185 genes were found for organism Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Nham_4355  CDS  NC_007960  44  628  585  hypothetical protein  YP_571778  normal  0.051926  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4356  CDS  NC_007960  1159  1515  357  hypothetical protein  YP_571779  normal  0.0625217  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4357  CDS  NC_007960  1615  2022  408  hypothetical protein  YP_571780  normal  0.513388  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4358  CDS  NC_007960  2019  3437  1419  secretion protein HlyD  YP_571781  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4359  CDS  NC_007960  3434  6616  3183  heavy metal efflux pump CzcA  YP_571782  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4360  CDS  NC_007960  6759  7466  708  cytochrome c, class I  YP_571783  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4361  CDS  NC_007960  7589  8146  558  RNA polymerase sigma factor  YP_571784  normal  0.779824  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4362  CDS  NC_007960  8369  8710  342  hypothetical protein  YP_571785  normal  0.619822  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4363  CDS  NC_007960  8861  9547  687  hypothetical protein  YP_571786  normal  0.543834  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4364  CDS  NC_007960  9583  12018  2436  copper-translocating P-type ATPase  YP_571787  normal  0.750997  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4365  CDS  NC_007960  12054  13295  1242  major facilitator transporter  YP_571788  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4366  CDS  NC_007960  13859  14338  480  hypothetical protein  YP_571789  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4367  CDS  NC_007960  14429  16810  2382  putative phosphoketolase  YP_571790  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4368  CDS  NC_007960  17002  18123  1122  glycosidase, PH1107-related  YP_571791  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4369  CDS  NC_007960  18116  18892  777  HAD family hydrolase  YP_571792  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4370  CDS  NC_007960  18889  22155  3267  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  YP_571793  normal  0.402344  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4371  CDS  NC_007960  22288  23238  951  glucokinase  YP_571794  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4372  CDS  NC_007960  23417  24655  1239  acetate kinase  YP_571795  normal  0.920791  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4373  CDS  NC_007960  24706  25170  465  CBS domain-containing protein  YP_571796  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4374  CDS  NC_007960  25600  25887  288  hypothetical protein  YP_571797  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4375  CDS  NC_007960  25981  26787  807  Crp/FNR family transcriptional regulator  YP_571798  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4376  CDS  NC_007960  26781  27416  636  hypothetical protein  YP_571799  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4377  CDS  NC_007960  27655  30093  2439  magnesium-translocating P-type ATPase  YP_571800  normal  0.308216  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4378  CDS  NC_007960  30520  31326  807  purine phosphorylases family protein 1  YP_571801  normal  0.340466  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4379  CDS  NC_007960  31364  31984  621  hypothetical protein  YP_571802  normal  0.686834  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4380  CDS  NC_007960  32047  34503  2457  copper-translocating P-type ATPase  YP_571803  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4381  CDS  NC_007960  34557  34832  276  hypothetical protein  YP_571804  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4382  CDS  NC_007960  34919  35395  477  hypothetical protein  YP_571805  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4383  CDS  NC_007960  35416  35775  360  hypothetical protein  YP_571806  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4384  CDS  NC_007960  35785  37242  1458  outer membrane efflux protein  YP_571807  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4385  CDS  NC_007960  37254  38633  1380  twin-arginine translocation pathway signal  YP_571808  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4386    NC_007960  38650  38937  288      normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4387  CDS  NC_007960  39069  39689  621  cytochrome c family protein  YP_571809  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4388    NC_007960  39661  40298  638      normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4389  CDS  NC_007960  40454  40774  321  hypothetical protein  YP_571810  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4390    NC_007960  40876  41298  423      normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4391    NC_007960  41336  41665  330      normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4392    NC_007960  41764  43289  1526      normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4393  CDS  NC_007960  42574  43149  576  hypothetical protein  YP_571811  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4394  CDS  NC_007960  43286  43636  351  IstB  YP_571812  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4395  CDS  NC_007960  43656  45509  1854  resolvase-like protein  YP_571813  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4396  CDS  NC_007960  45704  46390  687  LuxR family transcriptional regulator  YP_571814  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4397  CDS  NC_007960  47118  48077  960  copper resistance D  YP_571815  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4398  CDS  NC_007960  48092  48448  357  copper resistance protein CopC  YP_571816  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4399  CDS  NC_007960  48451  49455  1005  hypothetical protein  YP_571817  normal  0.760851  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4400  CDS  NC_007960  49533  49976  444  hypothetical protein  YP_571818  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4401    NC_007960  50108  50350  243      normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4402    NC_007960  50347  50556  210      normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4403  CDS  NC_007960  50713  51111  399  hypothetical protein  YP_571819  normal  0.574836  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4404  CDS  NC_007960  51243  54440  3198  heavy metal efflux pump CzcA  YP_571820  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4405  CDS  NC_007960  54437  56089  1653  secretion protein HlyD  YP_571821  normal  0.164815  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4406  CDS  NC_007960  56331  56600  270  hypothetical protein  YP_571822  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4407  