3186 genes were found for organism Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 32    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Noc_0001  CDS  NC_007484  175  1524  +  1350  chromosomal replication initiator protein, DnaA  YP_342087  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0002  CDS  NC_007484  2396  3499  +  1104  DNA-directed DNA polymerase  YP_342088  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0003    NC_007484  3590  4215  -  626      normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0004    NC_007484  4225  4635  -  411      normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0005    NC_007484  4765  5076  -  312      normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0006    NC_007484  5101  5247  -  147      normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0007    NC_007484  5426  5620  -  195      normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0008    NC_007484  5692  6738  -  1047      normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0009    NC_007484  6745  7309  -  565      normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0010    NC_007484  7484  7735  -  252      normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0011    NC_007484  7862  8404  +  543      normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0012    NC_007484  8401  8592  -  192      normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0013    NC_007484  8632  9009  -  378      normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0014    NC_007484  9394  9711  -  318      normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0015    NC_007484  9938  10228  -  291      normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0016    NC_007484  10252  10596  +  345      normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0017  CDS  NC_007484  10544  11101  -  558  transposase ISY100e  YP_342089  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0018  CDS  NC_007484  11319  12410  +  1092  RecF protein  YP_342090  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0019  CDS  NC_007484  12438  14861  +  2424  DNA gyrase, B subunit  YP_342091  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0020  CDS  NC_007484  14920  15621  +  702  hypothetical protein  YP_342092  normal  0.671617  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0021  CDS  NC_007484  17144  18151  -  1008  fructose-1,6-bisphosphatase  YP_342093  normal  0.193201  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0022  CDS  NC_007484  18366  19184  -  819  formylmethanofuran dehydrogenase  YP_342094  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0023  CDS  NC_007484  19267  20124  -  858  formylmethanofuran--tetrahydromethanopterin formyltransferase  YP_342095  normal  0.701164  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0024  CDS  NC_007484  20172  21842  -  1671  DNA/RNA non-specific endonuclease  YP_342096  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0025  CDS  NC_007484  21857  23134  -  1278  formylmethanofuran dehydrogenase  YP_342097  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0026  CDS  NC_007484  23322  23927  -  606  hypothetical protein  YP_342098  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0027  CDS  NC_007484  23931  25688  -  1758  arginyl-tRNA synthetase  YP_342099  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0028  CDS  NC_007484  25794  28004  -  2211  primosome assembly protein PriA  YP_342100  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0029  CDS  NC_007484  28110  28664  -  555  DJ-1  YP_342101  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0030  CDS  NC_007484  28738  30057  -  1320  peptidase S41A  YP_342102  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0031  CDS  NC_007484  30469  32022  -  1554  phosphoglyceromutase  YP_342103  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0032  CDS  NC_007484  32678  33424  +  747  rhodanese-like protein  YP_342104  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0033  CDS  NC_007484  33428  33685  +  258  glutaredoxin GrxC  YP_342105  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0034  CDS  NC_007484  33751  34245  +  495  preprotein translocase subunit SecB  YP_342106  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0035  CDS  NC_007484  34256  35290  +  1035  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  YP_342107  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0036  CDS  NC_007484  35307  36278  +  972  hypothetical protein  YP_342108  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0037  CDS  NC_007484  36273  37454  -  1182  hypothetical protein  YP_342109  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0038  CDS  NC_007484  37544  38032  -  489  7, 8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase  YP_342110  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0039  CDS  NC_007484  38038  38415  -  378  dihydroneopterin aldolase family protein  YP_342111  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0040  CDS  NC_007484  38533  39126  +  594  hypothetical protein  YP_342112  normal  0.828352  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0041  CDS  NC_007484  39123  40130  -  1008  O-sialoglycoprotein endopeptidase  YP_342113  normal  0.676343  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0042  CDS  NC_007484  40548  40763  +  216  30S ribosomal protein S21  YP_342114  normal  0.0926773  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0043  CDS  NC_007484  40801  41271  +  471  hypothetical protein  YP_342115  normal  0.397691  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0044  CDS  NC_007484  41378  43102  +  1725  DNA primase  YP_342116  normal  0.723286  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0045  CDS  NC_007484  43212  45020  +  1809  hypothetical protein  YP_342117  normal  0.250484  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0046  CDS  NC_007484  45851  46606  +  756  Phage integrase  YP_342118  normal  0.380307  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0047  CDS  NC_007484  46609  47358  +  750  hypothetical protein  YP_342119  normal  0.185506  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0048  CDS  NC_007484  47396  47731  +  336  transposase  YP_342120  normal  0.169923  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0049  CDS  NC_007484  47706  48230  +  525  IS630 family transposase  YP_342121  normal  0.155938  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0050  CDS  NC_007484  48776  49048  +  273  hypothetical protein  YP_342122  normal  0.0141878  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0051  