76 genes were found for organism Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
EcE24377A_D0001  CDS  NC_009788  903  1136  234  hypothetical protein  YP_001451471  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0002  CDS  NC_009788  1194  1721  528  single-stranded DNA-binding protein  YP_001451472  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0003  CDS  NC_009788  2491  2682  192  hypothetical protein  YP_001451473  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0004  CDS  NC_009788  2679  3101  423  hypothetical protein  YP_001451474  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0005  CDS  NC_009788  3148  3573  426  antirestriction family protein  YP_001451475  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0006  CDS  NC_009788  3990  4760  771  hypothetical protein  YP_001451476  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0007  CDS  NC_009788  4805  5239  435  hypothetical protein  YP_001451477  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0008  CDS  NC_009788  5253  5474  222  hypothetical protein  YP_001451478  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0009  CDS  NC_009788  5475  6158  684  putative methylase  YP_001451479  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0010  CDS  NC_009788  6266  6391  126  hypothetical protein  YP_001451480  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0011  CDS  NC_009788  6542  7468  927  hypothetical protein  YP_001451481  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0012  CDS  NC_009788  8125  8517  393  stable plasmid inheritance protein  YP_001451482  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0013  CDS  NC_009788  8521  9495  975  plasmid segregation protein ParM  YP_001451483  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0014  CDS  NC_009788  11342  12175  834  resolvase  YP_001451484  normal  0.921027  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0015  CDS  NC_009788  12129  12542  414  hypothetical protein  YP_001451485  normal  0.680522  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0016  CDS  NC_009788  12578  12673  96  hypothetical protein  YP_001451486  normal  0.738902  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0017  CDS  NC_009788  13328  13744  417  PilT domain-containing protein  YP_001451487  normal  0.461831  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0018  CDS  NC_009788  13906  16044  2139  hypothetical protein  YP_001451488  normal  0.485123  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0019  CDS  NC_009788  16360  17898  1539  IS66 family transposase  YP_001451489  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0020  CDS  NC_009788  17948  18295  348  IS66 family orf2  YP_001451490  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0021  CDS  NC_009788  18292  18681  390  IS66 family orf1  YP_001451491  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0022  CDS  NC_009788  18981  19097  117  hypothetical protein  YP_001451492  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0023  CDS  NC_009788  19097  19687  591  hypothetical protein  YP_001451493  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0024  CDS  NC_009788  19705  20052  348  hypothetical protein  YP_001451494  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0025    NC_009788  20487  20702  216      normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0026  CDS  NC_009788  20712  20996  285  hypothetical protein  YP_001451495  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0027  CDS  NC_009788  20996  21856  861  AraC family transcriptional regulator  YP_001451496  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0028  CDS  NC_009788  22166  23368  1203  IS186, transposase  YP_001451497  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0029    NC_009788  24141  24494  354      normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0030  CDS  NC_009788  24963  25055  93  hypothetical protein  YP_001451498  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0031  CDS  NC_009788  25398  26027  630  AraC family transcriptional regulator  YP_001451499  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0032  CDS  NC_009788  27290  28060  771  hypothetical protein  YP_001451500  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0033  CDS  NC_009788  28840  29205  366  insertion sequence 2 OrfA protein  YP_001451501  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0034  CDS  NC_009788  29163  30068  906  insertion element IS2 transposase InsD  YP_001451502  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0035  CDS  NC_009788  30756  31847  1092  fimbrial protein  YP_001451503  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0036  CDS  NC_009788  31844  34462  2619  fimbrial usher family protein  YP_001451504  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0037  CDS  NC_009788  35110  35826  717  hypothetical protein  YP_001451505  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0038  CDS  NC_009788  35933  36262  330  hypothetical protein  YP_001451506  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0039    NC_009788  36597  37115  519      normal  0.514774  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0040    NC_009788  37170  38174  1005      normal  0.918321  