87 genes were found for organism Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
EcE24377A_F0001  CDS  NC_009786  255  698  -  444  hypothetical protein  YP_001451374  decreased coverage  0.000000381782  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0002  CDS  NC_009786  1352  3262  +  1911  hypothetical protein  YP_001451375  hitchhiker  0.000524095  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0003  CDS  NC_009786  3259  3753  +  495  hypothetical protein  YP_001451376  normal  0.0311326  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0004    NC_009786  3819  4028  -  210      normal  0.0419612  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0005  CDS  NC_009786  4316  5524  -  1209  IS1414, transposase  YP_001451377  normal  0.0682409  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0006  CDS  NC_009786  5640  6656  -  1017  ISShdy1, transposase  YP_001451378  normal  0.0989062  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0007  CDS  NC_009786  6771  6923  +  153  hypothetical protein  YP_001451379  normal  0.0767742  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0008  CDS  NC_009786  7123  8085  +  963  plasmid segregation protein ParM  YP_001451380  normal  0.278379  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0009  CDS  NC_009786  8505  9449  -  945  hypothetical protein  YP_001451381  normal  0.376639  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0010  CDS  NC_009786  9772  10053  -  282  DNA-binding protein  YP_001451382  normal  0.235299  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0011  CDS  NC_009786  10034  10363  -  330  prophage protein gp49  YP_001451383  normal  0.25604  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0012  CDS  NC_009786  10457  10975  -  519  IS3 family transposase  YP_001451384  normal  0.581726  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0013    NC_009786  12069  12173  -  105      normal  0.801723  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0014  CDS  NC_009786  12193  12384  -  192  hypothetical protein  YP_001451385  normal  0.825989  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0015    NC_009786  12448  13201  +  754      normal  0.866133  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0016  CDS  NC_009786  13358  13804  -  447  IS629, transposase orfB, truncation  YP_001451386  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0017  CDS  NC_009786  13921  15429  -  1509  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  YP_001451387  normal  0.485362  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0018  CDS  NC_009786  16036  16146  -  111  IS629, transposase orfB, truncation  YP_001451388  normal  0.483075  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0019  CDS  NC_009786  16130  16333  -  204  hypothetical protein  YP_001451389  normal  0.692933  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0020  CDS  NC_009786  16616  17425  +  810  heat-labile enterotoxin A  YP_001451390  normal  0.969992  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0021  CDS  NC_009786  18117  18935  -  819  ISSd1, transposase orfB  YP_001451391  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0022  CDS  NC_009786  19020  20171  -  1152  IS30, transposase  YP_001451392  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0023    NC_009786  20302  20601  +  300      normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0024  CDS  NC_009786  20662  22626  +  1965  plasmid partition protein B  YP_001451393  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0025  CDS  NC_009786  22681  23058  +  378  plasmid SOS inhibition protein B  YP_001451394  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0026  CDS  NC_009786  23112  23873  +  762  plasmid SOS inhibition protein A  YP_001451395  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0027  CDS  NC_009786  23815  24129  +  315  hypothetical protein  YP_001451396  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0028  CDS  NC_009786  25398  25568  +  171  hypothetical protein  YP_001451397  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0029  CDS  NC_009786  25486  25602  +  117  protein TraI  YP_001451398  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0030  CDS  NC_009786  25622  26368  +  747  conjugal transfer pilus acetylation protein TraX  YP_001451399  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0031  CDS  NC_009786  26427  27287  +  861  alpha/beta fold family hydrolase  YP_001451400  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0032  CDS  NC_009786  27390  27950  +  561  conjugal transfer fertility inhibition protein FinO  YP_001451401  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0033  CDS  NC_009786  28151  28333  -  183  hypothetical protein  YP_001451402  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0034  CDS  NC_009786  28194  28400  +  207  hypothetical protein  YP_001451403  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0035  CDS  NC_009786  28702  29328  +  627  hypothetical protein  YP_001451404  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0036  CDS  NC_009786  29480  30070  +  591  hypothetical protein  YP_001451405  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0037  CDS  NC_009786  30868  31725  +  858  replication protein  YP_001451406  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0038  CDS  NC_009786  32696  33007  +  312  prophage protein gp49  YP_001451407  normal  0.369926  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0039  CDS  NC_009786  33007  33294  +  288  DNA-binding protein  YP_001451408  normal  0.514774  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0040  CDS  NC_009786  33671  34180  +  510  peptide deformylase  YP_001451409  normal  0.285636  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0041  CDS  NC_009786  34195  34311  +  117  hypothetical protein  YP_001451410  normal  0.207208  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0042  CDS  NC_009786  34817  35035  +  219  IS630, transposase, truncation  