3304 genes were found for organism Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 34    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Mhun_0001  CDS  NC_007796  18  266  +  249  hypothetical protein  YP_501501  normal  0.0395988  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0002  CDS  NC_007796  505  891  -  387  tetratricopeptide TPR_2  YP_501502  hitchhiker  0.00992655  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0003  CDS  NC_007796  1257  1859  -  603  CheW protein  YP_501503  normal  0.0102214  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0004  CDS  NC_007796  2056  5175  +  3120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  YP_501504  normal  0.763661  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0005  CDS  NC_007796  5172  9371  +  4200  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  YP_501505  normal  0.7049  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0006  CDS  NC_007796  9683  10921  -  1239  putative PAS/PAC sensor protein  YP_501506  normal  0.533638  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0007  CDS  NC_007796  11176  11685  -  510  CheW protein  YP_501507  normal  1  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0008  CDS  NC_007796  11694  13253  -  1560  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_501508  normal  1  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0009  CDS  NC_007796  13386  14996  +  1611  transposase, IS4  YP_501509  normal  0.272991  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0010  CDS  NC_007796  15045  17297  -  2253  putative PAS/PAC sensor protein  YP_501510  normal  0.0248614  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0011  CDS  NC_007796  17422  20331  +  2910  putative PAS/PAC sensor protein  YP_501511  normal  0.161167  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0012    NC_007796  20306  20650  +  345      normal  0.772872  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0013    NC_007796  20712  20885  +  174      normal  1  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0014  CDS  NC_007796  20995  22542  +  1548  hypothetical protein  YP_501512  normal  1  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0015  CDS  NC_007796  22854  24974  -  2121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_501513  normal  1  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0016  CDS  NC_007796  25025  28054  -  3030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  YP_501514  normal  0.0724205  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0017    NC_007796  28108  28452  +  345      normal  0.123355  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0018  CDS  NC_007796  28470  30347  -  1878  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  YP_501515  normal  0.470845  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0019  CDS  NC_007796  30650  30925  +  276  hypothetical protein  YP_501516  normal  0.938389  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0020  CDS  NC_007796  30912  31688  -  777  hypothetical protein  YP_501517  normal  0.852542  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0021  CDS  NC_007796  31691  32494  -  804  dihydropteroate synthase  YP_501518  normal  1  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0022  CDS  NC_007796  32476  33315  -  840  bifunctional 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase/ 5,10-methylene-tetrahydrofolate cyclohydrolase  YP_501519  normal  1  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0023  CDS  NC_007796  33312  34622  -  1311  serine hydroxymethyltransferase  YP_501520  normal  1  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0024  CDS  NC_007796  34729  35172  +  444  hypothetical protein  YP_501521  normal  1  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0025  CDS  NC_007796  35214  38654  +  3441  chromosome segregation protein SMC  YP_501522  normal  0.962242  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0026  CDS  NC_007796  38647  39381  +  735  chromosome segregation and condensation protein ScpA  YP_501523  normal  1  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0027  CDS  NC_007796  45012  45851  +  840  hypothetical protein  YP_501524  normal  1  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0028  CDS  NC_007796  45870  46526  -  657  amino acid ABC transporter permease  YP_501525  normal  1  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0029  CDS  NC_007796  46536  47288  -  753  ABC transporter related  YP_501526  normal  0.957294  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0030  CDS  NC_007796  47293  47964  -  672  amino acid ABC transporter permease  YP_501527  normal  0.685158  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0031  CDS  NC_007796  48086  48904  -  819  extracellular solute-binding protein  YP_501528  normal  0.246666  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0032  CDS  NC_007796  49051  49881  +  831  extracellular solute-binding protein  YP_501529  normal  0.427857  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0033  CDS  NC_007796  49961  51052  +  1092  hypothetical protein  YP_501530  normal  0.586052  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0034  CDS  NC_007796  51100  52995  +  1896  peptidyl-arginine deiminase  YP_501531  normal  0.137362  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0035  CDS  NC_007796  53027  53353  +  327  large conductance mechanosensitive channel protein  YP_501532  