45 genes were found for organism Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Bamb_6591  CDS  NC_008385  291  653  -  363  conjugal transfer protein TrbA  YP_771668  hitchhiker  0.00000000000000102889  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6592  CDS  NC_008385  767  1108  +  342  single-strand binding protein  YP_771669  hitchhiker  0.000000000000130329  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6593  CDS  NC_008385  1155  2375  +  1221  TrfA family protein  YP_771670  hitchhiker  0.00000000121098  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6594  CDS  NC_008385  3698  4012  -  315  plasmid stabilization system protein  YP_771671  hitchhiker  0.000313178  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6595  CDS  NC_008385  4009  4278  -  270  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  YP_771672  hitchhiker  0.00498827  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6596  CDS  NC_008385  4447  4875  +  429  antirestriction protein  YP_771673  normal  0.0289117  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6597  CDS  NC_008385  4927  6132  +  1206  hypothetical protein  YP_771674  normal  0.609028  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6598  CDS  NC_008385  6149  6406  +  258  hypothetical protein  YP_771675  normal  0.205855  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6599  CDS  NC_008385  6566  6802  +  237  hypothetical protein  YP_771676  normal  0.08134  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6600  CDS  NC_008385  7221  7550  +  330  hypothetical protein  YP_771677  normal  0.137188  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6601  CDS  NC_008385  7552  8082  +  531  hypothetical protein  YP_771678  normal  0.131703  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6602  CDS  NC_008385  8183  9259  +  1077  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_771679  normal  1  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6603  CDS  NC_008385  9256  10305  +  1050  parB-like partition proteins  YP_771680  normal  1  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6604  CDS  NC_008385  10485  11516  +  1032  hypothetical protein  YP_771681  normal  1  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6605  CDS  NC_008385  11687  12034  +  348  putative conjugation protein TraO  YP_771682  normal  1  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6606  CDS  NC_008385  12063  12716  +  654  hypothetical protein  YP_771683  normal  1  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6607  CDS  NC_008385  12919  13359  -  441  conjugal transfer protein TraM  YP_771684  normal  1  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6608  CDS  NC_008385  13359  14084  -  726  conjugal transfer protein TraL  YP_771685  normal  1  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6609  CDS  NC_008385  14084  14482  -  399  TraK protein of DNA transfer system  YP_771686  normal  1  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6610  CDS  NC_008385  14856  15230  +  375  conjugal transfer relaxosome component TraJ  YP_771687  normal  1  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6611  CDS  NC_008385  15265  17505  +  2241  conjugal transfer relaxase TraI  YP_771688  normal  1  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6612  CDS  NC_008385  17502  19415  +  1914  conjugal transfer coupling protein TraG  YP_771689  normal  1  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6613  CDS  NC_008385  19412  19948  +  537  conjugal transfer peptidase TraF  YP_771690  normal  1  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6614  CDS  NC_008385  19960  22023  +  2064  DNA topoisomerase III  YP_771691  normal  0.668751  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6615  CDS  NC_008385  22045  22434  +  390  conjugal transfer protein  YP_771692  normal  0.184542  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6616  CDS  NC_008385  22438  26784  +  4347  hypothetical protein  YP_771693  normal  0.0777828  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6617  CDS  NC_008385  27075  28976  +  1902  transposase Tn3 family protein  YP_771694  normal  1  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6618  CDS  NC_008385  29073  29453  -  381  hypothetical protein  YP_771695  normal  1  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6619  CDS  NC_008385  29539  30036  -  498  hypothetical protein  YP_771696  normal  1  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6620  CDS  NC_008385  30191  30622  -  432  hypothetical protein  YP_771697  normal  1  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6621  CDS  NC_008385  30638  31336  -  699  conjugal transfer protein TrbP  YP_771698  normal  1  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6622  CDS  NC_008385  31336  31602  -  267  hypothetical protein  YP_771699  normal  1  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6623  CDS  NC_008385  31631  32266  -  636  conjugal transfer protein TrbN  YP_771700  normal  1  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6624  CDS  NC_008385  32280  32867  -  588  conjugal transfer protein TrbM  YP_771701  normal  1  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6625  CDS  NC_008385  32885  34603  -  1719  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  YP_771702  normal  1  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6626  CDS  NC_008385  34614  34841  -  228  entry exclusion protein TrbK  YP_771703  normal  0.269198  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6627  CDS  NC_008385  34851  35615  -  765  conjugal transfer protein TrbJ  YP_771704  normal  0.331539  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6628  CDS  NC_008385  35636  37057  -  1422  conjugal transfer protein TrbI  YP_771705  normal  1  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6629  CDS  NC_008385  37062  37550  -  489  conjugal transfer protein TrbH  YP_771706  normal  1  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6630  CDS  NC_008385  37553  38452  -  900  conjugal transfer protein TrbG  YP_771707  normal  1  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6631  CDS  NC_008385  38470  39252  -  783  conjugal transfer protein TrbF  YP_771708  normal  1  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6632  CDS  NC_008385  39249  41807  -  2559  conjugal transfer protein TrbE  YP_771709  normal  0.0411416  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6633  CDS  NC_008385  41804  42115  -  312  conjugal transfer protein TrbD  YP_771710  hitchhiker  0.00000138876  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6634  CDS  NC_008385  42119  42583  -  465  conjugal transfer protein TrbC  YP_771711  hitchhiker  0.000000000197528  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6635  CDS  NC_008385  42600  43562  -  963  conjugal transfer ATPase TrbB  YP_771712  decreased coverage  0.00000000000001277  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>