195 genes were found for organism Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Ppro_3627  CDS  NC_008607  45  1586  +  1542  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  YP_899472  normal  0.180644  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3628  CDS  NC_008607  1583  2209  +  627  hypothetical protein  YP_899473  normal  0.799442  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3629  CDS  NC_008607  2647  3624  +  978  peptidase M50  YP_899474  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3630  CDS  NC_008607  3686  4102  +  417  response regulator receiver protein  YP_899475  normal  0.536096  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3631  CDS  NC_008607  4104  5189  +  1086  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  YP_899476  normal  0.991332  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3632  CDS  NC_008607  5189  5722  +  534  hypothetical protein  YP_899477  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3633  CDS  NC_008607  5719  7272  +  1554  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_899478  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3634  CDS  NC_008607  7269  9275  +  2007  TonB-dependent receptor, plug  YP_899479  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3635  CDS  NC_008607  9314  9655  +  342  hypothetical protein  YP_899480  normal  0.969995  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3636  CDS  NC_008607  10128  10493  -  366  hypothetical protein  YP_899481  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3637  CDS  NC_008607  10734  11057  -  324  hypothetical protein  YP_899482  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3638  CDS  NC_008607  11352  11642  +  291  hypothetical protein  YP_899483  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3639  CDS  NC_008607  11663  14023  +  2361  heavy metal translocating P-type ATPase  YP_899484  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3640  CDS  NC_008607  14279  15241  +  963  metal dependent phosphohydrolase  YP_899485  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3641  CDS  NC_008607  15684  16160  +  477  heavy metal transport/detoxification protein  YP_899486  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3642  CDS  NC_008607  16175  16639  +  465  hypothetical protein  YP_899487  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3643  CDS  NC_008607  16667  17827  +  1161  hypothetical protein  YP_899488  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3644  CDS  NC_008607  17840  18505  +  666  ABC transporter related  YP_899489  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3645  CDS  NC_008607  18529  19083  +  555  peptidase M23B  YP_899490  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3646  CDS  NC_008607  19091  20209  +  1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_899491  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3647  CDS  NC_008607  20206  21561  +  1356  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  YP_899492  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3648  CDS  NC_008607  21767  23107  +  1341  outer membrane efflux protein  YP_899493  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3649  CDS  NC_008607  23144  24562  +  1419  RND family efflux transporter MFP subunit  YP_899494  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3650  CDS  NC_008607  24636  27773  +  3138  CzcA family heavy metal efflux protein  YP_899495  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3651  CDS  NC_008607  28003  28575  +  573  putative lipoprotein  YP_899496  normal  0.950537  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3652  CDS  NC_008607  28757  29224  +  468  hypothetical protein  YP_899497  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3653  CDS  NC_008607  29206  29532  +  327  hypothetical protein  YP_899498  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3654  CDS  NC_008607  29590  30450  +  861  hypothetical protein  YP_899499  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3655  CDS  NC_008607  30473  30910  +  438  hypothetical protein  YP_899500  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3656  CDS  NC_008607  31260  31523  +  264  hypothetical protein  YP_899501  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3657  CDS  NC_008607  31721  32362  +  642  YHS domain-containing protein  YP_899502  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3658  CDS  NC_008607  32368  32934  +  567  hypothetical protein  YP_899503  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3659  CDS  NC_008607  32980  33201  +  222  CopG/DNA-binding domain-containing protein  YP_899504  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3660  CDS  NC_008607  33483  34091  -  609  resolvase domain-containing protein  YP_899505  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3661  CDS  NC_008607  34380  37232  +  2853  transposase Tn3 family protein  YP_899506  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3662  CDS  NC_008607  37719  39428  -  1710  hypothetical protein  YP_899507  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3663  CDS  NC_008607  40565  41128  -  564  nuclease  YP_899508  unclonable  0.00000641477  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3664  CDS  NC_008607  41908  42561  +  654  hypothetical protein  YP_899509  unclonable  0.0000112118  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3665  CDS  NC_008607  42569  43687  +  1119  hypothetical protein  YP_899510  hitchhiker  0.00323542  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3666  CDS  NC_008607  44050  45846  +  1797  hypothetical protein  YP_899511  normal  0.350699  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3667  CDS  NC_008607  45989  46255  -  267  hypothetical protein  YP_899512  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3668  CDS  NC_008607  46248  49514  -  3267  hypothetical protein  YP_899513  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3669  CDS  NC_008607  49515  52844  -  3330  helicase domain-containing protein  YP_899514  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3670  CDS  NC_008607  53146  53703  +  558  resolvase domain-containing protein  YP_899515  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3671  CDS  NC_008607  53780  54247  -  468  hypothetical protein  YP_899516  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3673  CDS  NC_008607  54307  54873  +  567  hypothetical protein  YP_899517  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3674  CDS  NC_008607  55867  56277  -  411  hypothetical protein  YP_899518  normal  0.537699  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3675  CDS  NC_008607  56548  57000  -  453  hypothetical protein  YP_899519  normal  0.360265  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3676  CDS  NC_008607  57203  57334  -  132  hypothetical protein  YP_899520  normal  0.426328  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3677  CDS  NC_008607  57536  58159  -  624  high-affinity nickel-transporter  YP_899521  normal  0.841534  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3678  CDS  NC_008607  58192  59226  +  1035  transposase and inactivated derivatives  YP_899522  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3679  CDS  NC_008607  59457  60125  -  669  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  YP_899523  normal  0.928215  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3680  CDS  NC_008607  60235  60894  -  660  DtxR family iron dependent repressor  YP_899524  normal  0.361063  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3681  CDS  NC_008607  60932  62926  -  1995  ferrous iron transport protein B  YP_899525  normal  0.10548  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3682  CDS  NC_008607  62963  63742  -  780  hypothetical protein  YP_899526  unclonable  0.0000140139  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3683  CDS  NC_008607  63778  66153  -  2376  heavy metal translocating P-type ATPase  YP_899527  unclonable  0.00270096  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3684  CDS  NC_008607  66234  66581  -  348  hypothetical protein  YP_899528  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3685  CDS  NC_008607  66588  66815  +  228  hypothetical protein  YP_899529  normal  0.719282  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3686  CDS  NC_008607  66844  67242  -  399  hypothetical protein  YP_899530  normal  0.829007  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3687  CDS  NC_008607  67267  67761  -  495  lipoprotein signal peptidase  YP_899531  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3688  CDS  NC_008607  67854  68201  -  348  hypothetical protein  YP_899532  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3689  CDS  NC_008607  68248  68637  -  390  hypothetical protein  YP_899533  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3690  CDS  NC_008607  68708  70078  -  1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_899534  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3691  CDS  NC_008607  70071  70763  -  693  two component transcriptional regulator  YP_899535  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3692  CDS  NC_008607  70814  71209  -  396  hypothetical protein  YP_899536  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3693  CDS  NC_008607  71206  71577  -  372  ArsR family transcriptional regulator  YP_899537  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3694  CDS  NC_008607  71784  72404  -  621  resolvase domain-containing protein  YP_899538  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3695  CDS  NC_008607  72561  75470  +  2910  transposase Tn3 family protein  YP_899539  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3696  CDS  NC_008607  75584  75808  -  225  antibiotic biosynthesis monooxygenase  YP_899540  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3697  CDS  NC_008607  75840  76034  -  195  ferredoxin family protein, putative  YP_899541  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3698  CDS  NC_008607  76112  76747  -  636  hypothetical protein  YP_899542  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3699  CDS  NC_008607  76806  78014  -  1209  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  YP_899543  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3700  CDS  NC_008607  78071  78778  -  708  hypothetical protein  YP_899544  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3701  CDS  NC_008607  78839  79276  -  438  putative PAS/PAC sensor protein  YP_899545  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3702  CDS  NC_008607  79469  81070  -  1602  hydroxylamine reductase  YP_899546  normal  0.456407  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3703  CDS  NC_008607  81165  81731  -  567  HPP family protein+B94  YP_899547  normal  0.422801  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3704  CDS  NC_008607  81750  82739  -  990  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_899548  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3705  CDS  NC_008607  82811  84352  -  1542  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  YP_899549  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3706  CDS  NC_008607  84377  85441  -  1065  transposase, IS4 family protein  YP_899550  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3707  CDS  NC_008607  85618  86076  -  459  cytochrome c nitrite reductase, small subunit NrfH, putative  YP_899551  normal  0.741906  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3708  CDS  NC_008607  86440  87429  +  990  ISSpo8, transposase  YP_899552  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3709  CDS  NC_008607  87500  88117  +  618  TetR family transcriptional regulator  YP_899553  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3710  CDS  NC_008607  88182  89441  +  1260  outer membrane efflux protein  YP_899554  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3711  CDS  NC_008607  89468  90637  +  1170  RND family efflux transporter MFP subunit  YP_899555  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3712  CDS  NC_008607  90634  91836  +  1203  hypothetical protein  YP_899556  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3713  CDS  NC_008607  91840  92541  +  702  ABC transporter related  YP_899557  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3714  CDS  NC_008607  92650  93216  -  567  resolvase domain-containing protein  YP_899558  normal  0.566828  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3715  CDS  NC_008607  93386  95581  +  2196  transposase Tn3 family protein  YP_899559  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3716  CDS  NC_008607  95542  96318  -  777  IstB ATP binding domain-containing protein  YP_899560  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3717  CDS  NC_008607  96306  97544  -  1239  integrase catalytic subunit  YP_899561  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3718  CDS  NC_008607  97633  98550  +  918  transposase Tn3 family protein  YP_899562  normal  0.396342  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3719  CDS  NC_008607  99224  99697  +  474  hypothetical protein  YP_899563  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3720  CDS  NC_008607  99837  100268  +  432  single-strand binding protein  YP_899564  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3721  CDS  NC_008607  100428  101432  +  1005  hypothetical protein  YP_899565  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3722  CDS  NC_008607  101540  102088  +  549  hypothetical protein  YP_899566  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3723  CDS  NC_008607  102214  105555  +  3342  type III restriction enzyme, res subunit  YP_899567  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3724  CDS  NC_008607  105568  105813  +  246  hypothetical protein  YP_899568  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3725  CDS  NC_008607  105916  106911  +  996  hypothetical protein  YP_899569  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3726  CDS  NC_008607  106986  107246  +  261  hypothetical protein  YP_899570  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_3727  CDS  NC_008607  107243  107455  +  213  hypothetical protein  YP_899571  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>