1898 genes were found for organism Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 19    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
LGAS_0001  CDS  NC_008530  102  1496  +  1395  chromosomal replication initiation protein  YP_813856  hitchhiker  0.000013935  decreased coverage  1.67388e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0002  CDS  NC_008530  1681  2811  +  1131  DNA polymerase sliding clamp subunit  YP_813857  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0003  CDS  NC_008530  3089  3238  +  150  S4-like RNA binding protein  YP_813858  normal  1  hitchhiker  4.31544e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0004  CDS  NC_008530  3242  4366  +  1125  recombination protein F  YP_813859  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0005  CDS  NC_008530  4367  6334  +  1968  DNA gyrase, B subunit  YP_813860  normal  0.452102  hitchhiker  2.3265900000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0006  CDS  NC_008530  6345  8834  +  2490  DNA gyrase, A subunit  YP_813861  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0007  CDS  NC_008530  9021  9317  +  297  30S ribosomal protein S6  YP_813862  hitchhiker  0.00000000068559  hitchhiker  0.0000000000002413  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0008  CDS  NC_008530  9351  9869  +  519  single-stranded DNA-binding protein  YP_813863  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0009  CDS  NC_008530  9894  10127  +  234  ribosomal protein S18  YP_813864  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0010  CDS  NC_008530  10222  10908  +  687  Mg2+ and Co2+ transporter  YP_813865  hitchhiker  0.000139051  hitchhiker  0.00000000019085  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0011  CDS  NC_008530  11245  13263  +  2019  signal protein  YP_813866  hitchhiker  0.00560638  hitchhiker  0.0000000733083  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0012  CDS  NC_008530  13266  13730  +  465  50S ribosomal protein L9  YP_813867  normal  0.181348  hitchhiker  0.0000209307  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0013  CDS  NC_008530  13733  15106  +  1374  replicative DNA helicase  YP_813868  normal  1  hitchhiker  0.0000449355  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0014  CDS  NC_008530  15201  16085  +  885  transcriptional regulator and fructokinase  YP_813869  normal  1  hitchhiker  0.000579085  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0015  CDS  NC_008530  16159  17301  -  1143  hypothetical protein  YP_813870  normal  1  normal  0.0111158  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0016  CDS  NC_008530  17430  19448  -  2019  hypothetical protein  YP_813871  normal  1  normal  0.0164555  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0017  CDS  NC_008530  19556  20257  -  702  Mg2+ transporter  YP_813872  normal  1  normal  0.0915905  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0019  CDS  NC_008530  20749  21375  -  627  phosphatase  YP_813873  normal  1  normal  0.379676  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0020  CDS  NC_008530  21739  21951  +  213  transcriptional regulator  YP_813874  normal  1  normal  0.555038  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0021  CDS  NC_008530  21954  22472  +  519  hypothetical protein  YP_813875  normal  1  normal  0.614815  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0022  CDS  NC_008530  22512  23558  +  1047  oxidoreductase  YP_813876  decreased coverage  0.00128895  normal  0.715289  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0024  CDS  NC_008530  23795  24955  +  1161  acetyltransferase  YP_813877  normal  0.0751333  normal  0.978526  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0025  CDS  NC_008530  25106  25753  +  648  putative NADH-flavin reductase  YP_813878  normal  0.0898967  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0026  CDS  NC_008530  25806  26549  -  744  integral membrane protein  YP_813879  normal  0.667689  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0027  CDS  NC_008530  26636  27343  +  708  HAD superfamily hydrolase  YP_813880  normal  1  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0028  CDS  NC_008530  27379  28218  -  840  hypothetical protein  YP_813881  normal  1  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0029  CDS  NC_008530  28330  28515  -  186  hypothetical protein  YP_813882  normal  1  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0030  CDS  NC_008530  28890  30812  +  1923  translation elongation factor (GTPase)  YP_813883  normal  1  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0031  CDS  NC_008530  30847  31773  -  927  Mg2+ and Co2+ transporter  YP_813884  normal  1  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0032  CDS  NC_008530  32036  32227  +  192  general stress response protein  YP_813885  normal  1  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0033  CDS  NC_008530  32262  32528  +  267  hypothetical protein  YP_813886  normal  1  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0034  CDS  NC_008530  32664  33491  +  828  exonuclease III  YP_813887  normal  1  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0035  CDS  NC_008530  33548  36397  +  2850  superfamily II DNA/RNA helicase  YP_813888  normal  0.0259774  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0036  CDS  NC_008530  36492  37379  +  888  alpha/beta hydrolase superfamily protein  YP_813889  normal  0.0152607  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0037  CDS  NC_008530  