucleotide reductase stimulatory protein  YP_424094  normal  n/a    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 9    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9    next >  last >>