4162 genes were found for organism Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 42    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Sfum_0001  CDS  NC_008554  346  1698  +  1353  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_844140  normal  1  normal  0.439492  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0002  CDS  NC_008554  2035  2322  -  288  histone family protein DNA-binding protein  YP_844141  normal  1  normal  0.634668  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0003  CDS  NC_008554  3108  3491  +  384  putative 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase  YP_844142  normal  0.702249  normal  0.634668  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0004  CDS  NC_008554  3935  4657  +  723  hypothetical protein  YP_844143  normal  0.766809  normal  0.6832  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0005  CDS  NC_008554  4738  6567  -  1830  TPR repeat-containing protein  YP_844144  normal  0.910602  normal  0.795946  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0006  CDS  NC_008554  6663  7736  -  1074  KpsF/GutQ family protein  YP_844145  normal  0.157738  normal  1  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0007  CDS  NC_008554  7764  9227  -  1464  amidophosphoribosyltransferase  YP_844146  normal  0.30048  normal  1  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0008  CDS  NC_008554  9364  12606  -  3243  carbamoyl phosphate synthase large subunit  YP_844147  normal  0.196188  normal  1  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0009  CDS  NC_008554  13077  14252  -  1176  carbamoyl phosphate synthase small subunit  YP_844148  normal  0.35972  normal  1  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0010  CDS  NC_008554  14823  15575  -  753  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  YP_844149  normal  0.460305  normal  1  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0011  CDS  NC_008554  15808  18558  +  2751  (glutamate--ammonia-ligase) adenylyltransferase  YP_844150  normal  1  normal  1  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0012    NC_008554  18755  21190  -  2436      normal  1  normal  1  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0013  CDS  NC_008554  21465  23087  -  1623  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  YP_844151  normal  1  normal  0.779838  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0014  CDS  NC_008554  23084  26434  -  3351  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_844152  normal  1  normal  0.952368  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0015  CDS  NC_008554  26434  27054  -  621  2-oxoglutarate synthase  YP_844153  normal  1  normal  0.439492  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0016  CDS  NC_008554  27086  27928  -  843  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  YP_844154  normal  0.975034  normal  0.448103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0017  CDS  NC_008554  28280  29437  -  1158  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit alpha  YP_844155  normal  0.130806  normal  0.512001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0018  CDS  NC_008554  29501  29782  -  282  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_844156  normal  0.0689181  normal  0.439492  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0019  CDS  NC_008554  30557  31330  -  774  hypothetical protein  YP_844157  normal  0.0735022  normal  0.290854  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0020  CDS  NC_008554  32284  34755  -  2472  ATP-dependent protease, putative  YP_844158  normal  0.140592  normal  0.225222  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0021  CDS  NC_008554  34935  35171  -  237  hypothetical protein  YP_844159  normal  0.055536  normal  0.167537  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0022  CDS  NC_008554  35199  35504  -  306  hypothetical protein  YP_844160  normal  0.0601173  normal  0.292337  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0023  CDS  NC_008554  35568  36401  -  834  xylose isomerase domain-containing protein  YP_844161  normal  0.140146  normal  0.179482  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0024  CDS  NC_008554  37084  38022  +  939  periplasmic solute binding protein  YP_844162  normal  0.229432  normal  0.178577  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0025  CDS  NC_008554  38113  38562  +  450  ferric uptake regulator family protein  YP_844163  normal  0.344249  normal  0.157034  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0026  CDS  NC_008554  38724  39092  -  369  hypothetical protein  YP_844164  normal  0.134976  normal  0.151496  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0027  CDS  NC_008554  39107  39952  +  846  extracellular solute-binding protein  YP_844165  normal  0.0472566  normal  0.160899  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0028  CDS  NC_008554  39986  40678  +  693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_844166  hitchhiker  0.000259316  normal  0.154621  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0029  CDS  NC_008554  40678  41406  +  729  ABC transporter related  YP_844167  hitchhiker  0.000212578  normal  0.439492  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0030  CDS  NC_008554  42222  43301  +  1080  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  YP_844168  decreased coverage  0.00062453  normal  0.73393  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0031  CDS  NC_008554  43350  44936  +  1587  molybdopterin oxidoreductase  YP_844169  normal  0.116629  normal  0.760475  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0032  CDS  NC_008554  45717  47351  +  1635  molybdopterin binding domain-containing protein  YP_844170  normal  0.360956  normal  0.467855  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0033  CDS  NC_008554  47379  47846  +  468  