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0041  CDS  NC_009788  38505  38696  192  hypothetical protein  YP_001451507  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0042  CDS  NC_009788  38758  39552  795  IS21 family transposition helper protein  YP_001451508  normal  0.932139  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0043  CDS  NC_009788  39552  40724  1173  IS21 family transposase  YP_001451509  normal  0.920387  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0044  CDS  NC_009788  41361  41555  195  hypothetical protein  YP_001451510  normal  0.203145  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0045  CDS  NC_009788  41552  41821  270  hypothetical protein  YP_001451511  normal  0.130777  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0046  CDS  NC_009788  41618  41728  111  hypothetical protein  YP_001451512  normal  0.189765  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0047  CDS  NC_009788  42732  43763  1032  replication initiation protein  YP_001451513  normal  0.0286778  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0048  CDS  NC_009788  45646  46179  534  transcription termination factor NusG domain-containing protein  YP_001451514  normal  0.109108  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0049  CDS  NC_009788  46432  47115  684  hypothetical protein  YP_001451515  normal  0.0376277  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0050    NC_009788  47802  48067  266      hitchhiker  0.00852183  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0051  CDS  NC_009788  48744  49811  1068  PilL protein  YP_001451516  normal  0.107454  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0052  CDS  NC_009788  49811  50248  438  PilM protein  YP_001451517  normal  0.245943  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0053  CDS  NC_009788  50477  50803  327  IS629, transposase orfA  YP_001451518  normal  0.214082  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0054    NC_009788  50803  51282  480      normal  0.0481234  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0055  CDS  NC_009788  51889  53397  1509  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  YP_001451519  normal  0.155092  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0056    NC_009788  53514  53960  447      normal  0.0468813  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0057  CDS  NC_009788  53944  55716  1773  hypothetical protein  YP_001451520  normal  0.0209487  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0058  CDS  NC_009788  55753  58452  2700  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  YP_001451521  normal  0.0607238  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0059  CDS  NC_009788  59029  59364  336  hypothetical protein  YP_001451522  hitchhiker  0.00742469  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0060  CDS  NC_009788  59450  60298  849  hypothetical protein  YP_001451523  normal  0.218485  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0061    NC_009788  60530  60820  291      normal  0.213124  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0062  CDS  NC_009788  60879  60974  96  hypothetical protein  YP_001451524  normal  0.175589  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0063  CDS  NC_009788  61001  62572  1572  IS66 family transposase  YP_001451525  normal  0.394688  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0064  CDS  NC_009788  62592  62939  348  IS66 family orf2  YP_001451526  normal  0.719086  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0065  CDS  NC_009788  62939  63616  678  IS66 family orf1  YP_001451527  normal  0.22402  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0066  CDS  NC_009788  63703  63837  135  hypothetical protein  YP_001451528  normal  0.20639  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0067  CDS  NC_009788  63868  64026  159  hypothetical protein  YP_001451529  normal  0.218261  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0068  CDS  NC_009788  64089  64979  891  putative transposase  YP_001451530  normal  0.565138  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0069  CDS  NC_009788  64976  65440  465  hypothetical protein  YP_001451531  normal  0.536383  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0070  CDS  NC_009788  65542  65808  267  hypothetical protein  YP_001451532  normal  0.349352  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0071  CDS  NC_009788  65902  66336  435  hypothetical protein  YP_001451533  normal  0.252267  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0072  CDS  NC_009788  66580  66675  96  hypothetical protein  YP_001451534  normal  0.209619  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0073  CDS  NC_009788  67065  67625  561  putative anti-restriction protein  YP_001451535  normal  0.316567  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0074  CDS  NC_009788  67697  68293  597  hypothetical protein  YP_001451536  normal  0.473714  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0075  CDS  NC_009788  68290  69009  720  plasmid SOS inhibition protein A  YP_001451537  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_D0076  CDS  NC_009788  69006  69440  435  plasmid SOS inhibition protein B  YP_001451538  normal  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>