CDS  NC_007960  56966  57607  642  hypothetical protein  YP_571823  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4408  CDS  NC_007960  57604  58158  555  RNA polymerase sigma factor  YP_571824  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4409  CDS  NC_007960  58439  58681  243  hypothetical protein  YP_571825  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4410  CDS  NC_007960  59184  60467  1284  hypothetical protein  YP_571826  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4411  CDS  NC_007960  60539  60916  378  hypothetical protein  YP_571827  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4412  CDS  NC_007960  61175  61429  255  hypothetical protein  YP_571828  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4413  CDS  NC_007960  61457  62107  651  hypothetical protein  YP_571829  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4414  CDS  NC_007960  62216  62539  324  hypothetical protein  YP_571830  normal  0.91662  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4415  CDS  NC_007960  62766  64145  1380  hypothetical protein  YP_571831  normal  0.247797  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4416  CDS  NC_007960  64478  64816  339  hypothetical protein  YP_571832  normal  0.21107  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4417  CDS  NC_007960  64853  65137  285  mercuric transport protein periplasmic protein  YP_571833  normal  0.192588  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4418  CDS  NC_007960  65149  65526  378  mercuric ion transport protein, MerT  YP_571834  normal  0.468664  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4419  CDS  NC_007960  65539  66237  699  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  YP_571835  normal  0.269969  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4420  CDS  NC_007960  66234  66494  261  thioredoxin/glutaredoxin  YP_571836  normal  0.0845291  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4421  CDS  NC_007960  66498  66917  420  MerR family transcriptional regulator  YP_571837  normal  0.0298638  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4422  CDS  NC_007960  67035  68267  1233  major facilitator transporter  YP_571838  normal  0.179143  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4423  CDS  NC_007960  68287  70740  2454  heavy metal translocating P-type ATPase  YP_571839  normal  0.332759  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4424  CDS  NC_007960  70806  71021  216  heavy metal transport/detoxification protein  YP_571840  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4425  CDS  NC_007960  71270  71737  468  ArsR family transcriptional regulator  YP_571841  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4426  CDS  NC_007960  71968  72489  522  twin-arginine translocation pathway signal  YP_571842  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4427  CDS  NC_007960  72502  74964  2463  arsenate reductase (azurin)  YP_571843  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4428  CDS  NC_007960  75160  75882  723  NADPH-dependent FMN reductase  YP_571844  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4429  CDS  NC_007960  75872  76276  405  arsenate reductase  YP_571845  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4430  CDS  NC_007960  76273  76971  699  major intrinsic protein  YP_571846  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4431  CDS  NC_007960  76971  77846  876  ArsR family transcriptional regulator  YP_571847  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4432  CDS  NC_007960  77954  78271  318  ArsR family transcriptional regulator  YP_571848  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4433  CDS  NC_007960  78321  79691  1371  putative secreted protein  YP_571849  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4434  CDS  NC_007960  79702  80883  1182  major facilitator transporter  YP_571850  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4435  CDS  NC_007960  81125  81820  696  LuxR family transcriptional regulator  YP_571851  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4436  CDS  NC_007960  82387  84531  2145  TRAG protein  YP_571852  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4437  CDS  NC_007960  84509  85558  1050  type II secretion system protein E  YP_571853  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4438  CDS  NC_007960  85530  86867  1338  conjugation TrbI-like protein  YP_571854  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4439  CDS  NC_007960  86874  87677  804  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  YP_571855  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4440  CDS  NC_007960  87674  88390  717  VirB8  YP_571856  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4441  CDS  NC_007960  88387  89517  1131  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  YP_571857  normal  0.418646  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4442  CDS  NC_007960  89714  89923  210  hypothetical protein  YP_571858  normal  0.473715  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4443  CDS  NC_007960  89920  90639  720  conjugal transfer protein  YP_571859  normal  0.228705  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4444  CDS  NC_007960  90650  91543  894  hypothetical protein  YP_571860  normal  0.457311  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4445  CDS  NC_007960  91540  93951  2412  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  YP_571861  normal  0.346994  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4446  CDS  NC_007960  93962  94258  297  type IV secretory pathway, VirB3-like  YP_571862  normal  0.593094  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4447  CDS  NC_007960  94255  94560  306  conjugal transfer protein, trbC  YP_571863  normal  0.633969  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4448  CDS  NC_007960  94575  95327  753  lytic transglycosylase, catalytic  YP_571864  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4449  CDS  NC_007960  95428  95937  510  hypothetical protein  YP_571865  normal  0.581783  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4450  CDS  NC_007960  95939  96538  600  succinoglycan biosynthesis protein exoI-like  YP_571866  normal  0.623703  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4451  CDS  NC_007960  96567  96905  339  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  YP_571867  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4452  CDS  NC_007960  96892  97476  585  hypothetical protein  YP_571868  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4453  CDS  NC_007960  97473  98021  549  hypothetical protein  YP_571869  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_4454  CDS  NC_007960  98031  98696  666  hypothetical protein  YP_571870  normal  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>