ModE family transcriptional regulator  YP_844171  normal  0.0601173  normal  0.403792  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0034  CDS  NC_008554  47918  48721  +  804  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  YP_844172  normal  0.190286  normal  0.450468  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0035  CDS  NC_008554  49011  49598  +  588  formate dehydrogenase  YP_844173  hitchhiker  0.0057106  normal  0.285517  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0036  CDS  NC_008554  49647  52061  +  2415  formate dehydrogenase, alpha subunit  YP_844174  normal  0.0129417  normal  0.222699  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0037  CDS  NC_008554  52074  52727  +  654  formate dehydrogenase, beta subunit, putative  YP_844175  hitchhiker  0.000711917  normal  0.283139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0038  CDS  NC_008554  52769  53779  +  1011  protein involved in formate dehydrogenase formation  YP_844176  hitchhiker  0.0000731666  normal  0.296733  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0039  CDS  NC_008554  53803  54669  -  867  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  YP_844177  unclonable  0.00000295564  normal  0.292337  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0040  CDS  NC_008554  55042  55374  +  333  hypothetical protein  YP_844178  unclonable  0.000000611204  normal  0.432032  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0041  CDS  NC_008554  55576  56631  -  1056  chorismate synthase  YP_844179  hitchhiker  0.0022126  normal  0.467855  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0042  CDS  NC_008554  56834  57076  +  243  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  YP_844180  hitchhiker  0.00150413  normal  0.403792  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0043  CDS  NC_008554  57077  59407  +  2331  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  YP_844181  hitchhiker  0.00409723  normal  0.565561  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0044  CDS  NC_008554  59426  60130  +  705  leucyl/phenylalanyl-tRNA--protein transferase  YP_844182  normal  0.877978  normal  0.737015  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0045  CDS  NC_008554  60382  60672  -  291  hypothetical protein  YP_844183  normal  1  normal  1  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0046  CDS  NC_008554  61277  62605  +  1329  hypothetical protein  YP_844184  normal  1  normal  1  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0047  CDS  NC_008554  62717  63652  +  936  carbamate kinase  YP_844185  normal  1  normal  1  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0048  CDS  NC_008554  63699  64796  -  1098  hypothetical protein  YP_844186  normal  1  normal  1  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0049  CDS  NC_008554  64811  65401  -  591  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  YP_844187  normal  1  normal  1  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0050  CDS  NC_008554  66160  66795  -  636  lytic transglycosylase, catalytic  YP_844188  normal  1  normal  1  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0051  CDS  NC_008554  66965  67630  -  666  putative transaldolase  YP_844189  normal  1  normal  0.809521  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0052  CDS  NC_008554  67652  67909  -  258  TRASH domain-containing protein  YP_844190  normal  1  normal  0.774005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0053  CDS  NC_008554  67923  68417  -  495  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  YP_844191  normal  1  normal  0.786018  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0054  CDS  NC_008554  68460  69626  -  1167  aminotransferase, class I and II  YP_844192  normal  1  normal  0.848733  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0055  CDS  NC_008554  69890  70693  -  804  dihydrodipicolinate reductase  YP_844193  normal  0.983155  normal  0.818927  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0056  CDS  NC_008554  70727  71602  -  876  dihydrodipicolinate synthase  YP_844194  normal  0.821032  normal  0.798921  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0057  CDS  NC_008554  71613  72476  -  864  diaminopimelate epimerase  YP_844195  normal  1  normal  0.809521  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0058  CDS  NC_008554  72652  73956  -  1305  diaminopimelate decarboxylase  YP_844196  normal  0.586159  normal  0.874852  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0059  CDS  NC_008554  74133  75224  -  1092  fibronectin, type III domain-containing protein  YP_844197  normal  1  normal  0.798921  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0060  CDS  NC_008554  75248  76648  -  1401  argininosuccinate lyase  YP_844198  normal  1  normal  0.58938  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0061  CDS  NC_008554  76678  77883  -  1206  argininosuccinate synthase  YP_844199  normal  1  normal  0.372491  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0062  CDS  NC_008554  77970  78908  -  939  ornithine carbamoyltransferase  YP_844200  normal  1  normal  0.366315  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0063  CDS  NC_008554  78905  80095  -  1191  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  YP_844201  normal  0.857354  normal  0.372491  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0064  CDS  NC_008554  80165  81061  -  897  acetylglutamate kinase  YP_844202  normal  1  normal  0.362735  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0065  CDS  NC_008554  81161  82561  -  1401  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  YP_844203  normal  1  normal  0.215309  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0066  CDS  NC_008554  82567  83106  -  540  ATP-dependent protease peptidase subunit  YP_844204  normal  1  normal  0.183253  