CDS  NC_007484  49045  49437  +  393  hypothetical protein  YP_342123  normal  0.0102195  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0052  CDS  NC_007484  49434  50033  +  600  hypothetical protein  YP_342124  normal  0.0183338  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0053  CDS  NC_007484  50043  51848  +  1806  TOPRIM domain-containing protein  YP_342125  decreased coverage  0.00140147  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0054  CDS  NC_007484  51909  52556  -  648  hypothetical protein  YP_342126  normal  0.0442309  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0055  CDS  NC_007484  53559  54056  +  498  hypothetical protein  YP_342127  normal  0.513038  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0056  CDS  NC_007484  54071  57892  +  3822  hypothetical protein  YP_342128  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0057  CDS  NC_007484  57899  59566  +  1668  hypothetical protein  YP_342129  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0058  CDS  NC_007484  59633  59992  +  360  hypothetical protein  YP_342130  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0059  CDS  NC_007484  59989  62832  +  2844  hypothetical protein  YP_342131  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0060  CDS  NC_007484  62833  63705  +  873  ATP-binding region, ATPase-like  YP_342132  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0061  CDS  NC_007484  63723  64097  +  375  hypothetical protein  YP_342133  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0062  CDS  NC_007484  64087  64638  +  552  PilT-like protein  YP_342134  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0063  CDS  NC_007484  64658  67546  +  2889  Type III restriction enzyme, res subunit  YP_342135  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0064  CDS  NC_007484  67546  69540  +  1995  hypothetical protein  YP_342136  normal  0.834835  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0065  CDS  NC_007484  69540  70307  +  768  hypothetical protein  YP_342137  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0066  CDS  NC_007484  70800  71636  -  837  TrfA-related protein  YP_342138  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0067    NC_007484  71747  72058  -  312      normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0068    NC_007484  72068  72379  -  312      normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0069    NC_007484  72690  72917  +  228      normal  0.71229  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0070  CDS  NC_007484  72989  73324  +  336  transposase  YP_342139  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0071  CDS  NC_007484  73299  73823  +  525  IS630 family transposase  YP_342140  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0072    NC_007484  74420  74746  +  327      normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0073  CDS  NC_007484  74779  75159  +  381  putative transposase  YP_342141  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0074  CDS  NC_007484  75203  75625  +  423  putative transposase  YP_342142  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0075    NC_007484  75658  76188  +  531      normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0076  CDS  NC_007484  75986  77884  -  1899  DNA helicase II  YP_342143  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0077  CDS  NC_007484  78286  79368  +  1083  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  YP_342144  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0078  CDS  NC_007484  79413  85016  -  5604  excinuclease ABC subunit A  YP_342145  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0079  CDS  NC_007484  85072  85677  -  606  DNA-3-methyladenine glycosylase II  YP_342146  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0080    NC_007484  85910  86765  -  856      normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0081  CDS  NC_007484  86929  87738  +  810  hypothetical protein  YP_342147  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0082  CDS  NC_007484  87829  88731  +  903  sulfotransferase  YP_342148  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0083  CDS  NC_007484  88891  89154  +  264  hypothetical protein  YP_342149  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0084  CDS  NC_007484  89144  89413  +  270  hypothetical protein  YP_342150  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0085  CDS  NC_007484  89460  89768  +  309  hypothetical protein  YP_342151  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0086  CDS  NC_007484  89746  89982  +  237  helix-turn-helix protein, CopG  YP_342152  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0087  CDS  NC_007484  90148  90867  +  720  hypothetical protein  YP_342153  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0088    NC_007484  90979  91290  -  312      normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0089  CDS  NC_007484  91778  92896  +  1119  nitrite reductase (NO-forming)  YP_342154  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0090  CDS  NC_007484  92886  93251  +  366  hypothetical protein  YP_342155  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0091    NC_007484  93439  93750  +  312      normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0092  CDS  NC_007484  94010  94753  +  744  hypothetical protein  YP_342156  normal  0.796375  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0093  CDS  NC_007484  95115  95894  +  780  glucose/ribitol dehydrogenase  YP_342157  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0094  CDS  NC_007484  95970  96542  +  573  NADPH-dependent FMN reductase  YP_342158  normal  0.17676  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0095    NC_007484  96585  96945  +  361      normal  0.298186  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0096  CDS  NC_007484  97214  97411  +  198  hypothetical protein  YP_342159  normal  0.410091  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0097  CDS  NC_007484  97494  98048  +  555  hypothetical protein  YP_342160  normal  0.371233  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0098  CDS  NC_007484  98555  99265  +  711  hypothetical protein  YP_342161  normal  0.888213  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0099  CDS  NC_007484  99270  100871  +  1602  glycoside hydrolase family protein  YP_342162  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_0100  CDS  NC_007484  100934  102397  +  1464  glycogen synthase  YP_342163  normal  1  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 32    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>