120 genes were found for organism Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
VIBHAR_p08159  CDS  NC_009777  721  1074  354  transposase  YP_001436026  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08160  CDS  NC_009777  1071  1397  327  hypothetical protein  YP_001436027  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08161  CDS  NC_009777  1566  1790  225  hypothetical protein  YP_001436028  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08162  CDS  NC_009777  1777  2214  438  hypothetical protein  YP_001436029  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08163  CDS  NC_009777  2217  2462  246  hypothetical protein  YP_001436030  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08164  CDS  NC_009777  2568  2696  129  hypothetical protein  YP_001436031  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08165  CDS  NC_009777  2969  3886  918  DNA repair protein RadC  YP_001436032  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08166  CDS  NC_009777  3924  4055  132  hypothetical protein  YP_001436033  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08167  CDS  NC_009777  4734  4862  129  hypothetical protein  YP_001436034  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08168  CDS  NC_009777  5135  5419  285  hypothetical protein  YP_001436035  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08169  CDS  NC_009777  5503  5823  321  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  YP_001436036  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08170  CDS  NC_009777  6173  6595  423  hypothetical protein  YP_001436037  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08171  CDS  NC_009777  6616  7353  738  hypothetical protein  YP_001436038  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08172  CDS  NC_009777  7365  7835  471  hypothetical protein  YP_001436039  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08173  CDS  NC_009777  8090  8443  354  relaxosome NikA  YP_001436040  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08174  CDS  NC_009777  8437  11370  2934  relaxase NikB  YP_001436041  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08175  CDS  NC_009777  11802  12491  690  hypothetical protein  YP_001436042  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08176  CDS  NC_009777  12573  12692  120  hypothetical protein  YP_001436043  normal  0.641094  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08177  CDS  NC_009777  12667  12894  228  transposase  YP_001436044  normal  0.446869  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08178  CDS  NC_009777  12863  14431  1569  transposase  YP_001436045  normal  0.107815  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08179  CDS  NC_009777  14468  14821  354  transposase  YP_001436046  hitchhiker  0.00000803759  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08180  CDS  NC_009777  14818  15144  327  hypothetical protein  YP_001436047  hitchhiker  0.00000024141  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08181  CDS  NC_009777  15181  15756  576  transposase  YP_001436048  hitchhiker  0.000000000543405  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08182  CDS  NC_009777  15897  16178  282  transposase  YP_001436049  hitchhiker  0.00000000000000279853  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08183  CDS  NC_009777  16425  16772  348  hypothetical protein  YP_001436050  decreased coverage  3.68469e-18  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08184  CDS  NC_009777  16784  17122  339  hypothetical protein  YP_001436051  decreased coverage  1.10694e-16  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08185  CDS  NC_009777  17322  18023  702  integrase, catalytic region  YP_001436052  hitchhiker  0.000000144763  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08186  CDS  NC_009777  18164  18445  282  transposase  YP_001436053  hitchhiker  0.0000609698  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08187  CDS  NC_009777  18675  18806  132  hypothetical protein  YP_001436054  hitchhiker  0.00104163  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08188  CDS  NC_009777  19389  19820  432  hypothetical protein  YP_001436055  normal  0.31012  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08189  CDS  NC_009777  19874  20563  690  transposase  YP_001436056  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08190  CDS  NC_009777  20693  20977  285  hypothetical protein  YP_001436057  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08191  CDS  NC_009777  21280  21402  123  hypothetical protein  YP_001436058  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08192  CDS  NC_009777  21436  22479  1044  transposase  YP_001436059  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08193  CDS  NC_009777  22896  23912  1017  transposase  YP_001436060  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08194  CDS  NC_009777  24023  25222  1200  transposase  YP_001436061  normal  0.679296  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08195  CDS  NC_009777  25436  25756  321  hypothetical protein  YP_001436062  hitchhiker  0.00206953  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08196  CDS  NC_009777  26003  26827  825  hypothetical protein  YP_001436063  hitchhiker  0.00000170796  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08197  CDS  NC_009777  27184  27402  219  hypothetical protein  YP_001436064  hitchhiker  0.0000000000485454  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08198  CDS  NC_009777  27553  27849  297  ArsR family transcriptional regulator  YP_001436065  hitchhiker  0.00000000000862808  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08199  CDS  NC_009777  27836  28033  198  hypothetical protein  YP_001436066  hitchhiker  0.00000000000026245  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08200  CDS  NC_009777  28171  29208  1038  permease  YP_001436067  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08201  CDS  NC_009777  29680  31884  2205  DNA topoisomerase III  YP_001436068  normal  0.0178997  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08202  CDS  NC_009777  31893  32429  537  sex pilus assembly and synthesis protein  YP_001436069  normal  0.994682  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08203  CDS  NC_009777  32440  34218  1779  conjugal transfer protein TraK  YP_001436070  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08204  CDS  NC_009777  34222  35238  1017  type II secretion system protein E  YP_001436071  normal  0.291523  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08205  CDS  NC_009777  35222  35395  174  hypothetical protein  YP_001436072  normal  0.235218  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08206  CDS  NC_009777  35589  36782  1194  conjugal transfer protein  YP_001436073  normal  0.0354612  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08207  CDS  NC_009777  36775  37542  768  conjugal transfer outer membrane protein TraH  YP_001436074  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08208  CDS  NC_009777  37539  38294  756  conjugal transfer protein TraG  YP_001436075  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08209  