135 genes were found for organism Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Nham_4540  CDS  NC_007961  122  3445  3324  Dtr system oriT relaxase  YP_571950  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4541  CDS  NC_007961  3442  3975  534  conjugal transfer pilin processing protease TraF  YP_571951  normal  0.708935  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4542  CDS  NC_007961  3995  5131  1137  conjugal transfer protein TraB  YP_571952  normal  0.325638  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4543  CDS  NC_007961  5143  5766  624  conjugal transfer protein TraH  YP_571953  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4544    NC_007961  5851  6162  312      normal  0.86015  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4545    NC_007961  6219  6464  246      normal  0.793675  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4546  CDS  NC_007961  7284  8003  720  hypothetical protein  YP_571954  normal  0.960942  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4547    NC_007961  8052  8252  201      normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4548  CDS  NC_007961  8473  8919  447  hypothetical protein  YP_571955  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4549  CDS  NC_007961  8944  9324  381  hypothetical protein  YP_571956  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4550  CDS  NC_007961  9433  9933  501  heat shock protein Hsp20  YP_571957  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4551  CDS  NC_007961  10019  10480  462  heat shock protein Hsp20  YP_571958  normal  0.448918  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4552  CDS  NC_007961  10615  10905  291  hypothetical protein  YP_571959  normal  0.413409  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4553  CDS  NC_007961  10902  11330  429  PilT protein-like  YP_571960  normal  0.0286007  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4554  CDS  NC_007961  11687  11944  258  hypothetical protein  YP_571961  normal  0.0440351  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4555  CDS  NC_007961  11949  12368  420  hypothetical protein  YP_571962  normal  0.0630464  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4556  CDS  NC_007961  13055  14200  1146  transposase IS116/IS110/IS902  YP_571963  normal  0.0733262  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4557  CDS  NC_007961  14413  14742  330  hypothetical protein  YP_571964  normal  0.19178  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4558  CDS  NC_007961  14844  15548  705  LuxR family transcriptional regulator  YP_571965  normal  0.534127  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4559  CDS  NC_007961  15988  17289  1302  conjugal transfer protein TrbI  YP_571966  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4560  CDS  NC_007961  17300  17752  453  conjugal transfer protein TrbH  YP_571967  normal  0.782345  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4561  CDS  NC_007961  17755  18594  840  conjugal transfer protein TrbG  YP_571968  normal  0.843427  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4562  CDS  NC_007961  18612  19274  663  conjugal transfer protein TrbF  YP_571969  normal  0.905041  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4563  CDS  NC_007961  19317  20471  1155  conjugal transfer protein TrbL  YP_571970  normal  0.87565  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4564  CDS  NC_007961  20484  20669  186  hypothetical protein  YP_571971  normal  0.385771  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4565  CDS  NC_007961  20666  21463  798  conjugal transfer protein TrbJ  YP_571972  normal  0.30666  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4566  CDS  NC_007961  21435  23888  2454  conjugal transfer protein TrbE  YP_571973  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4567  CDS  NC_007961  23898  24197  300  conjugal transfer protein TrbD  YP_571974  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4568  CDS  NC_007961  24190  24561  372  conjugal transfer protein TrbC  YP_571975  normal  0.437419  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4569  CDS  NC_007961  24551  25540  990  conjugal transfer protein TrbB  YP_571976  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4570  CDS  NC_007961  25537  26160  624  putative autoinducer synthesis protein  YP_571977  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4571  CDS  NC_007961  26576  27790  1215  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_571978  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4572  CDS  NC_007961  27787  28818  1032  parB-like partition proteins  YP_571979  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4573  CDS  NC_007961  29095  30420  1326  replication initiation protein RepC  YP_571980  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4574  CDS  NC_007961  30442  30750  309  hypothetical protein  YP_571981  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4575  CDS  NC_007961  30747  31160  414  PilT protein-like  YP_571982  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4576  CDS  NC_007961  31165  32238  1074  phage integrase  YP_571983  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4577  CDS  NC_007961  32241  32627  387  PilT protein-like  YP_571984  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4578  CDS  NC_007961  32627  32881  255  Rv0623-like transcription factor  YP_571985  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4579  CDS  NC_007961  33183  34838  1656  integrase catalytic subunit  YP_571986  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4580  CDS  NC_007961  34835  35758  924  TniB  YP_571987  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4581  CDS  NC_007961  35806  36975  1170  hypothetical protein  YP_571988  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4582  CDS  NC_007961  37169  38113  945  hypothetical protein  YP_571989  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4583  CDS  NC_007961  38131  38829  699  putative transcriptional regulator  YP_571990  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4584    NC_007961  39117  39410  294      normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4585    NC_007961  39410  39991  582      normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4586  CDS  NC_007961  40050  40340  291  CopG-like DNA-binding  YP_571991  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4587  CDS  NC_007961  40328  40843  516  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_571992  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4588  CDS  NC_007961  41155  42996  1842  diguanylate cyclase  YP_571993  normal  0.0646445  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4589    