YP_001451411  normal  0.46468  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0043    NC_009786  35097  36042  -  946      normal  0.545705  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0044  CDS  NC_009786  36107  37057  -  951  hypothetical protein  YP_001451412  normal  0.793542  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0045  CDS  NC_009786  37062  38150  -  1089  glycosyl transferase, group 1 family protein  YP_001451413  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0046  CDS  NC_009786  38153  38974  -  822  polysaccharide deacetylase family protein  YP_001451414  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0047  CDS  NC_009786  39239  39781  -  543  hypothetical protein  YP_001451415  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0048  CDS  NC_009786  39781  40038  -  258  hypothetical protein  YP_001451416  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0049  CDS  NC_009786  40560  40778  +  219  plasmid maintenance protein CcdA  YP_001451417  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0050  CDS  NC_009786  40780  41085  +  306  plasmid maintenance protein CcdB  YP_001451418  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0051  CDS  NC_009786  41086  41892  +  807  resolvase  YP_001451419  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0052  CDS  NC_009786  42070  42714  +  645  ParA protein  YP_001451420  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0053  CDS  NC_009786  42801  43109  +  309  putative 60 kDa chaperonin  YP_001451421  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0054    NC_009786  43331  44444  +  1114      normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0055    NC_009786  44793  45922  -  1130      normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0056  CDS  NC_009786  45986  46159  +  174  hypothetical protein  YP_001451422  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0057    NC_009786  46241  47406  +  1166      normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0058  CDS  NC_009786  47406  48203  +  798  IS21 family transposition helper protein  YP_001451423  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0059    NC_009786  48318  48582  +  265      normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0060  CDS  NC_009786  49061  49786  +  726  periplasmic pilus chaperone CS3-1  YP_001451424  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0061    NC_009786  49761  52205  +  2445      normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0062  CDS  NC_009786  54098  54520  +  423  IS91, orf2  YP_001451425  normal  0.906771  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0063    NC_009786  54607  55352  +  746      normal  0.447808  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0064  CDS  NC_009786  55626  55901  +  276  IS1, transposase orfA  YP_001451426  normal  0.408312  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0065  CDS  NC_009786  55820  56323  +  504  IS1, transposase orfB  YP_001451427  normal  0.343111  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0066  CDS  NC_009786  56818  57615  +  798  AraC family transcription regulator  YP_001451428  normal  0.0603708  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0067    NC_009786  57984  58729  -  746      normal  0.182008  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0068  CDS  NC_009786  58816  59238  -  423  IS91, orf2  YP_001451429  normal  0.65691  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0069    NC_009786  59228  60046  +  819      normal  0.613944  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0070  CDS  NC_009786  60596  61735  +  1140  putative efflux ABC transporter, permease protein  YP_001451430  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0071  CDS  NC_009786  61768  62934  +  1167  hypothetical protein  YP_001451431  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0072  CDS  NC_009786  62891  63664  +  774  hypothetical protein  YP_001451432  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0073    NC_009786  64465  64763  +  299      normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0074    NC_009786  64760  65627  +  868      normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0075  CDS  NC_009786  66131  66496  +  366  insertion sequence 2 OrfA protein  YP_001451433  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0076  CDS  NC_009786  66454  67365  +  912  IS2, transposase orfB  YP_001451434  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0077  CDS  NC_009786  68024  68308  +  285  IS1414, transposase, truncation  YP_001451435  normal  0.829264  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0078  CDS  NC_009786  68336  68635  +  300  IS3, transposase orfA  YP_001451436  normal  0.598745  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0079    NC_009786  68632  69499  +  868      normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0080    NC_009786  69603  69926  +  324      normal  0.829264  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0081  CDS  NC_009786  69998  71284  -  1287  hypothetical protein  YP_001451437  normal  0.559606  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0082    NC_009786  71511  72378  -  868      normal  0.0254232  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0083  CDS  NC_009786  72375  72674  -  300  IS3, transposase orfA  YP_001451438  normal  0.013235  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0084    NC_009786  72702  73808  -  1107      normal  0.0145229  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0085  CDS  NC_009786  73885  74250  -  366  IS91, orf2  YP_001451439  normal  0.0136313  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0086  CDS  NC_009786  74269  74940  +  672  IS2, transposase orfB, truncation  YP_001451440  normal  0.0106176  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_F0087  CDS  NC_009786  75209  76954  +  1746  hypothetical protein  YP_001451441  hitchhiker  0.00223104  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>