37367  37504  +  138  hypothetical protein  YP_813890  normal  1  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0038  CDS  NC_008530  37424  37675  -  252  hypothetical protein  YP_813891  normal  1  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0039  CDS  NC_008530  37786  38835  +  1050  permease  YP_813892  normal  1  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0040  CDS  NC_008530  39078  40409  +  1332  glutathione reductase  YP_813893  normal  1  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0041  CDS  NC_008530  40454  41608  -  1155  IMP dehydrogenase/GMP reductase  YP_813894  normal  1  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0042  CDS  NC_008530  41682  42257  -  576  lysophospholipase L1 related esterase  YP_813895  normal  1  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0043  CDS  NC_008530  42332  43363  -  1032  D-lactate dehydrogenase, LdhA  YP_813896  decreased coverage  0.000238116  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0044  CDS  NC_008530  43603  46224  +  2622  adhesion exoprotein  YP_813897  normal  1  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0045  CDS  NC_008530  46590  57668  +  11079  adhesion exoprotein  YP_813898  normal  1  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0046  CDS  NC_008530  57837  60794  +  2958  adhesion exoprotein  YP_813899  normal  1  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0047  CDS  NC_008530  60863  62347  +  1485  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  YP_813900  normal  1  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0048  CDS  NC_008530  62531  63457  +  927  transcriptional regulator  YP_813901  normal  1  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0049  CDS  NC_008530  63587  65437  +  1851  fumarate reductase flavoprotein subunit  YP_813902  hitchhiker  0.00375543  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0050  CDS  NC_008530  65528  66892  +  1365  branched-chain amino acid permease  YP_813903  unclonable  0.0000000000377191  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0051  CDS  NC_008530  66959  67672  +  714  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  YP_813904  normal  0.181609  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0052  CDS  NC_008530  67716  68630  +  915  prolyl aminopeptidase  YP_813905  normal  0.946601  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0053  CDS  NC_008530  68765  69367  +  603  hypothetical protein  YP_813906  normal  1  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0054  CDS  NC_008530  69430  70380  -  951  conjugated bile salt hydrolase-like protein  YP_813907  normal  1  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0055  CDS  NC_008530  70398  71753  -  1356  conjugated bile Salt transporter  YP_813908  normal  1  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0056    NC_008530  71778  73124  -  1347      normal  1  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0057  CDS  NC_008530  73311  74171  -  861  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  YP_813909  normal  0.870618  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0058  CDS  NC_008530  74168  75118  -  951  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  YP_813910  decreased coverage  0.0031105  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0059  CDS  NC_008530  75131  76084  -  954  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  YP_813911  hitchhiker  0.00101  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0060  CDS  NC_008530  76114  76938  -  825  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  YP_813912  hitchhiker  0.00709812  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0061  CDS  NC_008530  76935  77717  -  783  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  YP_813913  normal  0.0168338  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0064  CDS  NC_008530  78181  78888  +  708  DNA-binding response regulator  YP_813914  normal  0.611294  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0065  CDS  NC_008530  78920  80785  +  1866  Signal transduction histidine kinase  YP_813915  normal  1  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0066  CDS  NC_008530  80679  82103  +  1425  hypothetical protein  YP_813916  decreased coverage  0.000449157  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0067  CDS  NC_008530  82093  82914  +  822  hypothetical protein  YP_813917  normal  0.206847  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0068  CDS  NC_008530  82921  83718  +  798  beta-lactamase superfamily hydrolase  YP_813918  normal  1  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0069  CDS  NC_008530  83766  85025  +  1260  trypsin-like serine protease  YP_813919  normal  0.0357916  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0070  CDS  NC_008530  85539  86018  +  480  rRNA large subunit methyltransferase  YP_813920  decreased coverage  0.00000017339  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0071  CDS  NC_008530  86019  86672  -  654  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  YP_813921  hitchhiker  0.00121752  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0072  CDS  NC_008530  86686  88038  -  1353  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  YP_813922  normal  1  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0073  CDS  NC_008530  88019  88603  -  585  ABC-type cobalt transport system, permease component  YP_813923  normal  1  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0074  