NC_007961  43621  43909  289      hitchhiker  0.00146784  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4590    NC_007961  43924  45325  1402      normal  0.0443012  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4591    NC_007961  45569  45823  255      normal  0.846436  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4592  CDS  NC_007961  45836  46090  255  hypothetical protein  YP_571994  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4593  CDS  NC_007961  46083  46616  534  hypothetical protein  YP_571995  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4594  CDS  NC_007961  46677  48005  1329  hypothetical protein  YP_571996  normal  0.29723  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4595    NC_007961  48420  48848  429      normal  0.655798  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4596    NC_007961  48866  49818  953      normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4597  CDS  NC_007961  50051  50476  426  transposase IS200-like  YP_571997  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4598  CDS  NC_007961  50684  51910  1227  Na+/H+ antiporter NhaA  YP_571998  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4599  CDS  NC_007961  51953  53017  1065  putative transposase  YP_571999  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4600  CDS  NC_007961  53096  54199  1104  feruloyl esterase  YP_572000  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4601  CDS  NC_007961  54790  55854  1065  fatty acid desaturase  YP_572001  normal  0.845504  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4602  CDS  NC_007961  55920  56873  954  esterase, PHB depolymerase  YP_572002  normal  0.462256  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4603    NC_007961  56928  57243  316      normal  0.814867  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4604    NC_007961  57395  57983  589      normal  0.927035  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4605  CDS  NC_007961  57980  61258  3279  MCP methyltransferase, CheR-type  YP_572003  normal  0.315944  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4606  CDS  NC_007961  61332  61805  474  hypothetical protein  YP_572004  normal  0.816682  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4607  CDS  NC_007961  62000  63430  1431  resolvase-like protein  YP_572005  normal  0.435176  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4608    NC_007961  63489  63791  303      normal  0.130934  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4609    NC_007961  64038  65504  1467      normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4610    NC_007961  65499  66667  1169      normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4611  CDS  NC_007961  66743  68224  1482  sulphate transporter  YP_572006  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4612    NC_007961  68619  68792  174      normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4613  CDS  NC_007961  69424  70143  720  hypothetical protein  YP_572007  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4614  CDS  NC_007961  70140  70376  237  hypothetical protein  YP_572008  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4615  CDS  NC_007961  70485  70940  456  hypothetical protein  YP_572009  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4616  CDS  NC_007961  70996  71265  270  hypothetical protein  YP_572010  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4617  CDS  NC_007961  71429  72160  732  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  YP_572011  normal  0.219004  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4618  CDS  NC_007961  72649  74013  1365  signal transduction histidine kinase  YP_572012  normal  0.723174  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4619    NC_007961  74170  74718  549      normal  0.483735  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4620  CDS  NC_007961  74752  75144  393  rhodanese-like protein  YP_572013  normal  0.178094  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4621  CDS  NC_007961  75255  76163  909  beta-lactamase-like  YP_572014  normal  0.380042  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4622  CDS  NC_007961  76176  76979  804  hypothetical protein  YP_572015  normal  0.479297  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4623  CDS  NC_007961  76976  77431  456  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  YP_572016  normal  0.910607  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4624  CDS  NC_007961  77435  77860  426  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  YP_572017  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4625  CDS  NC_007961  79116  79433  318  hypothetical protein  YP_572018  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4626  CDS  NC_007961  79517  80317  801  transposase IS116/IS110/IS902  YP_572019  normal  0.878988  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4627    NC_007961  80455  80715  261      normal  0.528428  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4628    NC_007961  80746  80916  171      normal  0.959004  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4629  CDS  NC_007961  80954  81574  621  hypothetical protein  YP_572020  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4630  CDS  NC_007961  81637  84042  2406  copper-translocating P-type ATPase  YP_572021  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4631  CDS  NC_007961  84113  84517  405  hypothetical protein  YP_572022  normal  0.316237  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4632  CDS  NC_007961  84543  84896  354  hypothetical protein  YP_572023  normal  0.192705  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4633  CDS  NC_007961  84906  86363  1458  outer membrane efflux protein  YP_572024  normal  0.706868  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4634  CDS  NC_007961  86375  87763  1389  twin-arginine translocation pathway signal  YP_572025  normal  0.294072  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4635  CDS  NC_007961  87811  88110  300  hypothetical protein  YP_572026  normal  0.438517  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4636  CDS  NC_007961  88159  88671  513  hypothetical protein  YP_572027  normal  0.733458  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4637  CDS  NC_007961  88828  89445  618  cytochrome c family protein  YP_572028  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4638  CDS  NC_007961  89872  90297  426  hypothetical protein  YP_572029  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4639  CDS  NC_007961  90404  90907  504  hypothetical protein  YP_572030  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>