normal  0.262039  normal  0.835133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0036  CDS  NC_007796  53356  53886  +  531  hypothetical protein  YP_501533  normal  0.367513  normal  0.816705  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0037  CDS  NC_007796  53918  54655  +  738  hypothetical protein  YP_501534  normal  1  normal  0.860871  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0038  CDS  NC_007796  54652  55005  +  354  zinc finger, SWIM-type  YP_501535  normal  1  normal  0.860871  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0039  CDS  NC_007796  55025  57775  +  2751  alanyl-tRNA synthetase  YP_501536  normal  1  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0040  CDS  NC_007796  57768  58442  +  675  putative transcriptional regulator  YP_501537  normal  1  normal  0.533704  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0041  CDS  NC_007796  58695  59573  -  879  hypothetical protein  YP_501538  normal  1  normal  0.543626  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0042  CDS  NC_007796  59600  59959  -  360  hypothetical protein  YP_501539  normal  1  normal  0.502331  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0043  CDS  NC_007796  60009  60746  +  738  hypothetical protein  YP_501540  normal  1  normal  0.539415  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0044  CDS  NC_007796  60775  61302  -  528  Ferritin and Dps  YP_501541  normal  1  normal  0.311572  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0045  CDS  NC_007796  61557  63146  +  1590  ferredoxin-dependent glutamate synthase  YP_501542  normal  1  normal  0.378634  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0046  CDS  NC_007796  63530  63730  +  201  hypothetical protein  YP_501543  normal  1  normal  0.785412  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0047  CDS  NC_007796  63922  65118  +  1197  hypothetical protein  YP_501544  normal  1  normal  0.577583  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0048  CDS  NC_007796  65248  66423  -  1176  hypothetical protein  YP_501545  normal  1  normal  0.349363  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0049  CDS  NC_007796  66843  67094  +  252  DNA-directed RNA polymerase subunit H  YP_501546  normal  1  normal  0.536679  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0050  CDS  NC_007796  67113  68669  +  1557  DNA-directed RNA polymerase subunit beta''  YP_501547  normal  1  normal  0.620898  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0051  CDS  NC_007796  68669  70489  +  1821  DNA-directed RNA polymerase subunit B'  YP_501548  normal  1  normal  0.620898  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0052  CDS  NC_007796  70504  73164  +  2661  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  YP_501549  normal  1  normal  0.421691  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0053  CDS  NC_007796  73164  75125  +  1962  DNA-directed RNA polymerase, subunit A''  YP_501550  normal  1  normal  0.0449558  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0054  CDS  NC_007796  75137  75424  +  288  50S ribosomal protein L30e  YP_501551  normal  1  normal  0.0738724  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0055  CDS  NC_007796  75434  75862  +  429  NusA family protein  YP_501552  normal  1  normal  0.0755132  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0056  CDS  NC_007796  75926  76711  +  786  hypothetical protein  YP_501553  normal  1  normal  0.0354366  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0057  CDS  NC_007796  76877  77272  -  396  hypothetical protein  YP_501554  normal  1  normal  0.034078  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0058  CDS  NC_007796  77278  78012  -  735  hypothetical protein  YP_501555  normal  1  normal  0.0354366  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0059  CDS  NC_007796  78113  78571  +  459  hypothetical protein  YP_501556  normal  1  normal  0.0315655  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0060  CDS  NC_007796  78586  80706  +  2121  serine phosphatase  YP_501557  normal  1  normal  0.0461367  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0061  CDS  NC_007796  80711  82429  -  1719  hypothetical protein  YP_501558  normal  1  normal  0.0922669  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0062  CDS  NC_007796  82520  82870  +  351  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  YP_501559  normal  1  normal  0.0726506  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0063  CDS  NC_007796  82894  83316  +  423  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  YP_501560  normal  1  normal  0.0713993  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0064  CDS  NC_007796  83363  84169  +  807  hypothetical protein  YP_501561  normal  1  normal  0.0768546  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0065  CDS  NC_007796  84323  84826  +  504  hypothetical protein  YP_501562  normal  1  normal  0.0709944  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0066  CDS  NC_007796  84949  85449  +  501  hypothetical protein  YP_501563  normal  1  normal  0.0701675  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0067  CDS  NC_007796  85562  86035  -  474  superfamily II helicase-like protein  YP_501564  normal  1  normal  0.0705682  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0068  CDS  NC_007796  86233  87780  -  1548  hypothetical protein  YP_501565  normal  1  normal  0.090437  