CDS  NC_008530  88813  89742  +  930  AraC-type DNA-binding protein, response regulator  YP_813924  normal  1  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0075  CDS  NC_008530  89782  90672  -  891  heat shock protein HtpX  YP_813925  normal  1  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0076  CDS  NC_008530  90681  91238  -  558  hypothetical protein  YP_813926  normal  0.071632  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0077  CDS  NC_008530  91355  92461  -  1107  di- and tricarboxylate transporter  YP_813927  hitchhiker  0.0000000000154883  normal  0.998926  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0078  CDS  NC_008530  92638  93048  +  411  hypothetical protein  YP_813928  hitchhiker  0.00000000000134929  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0079  CDS  NC_008530  93127  93267  +  141  hypothetical protein  YP_813929  hitchhiker  0.000000000000311504  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0080  CDS  NC_008530  93441  94301  +  861  hypothetical protein  YP_813930  hitchhiker  0.000000215459  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0081  CDS  NC_008530  94434  95741  +  1308  glycosyltransferase  YP_813931  hitchhiker  0.00000323026  normal  1  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0082  CDS  NC_008530  95751  96869  +  1119  endoglucanase Y  YP_813932  hitchhiker  0.0000000532728  normal  0.916342  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0083  CDS  NC_008530  96984  97628  +  645  HD superfamily hydrolase  YP_813933  hitchhiker  0.0000000142377  normal  0.689622  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0084  CDS  NC_008530  97630  98559  +  930  restriction endonuclease  YP_813934  hitchhiker  0.000000299612  normal  0.866494  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0085  CDS  NC_008530  98606  99370  -  765  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  YP_813935  hitchhiker  0.000000203236  normal  0.523772  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0086  CDS  NC_008530  99354  100967  -  1614  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  YP_813936  normal  0.0796672  normal  0.210719  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0087  CDS  NC_008530  101303  101872  -  570  3-methyladenine DNA glycosylase  YP_813937  normal  1  normal  0.0848019  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0088  CDS  NC_008530  101960  102358  +  399  hypothetical protein  YP_813938  normal  1  normal  0.0412988  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0089  CDS  NC_008530  102355  103137  -  783  hypothetical protein  YP_813939  normal  1  normal  0.0183454  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0090  CDS  NC_008530  103124  103654  -  531  methylated DNA-protein cysteine methyltransferase  YP_813940  normal  1  normal  0.0169354  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0091  CDS  NC_008530  103770  104483  -  714  NAD-dependent deacetylase  YP_813941  normal  1  normal  0.0206655  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0092  CDS  NC_008530  104529  105083  +  555  hypothetical protein  YP_813942  normal  1  normal  0.0117124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0093  CDS  NC_008530  105164  106555  -  1392  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  YP_813943  normal  1  hitchhiker  0.00325157  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0094  CDS  NC_008530  106639  107346  -  708  Zn-dependent protease  YP_813944  normal  1  hitchhiker  0.00198706  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0095  CDS  NC_008530  107370  108293  -  924  alpha/beta hydrolase superfamily protein  YP_813945  normal  1  hitchhiker  0.00130774  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0096  CDS  NC_008530  108377  109132  +  756  RNase H  YP_813946  normal  1  hitchhiker  0.000638062  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0097  CDS  NC_008530  109292  110260  -  969  hypothetical protein  YP_813947  normal  1  hitchhiker  0.000152524  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0098  CDS  NC_008530  110388  111218  +  831  glycosyltransferase-like protein  YP_813948  normal  1  hitchhiker  0.00000850354  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0099  CDS  NC_008530  111243  111905  +  663  alpha/beta fold family hydrolase  YP_813949  normal  1  hitchhiker  0.00000675213  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0100  CDS  NC_008530  111994  112356  +  363  hypothetical protein  YP_813950  hitchhiker  0.00539643  hitchhiker  0.00000109189  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0101  CDS  NC_008530  112437  113429  +  993  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  YP_813951  hitchhiker  0.0000000630999  hitchhiker  0.000002029  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0102  CDS  NC_008530  113581  114795  +  1215  immunity protein PlnI  YP_813952  unclonable  0.0000000000029241  hitchhiker  0.00000103836  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0103  CDS  NC_008530  114928  116277  +  1350  gamma-aminobutyrate permease related permease  YP_813953  hitchhiker  0.0000103198  hitchhiker  0.00000046337  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0104  CDS  NC_008530  116451  117110  +  660  transcriptional regulator  YP_813954  hitchhiker  0.00000798599  hitchhiker  0.000000102912  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 19    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>