2876 genes were found for organism Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 29    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NmulC_2780  CDS  NC_007616  673  1593  +  921  hypothetical protein  YP_413476  normal  0.0971539  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
NmulC_2781  CDS  NC_007616  1653  2528  -  876  hypothetical protein  YP_413477  normal  0.572225  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
NmulC_2782  CDS  NC_007616  2521  2841  -  321  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  YP_413478  normal  0.821719  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
NmulC_2783  CDS  NC_007616  3476  4297  -  822  integrase catalytic subunit  YP_413479  normal  0.983973  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
NmulC_2784  CDS  NC_007616  4291  4557  -  267  transposase IS3/IS911  YP_413480  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
NmulC_2785  CDS  NC_007616  5108  6079  -  972  BsuBI/PstI restriction endonuclease, C-terminal  YP_413481  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
NmulC_2786  CDS  NC_007616  6076  7590  -  1515  hypothetical protein  YP_413482  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
NmulC_2787  CDS  NC_007616  7748  8062  -  315  hypothetical protein  YP_413483  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
NmulC_2788  CDS  NC_007616  8049  8699  -  651  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_413484  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
NmulC_2789  CDS  NC_007616  9223  10275  +  1053  hypothetical protein  YP_413485  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
NmulC_2790  CDS  NC_007616  10306  11979  -  1674  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  YP_413486  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
NmulC_2791  CDS  NC_007616  11976  12308  -  333  mobilization protein  YP_413487  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
NmulC_2792  CDS  NC_007616  13350  13661  +  312  hypothetical protein  YP_413488  hitchhiker  0.00225377  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
NmulC_2793  CDS  NC_007616  13678  15663  +  1986  TRAG protein  YP_413489  normal  0.0977234  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
NmulC_2794  CDS  NC_007616  15653  16426  +  774  hypothetical protein  YP_413490  normal  0.314035  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
NmulC_2795  CDS  NC_007616  16723  16968  -  246  resolvase family site-specific recombinase  YP_413491  normal  0.127054  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0001  CDS  NC_007614  69  1499  +  1431  chromosomal replication initiation protein  YP_410702  hitchhiker  0.00109258  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0002  CDS  NC_007614  1719  2828  +  1110  DNA polymerase III, beta subunit  YP_410703  decreased coverage  0.0000100173  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0003  CDS  NC_007614  3157  5589  +  2433  DNA gyrase subunit B  YP_410704  normal  0.835475  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0004  CDS  NC_007614  5730  6980  +  1251  serine hydroxymethyltransferase  YP_410705  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0005  CDS  NC_007614  7110  7589  +  480  transcriptional regulator NrdR  YP_410706  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0006  CDS  NC_007614  7704  8804  +  1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  YP_410707  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0007  CDS  NC_007614  8891  9454  -  564  two component Fis family transcriptional regulator  YP_410708  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0008  CDS  NC_007614  9451  10716  -  1266  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  YP_410709  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0009  CDS  NC_007614  10912  11538  +  627  riboflavin synthase subunit alpha  YP_410710  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0010  CDS  NC_007614  11535  12668  +  1134  bifunctional 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase/GTP cyclohydrolase II-like protein  YP_410711  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0011  CDS  NC_007614  12785  13267  +  483  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  YP_410712  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0012  CDS  NC_007614  13378  13854  +  477  NusB antitermination factor  YP_410713  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0013  CDS  NC_007614  13916  14941  +  1026  thiamine-monophosphate kinase  YP_410714  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0014  CDS  NC_007614  14922  15554  +  633  phosphatidylglycerophosphatase A  YP_410715  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0015  CDS  NC_007614  15630  16139  +  510  CinA-like  YP_410716  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0016  CDS  NC_007614  16151  16798  -  648  hypothetical protein  YP_410717  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0017  CDS  NC_007614  16951  18174  +  1224  tetratricopeptide TPR_3  YP_410718  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0018  CDS  NC_007614  18171  18386  +  216  hypothetical protein  YP_410719  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0019  CDS  NC_007614  18529  19548  +  1020  recombinase A  YP_410720  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0020  CDS  NC_007614  19616  20068  +  453  regulatory protein RecX  YP_410721  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0021  CDS  NC_007614  20065  20517  +  453  hypothetical protein  YP_410722  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0022  CDS  NC_007614  20524  23112  +  2589  alanyl-tRNA synthetase  YP_410723  normal  0.711035  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0023  CDS  NC_007614  23153  24103  +  951  thioredoxin reductase  YP_410724  normal  0.459849  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0024  CDS  NC_007614  24258  24893  +  636  Smr protein/MutS2-like  YP_410725  normal  0.415846  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0025  CDS  NC_007614  24924  25319  -  396  TraR/DksA family transcriptional regulator  YP_410726  normal  0.795475  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0026  CDS  NC_007614  26103  27338  -  1236  major facilitator transporter  YP_410727  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0027  CDS  NC_007614  28045  28866  +  822  hypothetical protein  YP_410728  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0028  CDS  NC_007614  29878  30336  -  459  surface antigen protein  YP_410729  normal  0.722933  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0029  CDS  NC_007614  30389  30721  +  333  hypothetical protein  YP_410730  normal  0.586893  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0030  CDS  NC_007614  30847  32124  -  1278  hypothetical protein  YP_410731  normal  0.29018  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0031  CDS  NC_007614  32159  32398  -  240  hypothetical protein  YP_410732  normal  0.124793  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0032  CDS  NC_007614  32528  33013  +  486  hypothetical protein  YP_410733  normal  0.199385  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0033  CDS  NC_007614  33010  33522  +  513  hypothetical protein  YP_410734  normal  0.138172  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0034  CDS  NC_007614  33715  34551  +  837  hypothetical protein  YP_410735  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0035  CDS  NC_007614  34825  35184  +  360  hypothetical protein  YP_410736  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0036  CDS  NC_007614  35230  36420  -  1191  S-adenosylmethionine synthetase  YP_410737  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0037  CDS  NC_007614  36417  39539  -  3123  ATPase, E1-E2 type  YP_410738  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0038  CDS  NC_007614  39950  41914  +  1965  amine oxidase  YP_410739  normal  0.301145  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0039  CDS  NC_007614  41919  43004  -  1086  hypothetical protein  YP_410740  normal  0.204308  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0040  CDS  NC_007614  43320  43700  -  381  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_410741  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0041  CDS  NC_007614  43871  44449  +  579  TetR family transcriptional regulator  YP_410742  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0042  CDS  NC_007614  44617  45792  +  1176  secretion protein HlyD  YP_410743  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0043  CDS  NC_007614  45802  48930  +  3129  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  YP_410744  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0044  CDS  NC_007614  49143  49829  -  687  hypothetical protein  YP_410745  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0045  CDS  NC_007614  50064  53867  +  3804  B12-dependent methionine synthase  YP_410746  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0046  CDS  NC_007614  53982  54362  +  381  IS298, transposase OrfA  YP_410747  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0047  CDS  NC_007614  54212  54745  +  534  transposase IS4  YP_410748  normal  0.683119  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0048  CDS  NC_007614  54842  55651  +  810  hypothetical protein  YP_410749  normal  0.139303  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0049  CDS  NC_007614  55669  56367  -  699  hypothetical protein  YP_410750  normal  0.435898  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0050  CDS  NC_007614  56539  58686  -  2148  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  YP_410751  normal  0.239296  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0051  CDS  NC_007614  58820  59026  -  207  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  YP_410752  normal  0.0139624  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0052  CDS  NC_007614  59209  59841  -  633  guanylate kinase  YP_410753  hitchhiker  0.00408303  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0053  CDS  NC_007614  60014  60454  -  441  thioredoxin  YP_410754  hitchhiker  0.000803765  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0054  CDS  NC_007614  60899  61306  +  408  transposase IS3/IS911  YP_410755  hitchhiker  0.0000565593  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0055  CDS  NC_007614  61303  62151  +  849  integrase catalytic subunit  YP_410756  unclonable  0.000000315593  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0056  CDS  NC_007614  62655  63260  -  606  hypothetical protein  YP_410757  hitchhiker  0.000280933  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0057  CDS  NC_007614  63303  64268  -  966  peptidase S49  YP_410758  normal  0.0181813  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0058  CDS  NC_007614  64265  65140  -  876  hypothetical protein  YP_410759  normal  0.41426  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0059  CDS  NC_007614  65529  66923  -  1395  hypothetical protein  YP_410760  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0060  CDS  NC_007614  66910  67335  -  426  hypothetical protein  YP_410761  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0061  CDS  NC_007614  67332  67607  -  276  hypothetical protein  YP_410762  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0062  CDS  NC_007614  68549  68803  -  255  putative transcriptional regulator  YP_410763  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0063  CDS  NC_007614  68916  69539  -  624  hypothetical protein  YP_410764  normal  0.732448  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0064  CDS  NC_007614  69640  70902  -  1263  Phage integrase  YP_410765  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0065  CDS  NC_007614  71155  72048  -  894  hypothetical protein  YP_410766  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0066  CDS  NC_007614  72220  72936  +  717  ribonuclease PH  YP_410767  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0067  CDS  NC_007614  72945  73538  +  594  putative deoxyribonucleotide triphosphate pyrophosphatase  YP_410768  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0068  CDS  NC_007614  73643  74869  +  1227  coproporphyrinogen III oxidase  YP_410769  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0069  CDS  NC_007614  74876  75565  -  690  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  YP_410770  normal  0.662361  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0070  CDS  NC_007614  75617  76411  -  795  thiazole synthase  YP_410771  normal  0.496923  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0071  CDS  NC_007614  76415  76903  -  489  thiamine biosynthesis protein ThiS  YP_410772  normal  0.290426  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0072  CDS  NC_007614  77017  77475  +  459  hypothetical protein  YP_410773  normal  0.399917  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0073  CDS  NC_007614  77708  78220  -  513  hypothetical protein  YP_410774  normal  0.463818  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0074  CDS  NC_007614  78484  78903  +  420  hypothetical protein  YP_410775  normal  0.51381  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0075  CDS  NC_007614  79069  79404  -  336  membrane protein, Kef-type K+ transport system NAD-binding component  YP_410776  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0076  CDS  NC_007614  79526  80437  +  912  Ion transport protein  YP_410777  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0077  CDS  NC_007614  80802  82322  +  1521  AsmA  YP_410778  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0078  CDS  NC_007614  82322  83473  +  1152  A/G-specific adenine glycosylase  YP_410779  normal  0.99857  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0079  CDS  NC_007614  83497  84150  +  654  5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase  YP_410780  normal  0.963155  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0080  CDS  NC_007614  84182  84817  -  636  aromatic acid decarboxylase  YP_410781  normal  0.869407  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0081  CDS  NC_007614  84905  85744  -  840  hypothetical protein  YP_410782  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0082  CDS  NC_007614  85831  86775  -  945  HPr kinase/phosphorylase  YP_410783  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0083  CDS  NC_007614  86952  87254  -  303  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  YP_410784  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Nmul_A0084  CDS  NC_007614  87281  88747  -  1467  sigma-54 (RpoN)  YP_410785  normal  1  n/a    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 29    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>