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0067  CDS  NC_008554  83198  84184  -  987  phage integrase family protein  YP_844205  normal  1  normal  0.183253  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0068  CDS  NC_008554  84698  86773  +  2076  elongation factor G  YP_844206  normal  0.480211  normal  0.213325  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0069  CDS  NC_008554  86914  88029  +  1116  hypothetical protein  YP_844207  normal  0.568066  normal  0.0454782  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0070  CDS  NC_008554  88040  88579  +  540  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  YP_844208  normal  0.426319  normal  0.0412315  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0071  CDS  NC_008554  88847  89242  -  396  hypothetical protein  YP_844209  normal  0.233077  normal  0.0151783  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0072  CDS  NC_008554  89274  89750  -  477  hypothetical protein  YP_844210  normal  0.587358  normal  0.0153972  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0073  CDS  NC_008554  89747  90532  -  786  hypothetical protein  YP_844211  normal  1  normal  0.0162611  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0074  CDS  NC_008554  90604  92307  -  1704  TPR repeat-containing protein  YP_844212  normal  1  hitchhiker  0.00635622  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0075  CDS  NC_008554  92497  93741  +  1245  hypothetical protein  YP_844213  normal  1  hitchhiker  0.000235956  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0076  CDS  NC_008554  93794  94720  -  927  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  YP_844214  normal  1  hitchhiker  0.000211286  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0077  CDS  NC_008554  94725  95297  -  573  elongation factor P  YP_844215  normal  1  unclonable  0.0000164055  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0078  CDS  NC_008554  95481  96761  +  1281  phosphopyruvate hydratase  YP_844216  normal  0.983155  unclonable  0.0000170876  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0079  CDS  NC_008554  97253  98035  +  783  hypothetical protein  YP_844217  normal  0.376514  unclonable  0.0000154463  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0080  CDS  NC_008554  98054  99481  +  1428  iron-sulfur cluster binding protein  YP_844218  normal  0.157943  unclonable  0.0000167452  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0081  CDS  NC_008554  99875  100303  +  429  hypothetical protein  YP_844219  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0082  CDS  NC_008554  100272  100793  -  522  hypothetical protein  YP_844220  hitchhiker  0.000120859  unclonable  0.0000102783  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0083  CDS  NC_008554  100769  101329  -  561  hypothetical protein  YP_844221  unclonable  0.00000125962  unclonable  0.00000966557  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0084  CDS  NC_008554  101883  102251  +  369  RNP-1 like RNA-binding protein  YP_844222  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0085  CDS  NC_008554  103403  103651  -  249  hypothetical protein  YP_844223  hitchhiker  0.00000661544  unclonable  0.00000785992  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0086  CDS  NC_008554  104087  105943  +  1857  ABC transporter related  YP_844224  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0087  CDS  NC_008554  106093  107361  +  1269  hypothetical protein  YP_844225  normal  0.113697  unclonable  0.0000108237  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0088  CDS  NC_008554  107499  109076  -  1578  hypothetical protein  YP_844226  normal  0.191351  unclonable  0.0000123626  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0089  CDS  NC_008554  109721  110014  -  294  hypothetical protein  YP_844227  normal  0.361159  unclonable  0.00000762026  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0090  CDS  NC_008554  110252  111904  +  1653  cytochrome c family protein  YP_844228  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0091  CDS  NC_008554  111908  112576  +  669  cytochrome B561  YP_844229  normal  1  unclonable  0.00000871818  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0092  CDS  NC_008554  112749  114035  -  1287  chromate transporter  YP_844230  normal  1  unclonable  0.0000119825  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0093  CDS  NC_008554  114050  114370  -  321  rhodanese domain-containing protein  YP_844231  normal  1  unclonable  0.00000890078  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0094  CDS  NC_008554  114367  115656  -  1290  major facilitator transporter  YP_844232  normal  1  unclonable  0.0000112737  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0095  CDS  NC_008554  115679  116020  -  342  hypothetical protein  YP_844233  normal  1  unclonable  0.00000777984  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0096  CDS  NC_008554  116446  116916  +  471  hypothetical protein  YP_844234  normal  0.806408  unclonable  0.00000844821  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0097  CDS  NC_008554  116913  117332  +  420  hypothetical protein  YP_844235  normal  1  unclonable  0.00000827491  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0098  CDS  NC_008554  118044  120491  -  2448  ATP-dependent protease La  YP_844236  normal  1  unclonable  0.0000146786  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0099  CDS  NC_008554  120691  121944  -  1254  ATP-dependent protease ATP-binding subunit ClpX  YP_844237  normal  1  hitchhiker  0.000164599  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Sfum_0100  CDS  NC_008554  122508  123116  -  609  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  YP_844238  normal  1  hitchhiker  0.000862905  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 42    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>