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0069  CDS  NC_007796  88206  88844  -  639  hypothetical protein  YP_501566  normal  0.465201  normal  0.0755132  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0070  CDS  NC_007796  88986  90149  +  1164  thiamine biosynthesis protein  YP_501567  normal  1  normal  0.090437  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0071  CDS  NC_007796  90155  91336  -  1182  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  YP_501568  normal  1  normal  0.0929376  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0072  CDS  NC_007796  91462  93072  -  1611  transposase, IS4  YP_501569  normal  0.173128  normal  0.0995371  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0073  CDS  NC_007796  93392  94333  -  942  hypothetical protein  YP_501570  normal  0.0571388  normal  0.087721  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0074  CDS  NC_007796  94371  95858  +  1488  hypothetical protein  YP_501571  normal  0.0871233  normal  0.176107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0075  CDS  NC_007796  95860  96720  -  861  formate/nitrite transporter  YP_501572  decreased coverage  0.00341405  normal  0.480537  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0076  CDS  NC_007796  96787  98529  -  1743  hypothetical protein  YP_501573  normal  0.0190792  normal  0.314766  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0077  CDS  NC_007796  98547  99446  -  900  PfkB  YP_501574  normal  0.273667  normal  0.451983  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0078  CDS  NC_007796  99443  99781  -  339  hypothetical protein  YP_501575  normal  0.153667  normal  0.432637  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0079  CDS  NC_007796  99805  100332  -  528  nitroreductase  YP_501576  normal  0.423186  normal  0.734054  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0080  CDS  NC_007796  100319  100675  -  357  hypothetical protein  YP_501577  normal  0.238936  normal  0.726541  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0081  CDS  NC_007796  100865  101203  -  339  hypothetical protein  YP_501578  normal  0.313059  normal  0.734054  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0082  CDS  NC_007796  101277  103121  -  1845  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit E  YP_501579  normal  0.334037  normal  0.909155  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0083  CDS  NC_007796  103118  104350  -  1233  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit D  YP_501580  normal  0.731285  normal  0.499768  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0084  CDS  NC_007796  104347  105828  -  1482  argininosuccinate lyase  YP_501581  normal  1  normal  0.491917  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0085  CDS  NC_007796  105995  107047  +  1053  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  YP_501582  normal  1  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0086  CDS  NC_007796  107137  107922  +  786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_501583  normal  1  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0087  CDS  NC_007796  107924  108715  +  792  ABC transporter related  YP_501584  normal  1  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0088  CDS  NC_007796  108746  109258  +  513  50S ribosomal protein L10e  YP_501585  normal  1  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0089  CDS  NC_007796  109328  110164  +  837  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  YP_501586  normal  1  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0090  CDS  NC_007796  110161  110718  +  558  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  YP_501587  normal  1  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0091  CDS  NC_007796  110715  110987  +  273  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  YP_501588  normal  1  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0092  CDS  NC_007796  111001  112095  +  1095  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit alpha  YP_501589  normal  1  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0093  CDS  NC_007796  112092  112883  +  792  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  YP_501590  normal  1  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0094  CDS  NC_007796  112873  113412  +  540  2-oxoacid:acceptor oxidoreductase, gamma subunit, pyruvate/2-ketoisovalerate  YP_501591  normal  1  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0095  CDS  NC_007796  113409  114488  +  1080  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  YP_501592  normal  1  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0096  CDS  NC_007796  114485  115351  +  867  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  YP_501593  normal  1  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0097  CDS  NC_007796  115352  116341  +  990  hypothetical protein  YP_501594  normal  1  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0098  CDS  NC_007796  116348  117082  +  735  hypothetical protein  YP_501595  normal  1  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0099  CDS  NC_007796  117084  117815  -  732  TPR repeat-containing protein  YP_501596  normal  1  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Mhun_0100  CDS  NC_007796  118095  118988  +  894  hypothetical protein  YP_501597  normal  1  normal  1  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 34    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>