CDS  NC_009777  38291  38404  114  hypothetical protein  YP_001436076  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08210  CDS  NC_009777  38518  39468  951  conjugal transfer protein TraA  YP_001436077  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08211  CDS  NC_009777  39478  39711  234  hypothetical protein  YP_001436078  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08212  CDS  NC_009777  39724  40389  666  conjugal transfer protein TrbJ  YP_001436079  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08213  CDS  NC_009777  40392  42650  2259  conjugal transfer protein TraE  YP_001436080  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08214  CDS  NC_009777  42685  43056  372  conjugal transfer protein traD  YP_001436081  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08215  CDS  NC_009777  43059  43376  318  conjugal transfer prepropilin  YP_001436082  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08216  CDS  NC_009777  43391  43993  603  conjugal transfer protein TraB  YP_001436083  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08217  CDS  NC_009777  43983  44342  360  hypothetical protein  YP_001436084  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08218  CDS  NC_009777  44396  44578  183  conjugative transfer protein TraY  YP_001436085  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08219  CDS  NC_009777  44584  44745  162  hypothetical protein  YP_001436086  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08220  CDS  NC_009777  45337  45927  591  DNA-binding protein RDGA  YP_001436087  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08221  CDS  NC_009777  45949  46380  432  hypothetical protein  YP_001436088  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08222  CDS  NC_009777  46387  47034  648  isoprenoid biosynthesis protein with amidotransferase-like domain  YP_001436089  normal  0.110955  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08223  CDS  NC_009777  47031  47510  480  hypothetical protein  YP_001436090  normal  0.0308055  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08224  CDS  NC_009777  48118  49014  897  hypothetical protein  YP_001436091  hitchhiker  0.0000213118  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08225  CDS  NC_009777  49611  49733  123  hypothetical protein  YP_001436092  hitchhiker  0.00000000000256866  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08226  CDS  NC_009777  49714  50112  399  hypothetical protein  YP_001436093  decreased coverage  1.2542400000000002e-18  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08227  CDS  NC_009777  50225  50992  768  chromosome partitioning protein ParA  YP_001436094  hitchhiker  0.00000000000000521031  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08228  CDS  NC_009777  51013  51309  297  hypothetical protein  YP_001436095  hitchhiker  0.000000000000205137  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08229  CDS  NC_009777  51522  51683  162  hypothetical protein  YP_001436097  hitchhiker  0.00000000000271554  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08230  CDS  NC_009777  51369  51539  171  hypothetical protein  YP_001436096  hitchhiker  0.000000000000189172  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08231  CDS  NC_009777  51662  52000  339  plasmid stabilization protein  YP_001436098  hitchhiker  0.000000000126553  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08232  CDS  NC_009777  52011  52280  270  prevent-host-death family protein  YP_001436099  hitchhiker  0.000000000278747  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08233  CDS  NC_009777  53129  53581  453  hypothetical protein  YP_001436100  hitchhiker  0.00000000113861  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08234  CDS  NC_009777  53778  54764  987  hypothetical protein  YP_001436101  hitchhiker  0.0000033969  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08235  CDS  NC_009777  54852  55247  396  hypothetical protein  YP_001436102  hitchhiker  0.000204654  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08236  CDS  NC_009777  55450  56994  1545  transposase  YP_001436103  normal  0.0445015  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08237  CDS  NC_009777  57054  57407  354  transposase  YP_001436104  normal  0.143502  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08238  CDS  NC_009777  57404  57730  327  hypothetical protein  YP_001436105  normal  0.317617  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08239  CDS  NC_009777  57956  58441  486  N-acetyltransferase  YP_001436106  normal  0.576483  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08240  CDS  NC_009777  59173  59937  765  hypothetical protein  YP_001436107  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08241  CDS  NC_009777  60093  60206  114  hypothetical protein  YP_001436108  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08242  CDS  NC_009777  60233  60529  297  hypothetical protein  YP_001436109  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08243  CDS  NC_009777  60457  60678  222  hypothetical protein  YP_001436110  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08244  CDS  NC_009777  60686  61888  1203  hypothetical protein  YP_001436111  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08245  CDS  NC_009777  62203  62742  540  resolvase  YP_001436112  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08246  CDS  NC_009777  62951  63211  261  prevent-host-death family protein  YP_001436113  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08247  CDS  NC_009777  63211  63513  303  plasmid stabilization protein ParE  YP_001436114  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08248  CDS  NC_009777  63596  63724  129  site-specific recombinase  YP_001436115  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08249  CDS  NC_009777  63714  64121  408  site-specific recombinase  YP_001436116  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08250  CDS  NC_009777  64728  65804  1077  replication protein  YP_001436117  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08251  CDS  NC_009777  66017  66139  123  hypothetical protein  YP_001436118  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08252  CDS  NC_009777  66745  67047  303  hypothetical protein  YP_001436119  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08253  CDS  NC_009777  67138  67467  330  hypothetical protein  YP_001436120  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08254  CDS  NC_009777  67457  68206  750  hypothetical protein  YP_001436121  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08255  CDS  NC_009777  68203  68721  519  hypothetical protein  YP_001436122  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08256  CDS  NC_009777  68756  69334  579  pili retraction protein PilT  YP_001436123  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08257  CDS  NC_009777  69415  69612  198  hypothetical protein  YP_001436124  normal  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_p08258  CDS  NC_009777  69528  71042  1515  RNA-directed DNA polymerase  YP_001436125  normal  0.867561  n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>